Protein
View in Explore- Genbank accession
- WFG78407.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber protein distal subunit
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKTAGQLPAASVLAEGELAINLKDKAIFTKDDSGNVIELGLKYGGTIDGSLTVNGNITGTLIGNSSTATKLQTPRKINGISFDGSKDITLTPSDINVNSTTFIKNNGELPVDANLDEYGPVEEYLGVWSKSTSTNAQPANKFPEENAVGVLEVFVAGQFAGTQRYTVRSGNVYVRSLSAKWNGVNGPWGVWRNVQASTRPLSQTIDLDSLGELEHCGLWRNSSSAIASFDRHYPEEGSAAQGFLEIFEGGLYTRTQRYTTRMGMVYTRCLAAAWDASAPKWEEWKQVGHGTPATFYDGDLNDFKTPGLYNILGTDAVINCPTGEGLPAVIVGLLEVKQRASGGAIFQKFTTAGTGETTRDRIFERAYTGGAWGAWNEVYTSYSLPITLGMGGIKAQLSELDWQTFDFVPGSMFSVPLNKIKNMPANMDWGTIDGNLVMFSVGPSEHTGTGRTVQVWRGTVSQTNYRYFVVRIAGNPGNRTNTCRRVVLEDGSHTWTAQQNFRGLLNITADINLGANKKISIAPGAYIQGPASGSGSNTYANQNTTIAPLYQAIDDSNKNQFAPIVKQKNTVTNITMASGMDIASSEYRIIAQGDLSATGTTANELATWRFLPSGRFMSQSRVYAGAAFLNTDGNIAGSIWKKYNDATNLDAALNTRVGKSGDIMTGRLTIQSPGDSIVLSAPASNSLHIRGDVDGTGNWYIGKGGDDNGLAFYSYATNAGVYITNAGDITLSPKGVEMAHVNNIRLYVHGERWTASQPGDWGNQWRVEAPIFVDHGYVGSDSYYPIIKGRSVVTNQGFVTAVDLGIRRVPNNWGQAIIRVGSAEASPAAGHPNAVFEFHYDGTFYSPGNGNFNDVYIRSDGRLKINKEELENGALEKVCRLKVYTYDKVKSIKDRSVIKREVGIIAQDLEKELPEAVSKVEVDGSDVLTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPFFTKIARKISNYFKF
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 982 AA molecular weight: 106683,30700 Da isoelectric point: 6,64677 aromaticity: 0,09470 hydropathy: -0,30387
Domains
Domains [InterPro]
cd19958
137–203
137–203
1
982
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_VIPECOOM03 [NCBI] |
3034280 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WFG78407.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ721911
[NCBI]
CDS location
range 155201 -> 158149
strand +
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTCAACTTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATTAATTTAAAAGATAAAGCAATTTTCACAAAAGATGATTCAGGCAATGTTATAGAATTAGGTTTAAAATATGGAGGAACAATTGATGGTTCTTTAACTGTTAATGGAAATATAACTGGAACTTTAATTGGAAATTCTAGCACAGCTACTAAATTGCAAACACCTAGGAAAATTAATGGTATATCCTTTGATGGGTCAAAAGATATCACGCTAACTCCATCTGACATAAATGTCAATAGCACAACGTTTATAAAAAATAACGGCGAATTACCGGTTGATGCTAATTTAGATGAGTATGGGCCTGTTGAAGAATATCTTGGGGTTTGGTCGAAATCTACTTCAACAAATGCGCAACCGGCAAATAAATTCCCAGAAGAAAATGCCGTAGGTGTACTAGAAGTATTTGTGGCCGGTCAATTTGCTGGTACTCAGAGATATACTGTAAGATCTGGTAACGTATATGTTCGATCTTTGTCTGCTAAATGGAACGGTGTTAACGGTCCGTGGGGAGTTTGGCGTAATGTTCAAGCGTCAACTCGTCCACTTTCACAAACGATTGACCTTGATAGCTTGGGAGAATTAGAACATTGCGGCTTATGGCGAAATAGTTCAAGTGCTATTGCATCATTTGATCGCCATTATCCAGAAGAAGGATCAGCCGCACAAGGATTTTTAGAAATATTTGAAGGTGGTTTATACACGAGAACGCAGCGATATACTACCCGCATGGGTATGGTTTATACTCGTTGTCTCGCTGCCGCATGGGATGCTAGCGCACCCAAGTGGGAGGAATGGAAGCAGGTTGGTCATGGCACACCAGCGACTTTTTATGATGGAGATCTGAATGATTTTAAAACTCCTGGGTTATATAATATTTTAGGCACTGATGCCGTTATTAATTGCCCTACAGGTGAAGGTTTACCAGCCGTTATTGTTGGTTTGCTAGAAGTTAAACAGCGTGCTTCTGGTGGTGCTATTTTCCAAAAATTTACTACTGCCGGAACGGGTGAAACTACTCGCGATCGTATTTTTGAGCGTGCATATACTGGTGGTGCGTGGGGTGCATGGAACGAAGTATATACATCTTATTCTCTGCCAATTACTTTGGGTATGGGTGGTATTAAAGCTCAATTATCGGAGTTAGATTGGCAAACCTTTGATTTTGTTCCTGGTAGTATGTTTAGCGTTCCTTTGAACAAAATAAAGAATATGCCAGCAAATATGGATTGGGGCACGATTGATGGAAACCTGGTTATGTTTTCCGTTGGTCCTAGCGAACATACTGGCACAGGACGTACTGTTCAGGTTTGGCGTGGTACTGTATCCCAGACAAACTACCGTTATTTTGTTGTGCGTATAGCTGGAAATCCAGGAAACAGGACTAACACTTGTCGCCGTGTTGTTCTTGAAGACGGATCACATACTTGGACTGCTCAACAAAACTTTAGGGGATTGCTAAATATCACCGCTGATATTAATCTTGGTGCTAATAAGAAAATTTCAATTGCTCCGGGAGCATATATTCAAGGCCCTGCTAGCGGTTCTGGTTCAAATACTTACGCAAATCAGAATACTACTATTGCGCCATTATATCAGGCCATTGACGATTCAAATAAAAACCAGTTTGCTCCTATTGTAAAACAGAAAAACACTGTAACAAATATTACTATGGCTTCTGGTATGGATATTGCTAGTTCAGAATATCGTATCATTGCTCAAGGTGATTTATCCGCTACTGGAACTACAGCTAATGAATTAGCTACATGGCGTTTCTTGCCGTCTGGCCGATTCATGTCACAAAGTCGAGTTTATGCTGGCGCAGCATTCTTGAACACTGATGGTAACATTGCTGGTTCAATCTGGAAGAAATACAACGATGCAACCAACTTAGACGCTGCTTTGAATACTCGCGTAGGTAAAAGCGGTGATATTATGACCGGACGCTTGACAATTCAAAGCCCAGGTGATTCTATTGTATTATCAGCACCTGCTAGTAATTCTTTGCATATTCGTGGTGACGTAGACGGGACTGGTAACTGGTATATTGGTAAGGGTGGTGATGATAATGGATTAGCGTTCTATAGTTATGCTACTAATGCTGGTGTATACATTACAAACGCAGGAGATATCACGCTAAGTCCAAAAGGCGTCGAAATGGCTCATGTCAATAACATTCGATTATATGTTCATGGTGAACGTTGGACCGCTAGTCAACCAGGTGATTGGGGCAACCAATGGCGAGTAGAAGCGCCAATATTCGTCGATCATGGTTATGTTGGATCAGATAGCTATTATCCAATTATTAAAGGAAGAAGTGTAGTCACCAATCAAGGGTTTGTAACTGCCGTCGATCTTGGTATTCGTCGTGTCCCTAATAATTGGGGACAAGCAATTATTCGTGTTGGATCTGCGGAGGCATCGCCAGCGGCTGGACACCCTAACGCGGTATTTGAATTTCATTACGACGGTACTTTCTATTCTCCTGGTAATGGTAACTTTAACGATGTGTATATTCGTTCCGATGGTCGACTTAAGATCAATAAAGAAGAGTTAGAAAACGGAGCACTTGAAAAAGTATGCCGACTGAAGGTTTATACATACGATAAGGTTAAGTCTATTAAAGATCGTAGTGTTATTAAACGTGAAGTTGGTATTATTGCTCAGGATCTTGAAAAAGAATTACCGGAAGCTGTGTCTAAAGTTGAAGTTGATGGATCTGATGTTCTGACAATTTCTAACTCCGCTGTGAATGCTCTTTTAATTAAGGCTATCCAAGAAATGAGCGAAGAAATTAAAGAATTAAAAACGCCTTTCTTCACTAAAATTGCTCGCAAAATTAGTAATTATTTTAAATTCTAA
Tertiary structure
PDB ID
0f2dd5efb26711a9685b4d5065ba44702b97c1c189e2ff58992cd92761109e2c
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50