Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAL1327496.1 [GenBank]
- Protein name
- Long tail fiber
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSTPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAIVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETKWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQQGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTMRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNIMFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAINGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPVNKTVKFEWVE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1289 AA molecular weight: 140149,82340 Da isoelectric point: 5,49226 aromaticity: 0,07448 hydropathy: -0,31924
Domains
Domains [InterPro]
IPR048390
980–1092
980–1092
1
1289
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAL1327496.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ034682.1
[NCBI]
CDS location
range 147713 -> 151582
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCGGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACCGATGCTAACTGGATTACAGTCTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCCGGTGAAGCTATTTCGGTTAACACTGCAGCTGGTAATGATATTACATTTACTTTACCATCTACCCCAATTGACGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGCTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTATAGTTGTAACGCCTGCGAGTCTCTATCAGGCGCAATCAAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTCAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAACGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAACTCAAACAATTGAGCTTCAGCTTCCTACTGATATCTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAACTAAATGGGTAACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAGGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATTACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATACAGGAACCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGTGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACAAATGTTTATAATAAAAACACTAATAACTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAACAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAGGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACACTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAGGTCGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGCTGGTTCTACGCAGGACTTAGAGCTATACGAGAAAAACAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGATACAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCGCAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGTTCAGATACAATGCGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGCAATAAAGCTGGGAATATAATGTTTAGTATCAATGGTACTGTAATGCCAATAAATGTTAATGCTTCGGGTTCTTTGAATGCGAACGGCGTTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGTGAATTCATCAGCAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATAAATGGCGACTATGGATTCTTTATTCGCAATGATGCTGCTAACACCTATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACATCTGACTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATAGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAACGAAGTGACTGGACTTCCGTACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACACAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACACCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTGCGAATTGGTAATGTTCGCATTGTTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA
Tertiary structure
PDB ID
3741fc5e4d27347f0b165d4533ab9c97881623d897f38711a2a53ec350c73ead
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50