Protein

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Genbank accession
YAS76701.1 [GenBank]
Protein name
central tail fiber J
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MGSAHQQSDLVVSPNPVTLEGQYAIPVDLRLGETLYSFLHRHVENLDNEKWIVTIGGKEVPMQLWTLVKPKHGQHIEIRGDVGNRSILTLVAMLVLTYFTFGIGAYGGAIAGAYGTAAAAGVYIAGAMLINKMLAPKEPGSSSADRGQLFSLNGTNNQKRPGQPFGLAFGTPRIAPDVISDPYIWFEGDEQMLGMVLTPGFNVQSVEPIYNDDTLLSSYDGTKVFYNNFPGMPNDTIPLYTNQESVEGGSLDADEKHQTGPWVVRSTVDNTIRAVVNIQYTLFDTTSKGKPKQNQEFFQIQYAPTGTENWGQTFNFLVSNSDQKPHRRSYAFDLPEGKYDFRVRIAGANTDGQGANTSFTMANLVSIQPDKTNYDFIPRIGIQLKATGQFNGAPNELRTIVHTKPIPVWKGNAWVNEESSNPGAQILQYIRGIRDNTGRVVAGMEVPDEDIDIESFKAFMLHCAANNFTYDFWIQEARSHENIIQTIALNGLGQITASRGKFAAIWVMEDAPFNGIATMATMQEASFQVDYTLANAADGVDLSFVSRDDNWEIKTLRVIDPTSSRTEALNPSRVSAEGVTRAAHGAILARYYMGQSLYQTKDISFQTDAEHLSYGRYDKLQVSNDLTQWGFSGRLQSATRIANQVLLKLDVTVPALATPYIGIRALGEKTVRIFKVVDFQGENNQVIITPFPGQGEASNVWPSDMTFPGEDGTVVSDFLWIYDFKTTPGYPVRVSSIEPDMDQRASVSVVWEGPEFWDYVNRGIYQPPANASSLAAKPIASNLRFDEEVVVQGNTVFTNLTVSFDISGASLYTNVYMAGSDGILQQVGTRLTTRSCTFRIEEATELAILVTPYSLSEIPGRSASARYLPTSLGLAPRNVDTFDVNELDGGIREYTWGFNAETIQSPDFVGVEIRYTEGSVANPDWEVMTVIGDEGFHTAAFQAVAPVAGSYTFCIRARNSSGILSTDILQRFKTLSFNLGERYTELTQQLSRTELELTETIEQVDQYSEAVIQQAIEISEINGKTVNNRAFIAQVNATKIDSGQATAIITQQVGAQTGDLRATVQQNSEAITDIAGNISASYNVKVQADINGRYYLAGIGLGIYANGGVVQSEIAMLADRFVFLNQAVGGQYYYPFEIVNGVVYANAAMIRDGTITNAKIGEEIKSVNYQWDGANGIYIGWRIGKDGTAQFGGDVEIRGDVSARTITGSFESSVAISWTGSISNGGISPVFTLPAPINSTQSHRPELSLALQLKTGDGQDATSCTITMQRQNPNNANEWWNIVTREYAIFKFMNASMAFMYLDEWTNVPNNFRFVINQINGQAISLTNINGRIRGAR
Physico‐chemical
properties
protein length:1337 AA
molecular weight: 146857,72150 Da
isoelectric point:4,88221
aromaticity:0,10022
hydropathy:-0,21331

