Protein

View in Explore
Genbank accession
WGH49876.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,70
Protein sequence
MAYYLEIAGSDTHVAVDTAIVVPPVGTDGVLLSLDIQFNDLGTHQAILSSGTSNFIDIKNNGSSMELRSTSAVVVFTLSPPLVANQRYLLTVERTDRSLVVKNNGDVISNTGTQAVGRTFSVTRISGLSAGFRPGNFRLYALTFPLNNNDYNSSTSNGTGLTLIDTEGGNDGTLVNFPTDNSQWLWEEDTPLNTGESRVGSGWAPSIRDYSLLNDWKNAKKTEPTYQTALCRGYLGNPFFDIVAADFPAGALISGVVKYTGNNHDQLAHYARKFVINSTSQVIAEHLKITHSTGLQPTVGVQNTGGSIIRNSYVLNTGQAGANSGSAVLSGNGTLQNCVVHGTQPVNNLVLRPSNQAQVLNCIAIGGYTGLSMPWPDVVVDSTFIVNASNACIIGNVPTTNTATEDTTGEFTGYTTSAFVDFANGDYRIRVGSPLHKLGIGAFFQEDLLPELDYQEYYELSKPITAGLSLTTATEVIILPSEDVSIEFTFTLNQVPAFSEYYYLFGADSWDQNHNLRKINNTDYSIRLRGILDATFSTPVILLGQNEVNKIIVSRSAGELEVWINNHKVSAANISAQADTNFQLKHFFRYNTNTYTNAVTLGYFKIRRDDILTNYWVNAQSPTASEWVDVIGNNDASFSGSWPINYSHWKYISTSSNLVGESRVGTGWAPSIRDFNSLENWRDGITNTQKNYALCRGSILTRHISFGNSNTFPLGLEIIGDVKYKGNNLAELAHTNNFGMDIGGSPIRVHHLYLYTDNRYYVPAWIRYTTPSASDILSFNHCYIKHTNVDKLGQVTSGNGSSENDGWFNCIIDCDGRAYGYSVGYSQKVSLINNTYINYTTTGFNSPSFGNPSGRFYENNFCPENTGTDYNVQGFGSFINNASADTTGNITGYGKEQFVDFANGDYRIKASSPLHALGIGSFFEEAGTPTSSYYYSDVSNIQLNSVTSIDYIIDPANDPTAPNYVLFLNGADEYVQLNSPINITTPEFEIEFIGNGRAYDESVVYIFGNLGDANNRLWIGGVNYNELSLSNAAGQTINFTNMNFFVADENRLVISRDINNIVSVSINGVPHNQTFVLSGDITPSILGNSGGALPSGIARADEIEIDKLKVTVGGVVINHYEPTVTEGVGIILKDTESGNDGTIINFKSNLHHWKYYDGIVIDEQTEVRIGNGWASKVYVSSTTLGGFLDTYKSLTFTDEITCYAVGDCSYNEFFDKTGETLNFTNADFEQGLYVKGMIPFNGKNYDRLARLNNQITSNSQLFIDDFYIYSEQVGTSTLVADDNTYLYRCYVEHTGGASELGIVQMKNYSDLTNCVVRSLTPSPLGVSALETSFIGNTVVLGCDVNIKLSAPSGSYEYLFATQSTLSDFDDSGIYVFEYASGDNTGQYTGYTTAEFVDFANKDYRIKYSSDLHPLGIGAFFQEFVEGGISYFYGDSSVLTLNSEQSLYSKIANSYVSTFSIVGNGNGSHITVPNNQVSTISIDFNNELYASIHQGGTSEVGVDFIPNTSAVSQIIESSNVQVDDVQSLMVEISNSNLSNIDILFYANVSTHHNINNISELVIDDISNTNAVMTNNSLSNMHISNIDNTYIATNIFDYGDININSIDRHSVFSNISKISEFNFETVSKFNFRMNFFQDITMDIQTIDAHSGYANFNDVSQINIVSIDNVKINVGFSGVSVFDVSVLPNTYMSATVDNKSTFDISDVESFIAKFEIQDKSVFDIADISNAYISMTVDKSSSFDVSNIEAILAKFEVHDKSNFDVSDIASVLSEFQIQDRSTFDITDLSSNLIEHNIVDASTLFVDDVSAITLHASNHDKSTFNIWIDGDVFNSVSISDVFSISNFNLIMGEEYHIENNTNVVSSFNVHGLVNFHTEVNHADMSGISIITGDSYNINVTNNNVVDINVENITNTHMEMNQHEESLIEVDYLTASNVEFNEKTTSSINIDDVQSQYVVIRTSPVSELTVDLVPIYSVEFNAYTNSGFNLSYTGNPFIAAIIMDRSIIDLTIIDEIEYIIASPEFKYFDKSTLRIDGVDASTIFFNTSTVANNLVDFVPEFNTVTTIANGSMIDLVMSGNPILAIEYVSTSELTIDMVQSSEFVSLISNGSALDITTIQGQNFLVAVKDGSYNDLTIVESTNVAVAENTTSALNVSFSNQIQYASLYNDVSKFDVAFISEFFIVIDFDVYEYSERSISYIDVVPNYFVSHAEHSDSVFDIGTERGYNIEITDDTVGDIVVSIKTELDVRLFNNITIYIKPTDIGTPVVDTGKSWLDDSVFRTDMKTRTIITGKSMLDDLVISTAINRTTTIPLELSTRA
Physico‐chemical
properties
protein length:2313 AA
molecular weight: 254241,03800 Da
isoelectric point:4,40271
aromaticity:0,10852
hydropathy:-0,11556

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Alishewanella phage vB_AspM_Slickus01
[NCBI] 		3038239 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WGH49876.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ508957 [NCBI]
CDS location
range 102379 -> 109320
strand -
CDS
ATGGCCTATTATTTAGAGATAGCTGGAAGTGACACTCACGTAGCTGTTGATACAGCAATAGTTGTACCACCTGTCGGGACTGATGGGGTATTACTTAGTCTTGATATACAATTTAATGACTTAGGCACTCACCAAGCTATTTTATCTAGCGGTACATCTAACTTTATTGATATAAAAAATAACGGCTCATCAATGGAGTTGAGATCCACGAGCGCTGTAGTAGTATTTACGCTGTCCCCTCCGCTTGTAGCTAACCAGCGTTACTTACTAACGGTAGAACGAACCGATAGATCGTTAGTAGTTAAAAATAATGGCGATGTTATTTCCAATACAGGCACTCAGGCCGTAGGAAGAACCTTTTCAGTAACTCGAATAAGCGGTTTATCTGCGGGCTTTAGGCCTGGGAATTTCAGGTTATATGCTTTAACTTTTCCATTGAATAATAATGATTACAACTCCTCAACATCAAACGGCACAGGCTTAACGTTAATTGATACAGAGGGCGGCAACGATGGTACGCTAGTTAACTTCCCAACCGACAACTCCCAATGGCTCTGGGAAGAAGATACCCCACTTAACACTGGCGAGTCTCGCGTAGGTTCTGGCTGGGCACCGAGCATTCGTGATTACAGTCTATTAAATGATTGGAAAAATGCAAAGAAAACAGAACCAACCTATCAGACGGCTTTGTGTAGAGGATACTTAGGTAACCCGTTCTTTGATATTGTGGCAGCAGACTTTCCAGCGGGAGCATTAATTAGTGGTGTCGTAAAGTACACTGGTAACAATCACGACCAGCTTGCGCATTATGCTCGTAAATTCGTAATTAATAGTACAAGTCAAGTCATAGCAGAGCATTTAAAAATAACACATAGTACTGGACTACAGCCTACTGTTGGAGTACAGAACACTGGCGGATCGATAATAAGAAACTCGTATGTCTTAAATACTGGACAGGCGGGTGCTAACTCTGGTAGTGCAGTTTTGAGTGGAAACGGTACGTTACAAAACTGCGTAGTACATGGTACACAGCCTGTAAATAACCTCGTGTTAAGACCAAGCAATCAAGCACAAGTGCTTAACTGTATTGCTATTGGTGGATACACTGGATTATCCATGCCTTGGCCAGATGTGGTGGTAGATAGTACCTTTATAGTAAATGCAAGCAACGCTTGTATTATAGGAAACGTTCCGACAACCAATACCGCAACGGAAGACACTACTGGTGAATTCACTGGGTACACTACATCTGCGTTTGTTGATTTTGCTAATGGTGATTATCGCATTCGAGTAGGTTCGCCACTGCACAAATTAGGCATTGGTGCATTCTTTCAAGAAGATCTACTTCCAGAGTTAGACTATCAAGAATACTATGAGCTATCTAAGCCTATAACTGCTGGACTATCTCTCACAACAGCAACAGAAGTAATAATATTACCTAGTGAAGATGTATCTATAGAATTTACTTTCACTCTAAACCAAGTCCCCGCTTTCAGTGAGTATTATTATTTATTTGGTGCGGATAGCTGGGATCAAAATCACAATTTAAGAAAAATAAACAATACTGACTATTCCATACGATTAAGAGGAATATTAGACGCAACATTTAGTACTCCAGTTATACTATTAGGACAAAATGAAGTAAACAAGATAATAGTTTCCAGATCCGCAGGGGAATTAGAAGTATGGATTAATAACCATAAAGTATCAGCAGCAAACATCAGCGCCCAAGCAGATACAAATTTTCAATTAAAACACTTTTTTAGATACAATACTAACACATACACAAATGCTGTAACGTTGGGTTACTTTAAGATCCGTAGAGATGACATACTGACCAATTATTGGGTAAATGCCCAATCGCCAACCGCATCAGAGTGGGTGGACGTTATTGGTAATAATGATGCATCATTTTCGGGTTCATGGCCTATTAATTACAGTCACTGGAAGTACATTTCAACTAGTTCTAATTTAGTGGGCGAGTCTCGTGTTGGTACTGGATGGGCACCGAGTATTCGGGACTTTAATAGCTTGGAAAACTGGCGTGATGGAATAACCAACACTCAGAAAAATTATGCACTATGTCGTGGGTCTATCTTAACGAGGCATATAAGCTTTGGTAACTCTAACACGTTTCCTCTTGGGTTAGAAATAATCGGGGATGTTAAGTATAAAGGTAATAATTTAGCAGAACTAGCACATACTAATAATTTTGGTATGGATATTGGAGGTAGCCCTATCAGAGTGCACCACCTCTATTTATACACTGATAATAGATATTATGTTCCAGCTTGGATAAGATATACCACACCAAGTGCTTCTGATATCTTATCCTTTAACCACTGCTATATCAAACATACAAATGTTGATAAGTTAGGACAAGTTACCTCTGGAAATGGTAGTTCAGAAAATGATGGCTGGTTTAACTGCATTATTGATTGTGATGGAAGAGCTTATGGGTACTCTGTAGGGTACTCTCAAAAAGTTAGTCTAATCAACAACACTTACATCAACTACACCACAACAGGGTTCAATTCACCCTCTTTCGGTAACCCTTCTGGTAGATTTTATGAGAATAATTTTTGTCCTGAAAATACTGGAACCGACTATAACGTACAAGGCTTCGGAAGCTTCATTAATAATGCGAGTGCTGATACTACAGGTAATATCACTGGTTATGGTAAAGAGCAGTTCGTCGATTTTGCTAATGGCGATTACCGCATTAAGGCAAGTTCACCACTACATGCTTTAGGTATTGGTTCATTCTTTGAAGAAGCAGGGACACCAACAAGTTCATACTATTATTCTGATGTTTCTAATATACAACTTAACTCAGTTACATCAATTGATTATATTATAGATCCTGCTAACGATCCAACAGCGCCTAATTATGTATTATTTTTAAATGGTGCTGATGAGTATGTACAACTAAACTCACCAATCAATATAACAACGCCAGAATTTGAAATTGAGTTTATAGGTAATGGTCGCGCCTATGATGAGTCTGTTGTTTATATTTTTGGTAATCTTGGTGATGCTAATAATAGATTATGGATCGGTGGTGTAAACTATAATGAACTATCACTATCAAACGCAGCTGGACAGACGATAAATTTCACCAATATGAATTTCTTTGTAGCTGATGAAAATCGGTTGGTGATAAGCAGAGATATTAATAACATTGTTAGCGTTTCTATTAATGGTGTACCACACAATCAAACATTCGTTCTAAGTGGTGACATCACTCCATCTATTTTAGGTAATTCTGGTGGCGCTTTGCCATCTGGTATAGCAAGGGCAGATGAGATAGAGATTGATAAGTTAAAGGTTACCGTTGGTGGTGTGGTTATTAATCATTATGAACCTACTGTGACTGAGGGTGTCGGTATCATTCTAAAAGACACCGAAAGTGGCAATGATGGCACCATAATTAACTTCAAATCTAATTTACACCATTGGAAGTATTATGATGGTATTGTTATAGATGAGCAAACTGAGGTTAGGATTGGTAATGGTTGGGCATCTAAGGTTTACGTATCATCCACAACTCTAGGTGGATTTTTGGATACCTATAAATCATTAACCTTTACCGATGAGATAACATGCTACGCAGTTGGTGATTGTTCTTATAATGAATTTTTCGATAAGACTGGAGAAACATTAAACTTTACTAATGCTGATTTTGAGCAAGGACTCTATGTTAAAGGGATGATACCGTTTAATGGTAAAAACTATGACAGGTTAGCGAGACTAAACAATCAGATTACATCAAATTCTCAATTATTCATTGATGATTTTTATATCTACTCTGAACAAGTAGGCACTTCGACGTTAGTAGCAGACGATAATACCTATTTATATAGATGCTACGTGGAGCATACAGGTGGAGCAAGTGAACTAGGTATAGTTCAGATGAAAAATTACTCAGATCTTACAAACTGTGTAGTCAGATCTTTGACTCCTTCACCGCTAGGGGTAAGTGCACTAGAAACCTCATTCATAGGTAATACTGTAGTTTTAGGTTGCGATGTAAACATCAAATTATCAGCACCTTCTGGCAGTTATGAGTATTTATTTGCAACTCAATCAACTTTATCAGATTTTGACGATAGTGGTATATATGTATTCGAATATGCTTCTGGTGATAATACTGGTCAATATACTGGCTACACTACTGCTGAGTTTGTAGATTTTGCTAACAAAGATTATAGGATAAAATACTCATCAGACTTACATCCATTAGGCATTGGTGCATTCTTTCAAGAATTTGTTGAAGGTGGAATATCTTATTTCTACGGTGACTCTTCGGTACTGACTCTGAACTCTGAACAGTCTCTCTACTCAAAGATAGCAAACTCTTATGTTAGTACTTTTTCGATAGTCGGTAATGGTAATGGTAGTCACATAACAGTACCAAATAACCAAGTGTCAACAATCTCTATCGATTTTAATAATGAACTTTACGCAAGCATTCATCAAGGTGGTACATCAGAGGTTGGTGTTGATTTTATACCAAACACGTCAGCAGTCTCCCAGATCATAGAATCATCAAATGTTCAGGTAGATGATGTTCAATCTTTGATGGTTGAAATATCAAACAGCAATTTATCTAACATTGACATTTTATTTTATGCGAATGTATCAACACATCACAACATAAACAACATATCAGAGTTAGTAATAGATGATATATCCAATACTAATGCAGTAATGACTAATAATAGTCTATCCAATATGCATATATCTAACATAGATAATACGTATATAGCAACTAATATATTTGATTATGGTGATATAAACATTAATAGTATCGATCGTCATTCAGTCTTTAGTAATATTTCTAAGATAAGTGAGTTCAATTTTGAGACAGTGAGTAAGTTTAATTTCAGAATGAACTTCTTCCAAGACATCACCATGGACATTCAGACCATTGATGCTCACTCTGGCTATGCAAACTTTAATGATGTCTCACAGATAAATATTGTTAGTATAGACAATGTAAAAATCAATGTTGGATTTTCTGGTGTGTCTGTGTTTGATGTGAGTGTATTACCGAATACTTATATGAGTGCCACGGTAGACAACAAATCAACATTTGACATTAGTGATGTTGAGTCATTCATAGCAAAATTCGAAATACAAGATAAATCGGTATTTGACATAGCAGATATTTCCAATGCATACATCAGTATGACCGTGGATAAGAGTTCTTCGTTCGATGTGTCTAACATTGAAGCTATACTTGCTAAATTTGAAGTTCATGATAAGTCAAACTTTGATGTATCAGATATTGCGTCTGTCTTGTCCGAGTTCCAAATACAAGACAGATCAACATTCGACATTACTGATCTATCTTCTAATCTGATAGAACACAATATCGTTGATGCGTCTACCTTGTTTGTTGATGATGTTAGCGCTATAACACTACATGCGTCAAACCATGATAAGTCTACATTCAACATCTGGATTGATGGAGATGTGTTTAACTCAGTATCTATTTCTGACGTATTTAGTATCTCTAATTTCAACCTGATAATGGGTGAAGAGTACCACATTGAGAATAACACTAATGTTGTTAGCTCATTCAATGTGCATGGTCTTGTAAACTTCCATACCGAAGTCAACCATGCTGATATGTCTGGTATCTCTATCATTACTGGTGACAGTTACAATATTAATGTGACAAATAATAACGTGGTCGATATCAATGTAGAAAACATCACAAACACTCATATGGAGATGAACCAGCATGAAGAATCATTGATTGAGGTTGATTATCTGACTGCGAGTAATGTAGAGTTTAATGAGAAGACAACCTCATCGATTAACATTGATGATGTGCAGAGTCAGTACGTGGTAATCAGAACCTCACCAGTATCGGAACTTACTGTAGACCTTGTACCAATATATTCTGTTGAATTCAATGCGTATACTAATAGTGGTTTTAATCTTAGCTATACTGGTAACCCATTCATAGCCGCGATTATCATGGATAGAAGCATTATAGATCTGACCATCATAGATGAGATTGAGTATATAATTGCCAGCCCAGAGTTTAAATATTTCGATAAGTCAACTTTGCGTATTGATGGCGTGGACGCATCAACCATATTCTTTAACACCTCAACCGTAGCAAATAATTTGGTAGATTTTGTTCCAGAGTTTAATACAGTCACCACAATCGCAAATGGATCGATGATTGATCTGGTTATGTCTGGTAATCCTATATTAGCCATTGAGTACGTTAGTACATCAGAGCTGACCATTGATATGGTTCAGAGTAGTGAGTTTGTTAGTCTTATTAGTAACGGTAGTGCTTTAGACATAACCACGATACAAGGACAAAATTTCCTTGTGGCTGTAAAAGATGGATCATACAATGATCTTACAATCGTTGAAAGTACAAATGTCGCTGTTGCTGAAAACACAACTAGCGCACTGAATGTATCGTTCTCTAATCAGATCCAATACGCATCACTGTATAATGACGTGAGTAAATTCGATGTTGCTTTCATAAGCGAGTTTTTCATTGTAATCGACTTTGATGTGTATGAGTACTCTGAGCGTTCTATTTCGTATATTGATGTTGTTCCAAACTACTTCGTTTCACATGCAGAACACAGTGATTCTGTTTTTGATATTGGCACAGAGCGCGGATATAACATTGAGATCACGGATGACACAGTTGGTGATATTGTTGTTTCAATAAAAACAGAGTTAGATGTCAGACTGTTCAACAATATTACTATCTATATTAAGCCTACTGATATCGGTACACCTGTTGTTGATACTGGTAAATCTTGGTTGGATGACAGTGTATTCAGAACTGACATGAAAACGAGAACCATCATAACTGGTAAATCGATGTTGGATGATTTAGTAATATCCACTGCTATAAATAGAACTACAACGATTCCTTTAGAATTAAGTACGAGGGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
66f5e9d6f3347c7ff5fb0fe3ce5b503d24f1c7b8e37af0c94eaa2c6a72dbdb23
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2720
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecogenomics reveals distinctive viral-bacterial communities in the surface microlayer of a natural surface slick Rahlff,J., Wietz,M., Giebel,H.-A., Bayfield,O., Nilsson,E., Bergstrom,K., Kieft,K., Anantharaman,K., Ribas-Ribas,M., Schweitzer,H.D., Wurl,O., Hoetzinger,M., Antson,A. and Holmfeldt,K. 2023 — GenBank