Protein

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Genbank accession
WGH49876.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,66
Protein sequence
MAYYLEIAGSDTHVAVDTAIVVPPVGTDGVLLSLDIQFNDLGTHQAILSSGTSNFIDIKNNGSSMELRSTSAVVVFTLSPPLVANQRYLLTVERTDRSLVVKNNGDVISNTGTQAVGRTFSVTRISGLSAGFRPGNFRLYALTFPLNNNDYNSSTSNGTGLTLIDTEGGNDGTLVNFPTDNSQWLWEEDTPLNTGESRVGSGWAPSIRDYSLLNDWKNAKKTEPTYQTALCRGYLGNPFFDIVAADFPAGALISGVVKYTGNNHDQLAHYARKFVINSTSQVIAEHLKITHSTGLQPTVGVQNTGGSIIRNSYVLNTGQAGANSGSAVLSGNGTLQNCVVHGTQPVNNLVLRPSNQAQVLNCIAIGGYTGLSMPWPDVVVDSTFIVNASNACIIGNVPTTNTATEDTTGEFTGYTTSAFVDFANGDYRIRVGSPLHKLGIGAFFQEDLLPELDYQEYYELSKPITAGLSLTTATEVIILPSEDVSIEFTFTLNQVPAFSEYYYLFGADSWDQNHNLRKINNTDYSIRLRGILDATFSTPVILLGQNEVNKIIVSRSAGELEVWINNHKVSAANISAQADTNFQLKHFFRYNTNTYTNAVTLGYFKIRRDDILTNYWVNAQSPTASEWVDVIGNNDASFSGSWPINYSHWKYISTSSNLVGESRVGTGWAPSIRDFNSLENWRDGITNTQKNYALCRGSILTRHISFGNSNTFPLGLEIIGDVKYKGNNLAELAHTNNFGMDIGGSPIRVHHLYLYTDNRYYVPAWIRYTTPSASDILSFNHCYIKHTNVDKLGQVTSGNGSSENDGWFNCIIDCDGRAYGYSVGYSQKVSLINNTYINYTTTGFNSPSFGNPSGRFYENNFCPENTGTDYNVQGFGSFINNASADTTGNITGYGKEQFVDFANGDYRIKASSPLHALGIGSFFEEAGTPTSSYYYSDVSNIQLNSVTSIDYIIDPANDPTAPNYVLFLNGADEYVQLNSPINITTPEFEIEFIGNGRAYDESVVYIFGNLGDANNRLWIGGVNYNELSLSNAAGQTINFTNMNFFVADENRLVISRDINNIVSVSINGVPHNQTFVLSGDITPSILGNSGGALPSGIARADEIEIDKLKVTVGGVVINHYEPTVTEGVGIILKDTESGNDGTIINFKSNLHHWKYYDGIVIDEQTEVRIGNGWASKVYVSSTTLGGFLDTYKSLTFTDEITCYAVGDCSYNEFFDKTGETLNFTNADFEQGLYVKGMIPFNGKNYDRLARLNNQITSNSQLFIDDFYIYSEQVGTSTLVADDNTYLYRCYVEHTGGASELGIVQMKNYSDLTNCVVRSLTPSPLGVSALETSFIGNTVVLGCDVNIKLSAPSGSYEYLFATQSTLSDFDDSGIYVFEYASGDNTGQYTGYTTAEFVDFANKDYRIKYSSDLHPLGIGAFFQEFVEGGISYFYGDSSVLTLNSEQSLYSKIANSYVSTFSIVGNGNGSHITVPNNQVSTISIDFNNELYASIHQGGTSEVGVDFIPNTSAVSQIIESSNVQVDDVQSLMVEISNSNLSNIDILFYANVSTHHNINNISELVIDDISNTNAVMTNNSLSNMHISNIDNTYIATNIFDYGDININSIDRHSVFSNISKISEFNFETVSKFNFRMNFFQDITMDIQTIDAHSGYANFNDVSQINIVSIDNVKINVGFSGVSVFDVSVLPNTYMSATVDNKSTFDISDVESFIAKFEIQDKSVFDIADISNAYISMTVDKSSSFDVSNIEAILAKFEVHDKSNFDVSDIASVLSEFQIQDRSTFDITDLSSNLIEHNIVDASTLFVDDVSAITLHASNHDKSTFNIWIDGDVFNSVSISDVFSISNFNLIMGEEYHIENNTNVVSSFNVHGLVNFHTEVNHADMSGISIITGDSYNINVTNNNVVDINVENITNTHMEMNQHEESLIEVDYLTASNVEFNEKTTSSINIDDVQSQYVVIRTSPVSELTVDLVPIYSVEFNAYTNSGFNLSYTGNPFIAAIIMDRSIIDLTIIDEIEYIIASPEFKYFDKSTLRIDGVDASTIFFNTSTVANNLVDFVPEFNTVTTIANGSMIDLVMSGNPILAIEYVSTSELTIDMVQSSEFVSLISNGSALDITTIQGQNFLVAVKDGSYNDLTIVESTNVAVAENTTSALNVSFSNQIQYASLYNDVSKFDVAFISEFFIVIDFDVYEYSERSISYIDVVPNYFVSHAEHSDSVFDIGTERGYNIEITDDTVGDIVVSIKTELDVRLFNNITIYIKPTDIGTPVVDTGKSWLDDSVFRTDMKTRTIITGKSMLDDLVISTAINRTTTIPLELSTRA
Physico‐chemical
properties
protein length:2313 AA
molecular weight: 254241,03800 Da
isoelectric point:4,40271
aromaticity:0,10852
hydropathy:-0,11556