Domains

Domains [InterPro]
IPR055385
258–368
IPR055385 Coil IPR053171
IPR015406
1063–1202
IPR015406
YAS76701.1
1 1337
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Xanthomonas phage GJKY_A
[NCBI] 		3464432 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAS76701.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PX310626.1 [NCBI]
CDS location
range 28843 -> 32856
strand +
CDS
ATGGGAAGCGCCCATCAACAATCAGACCTAGTAGTTAGCCCTAATCCGGTAACTCTGGAAGGTCAGTATGCTATTCCAGTTGATTTGCGTCTGGGCGAAACTCTGTATTCATTTCTACATCGCCATGTCGAAAATCTAGACAATGAGAAGTGGATTGTAACTATCGGTGGCAAAGAAGTCCCGATGCAATTGTGGACGCTTGTAAAGCCTAAGCATGGTCAGCACATTGAGATTCGCGGCGATGTAGGCAACCGCTCCATTCTCACCCTTGTGGCTATGCTGGTACTGACGTACTTCACCTTCGGTATCGGTGCCTATGGCGGCGCTATTGCGGGGGCGTATGGTACCGCTGCTGCGGCTGGTGTTTACATTGCTGGTGCAATGCTAATCAATAAGATGCTCGCCCCTAAGGAACCGGGAAGCAGTAGTGCGGATCGCGGGCAGCTATTTTCTCTTAATGGTACTAACAATCAGAAGCGACCGGGTCAACCTTTCGGTCTAGCTTTCGGTACTCCACGTATTGCACCTGACGTTATCTCAGACCCTTACATTTGGTTTGAAGGTGATGAACAGATGCTAGGTATGGTTCTAACTCCGGGCTTTAATGTCCAGAGCGTTGAGCCTATCTACAATGATGATACTTTGCTGTCGTCGTATGACGGCACTAAGGTTTTCTATAACAACTTCCCTGGGATGCCTAACGACACGATTCCTCTGTATACCAATCAGGAGTCGGTTGAAGGTGGTAGTTTGGATGCTGACGAAAAGCATCAAACTGGACCTTGGGTGGTTCGTAGCACCGTAGATAATACGATTCGCGCGGTCGTAAACATTCAATACACCCTGTTCGATACGACCAGCAAAGGTAAGCCTAAACAGAATCAAGAGTTTTTCCAGATTCAGTACGCGCCGACCGGCACTGAAAATTGGGGACAGACTTTTAACTTTTTGGTTAGCAACAGTGACCAAAAGCCACATCGTCGGTCTTATGCTTTTGATTTACCTGAAGGTAAGTACGATTTTCGTGTTCGAATTGCAGGCGCTAATACCGATGGCCAAGGTGCTAACACTTCGTTTACGATGGCTAATCTTGTATCGATTCAGCCTGACAAAACAAACTATGATTTCATTCCGCGTATTGGTATCCAGCTTAAGGCTACGGGCCAGTTTAACGGTGCGCCTAATGAACTTCGTACCATCGTCCATACTAAACCAATTCCAGTTTGGAAGGGTAATGCTTGGGTAAACGAAGAATCATCTAATCCCGGTGCACAAATTCTTCAATACATTCGAGGTATTAGAGATAATACCGGCCGTGTCGTGGCAGGTATGGAAGTGCCTGATGAAGATATTGACATTGAATCCTTTAAAGCTTTTATGTTGCATTGCGCAGCTAATAACTTTACTTACGACTTTTGGATTCAAGAAGCACGTTCTCACGAAAACATTATCCAGACTATTGCTCTAAATGGCCTTGGTCAGATTACCGCTTCGCGCGGTAAGTTTGCTGCTATCTGGGTGATGGAAGATGCGCCCTTCAATGGCATAGCCACAATGGCTACCATGCAAGAGGCTTCTTTTCAAGTTGACTATACCTTGGCTAATGCTGCCGATGGTGTAGATTTGAGCTTTGTTTCGCGTGACGACAATTGGGAGATTAAGACCCTTCGCGTAATCGACCCCACCAGCAGCCGCACAGAGGCTTTGAACCCGTCGAGGGTGTCTGCTGAGGGTGTGACGCGCGCGGCTCATGGGGCCATTCTGGCGCGCTACTACATGGGTCAATCGCTCTACCAGACCAAGGATATCAGCTTCCAGACCGACGCAGAGCATTTGAGCTATGGTCGGTATGACAAGTTGCAGGTTAGTAATGACCTAACACAATGGGGGTTTAGTGGTCGTTTGCAGAGTGCAACACGTATTGCTAATCAGGTATTGTTGAAGCTTGATGTTACCGTGCCTGCTTTGGCAACCCCATACATTGGCATTCGCGCACTCGGCGAAAAGACTGTTCGCATTTTCAAGGTTGTAGATTTCCAAGGTGAAAACAATCAGGTAATCATTACTCCTTTCCCCGGTCAGGGCGAGGCTAGTAATGTTTGGCCGTCTGATATGACCTTCCCTGGCGAGGATGGGACAGTTGTAAGTGACTTCCTATGGATCTATGATTTCAAGACTACTCCCGGTTATCCTGTTCGTGTTTCTTCTATCGAACCCGACATGGATCAACGCGCAAGTGTATCGGTTGTTTGGGAAGGTCCGGAATTCTGGGACTATGTTAATCGCGGTATTTACCAACCACCGGCTAACGCAAGTAGCCTTGCGGCTAAACCTATCGCTAGCAATCTTCGATTCGATGAAGAAGTTGTAGTGCAGGGCAATACGGTATTTACCAACCTGACAGTATCTTTTGATATTTCTGGAGCTTCGCTTTATACCAATGTCTACATGGCAGGTTCTGACGGTATCTTGCAGCAGGTCGGTACTCGCCTAACTACTCGCTCCTGCACTTTCCGAATTGAAGAAGCGACAGAGTTAGCTATTCTAGTTACACCTTACTCTCTGAGTGAAATTCCCGGTAGGTCCGCATCGGCTAGATACTTGCCAACCTCTTTGGGTCTTGCACCTCGCAATGTTGATACATTTGACGTTAACGAGTTGGACGGCGGTATTCGAGAATACACTTGGGGATTCAACGCTGAAACAATCCAATCGCCGGACTTTGTAGGCGTAGAAATCCGCTATACCGAAGGCAGTGTGGCTAATCCTGATTGGGAAGTTATGACGGTCATTGGCGATGAAGGTTTCCATACTGCGGCATTCCAAGCTGTTGCTCCGGTAGCTGGTAGTTACACGTTCTGCATTAGGGCGCGCAATAGTAGTGGCATTCTTTCTACGGATATATTGCAGCGCTTTAAAACTTTGAGCTTTAATCTTGGAGAACGCTATACCGAATTGACTCAGCAGCTTAGCCGTACAGAACTTGAGTTGACTGAAACTATTGAACAAGTAGATCAATACTCGGAAGCTGTTATTCAGCAGGCAATTGAGATTAGCGAGATTAACGGCAAGACTGTTAACAATCGCGCTTTTATCGCACAGGTTAACGCAACTAAGATTGATTCAGGTCAAGCGACCGCAATTATCACTCAGCAGGTAGGTGCACAAACTGGCGATCTTAGAGCGACAGTACAGCAGAATTCGGAAGCAATTACTGATATTGCAGGAAACATTAGTGCTAGTTACAATGTAAAGGTTCAAGCTGATATTAATGGGCGGTACTACCTTGCAGGTATCGGTCTTGGCATCTATGCGAACGGCGGCGTCGTTCAATCTGAAATCGCCATGCTGGCCGACAGGTTCGTATTCCTTAATCAGGCGGTAGGCGGGCAATACTATTATCCATTTGAAATTGTAAATGGCGTAGTCTATGCAAATGCTGCTATGATCCGCGACGGCACGATTACCAACGCTAAGATCGGCGAAGAGATTAAGTCGGTTAACTATCAATGGGATGGTGCTAACGGTATCTACATTGGTTGGCGTATCGGCAAAGATGGTACTGCGCAGTTTGGTGGTGACGTAGAAATCAGAGGTGATGTTTCGGCCCGCACTATTACAGGCTCGTTCGAATCTTCTGTAGCTATCAGTTGGACAGGATCTATTAGCAATGGCGGTATCAGTCCTGTATTTACCTTGCCTGCGCCTATTAATAGTACGCAATCACATCGACCGGAACTAAGTTTGGCTTTACAGCTTAAGACTGGCGATGGACAAGACGCGACAAGTTGCACAATCACTATGCAGCGTCAGAACCCTAATAATGCAAATGAGTGGTGGAATATTGTTACTCGTGAATATGCAATCTTTAAATTCATGAATGCGTCGATGGCGTTTATGTATTTGGATGAATGGACTAACGTGCCTAACAATTTCCGCTTTGTTATCAACCAAATTAACGGCCAAGCAATTAGCCTGACAAACATCAATGGCCGTATTCGCGGCGCGCGTTAA

Tertiary structure

PDB ID
e2351c21827d80a382d48323187bd02aff574f8ed4e3f641278124a65fa5547a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7975
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50