Protein
View in Explore- Genbank accession
- XQU42679.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTFTFTF
- Protein sequence
-
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKVVFNPTGSSEVTIGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNNFNIRQAIVTDGEQLTLKKATNAGASYIQGRDANNQQTWYVGQGNANNTNVYLYNHATGSMLTLDATASFNKTLRVMGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGDNTFSGINNFVGEFKITRNNAALVIKNASNATGLYLLGVKADGTSKFYLGTDTSDSVVNLHNYSTSTTISLSDVISATKTVRITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSNLAKLSDMNIFRSTQVILQDDLSLQLRNTVQDNALYFAGYNADNVRRWYIGNGEVENPSKLIIHNDKAGTTIFMQDDFFLNKTVKINGQVQPSDWANIDARYYGKSETDSKYFWSASRGLVKETEGGVAWNQPSGIYTESTSDGGAELLVLNLFCNTKASTPSAQLKFRYKNGGMWYRTARDALGFEDVWSKVYTEAQRPTPSEIGAYTKAETDQKIATAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKGTNSTGGHTHSVSGTTSAAGNHAHHLGLLLVNGGDALYGYTTVGNSLPRTLDWLDRRDNKFPNTNTTGNHTHTWSGTTSGAGDHSHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 795 AA molecular weight: 86413,64820 Da isoelectric point: 7,32162 aromaticity: 0,09182 hydropathy: -0,40591
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoM_P54 [NCBI] |
3412730 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XQU42679.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV390658.1
[NCBI]
CDS location
range 50744 -> 53131
strand -
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGACACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACCATGACGGGTGATTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGTAGTCTTTAACCCAACAGGCTCTTCTGAGGTTACTATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATCAACGCAAATGGCCTTAAACTGACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAACCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGCTGGCTGTAACAAATAACTTCAACATTAGGCAAGCAATTGTAACTGATGGTGAGCAGTTAACCCTTAAGAAAGCAACGAATGCAGGAGCTTCATATATTCAGGGTAGAGATGCTAATAACCAGCAAACGTGGTATGTTGGACAGGGAAATGCAAACAACACTAATGTTTATCTGTACAATCATGCCACTGGCTCAATGTTAACCCTTGACGCAACAGCGTCATTTAACAAGACACTAAGAGTCATGGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTAGCTAATCAGAGATTTGCACAGCTAGCTGGTGATAACACCTTTAGTGGTATTAATAATTTTGTAGGTGAGTTCAAAATTACCAGAAATAATGCTGCGTTAGTTATTAAGAATGCCTCTAATGCAACCGGACTATACCTACTTGGAGTGAAGGCTGATGGTACAAGCAAATTCTACTTAGGGACTGATACTTCTGACTCTGTAGTTAATCTGCACAACTACAGCACAAGCACAACCATCTCTTTGTCAGATGTGATTAGTGCTACTAAGACTGTGAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCTACTTTGAGTAATCTTGCTAAACTCAGTGACATGAACATTTTCAGGTCTACACAAGTTATTCTCCAAGATGACCTATCGTTACAGCTAAGAAACACTGTTCAGGATAATGCACTATACTTTGCTGGTTATAACGCTGATAATGTGAGAAGATGGTACATCGGGAATGGCGAGGTAGAAAACCCATCTAAACTCATTATCCACAATGATAAAGCTGGGACCACTATTTTTATGCAAGATGACTTTTTTCTAAATAAAACAGTGAAAATCAATGGTCAAGTTCAACCCTCTGATTGGGCTAACATTGATGCAAGATACTACGGTAAATCAGAAACTGATTCGAAGTATTTCTGGTCAGCATCCAGAGGTCTGGTAAAAGAGACTGAAGGTGGTGTAGCTTGGAACCAACCTTCAGGAATCTACACTGAATCAACAAGTGATGGTGGGGCAGAACTCTTAGTCTTAAACCTGTTTTGTAATACGAAAGCCTCTACACCATCTGCACAATTAAAGTTTAGGTACAAAAATGGTGGGATGTGGTACAGAACAGCCAGAGATGCACTTGGTTTTGAGGATGTATGGTCTAAGGTTTACACCGAAGCTCAGAGACCAACCCCTTCAGAGATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAAATTGCAACAGCAATTAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTTCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATCGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACAGGTGGTTCAGATTCTGTGACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACTCACAGTTTCTCTGCTACCACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGGGCACTAATAGTACTGGTGGTCATACTCACTCTGTAAGTGGTACAACAAGTGCTGCTGGTAACCACGCTCACCACTTAGGTCTGCTATTGGTTAATGGTGGTGATGCTTTGTACGGATATACAACAGTTGGTAACAGCCTCCCTAGAACGCTTGACTGGCTTGATAGAAGAGATAACAAGTTCCCTAACACTAACACAACTGGTAACCATACACACACATGGTCTGGTACTACAAGCGGTGCTGGTGACCATTCCCACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
d0d5c279c1265edf23e890851e1821ea52c3a43421c53d1c01cc4af99ad0a2f7
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50