Protein

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Genbank accession
AVH85346.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,99
Protein sequence
MSNKLLIKRSSTSGKVPTIADIVVGELAMNTYDGRLFMHINNGSDSIIEIGALNSPAFTGIPTAPTASASTNTSQIATTAYVTTAISNAAFVSNSNNIVAGSGISVSKSGTDITISATGSGTGSVTSVALSMPSIFNVSGSPVTTTGTLTATLAGQNANTFLSGPGSGPADIPTFRAIAPADLPLATTTNVGAVSIGAGLTVDVSGVVKLDTNNAVQSFNGRYGTVTLTSADVTGVGGLLANNAALTGTPTAPTAAVNNNTTQIANTAFVTTAINNAISSGTVTAFNGRGGNVILQATDVTGVGGALLNSPTFTGTPAAPTAALGTNTTQIATTAFVAGAISNMSYVSSFNGRTGAVTLTQSDVTNVGIALLSGSDFTGTVTAPTPATSDNSTKVATTAFVKTVVASSGVSTFNGRSGDVSLTSSDILNAGGALLTSPAFTGTPTAPTPATSDNSTQIATTAFVKTALSGYTLPVATGSTPGAVIVGSGINVAPDGTISTTFPVTSVAGKTGAVTLSLSDINGASSLAPINSPSFSGTPLAPTIDPHNLTWSSGQPSDQIATNGFAVAVATQTSTSIGVTGGNVSLGNAANYQYIVITGTLTSDATIVLPGDPGGRWVFYNNTSGSYNVILAGPTANKATFTLQQGGTAEVVCVSSIGVLPATSVGITQPQTDNSTNLATTAFVKSMFAGQTAVTSFNSRVGAITLQTSDVSAVGAAMLTGANFTGAVTAPTPSIGDSSTNVATTQYVEKALLNTTTVSLSSTNVTLTPAQYGTAIIEFTGTLTQSVTITVPTSGQWVMYNATTGAFNVTLSNGQGSTYVVPQNQSASVMSLGSLGIVNANIAAFVLTPATATTLGGVYVPSGNGLTVDNTGAIKASIAGSTSSTTGVVYQGDGITIGSDGKLSANLRTVAGVTPTGGDITLAVGNISGAAPLNSPTFTGTPAAPTPATNDNSTRIATTAFVVNALGSIGVTSFNSRMGAVTLQASDVTGVGGALTASPTFTGTPAAPTPATSDNSTRIATTAFVQSVFAQIGSGVLTFNGRSGSVTLQASDVTGVGGALTASPGFTGTPTAPTATAGTNTTQIATTAFVQTAIAGVSGVSSFNTRTGAVTLTAADVSNVGGAMTASPSFSGTPTAPNPTIGTNTNQIATAQFVESTLFTASSVALSNANVTLSASQYGACIIKLTGTLTANVSITFPTSGQWDVYNATSGSFTVTLTNGTGSNVVAPQGTVTVVMSDNTAGMINTSAYAAANVARIACNIPGSPNVTTETFYLFGQACTLPANLTGATAYGVAAASSSAPYTVNVYKYVGTSSSGTQVGTITVNPGSTSTFATTGGTSVSFAVGDRLSYQFPTGNMTLFAATLVGTWQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1369 AA
molecular weight: 134756,89990 Da
isoelectric point:4,71493
aromaticity:0,05771
hydropathy:0,26947

