Protein
View in Explore- Genbank accession
- AWD93112.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MEVKMRKLTKFKFFYNTPFTDYQNTIHFNSNKERDDYFLNGRHFKSLDYSKQSYNFIRDRMEINVDMQWHDAQGINYMTFLSDFENRRYYAFVNQIEYVNDVVVKIYFVIDTIMTYTQGNVLEKLSNVNIERQHLSKRTYNYMLPMLRNNDDVLKVSNKNYVYNQMQQYLENLVLFQSSADLSKKFGTKKEPNLDTSKGTIYDNITSPVNLYVMEYDDFINFMDKMSAYPWITQNFQKVQMLPKDFINTKDLEDVKTSEKITGLKTLKQGGKSKEWSLNDLSLSFTELQEMMLSKKDEFKHMIRNEYMTIEFYDWNGNTMLLDAGKISQKTGVKLRTKSIIGYHNEVRVYPVDYNSAENDRPILSKNKDILIDTGSFLNTNITFNSFAQVPILINNGILGQSQQAYRQRNAESQLITSRIDNVLNGSDPKSRFYDAVSVASNLSPTALFGKFNEEYNFYKQQQAEYKDLALQPPSVTESEMGNAFQIANNINGLTMKISVPSPKEITFLQKYYMLFGFEVNDYNTSIEPINSMTVCNYLKCTGTYTIRDIDPMLMEQLKAILESGVRFWHNDGSGNPMLQNPLNNKFREGV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 591 AA molecular weight: 69060,49100 Da isoelectric point: 6,44738 aromaticity: 0,12521 hydropathy: -0,56836
Domains
Domains [InterPro]
IPR031772
7–119
7–119
1
591
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Staphylococcus phage CSA13 [NCBI] |
2108359 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AWD93112.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH107118.1
[NCBI]
CDS location
range 7546 -> 9321
strand +
strand +
CDS
ATGGAGGTAAAAATGAGAAAATTAACAAAATTTAAATTTTTCTATAACACACCGTTTACTGATTATCAAAATACGATTCATTTTAATAGTAATAAAGAACGTGATGATTATTTTTTAAATGGACGTCATTTTAAATCATTAGACTATTCCAAACAATCGTATAATTTTATACGTGATAGAATGGAAATCAATGTTGATATGCAGTGGCATGACGCACAAGGGATTAACTACATGACGTTTTTATCAGATTTTGAGAACAGACGTTATTATGCGTTTGTGAATCAAATCGAATATGTGAATGATGTTGTGGTTAAAATATATTTTGTGATTGATACTATTATGACGTATACACAAGGTAATGTATTAGAAAAACTCTCAAACGTTAATATTGAACGTCAACACTTATCAAAACGCACGTATAACTATATGTTACCAATGTTACGTAACAATGATGATGTGTTAAAAGTATCAAATAAAAACTATGTGTATAACCAAATGCAACAGTATTTGGAAAATTTAGTGTTATTCCAGTCAAGTGCTGATTTATCAAAGAAATTTGGTACTAAAAAAGAGCCAAACTTAGATACGTCTAAAGGTACGATATATGACAATATCACATCACCAGTCAACTTATACGTTATGGAATATGATGACTTTATTAACTTTATGGATAAAATGAGTGCCTATCCATGGATTACACAAAACTTTCAAAAGGTTCAAATGTTACCTAAAGATTTTATTAATACAAAAGATTTAGAGGACGTTAAGACAAGTGAAAAAATTACTGGATTAAAGACGTTAAAACAGGGTGGAAAATCAAAAGAATGGAGTTTAAACGATTTATCATTAAGTTTCACAGAGCTTCAAGAGATGATGTTGTCTAAAAAAGACGAGTTTAAACATATGATACGTAATGAGTACATGACGATTGAGTTTTATGACTGGAATGGTAATACTATGTTACTAGACGCTGGTAAGATTTCACAAAAAACAGGTGTTAAGTTACGTACAAAATCCATCATTGGTTATCATAATGAAGTGCGAGTTTATCCAGTAGATTATAACAGTGCTGAAAATGATAGACCGATACTTTCAAAAAATAAAGATATATTAATTGATACAGGTTCATTCTTAAATACAAATATAACATTTAATAGTTTTGCCCAAGTTCCAATTTTAATTAATAACGGTATATTAGGACAATCACAACAAGCATATAGACAGCGTAATGCAGAAAGTCAATTAATCACAAGTCGAATTGATAATGTATTAAATGGCAGTGACCCTAAATCAAGGTTTTACGACGCTGTAAGTGTAGCAAGTAATTTAAGTCCAACTGCTTTATTTGGTAAGTTTAATGAAGAATATAATTTCTACAAACAACAACAAGCAGAATATAAAGATTTAGCCTTACAACCACCATCAGTGACAGAGTCAGAAATGGGGAACGCTTTCCAGATAGCTAATAATATTAACGGTTTAACGATGAAAATTAGTGTACCGTCGCCTAAAGAAATTACATTTTTACAAAAATATTATATGTTGTTTGGTTTTGAAGTAAATGACTATAATACATCTATTGAACCAATTAATAGTATGACTGTTTGCAATTATTTAAAATGTACAGGTACGTATACAATACGTGACATTGACCCTATGTTAATGGAACAATTAAAAGCTATTTTGGAATCTGGTGTGAGATTTTGGCATAATGATGGTTCAGGTAACCCTATGTTACAAAATCCATTAAATAATAAATTTAGAGAGGGGGTATAA
Tertiary structure
PDB ID
a941bff39e0e1fdecc59d3d282ff0e1e463e0d7da92be5474b391c0e4234ee74
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50