Protein

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Genbank accession
AVH85346.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,52
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSNKLLIKRSSTSGKVPTIADIVVGELAMNTYDGRLFMHINNGSDSIIEIGALNSPAFTGIPTAPTASASTNTSQIATTAYVTTAISNAAFVSNSNNIVAGSGISVSKSGTDITISATGSGTGSVTSVALSMPSIFNVSGSPVTTTGTLTATLAGQNANTFLSGPGSGPADIPTFRAIAPADLPLATTTNVGAVSIGAGLTVDVSGVVKLDTNNAVQSFNGRYGTVTLTSADVTGVGGLLANNAALTGTPTAPTAAVNNNTTQIANTAFVTTAINNAISSGTVTAFNGRGGNVILQATDVTGVGGALLNSPTFTGTPAAPTAALGTNTTQIATTAFVAGAISNMSYVSSFNGRTGAVTLTQSDVTNVGIALLSGSDFTGTVTAPTPATSDNSTKVATTAFVKTVVASSGVSTFNGRSGDVSLTSSDILNAGGALLTSPAFTGTPTAPTPATSDNSTQIATTAFVKTALSGYTLPVATGSTPGAVIVGSGINVAPDGTISTTFPVTSVAGKTGAVTLSLSDINGASSLAPINSPSFSGTPLAPTIDPHNLTWSSGQPSDQIATNGFAVAVATQTSTSIGVTGGNVSLGNAANYQYIVITGTLTSDATIVLPGDPGGRWVFYNNTSGSYNVILAGPTANKATFTLQQGGTAEVVCVSSIGVLPATSVGITQPQTDNSTNLATTAFVKSMFAGQTAVTSFNSRVGAITLQTSDVSAVGAAMLTGANFTGAVTAPTPSIGDSSTNVATTQYVEKALLNTTTVSLSSTNVTLTPAQYGTAIIEFTGTLTQSVTITVPTSGQWVMYNATTGAFNVTLSNGQGSTYVVPQNQSASVMSLGSLGIVNANIAAFVLTPATATTLGGVYVPSGNGLTVDNTGAIKASIAGSTSSTTGVVYQGDGITIGSDGKLSANLRTVAGVTPTGGDITLAVGNISGAAPLNSPTFTGTPAAPTPATNDNSTRIATTAFVVNALGSIGVTSFNSRMGAVTLQASDVTGVGGALTASPTFTGTPAAPTPATSDNSTRIATTAFVQSVFAQIGSGVLTFNGRSGSVTLQASDVTGVGGALTASPGFTGTPTAPTATAGTNTTQIATTAFVQTAIAGVSGVSSFNTRTGAVTLTAADVSNVGGAMTASPSFSGTPTAPNPTIGTNTNQIATAQFVESTLFTASSVALSNANVTLSASQYGACIIKLTGTLTANVSITFPTSGQWDVYNATSGSFTVTLTNGTGSNVVAPQGTVTVVMSDNTAGMINTSAYAAANVARIACNIPGSPNVTTETFYLFGQACTLPANLTGATAYGVAAASSSAPYTVNVYKYVGTSSSGTQVGTITVNPGSTSTFATTGGTSVSFAVGDRLSYQFPTGNMTLFAATLVGTWQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1369 AA
molecular weight: 134756,89990 Da
isoelectric point:4,71493
aromaticity:0,05771
hydropathy:0,26947

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Ralstonia phage RsoM2USA
[NCBI] 		2070027 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AVH85346.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG752970 [NCBI]
CDS location
range 289857 -> 293966
strand +
CDS
