Protein

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Genbank accession
WPK35245.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,68
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTTGNGAWANQHSNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETGTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWHYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLIANGVSTGTINSTGVNSTKKLTVGYSRDSGSTWDYPNTNQAMFSARTEVDGNNNGDGQTHIGYSSNAKMYHYFRGAGRMAISMGEGLIVEPGILDIKTGSNSLNLRADGTIASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLIFKAASGIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTVKAWGNSFNATGDKARETVFEVSDGQGYYFYSQRVAPTGSETTGPVVTQFNGQVNARGSLITDGSLRVNGLSTLVGNVTMNNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNAGESGGISNLRPFYIALSNGKVSMDHDVDIGGGRFKVEAAGTTAGQRITVNMASDAIRINAPTQESSNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNVVRMHSYTYSHGIALNSDSVDITKPLKVGNAQLGTDGNITGGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATAGWYKFATVTMPQATSTVSITVTGGNGSNSGSFNQCAISEIVLRTGNNTPKGLNAVLYRRGLNSFRDIAWVNTSGDTYDIYVNMGTYANQLIFNYSSVDNATVQIIGAFSSAQSPVDTLPETNVKGQVADVLTNLVDSGKTKRFVAESEIAVNNQTGLRITSNGDKSGSNSVLFRNDGGSFYILLTDKNSSDGDNKATEGGWNGKRPFSIDMTAGTVRLGENTSFGKDVTIDGSINSRVKVVGQWSVSFSDISDVTRDRSAFLVNTGGISKTSQSYYPLFSGYSFLTDAGYRQSFEFGWLGVSGTWRQGIIRMRGDNPSGQQARWTFDMDGTFYAPILSCGSARAFGVNTTNGWGGNSIAIGDSDTGFRQVGDGLLETWANNVKVVRYTSSEVYSEKNVNAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALEKVEQLDGLIYDKAEYIGGEPVQTEAGIVAQTLQDVLPEAVREVEDIKGNKILTVSSQSQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1297 AA
molecular weight: 139582,26490 Da
isoelectric point:7,17492
aromaticity:0,09329
hydropathy:-0,34163

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
514–650
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
691–765
IPR048388 IPR030392 Coil
WPK35245.1
1 1297
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage AV115
[NCBI] 		3077260 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WPK35245.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR352945.1 [NCBI]
CDS location
range 59886 -> 63779
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGTGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAACTGGCGATTATTTACAAAACGGCACGTATAATCTCAATGGAAATCAGTTTGTTTACGCAGGAAAATACATTGAATTTTTACCTAAAACCACTGGAAATGGCGCTTGGGCTAACCAACATTCGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCACTGATTAAACAACGTTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCGGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGTACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCGACTTGGCACTATACTCCAACCGAAACAGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGACGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGCGTTATTGATTTGATTGCTAACGGTGTTTCGACCGGTACAATAAACAGTACTGGTGTTAATAGTACAAAGAAATTAACAGTTGGGTATAGCCGTGATTCTGGATCTACTTGGGATTATCCGAATACCAACCAGGCAATGTTCAGCGCTAGAACAGAAGTTGATGGTAATAATAACGGTGATGGTCAAACTCACATTGGTTATAGTTCTAATGCTAAGATGTATCATTATTTCCGTGGCGCTGGCCGCATGGCCATCAGCATGGGTGAAGGTCTTATTGTCGAACCAGGAATTCTTGATATTAAAACCGGTTCAAATTCGTTAAATTTGCGTGCTGATGGTACCATCGCTTCTGTTCAAACGTTAAAACTