Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAL1641169.1 [GenBank]
- Protein name
- Phage long tail fiber
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSTPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTNISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETKWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTMRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAINGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1289 AA molecular weight: 140134,70290 Da isoelectric point: 5,49471 aromaticity: 0,07448 hydropathy: -0,32684
Domains
Domains [InterPro]
IPR048390
980–1092
980–1092
1
1289
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_Eco_BGP [NCBI] |
2898834 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAL1641169.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ035849.1
[NCBI]
CDS location
range 66781 -> 70650
strand -
strand -
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCGGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACCGATGCTAACTGGATTACGGTTTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCTGGTGAAGCTATTTCGGTTAACACCGCAGCTGGTAATGATATTACATTTACTTTACCATCTACCCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCGGTGCAAAGTATTGTAAACTTCAGAGGCGAGCAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGCTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCGCAATCAAATGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAACTGAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAACGAAGAAGTCATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAACTCAAACAATTGAGCTTCAGCTTCCAACTAATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCGGGCGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAACTAAATGGGTAACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGACTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAATCGTACTGCTACTGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATTACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATACAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGCCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAGCAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAGGAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACACAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAGGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGCTGGTTCTACGCAGGACTTAGAGCTATACGAGAAAAACAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGATACAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACAGTTAATGGTTCACTAACCTTAACTCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGCGGATCAGTTTCGGCAAACAGCACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCGCAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGTTCAGATACAATGCGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGCAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGTATCAATGGTACTGTAATGCCAATAAATGTTAATGCTTCGGGTTCTTTGAATGCGAACGGCGTTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATAAATGGCGACTATGGATTCTTTATTCGCAATGATGCTGCTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACATCTGACTTATATACCCGTGCGCCAACGTCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACTCCAGAAGCACGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAGCCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA
Tertiary structure
PDB ID
c0cb526062731ab56f6c556edd04ea1ed296a8a8c37c46a958ea3c93a550ebff
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50