Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_007517929.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Protein sequence
MADKVPIRTVFDSSGNATGLAEYQSGETVGFVHGGTGLAAIGSAGQVLRVNSGANGLEYGDGFSANAITLDAATDITLDAGGADIILKDDGTEFGRFSNSSGQLVIKSSGSATTAISMSGANVTIAGNLTVTGTTEGDSNITLGDAATDTVTFGGTISGSLVFEGSSADSFETTLVPGNPSADISLTLPATASDTLAGIASTQTLTNKTLTTPVIAEIDSGSTITLDATTDINLDADGGDIILKDGGTEFGRFTNSGGQLVIKSSSSATTNMTMSGANTTIAGNLTVTGTSTFNGGTVNLGDSATDTIVFNGLVSGSIVFEGSNVDSFETTLTPGNPSSDITLTLPSASSDVLVGRATTDTLTNKTITSPTVSGLTLSDSAISFEGSTANSFETSLTVTDPTADRTITLPNATGTLISHGMFSGDATVATSGAVTLATVNSDTSAVGSTTVIPVITANAKGLVTSIGTASISTLLTVGADSGSNDTITVGTDTLDFSGGSNITTTVSNNDISIALDASPSVTNLTVGGNIVFEGSTADSFETTLAVTDPTADRTITIPNKSGTVAMTSDTSFPQSTLTEHPAAQGNADLAGGETPFEAIVDAFQVITSNLYDHMEPRGEVVTVDLGSVA
Physico‐chemical
properties
protein length:629 AA
molecular weight: 62617,56230 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,04134
hydropathy:0,11097

Taxonomy

Phage
Pelagibacter phage HTVC008M [NCBI] · taxon 1283076
Viruses Duplodnaviria Heunggongvirae Uroviricota Caudoviricetes
Host
Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062 [NCBI] · taxon 335992
Bacteria Proteobacteria Alphaproteobacteria Pelagibacterales Pelagibacteraceae Candidatus Pelagibacter

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
YP_007517929.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_020484 [NCBI]
CDS location
range 49760 -> 51649
strand +
CDS
ATGGCAGATAAAGTACCAATAAGGACGGTCTTTGATAGTAGTGGAAACGCTACTGGATTAGCAGAGTACCAATCAGGAGAAACAGTAGGTTTCGTACACGGTGGTACAGGTTTAGCCGCTATAGGAAGTGCCGGTCAAGTTTTAAGAGTAAATTCAGGTGCAAACGGTTTAGAATACGGTGACGGTTTTTCTGCTAACGCAATCACATTAGACGCTGCTACAGACATTACATTAGACGCTGGTGGCGCAGATATTATTTTAAAAGATGACGGTACTGAATTTGGTAGATTTAGTAACTCATCAGGACAACTTGTCATTAAATCAAGTGGTAGTGCTACTACTGCTATTTCAATGTCAGGTGCAAATGTTACCATTGCAGGTAACTTAACAGTTACAGGTACAACTGAGGGTGATAGTAATATTACTTTAGGTGACGCCGCTACAGATACAGTAACCTTTGGTGGTACTATTTCAGGTAGTTTAGTATTTGAAGGTTCAAGTGCTGATAGTTTTGAAACTACTTTAGTACCAGGTAATCCAAGTGCTGATATTAGTTTAACATTACCCGCTACTGCTAGTGATACATTAGCAGGTATTGCTTCAACACAAACTCTTACAAATAAAACATTAACAACACCTGTTATCGCTGAGATAGATAGTGGTTCAACAATTACACTTGACGCTACTACAGATATTAATTTAGACGCAGATGGCGGCGATATAATATTAAAAGACGGTGGTACTGAGTTTGGTAGATTTACAAATTCTGGTGGACAACTAGTAATTAAATCTAGTTCTTCAGCAACAACTAATATGACAATGAGTGGTGCTAACACCACAATTGCAGGTAACTTAACAGTTACAGGTACATCAACATTCAATGGTGGTACAGTTAATCTTGGTGATAGTGCTACAGATACAATTGTCTTTAATGGTCTTGTATCAGGAAGTATTGTCTTTGAAGGTAGTAACGTAGATAGTTTTGAAACTACTTTAACTCCAGGTAATCCAAGTTCAGATATTACATTAACATTGCCAAGTGCCTCTAGTGATGTACTAGTTGGTCGTGCAACAACAGACACATTAACAAATAAAACAATAACAAGTCCAACAGTTTCAGGTTTAACATTATCAGATAGTGCAATCAGTTTTGAAGGTTCTACTGCTAACTCATTTGAAACTTCTTTAACTGTAACAGACCCTACAGCAGATAGAACAATCACATTACCAAACGCAACTGGTACTCTTATATCTCATGGAATGTTTAGTGGTGACGCTACAGTAGCAACAAGTGGTGCAGTTACATTAGCGACAGTAAATAGTGATACATCAGCAGTTGGTAGTACAACTGTTATACCAGTAATTACTGCTAACGCAAAAGGACTTGTAACATCTATAGGTACTGCCTCTATATCTACTCTATTAACAGTAGGTGCAGATAGCGGTTCTAACGATACAATAACAGTAGGTACTGATACACTAGATTTCTCTGGTGGATCAAACATTACAACAACAGTTTCAAACAATGATATCTCAATCGCCTTAGACGCAAGTCCAAGTGTGACTAACTTAACAGTTGGTGGTAACATTGTATTTGAAGGTTCAACGGCAGACAGTTTTGAGACTACATTAGCAGTAACAGACCCAACCGCTGATAGAACAATCACAATACCTAATAAATCAGGTACTGTGGCAATGACAAGTGATACATCATTCCCACAATCAACATTAACTGAACACCCAGCGGCGCAAGGAAATGCTGATTTAGCAGGAGGTGAAACACCTTTTGAAGCAATCGTTGACGCATTCCAGGTTATTACATCTAATTTGTATGACCACATGGAACCTAGAGGTGAAGTAGTTACAGTTGATTTAGGAAGTGTAGCATAA

Genome Context

Tertiary structure

YP_007517929.1
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 68.2
Oligomeric state monomer
Download structure