Protein
View in Explore- Genbank accession
- QOI71625.1 [GenBank]
- Protein name
- putative structural protein
- RBP type
-
TSPTSP
- Protein sequence
-
MAYIVKGDLDAKQQITVQGKTVGVNFTTTDNSAVYSADTSGHVDLPITTSSDVDYIFKQLPLSQYGAINSVPLGVAGTFDGGSTIPYYSSMPVLLENDGTLAFLRPGSNGSTINYYYTYINTPDSSTVPNTTIRKYYEGPSKKIVFYDSYTKDTLIYEDIDNHIIHLVLTNGTLDKNSHQEGTFSNTLIPYNILTALKVGSYVYIIALYNTAYNLNNPVSINYNIADPLQFVFYRVPVSEIQAGTINTVQQVTGINGTTMYGDVISSSNAVKIADAWGSTTASATKSFMKYDSGIPGLSPFTYSIIGTGKAYFDGTNIIFSFYTNGYCVNNTRRTDTMYGMTITYNTTNNTYTHDLTSTPLVCTGGISGSLTWSNPYSINSSKIAGIGADISDGWSSAWYITDSGIQYTVKEKYVLHDYYIITRCTIPNFTNKADAYKIRSKQLSMTSRSNVMGDFASRVGDQLVGGSPLSPTRIMFTGTGSYQGTQYTKYKRGIADIGSTRTYTYNSFDRGTITGYAPQNFRVPLSDTNENLTRSKISFCDAAENISMYGCVFSEDIMLTTGYKLDASTLTYDKTVSIDNSTLVALKNSIISTSGIDSANAKVGLYFSPDTSFCKSIACVVSKNTSPDGGNVLFATVDCTMVNNVVTVANLNTIFYTGSFPTMQSVLISSEMLAKSGLSCVKYSDFTYISFSGLNAYGTPGDSAELSGCGVVNGNTISNVTVSQSYHASGIATNAREYSYIPNVGFGYYIYANNDRGTKLIFKNCGNTLAQFNSNISPGTGTDIVILAQDVVQGFYLYFTEVTPLFMGGQYFDVPISTVDLNAVTSNPGNKTFYIYIQLILGTPTYVASLTEIPETAINMFIGTIQTDGTKVSALNISKVSRFDVYRPSLTQIGSGFPVSSGNPQQTGTINW
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 913 AA molecular weight: 99084,73950 Da isoelectric point: 5,32572 aromaticity: 0,11829 hydropathy: -0,08828
Tail Spike Domain Segmentation
Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.
Domain layout
QOI71625.1
1
913 aa
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 50 | 50 | 0,8558 |
| Central domain | 51 | 303 | 254 | 0,8765 |
| C-terminal | 304 | 913 | 609 | 0,4889 |
N-terminal
Central domain
C-terminal
View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QOI71625.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT939487
[NCBI]
CDS location
range 77317 -> 80058
strand +
strand +
CDS
ATGGCATATATAGTTAAAGGCGATTTAGACGCCAAACAACAAATAACAGTACAGGGAAAAACTGTAGGTGTAAATTTTACAACCACAGATAATAGTGCTGTATATTCAGCAGATACATCAGGACATGTGGATTTACCAATTACAACATCTTCTGACGTAGATTACATTTTTAAACAATTGCCCCTATCCCAATATGGGGCAATTAATAGTGTACCATTGGGCGTAGCTGGTACATTTGATGGTGGTAGTACTATACCATATTATTCATCAATGCCAGTACTTTTAGAAAATGATGGTACTTTAGCGTTTCTTCGCCCTGGTTCTAATGGTAGTACTATAAATTATTATTACACATATATTAATACACCAGATTCTTCAACCGTACCTAATACTACCATAAGAAAGTATTATGAAGGCCCAAGTAAGAAGATTGTATTTTATGATTCATATACCAAAGATACATTAATTTATGAAGATATTGATAATCATATCATTCATTTAGTTCTTACGAACGGAACTTTAGATAAAAATTCCCATCAGGAAGGAACATTTAGTAATACACTAATACCATATAATATTTTAACAGCATTAAAAGTGGGTAGTTATGTTTATATTATAGCATTATATAATACTGCATACAACTTGAATAATCCAGTATCGATAAATTATAACATTGCTGACCCTCTACAATTTGTATTCTATAGAGTTCCAGTATCTGAAATACAAGCTGGAACAATTAATACAGTACAACAGGTTACCGGTATTAATGGTACAACTATGTATGGTGATGTAATATCATCATCAAATGCTGTAAAAATTGCTGATGCTTGGGGTAGTACTACAGCAAGTGCAACTAAATCCTTTATGAAATATGATTCAGGAATTCCTGGTTTATCACCATTTACCTATTCTATTATTGGTACAGGTAAAGCCTATTTTGATGGAACTAATATTATATTTTCATTCTATACAAATGGTTATTGTGTTAATAACACAAGAAGAACGGACACGATGTATGGCATGACAATTACTTATAATACTACAAATAATACATACACCCATGATTTAACTAGTACCCCACTTGTATGTACTGGTGGAATTTCTGGTTCATTAACTTGGTCAAATCCATATTCCATTAATTCATCTAAGATTGCTGGTATTGGAGCAGATATTAGTGATGGGTGGTCATCAGCATGGTATATTACTGATTCTGGAATTCAATACACGGTTAAAGAAAAATATGTATTACATGACTATTATATAATTACCCGTTGTACAATTCCTAATTTTACAAATAAAGCTGATGCATATAAAATACGTTCCAAGCAATTATCAATGACTTCTAGATCTAATGTCATGGGCGATTTTGCTTCTAGGGTTGGTGATCAATTAGTTGGTGGTTCACCATTAAGTCCAACTCGTATAATGTTTACAGGTACTGGTTCATATCAAGGGACACAGTATACAAAATATAAAAGAGGTATTGCAGATATAGGTAGTACTAGAACATACACATATAATTCATTTGACCGTGGAACAATTACGGGATATGCACCTCAGAATTTTCGTGTACCATTAAGTGATACGAATGAAAATTTAACTCGTTCAAAAATATCATTTTGTGATGCGGCGGAAAATATTTCTATGTACGGTTGTGTATTCAGTGAAGATATTATGTTGACGACTGGATATAAACTAGATGCATCAACATTAACATATGATAAAACTGTTAGTATTGATAATTCAACATTAGTTGCATTAAAAAATTCAATTATAAGTACTTCAGGAATTGACTCAGCTAATGCCAAAGTTGGTTTGTATTTTTCACCTGATACAAGTTTTTGTAAAAGTATTGCTTGTGTAGTTTCTAAAAATACAAGTCCAGATGGTGGTAATGTATTATTTGCTACGGTTGATTGTACTATGGTCAATAATGTAGTTACTGTGGCAAATCTTAACACTATTTTTTATACTGGTTCATTTCCTACTATGCAATCAGTATTAATTTCAAGTGAAATGCTTGCAAAATCTGGTTTAAGTTGTGTGAAATATTCCGATTTTACATATATTTCATTTAGTGGACTAAACGCATATGGCACACCTGGTGATAGTGCTGAATTATCTGGATGTGGAGTTGTTAATGGTAATACTATTTCTAATGTTACTGTATCTCAAAGTTACCATGCTTCTGGAATTGCAACAAATGCACGAGAATATAGTTATATACCAAATGTAGGATTTGGATATTATATATACGCTAATAACGACCGTGGAACTAAATTAATATTCAAAAATTGCGGAAATACTTTAGCACAATTTAATTCGAATATTTCTCCAGGAACGGGAACAGATATAGTTATACTTGCACAAGATGTGGTACAAGGTTTCTATTTGTATTTCACTGAAGTTACACCTTTATTCATGGGTGGACAATATTTTGATGTACCAATTAGTACTGTAGATTTAAATGCAGTAACATCTAATCCAGGAAATAAAACATTTTACATTTATATTCAGTTGATACTTGGTACACCAACATACGTTGCAAGTTTAACCGAGATTCCTGAAACTGCAATTAATATGTTCATTGGTACAATACAAACCGATGGAACAAAAGTATCTGCGTTAAATATAAGTAAGGTTTCACGCTTTGATGTGTACAGACCAAGTTTAACACAAATAGGTTCTGGTTTCCCTGTAAGTTCTGGAAATCCCCAACAAACAGGAACCATCAACTGGTAA
Genome Context
Tertiary structure
QOI71625.1
ColabFold structure
Source
ColabFold
pLDDT
27.4
Oligomeric state
monomer
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence of Erwinia phage pEa_SNUABM_47 | Kim,S.G., Lee,S.B. and Park,S.C. | 2021-01-07 | — | GenBank |