Taxonomy

Phage
Ralstonia phage RsoM2USA [NCBI] · taxon 2070027
No lineage information
Host
Ralstonia solanacearum [NCBI] · taxon 305
cellular organisms Bacteria Pseudomonadati Pseudomonadota Betaproteobacteria Burkholderiales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AVH85346.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG752970.1 [NCBI]
CDS location
range 289857 -> 293966
strand +
CDS
ATGTCAAACAAGTTGTTAATTAAACGATCATCTACATCTGGTAAAGTACCTACTATTGCAGATATAGTGGTTGGCGAACTAGCCATGAATACCTATGATGGTAGATTATTCATGCATATCAATAATGGATCGGATTCCATTATAGAAATAGGTGCGTTAAATTCTCCTGCTTTTACAGGAATTCCTACTGCTCCTACTGCATCTGCTAGTACAAATACCAGTCAAATAGCGACAACTGCGTATGTCACTACAGCAATATCCAATGCAGCATTTGTGTCAAATAGCAATAACATTGTTGCTGGGAGTGGTATTTCTGTTTCAAAATCGGGCACTGATATAACAATTTCGGCAACCGGATCTGGTACAGGGAGTGTAACCAGTGTGGCATTATCCATGCCATCTATTTTTAACGTTTCAGGTTCACCGGTAACCACTACTGGTACTCTTACTGCTACATTAGCAGGTCAGAATGCTAATACATTCTTAAGTGGCCCTGGATCTGGTCCTGCAGATATACCTACATTCAGAGCAATAGCACCAGCAGACCTACCGCTGGCCACAACGACTAATGTTGGCGCAGTATCAATAGGTGCAGGTTTGACGGTTGATGTTTCTGGTGTAGTTAAGCTTGATACGAATAACGCTGTTCAGTCATTCAACGGTCGATATGGAACAGTAACTCTAACAAGTGCAGATGTCACCGGTGTTGGTGGACTGTTGGCTAATAATGCTGCGCTGACAGGAACTCCTACCGCCCCAACTGCAGCAGTTAACAACAATACAACCCAGATAGCTAACACCGCCTTCGTAACCACGGCAATCAATAACGCTATTTCTAGTGGAACTGTTACTGCATTTAATGGTCGTGGTGGTAACGTAATTCTGCAGGCTACTGACGTTACTGGTGTAGGCGGAGCATTACTGAATTCACCTACATTTACAGGCACGCCTGCTGCTCCAACTGCTGCATTAGGAACTAACACTACTCAGATTGCTACAACGGCGTTCGTTGCCGGTGCGATTAGCAATATGTCATATGTGAGTTCGTTTAACGGCAGAACGGGAGCGGTAACACTAACACAATCTGACGTAACCAATGTTGGTATAGCTTTACTGAGTGGTTCCGATTTTACGGGAACTGTGACAGCGCCAACTCCAGCTACAAGTGATAATTCTACTAAGGTAGCAACAACTGCATTCGTTAAGACGGTCGTTGCATCATCTGGAGTATCCACTTTTAATGGTCGTTCTGGTGATGTGTCACTTACATCGAGTGATATTTTGAATGCTGGAGGAGCCCTATTAACAAGTCCAGCATTTACGGGAACACCAACAGCTCCAACGCCAGCTACAAGCGATAATTCGACGCAGATTGCAACGACGGCATTCGTTAAAACCGCTTTAAGTGGATATACATTGCCGGTTGCAACAGGATCGACTCCTGGGGCGGTAATAGTTGGATCTGGTATTAATGTCGCGCCCGACGGTACAATTTCAACAACGTTCCCGGTGACATCAGTAGCCGGTAAAACGGGAGCAGTTACACTGTCTCTCAGCGATATTAATGGTGCTTCTAGTTTAGCACCAATTAATAGCCCATCATTTTCTGGAACTCCTCTAGCACCCACTATTGATCCTCATAACTTAACATGGAGTTCTGGACAACCGAGTGATCAAATTGCTACCAATGGTTTCGCTGTAGCCGTAGCTACTCAGACGTCAACGAGCATTGGTGTGACAGGTGGAAACGTTTCACTTGGAAATGCAGCAAATTACCAGTATATTGTTATCACTGGAACTCTGACATCTGATGCAACAATTGTTCTTCCAGGAGATCCTGGTGGTCGTTGGGTATTCTACAACAATACATCAGGTAGCTATAACGTAATTCTCGCTGGACCTACTGCTAACAAGGCAACATTCACGCTTCAGCAGGGTGGAACTGCAGAAGTAGTTTGTGTATCGTCTATTGGTGTTCTTCCTGCAACTTCTGTAGGTATAACGCAACCTCAAACAGATAATTCGACAAACTTGGCTACAACAGCATTTGTTAAATCTATGTTTGCTGGTCAAACTGCAGTTACATCGTTTAACAGCAGAGTTGGAGCGATCACGCTGCAAACATCAGATGTTAGTGCTGTTGGTGCAGCAATGCTAACCGGGGCAAATTTCACCGGAGCAGTCACGGCACCAACTCCATCAATAGGTGATTCATCTACTAACGTTGCAACCACTCAGTACGTTGAAAAGGCACTTCTAAACACAACAACTGTATCGTTAAGTTCTACCAACGTTACGTTGACTCCGGCACAGTATGGTACTGCCATTATAGAATTCACTGGAACCTTAACGCAATCTGTTACGATAACTGTTCCTACTAGTGGTCAATGGGTGATGTATAACGCCACCACTGGTGCGTTCAATGTTACGTTGAGTAATGGTCAAGGATCGACTTATGTTGTTCCTCAGAATCAGAGCGCCTCGGTGATGTCTCTTGGTAGCCTAGGAATAGTGAATGCTAATATTGCGGCATTCGTTCTTACTCCTGCTACGGCTACAACTCTAGGTGGTGTATATGTACCAAGTGGAAATGGACTTACTGTTGATAACACCGGTGCTATAAAAGCTTCTATAGCCGGATCTACTTCGTCGACGACGGGTGTAGTGTATCAGGGTGATGGTATAACGATAGGATCTGATGGTAAATTAAGTGCTAACCTGCGGACAGTTGCAGGAGTTACTCCAACCGGTGGTGATATCACATTGGCTGTTGGAAATATTTCTGGAGCTGCACCACTTAACAGTCCTACATTTACAGGTACTCCTGCTGCACCAACTCCAGCAACAAATGACAATTCAACTCGTATAGCTACGACTGCTTTCGTTGTTAATGCTCTTGGATCAATTGGTGTTACATCGTTTAATAGCAGAATGGGAGCGGTTACGTTACAGGCTTCTGATGTTACTGGAGTGGGTGGAGCTCTGACGGCATCACCAACATTTACAGGTACTCCTGCTGCACCAACGCCAGCTACAAGTGATAATTCAACCAGAATTGCTACTACTGCGTTTGTGCAATCTGTTTTTGCTCAAATAGGATCCGGTGTTCTTACATTTAACGGTAGATCCGGGTCTGTAACGCTTCAAGCTTCTGACGTTACTGGCGTTGGTGGTGCATTGACGGCTTCTCCAGGATTTACCGGAACACCAACTGCGCCAACAGCAACGGCAGGTACTAACACTACTCAGATTGCTACAACCGCTTTCGTTCAGACAGCCATTGCTGGTGTTTCAGGAGTTTCTAGCTTTAATACCCGTACGGGTGCAGTGACATTAACTGCCGCGGATGTATCTAACGTTGGTGGTGCTATGACTGCATCTCCATCGTTTAGTGGTACCCCAACGGCACCTAATCCAACTATAGGAACCAACACAAACCAAATTGCTACTGCTCAATTTGTTGAAAGCACGCTATTTACTGCATCATCTGTGGCATTGTCAAATGCTAACGTTACCCTATCTGCATCACAGTATGGTGCGTGTATTATCAAATTGACTGGAACCTTAACGGCGAACGTCTCTATAACATTCCCTACAAGTGGTCAATGGGATGTTTATAACGCAACTTCTGGTTCATTTACTGTCACCCTTACTAACGGTACTGGATCAAATGTTGTGGCTCCTCAGGGAACGGTTACAGTCGTTATGTCTGATAACACTGCTGGAATGATAAACACTAGTGCATACGCCGCGGCCAACGTTGCACGTATAGCATGTAATATCCCAGGTAGTCCGAATGTTACGACAGAAACGTTCTATCTATTTGGACAAGCATGCACGTTACCAGCCAACTTGACAGGAGCAACAGCTTATGGGGTTGCAGCGGCAAGCAGCTCTGCTCCATACACCGTTAACGTGTATAAATACGTAGGAACTTCATCGTCAGGAACGCAAGTTGGAACCATAACTGTAAATCCAGGTTCGACATCAACTTTCGCCACGACCGGCGGCACTTCGGTATCGTTTGCGGTTGGAGACAGATTAAGTTATCAATTCCCAACTGGCAACATGACACTGTTTGCAGCAACGCTTGTTGGAACATGGCAGTAA

Genome Context

Tertiary structure

AVH85346.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 55.2
Oligomeric state monomer
Download structure

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome of RsoM2USA, the largest bacteriophage infecting plant pathogenic bacterium Ralstonia solanacearum Ahmad,A.A., Addy,H.S. and Huang,Q. 2021-09-27 — GenBank