Protein

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Genbank accession
AKC04906.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFNLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEINIGDVLKTFKINSNGLRLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNSFQAKQSVVANGEQLTLKTPAGASEAYSAIVGRNANNDKTWAVGNLTQGSLDVHLENSRGSRITLGAIVSVNKALAITGQVQPSDFSNLDARYFTQAVANQRFAQLAANNTFSGANTFTNSVSVNSDAAAIILKNKTVNDNLFILARDSENNNLWYIGKGDTNSNVTLYDYKGGTSIKLDSSGVTFNKVVKIIGQVQPSDWANIDSRYIPAATLNNLAKINVSNTFTNTQTIVANNEGLIVKNLTQNQPLYIRGVDTTNTSRWWIGVGGNNSNVVTWSNSYSGTAIALEQSVIVANKSLAIAGQVQPSDFSNLDARYYTQSVANSRYMLASLTGSASEKDGGNGVAWNARTGLYNVTNTTGGASFLVSHMFLGAGSTPSAQLKFEYRNGGMWYRTSRDAYGFEVNWSKVYTEAQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKGTNSTGGHTHSGSGSTSTNGEHSHYIEAWNGTGAGGSKMSSYAVAYRAGGSNTNAAGNHSHTFSFSTNNTGAHTHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:787 AA
molecular weight: 83976,55110 Da
isoelectric point:8,84804
aromaticity:0,08640
hydropathy:-0,34676

Domains

Domains [InterPro]
IPR048388
161–248
IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR048388
277–362
IPR048388 IPR048388
AKC04906.1
1 787
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_AYO145A
[NCBI] 		1636202 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli O145:NM
[NCBI] 		991919 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AKC04906.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KR014248 [NCBI]
CDS location
range 52262 -> 54625
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAATCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCAACAGGCTCTTCTGAGATTAATATTGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAACTCAAACGGTCTTAGACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACCCTGAATAAACCAAGTCCTAATGAGCTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTTACAAACTCATTCCAAGCTAAACAGAGTGTCGTAGCAAATGGCGAGCAGTTGACACTGAAGACCCCTGCTGGTGCAAGTGAGGCATACTCCGCTATTGTAGGTCGAAATGCCAATAATGATAAAACTTGGGCTGTTGGGAATCTAACTCAAGGAAGTCTTGATGTTCATCTCGAAAACAGCAGAGGTTCAAGAATCACTCTAGGTGCAATTGTGTCTGTTAATAAGGCTCTTGCTATTACTGGACAGGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATATTTTACTCAGGCAGTTGCTAACCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAACACTTTTAGTGGTGCAAACACATTCACTAATTCCGTCAGTGTGAACTCTGATGCTGCTGCTATCATTCTCAAAAATAAAACTGTTAATGATAATTTGTTCATCCTAGCAAGAGACAGTGAAAACAATAATTTGTGGTATATTGGTAAAGGTGATACAAACTCTAATGTCACATTATATGATTATAAGGGTGGTACTTCTATTAAATTAGACTCATCTGGTGTAACATTTAATAAGGTTGTAAAAATCATTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGGCTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCTACTTTGAATAATCTTGCTAAGATTAATGTATCTAATACATTCACGAATACACAAACTATTGTTGCTAACAATGAAGGGTTGATTGTAAAGAATTTAACACAAAATCAGCCTTTGTATATCCGTGGTGTTGATACCACAAACACCTCTAGATGGTGGATTGGTGTAGGAGGGAACAATTCTAACGTGGTTACTTGGAGCAACAGCTACTCTGGCACAGCAATTGCCCTTGAACAATCAGTAATTGTGGCTAACAAGAGTCTTGCTATCGCTGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGGTACTATACGCAATCTGTTGCGAACTCTAGGTACATGCTTGCAAGCCTCACTGGTTCAGCTTCTGAAAAGGATGGTGGGAATGGGGTTGCATGGAATGCTAGAACAGGGCTATACAATGTTACCAACACTACTGGTGGAGCATCTTTTCTTGTATCTCATATGTTTTTAGGTGCTGGCTCTACACCATCTGCACAATTAAAATTTGAATACAGAAATGGTGGGATGTGGTATAGAACATCAAGAGATGCCTATGGCTTCGAAGTTAATTGGTCTAAGGTTTACACGGAAGCACAAAAACCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGCAACGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAATAATGGTGTTGGGAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACTCACAGCTTCTCTGCTACCACTTCATCTTTTGATTATGGTACGAAGGGGACTAATAGTACTGGTGGTCACACTCACTCTGGTAGTGGTTCTACCAGCACAAATGGTGAGCACAGCCACTACATCGAGGCATGGAACGGGACTGGTGCAGGTGGTAGTAAGATGTCATCGTATGCCGTAGCATATAGGGCGGGTGGGAGTAACACTAATGCAGCAGGAAACCACAGCCACACTTTCTCTTTCTCAACTAACAATACTGGCGCTCACACACACTCTGTAGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGCTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTACAAATTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
890a1584e3c8706e436672a9cb8e8e10c36747f66c56c50b6bb3679dd3a222c1
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6786
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50