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTCTAATTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGTACTAAGCAAATTTTGTGGGAAGGCGGTACTCGTGCAGGTCAGAACAAAAGTTATGTGACCGTGAAAGCATGGGGTAACTCATTTAATGCTACTGGTGATAAAGCTCGAGAAACCGTATTTGAGGTTTCTGATGGCCAAGGTTATTATTTCTATTCTCAACGCGTAGCTCCGACCGGTTCTGAAACTACAGGCCCTGTTGTAACTCAGTTCAATGGACAGGTTAATGCTAGAGGAAGCTTAATAACCGACGGAAGTCTTAGAGTTAACGGATTAAGCACTCTAGTTGGCAACGTTACAATGAATAATGGATTGTTTGTTCAAGGCGGTTCTTCTATTACTGGACAAGTTAAAATTGGTGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACTCCGCAGAATGCTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTGCATTAAGTAATGGTAAAGTTTCTATGGATCATGATGTAGATATCGGCGGCGGCAGATTTAAAGTAGAAGCTGCTGGAACTACGGCTGGTCAACGCATAACAGTAAATATGGCATCAGATGCTATTAGAATAAATGCTCCAACACAAGAGTCTTCTAACTTCATTCAAGGACGTAAAGCAGATGTTCCGAAATGGTATTTAGGTATTGGCGACGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCACAGTTACACATATTCACATGGTATTGCATTAAACTCTGATTCTGTCGATATTACTAAACCTCTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACCGATGGCAATATCACGGGCGGTTCAGGAAACTTTGCTAACTTGAATACAACTTTAAACCGTAAAGTGAATTCTGGTTTTATTACTTATGGAGCAACTGCAGGTTGGTACAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCTCAAGCTACATCAACCGTTTCAATTACAGTCACTGGCGGAAATGGATCTAATTCTGGATCATTTAATCAGTGCGCAATTTCTGAAATTGTTCTTCGTACAGGAAACAATACTCCTAAAGGATTAAATGCTGTTCTATATAGAAGAGGACTAAATTCATTTAGAGATATTGCTTGGGTTAATACATCTGGCGATACATATGACATTTATGTCAATATGGGAACATATGCTAATCAGTTAATATTCAATTACAGTTCTGTTGATAATGCAACAGTTCAAATAATTGGCGCATTTAGCTCAGCTCAAAGTCCTGTTGATACATTACCGGAAACAAATGTTAAAGGACAGGTAGCAGATGTATTGACTAACTTAGTTGATTCAGGAAAAACAAAGCGTTTTGTTGCTGAATCTGAAATAGCTGTTAATAATCAAACTGGATTACGTATTACGAGTAATGGTGATAAATCTGGTTCAAATTCAGTATTATTTAGAAATGACGGTGGAAGCTTCTATATTTTACTGACCGACAAAAACTCTTCAGACGGCGATAATAAAGCAACTGAAGGTGGTTGGAATGGAAAACGACCATTTTCAATTGATATGACTGCTGGTACTGTTCGTCTTGGCGAAAATACTTCTTTTGGTAAAGATGTTACTATTGATGGAAGCATTAATTCACGAGTTAAAGTTGTCGGACAGTGGAGTGTTAGCTTTTCTGATATTTCAGATGTGACTCGTGACCGTTCTGCATTTTTAGTGAATACGGGTGGCATTTCCAAGACAAGTCAATCTTATTACCCGCTATTTTCTGGATACAGTTTTTTAACTGACGCAGGTTATCGCCAATCGTTTGAATTTGGATGGTTAGGTGTTTCTGGTACTTGGCGTCAAGGCATTATTCGCATGCGTGGTGACAACCCATCGGGGCAACAGGCTCGTTGGACTTTTGATATGGACGGAACATTTTATGCTCCTATACTATCATGCGGATCTGCGAGAGCATTCGGTGTCAATACAACAAATGGATGGGGTGGTAACTCAATTGCGATAGGTGATAGTGATACTGGTTTTAGACAAGTAGGCGATGGGCTTTTAGAAACATGGGCAAACAACGTTAAGGTCGTTCGTTATACTTCAAGTGAAGTTTATTCCGAGAAAAACGTCAACGCTCCTAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTGAAATCTAATTTCAAGCCTATTGAAAACGCGCTCGAAAAGGTTGAACAACTTGATGGTTTAATCTATGACAAAGCTGAATATATAGGCGGTGAACCTGTCCAAACAGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACACTGCAAGATGTTTTACCAGAAGCAGTTCGTGAAGTTGAAGATATTAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAATCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
445ea4b7968daa716c94c8a2ea7b983f98d890f380321ec555266e02ccc44883
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5075
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
A collection of diverse bacteriophages for biocontrol of ESBL- and AmpC-beta-lactamase-producing E. coli Vitt,A.R., Sorensen,A.N., Bojer,M.S., Bortolaia,V., Sorensen,M.C.H. and Brondsted,L. 2023 — GenBank