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

Domain layout
WGH49876.1
1 2313 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 225 225 0,1198
Central domain 226 427 203 0,8298
C-terminal 428 2313 1885 0,2246
N-terminal Central domain C-terminal

View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.

Taxonomy

Phage
Alishewanella phage vB_AspM_Slickus01 [NCBI] · taxon 3038239
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Alishewanella sp. SMS8 [NCBI] · taxon 2994676
Pseudomonadota Gammaproteobacteria Alteromonadales Alteromonadaceae Alishewanella

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
WGH49876.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ508957 [NCBI]
CDS location
range 102379 -> 109320
strand -
CDS
ATGGCCTATTATTTAGAGATAGCTGGAAGTGACACTCACGTAGCTGTTGATACAGCAATAGTTGTACCACCTGTCGGGACTGATGGGGTATTACTTAGTCTTGATATACAATTTAATGACTTAGGCACTCACCAAGCTATTTTATCTAGCGGTACATCTAACTTTATTGATATAAAAAATAACGGCTCATCAATGGAGTTGAGATCCACGAGCGCTGTAGTAGTATTTACGCTGTCCCCTCCGCTTGTAGCTAACCAGCGTTACTTACTAACGGTAGAACGAACCGATAGATCGTTAGTAGTTAAAAATAATGGCGATGTTATTTCCAATACAGGCACTCAGGCCGTAGGAAGAACCTTTTCAGTAACTCGAATAAGCGGTTTATCTGCGGGCTTTAGGCCTGGGAATTTCAGGTTATATGCTTTAACTTTTCCATTGAATAATAATGATTACAACTCCTCAACATCAAACGGCACAGGCTTAACGTTAATTGATACAGAGGGCGGCAACGATGGTACGCTAGTTAACTTCCCAACCGACAACTCCCAATGGCTCTGGGAAGAAGATACCCCACTTAACACTGGCGAGTCTCGCGTAGGTTCTGGCTGGGCACCGAGCATTCGTGATTACAGTCTATTAAATGATTGGAAAAATGCAAAGAAAACAGAACCAACCTATCAGACGGCTTTGTGTAGAGGATACTTAGGTAACCCGTTCTTTGATATTGTGGCAGCAGACTTTCCAGCGGGAGCATTAATTAGTGGTGTCGTAAAGTACACTGGTAACAATCACGACCAGCTTGCGCATTATGCTCGTAAATTCGTAATTAATAGTACAAGTCAAGTCATAGCAGAGCATTTAAAAATAACACATAGTACTGGACTACAGCCTACTGTTGGAGTACAGAACACTGGCGGATCGATAATAAGAAACTCGTATGTCTTAAATACTGGACAGGCGGGTGCTAACTCTGGTAGTGCAGTTTTGAGTGGAAACGGTACGTTACAAAACTGCGTAGTACATGGTACACAGCCTGTAAATAACCTCGTGTTAAGACCAAGCAATCAAGCACAAGTGCTTAACTGTATTGCTATTGGTGGATACACTGGATTATCCATGCCTTGGCCAGATGTGGTGGTAGATAGTACCTTTATAGTAAATGCAAGCAACGCTTGTATTATAGGAAACGTTCCGACAACCAATACCGCAACGGAAGACACTACTGGTGAATTCACTGGGTACACTACATCTGCGTTTGTTGATTTTGCTAATGGTGATTATCGCATTCGAGTAGGTTCGCCACTGCACAAATTAGGCATTGGTGCATTCTTTCAAGAAGATCTACTTCCAGAGTTAGACTATCAAGAATACTATGAGCTATCTAAGCCTATAACTGCTGGACTATCTCTCACAACAGCAACAGAAGTAATAATATTACCTAGTGAAGATGTATCTATAGAATTTACTTTCACTCTAAACCAAGTCCCCGCTTTCAGTGAGTATTATTATTTATTTGGTGCGGATAGCTGGGATCAAAATCACAATTTAAGAAAAATAAACAATACTGACTATTCCATACGATTAAGAGGAATATTAGACGCAACATTTAGTACTCCAGTTATACTATTAGGACAAAATGAAGTAAACAAGATAATAGTTTCCAGATCCGCAGGGGAATTAGAAGTATGGATTAATAACCATAAAGTATCAGCAGCAAACATCAGCGCCCAAGCAGATACAAATTTTCAATTAAAACACTTTTTTAGATACAATACTAACACATACACAAATGCTGTAACGTTGGGTTACTTTAAGATCCGTAGAGATGACATACTGACCAATTATTGGGTAAATGCCCAATCGCCAACCGCATCAGAGTGGGTGGACGTTATTGGTAATAATGATGCATCATTTTCGGGTTCATGGCCTATTAATTACAGTCACTGGAAGTACATTTCAACTAGTTCTAATTTAGTGGGCGAGTCTCGTGTTGGTACTGGATGGGCACCGAGTATTCGGGACTTTAATAGCTTGGAAAACTGGCGTGATGGAATAACCAACACTCAGAAAAATTATGCACTATGTCGTGGGTCTATCTTAACGAGGCATATAAGCTTTGGTAACTCTAACACGTTTCCTCTTGGGTTAGAAATAATCGGGGATGTTAAGTATAAAGGTAATAATTTAGCAGAACTAGCACATACTAATAATTTTGGTATGGATATTGGAGGTAGCCCTATCAGAGTGCACCACCTCTATTTATACACTGATAATAGATATTATGTTCCAGCTTGGATAAGATATACCACACCAAGTGCTTCTGATATCTTATCCTTTAACCACTGCTATATCAAACATACAAATGTTGATAAGTTAGGACAAGTTACCTCTGGAAATGGTAGTTCAGAAAATGATGGCTGGTTTAACTGCATTATTGATTGTGATGGAAGAGCTTATGGGTACTCTGTAGGGTACTCTCAAAAAGTTAGTCTAATCAACAACACTTACATCAACTACACCACAACAGGGTTCAATTCACCCTCTTTCGGTAACCCTTCTGGTAGATTTTATGAGAATAATTTTTGTCCTGAAAATACTGGAACCGACTATAACGTACAAGGCTTCGGAAGCTTCATTAATAATGCGAGTGCTGATACTACAGGTAATATCACTGGTTATGGTAAAGAGCAGTTCGTCGATTTTGCTAATGGCGATTACCGCATTAAGGCAAGTTCACCACTACATGCTTTAGGTATTGGTTCATTCTTTGAAGAAGCAGGGACACCAACAAGTTCATACTATTATTCTGATGTTTCTAATATACAACTTAACTCAGTTACATCAATTGATTATATTATAGATCCTGCTAACGATCCAACAGCGCCTAATTATGTATTATTTTTAAATGGTGCTGATGAGTATGTACAACTAAACTCACCAATCAATATAACAACGCCAGAATTTGAAATTGAGTTTATAGGTAATGGTCGCGCCTATGATGAGTCTGTTGTTTATATTTTTGGTAATCTTGGTGATGCTAATAATAGATTATGGATCGGTGGTGTAAACTATAATGAACTATCACTATCAAACGCAGCTGGACAGACGATAAATTTCACCAATATGAATTTCTTTGTAGCTGATGAAAATCGGTTGGTGATAAGCAGAGATATTAATAACATTGTTAGCGTTTCTATTAATGGTGTACCACACAATCAAACATTCGTTCTAAGTGGTGACATCACTCCATCTATTTTAGGTAATTCTGGTGGCGCTTTGCCATCTGGTATAGCAAGGGCAGATGAGATAGAGATTGATAAGTTAAAGGTTACCGTTGGTGGTGTGGTTATTAATCATTATGAACCTACTGTGACTGAGGGTGTCGGTATCATTCTAAAAGACACCGAAAGTGGCAATGATGGCACCATAATTAACTTCAAATCTAATTTACACCATTGGAAGTATTATGATGGTATTGTTATAGATGAGCAAACTGAGGTTAGGATTGGTAATGGTTGGGCATCTAAGGTTTACGTATCATCCACAACTCTAGGTGGATTTTTGGATACCTATAAATCATTAACCTTTACCGATGAGATAACATGCTACGCAGTTGGTGATTGTTCTTATAATGAATTTTTCGATAAGACTGGAGAAACATTAAACTTTACTAATGCTGATTTTGAGCAAGGACTCTATGTTAAAGGGATGATACCGTTTAATGGTAAAAACTATGACAGGTTAGCGAGACTAAACAATCAGATTACATCAAATTCTCAATTATTCATTGATGATTTTTATATCTACTCTGAACAAGTAGGCACTTCGACGTTAGTAGCAGACGATAATACCTATTTATATAGATGCTACGTGGAGCATACAGGTGGAGCAAGTGAACTAGGTATAGTTCAGATGAAAAATTACTCAGATCTTACAAACTGTGTAGTCAGATCTTTGACTCCTTCACCGCTAGGGGTAAGTGCACTAGAAACCTCATTCATAGGTAATACTGTAGTTTTAGGTTGCGATGTAAACATCAAATTATCAGCACCTTCTGGCAGTTATGAGTATTTATTTGCAACTCAATCAACTTTATCAGATTTTGACGATAGTGGTATATATGTATTCGAATATGCTTCTGGTGATAATACTGGTCAATATACTGGCTACACTACTGCTGAGTTTGTAGATTTTGCTAACAAAGATTATAGGATAAAATACTCATCAGACTTACATCCATTAGGCATTGGTGCATTCTTTCAAGAATTTGTTGAAGGTGGAATATCTTATTTCTACGGTGACTCTTCGGTACTGACTCTGAACTCTGAACAGTCTCTCTACTCAAAGATAGCAAACTCTTATGTTAGTACTTTTTCGATAGTCGGTAATGGTAATGGTAGTCACATAACAGTACCAAATAACCAAGTGTCAACAATCTCTATCGATTTTAATAATGAACTTTACGCAAGCATTCATCAAGGTGGTACATCAGAGGTTGGTGTTGATTTTATACCAAACACGTCAGCAGTCTCCCAGATCATAGAATCATCAAATGTTCAGGTAGATGATGTTCAATCTTTGATGGTTGAAATATCAAACAGCAATTTATCTAACATTGACATTTTATTTTATGCGAATGTATCAACACATCACAACATAAACAACATATCAGAGTTAGTAATAGATGATATATCCAATACTAATGCAGTAATGACTAATAATAGTCTATCCAATATGCATATATCTAACATAGATAATACGTATATAGCAACTAATATATTTGATTATGGTGATATAAACATTAATAGTATCGATCGTCATTCAGTCTTTAGTAATATTTCTAAGATAAGTGAGTTCAATTTTGAGACAGTGAGTAAGTTTAATTTCAGAATGAACTTCTTCCAAGACATCACCATGGACATTCAGACCATTGATGCTCACTCTGGCTATGCAAACTTTAATGATGTCTCACAGATAAATATTGTTAGTATAGACAATGT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Genome Context

Tertiary structure

WGH49876.1
ColabFold structure
Source ColabFold
pLDDT 27.2
Oligomeric state monomer
Download structure

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecogenomics reveals distinctive viral-bacterial communities in the surface microlayer of a natural surface slick Rahlff,J., Wietz,M., Giebel,H.-A., Bayfield,O., Nilsson,E., Bergstrom,K., Kieft,K., Anantharaman,K., Ribas-Ribas,M., Schweitzer,H.D., Wurl,O., Hoetzinger,M., Antson,A. and Holmfeldt,K. 2023 — GenBank