ATGTCAAACAAGTTGTTAATTAAACGATCATCTACATCTGGTAAAGTACCTACTATTGCAGATATAGTGGTTGGCGAACTAGCCATGAATACCTATGATGGTAGATTATTCATGCATATCAATAATGGATCGGATTCCATTATAGAAATAGGTGCGTTAAATTCTCCTGCTTTTACAGGAATTCCTACTGCTCCTACTGCATCTGCTAGTACAAATACCAGTCAAATAGCGACAACTGCGTATGTCACTACAGCAATATCCAATGCAGCATTTGTGTCAAATAGCAATAACATTGTTGCTGGGAGTGGTATTTCTGTTTCAAAATCGGGCACTGATATAACAATTTCGGCAACCGGATCTGGTACAGGGAGTGTAACCAGTGTGGCATTATCCATGCCATCTATTTTTAACGTTTCAGGTTCACCGGTAACCACTACTGGTACTCTTACTGCTACATTAGCAGGTCAGAATGCTAATACATTCTTAAGTGGCCCTGGATCTGGTCCTGCAGATATACCTACATTCAGAGCAATAGCACCAGCAGACCTACCGCTGGCCACAACGACTAATGTTGGCGCAGTATCAATAGGTGCAGGTTTGACGGTTGATGTTTCTGGTGTAGTTAAGCTTGATACGAATAACGCTGTTCAGTCATTCAACGGTCGATATGGAACAGTAACTCTAACAAGTGCAGATGTCACCGGTGTTGGTGGACTGTTGGCTAATAATGCTGCGCTGACAGGAACTCCTACCGCCCCAACTGCAGCAGTTAACAACAATACAACCCAGATAGCTAACACCGCCTTCGTAACCACGGCAATCAATAACGCTATTTCTAGTGGAACTGTTACTGCATTTAATGGTCGTGGTGGTAACGTAATTCTGCAGGCTACTGACGTTACTGGTGTAGGCGGAGCATTACTGAATTCACCTACATTTACAGGCACGCCTGCTGCTCCAACTGCTGCATTAGGAACTAACACTACTCAGATTGCTACAACGGCGTTCGTTGCCGGTGCGATTAGCAATATGTCATATGTGAGTTCGTTTAACGGCAGAACGGGAGCGGTAACACTAACACAATCTGACGTAACCAATGTTGGTATAGCTTTACTGAGTGGTTCCGATTTTACGGGAACTGTGACAGCGCCAACTCCAGCTACAAGTGATAATTCTACTAAGGTAGCAACAACTGCATTCGTTAAGACGGTCGTTGCATCATCTGGAGTATCCACTTTTAATGGTCGTTCTGGTGATGTGTCACTTACATCGAGTGATATTTTGAATGCTGGAGGAGCCCTATTAACAAGTCCAGCATTTACGGGAACACCAACAGCTCCAACGCCAGCTACAAGCGATAATTCGACGCAGATTGCAACGACGGCATTCGTTAAAACCGCTTTAAGTGGATATACATTGCCGGTTGCAACAGGATCGACTCCTGGGGCGGTAATAGTTGGATCTGGTATTAATGTCGCGCCCGACGGTACAATTTCAACAACGTTCCCGGTGACATCAGTAGCCGGTAAAACGGGAGCAGTTACACTGTCTCTCAGCGATATTAATGGTGCTTCTAGTTTAGCACCAATTAATAGCCCATCATTTTCTGGAACTCCTCTAGCACCCACTATTGATCCTCATAACTTAACATGGAGTTCTGGACAACCGAGTGATCAAATTGCTACCAATGGTTTCGCTGTAGCCGTAGCTACTCAGACGTCAACGAGCATTGGTGTGACAGGTGGAAACGTTTCACTTGGAAATGCAGCAAATTACCAGTATATTGTTATCACTGGAACTCTGACATCTGATGCAACAATTGTTCTTCCAGGAGATCCTGGTGGTCGTTGGGTATTCTACAACAATACATCAGGTAGCTATAACGTAATTCTCGCTGGACCTACTGCTAACAAGGCAACATTCACGCTTCAGCAGGGTGGAACTGCAGAAGTAGTTTGTGTATCGTCTATTGGTGTTCTTCCTGCAACTTCTGTAGGTATAACGCAACCTCAAACAGATAATTCGACAAACTTGGCTACAACAGCATTTGTTAAATCTATGTTTGCTGGTCAAACTGCAGTTACATCGTTTAACAGCAGAGTTGGAGCGATCACGCTGCAAACATCAGATGTTAGTGCTGTTGGTGCAGCAATGCTAACCGGGGCAAATTTCACCGGAGCAGTCACGGCACCAACTCCATCAATAGGTGATTCATCTACTAACGTTGCAACCACTCAGTACGTTGAAAAGGCACTTCTAAACACAACAACTGTATCGTTAAGTTCTACCAACGTTACGTTGACTCCGGCACAGTATGGTACTGCCATTATAGAATTCACTGGAACCTTAACGCAATCTGTTACGATAACTGTTCCTACTAGTGGTCAATGGGTGATGTATAACGCCACCACTGGTGCGTTCAATGTTACGTTGAGTAATGGTCAAGGATCGACTTATGTTGTTCCTCAGAATCAGAGCGCCTCGGTGATGTCTCTTGGTAGCCTAGGAATAGTGAATGCTAATATTGCGGCATTCGTTCTTACTCCTGCTACGGCTACAACTCTAGGTGGTGTATATGTACCAAGTGGAAATGGACTTACTGTTGATAACACCGGTGCTATAAAAGCTTCTATAGCCGGATCTACTTCGTCGACGACGGGTGTAGTGTATCAGGGTGATGGTATAACGATAGGATCTGATGGTAAATTAAGTGCTAACCTGCGGACAGTTGCAGGAGTTACTCCAACCGGTGGTGATATCACATTGGCTGTTGGAAATATTTCTGGAGCTGCACCACTTAACAGTCCTACATTTACAGGTACTCCTGCTGCACCAACTCCAGCAACAAATGACAATTCAACTCGTATAGCTACGACTGCTTTCGTTGTTAATGCTCTTGGATCAATTGGTGTTACATCGTTTAATAGCAGAATGGGAGCGGTTACGTTACAGGCTTCTGATGTTACTGGAGTGGGTGGAGCTCTGACGGCATCACCAACATTTACAGGTACTCCTGCTGCACCAACGCCAGCTACAAGTGATAATTCAACCAGAATTGCTACTACTGCGTTTGTGCAATCTGTTTTTGCTCAAATAGGATCCGGTGTTCTTACATTTAACGGTAGATCCGGGTCTGTAACGCTTCAAGCTTCTGACGTTACTGGCGTTGGTGGTGCATTGACGGCTTCTCCAGGATTTACCGGAACACCAACTGCGCCAACAGCAACGGCAGGTACTAACACTACTCAGATTGCTACAACCGCTTTCGTTCAGACAGCCATTGCTGGTGTTTCAGGAGTTTCTAGCTTTAATACCCGTACGGGTGCAGTGACATTAACTGCCGCGGATGTATCTAACGTTGGTGGTGCTATGACTGCATCTCCATCGTTTAGTGGTACCCCAACGGCACCTAATCCAACTATAGGAACCAACACAAACCAAATTGCTACTGCTCAATTTGTTGAAAGCACGCTATTTACTGCATCATCTGTGGCATTGTCAAATGCTAACGTTACCCTATCTGCATCACAGTATGGTGCGTGTATTATCAAATTGACTGGAACCTTAACGGCGAACGTCTCTATAACATTCCCTACAAGTGGTCAATGGGATGTTTATAACGCAACTTCTGGTTCATTTACTGTCACCCTTACTAACGGTACTGGATCAAATGTTGTGGCTCCTCAGGGAACGGTTACAGTCGTTATGTCTGATAACACTGCTGGAATGATAAACACTAGTGCATACGCCGCGGCCAACGTTGCACGTATAGCATGTAATATCCCAGGTAGTCCGAATGTTACGACAGAAACGTTCTATCTATTTGGACAAGCATGCACGTTACCAGCCAACTTGACAGGAGCAACAGCTTATGGGGTTGCAGCGGCAAGCAGCTCTGCTCCATACACCGTTAACGTGTATAAATACGTAGGAACTTCATCGTCAGGAACGCAAGTTGGAACCATAACTGTAAATCCAGGTTCGACATCAACTTTCGCCACGACCGGCGGCACTTCGGTATCGTTTGCGGTTGGAGACAGATTAAGTTATCAATTCCCAACTGGCAACATGACACTGTTTGCAGCAACGCTTGTTGGAACATGGCAGTAA

Tertiary structure

PDB ID
de7a6c24ab19c3787ed938b2eb3c1b8da12c225eceb5daf1937dce3c8a77e72d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5522
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome of RsoM2USA, the largest bacteriophage infecting plant pathogenic bacterium Ralstonia solanacearum Ahmad,A.A., Addy,H.S. and Huang,Q. 2021-09-27 — GenBank