Protein

View in Explore
UniProt accession
H8ZMD7 [UniProt]
Protein name
Short tail fiber
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,62
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSLQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYVVDNRPGEVLYTNVAPIDENSNLDITSPNNVLYKYNSVEGGIIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTTYTAKGINTEADVPPRTAIFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYFKPDSTELISPKFSHHRLTCFQFADGLNSLQTLIDSGTVPVGNYGVVDDIYERTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPTTDQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGNTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINISGVTGSTGPQSEVDATEYNGSFTVTSASGNVFTYQMSATPTGNAVGSNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMRADGSKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATEGDGAHLDGFAEYRKGWAHEHITATNDSFIQAVSVFAVGYGTHFTTESGADMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKSFSKDKAGEITHIIPPRSLNVISTSATGTSGTNTVTLADDGSVEGIIEGMLINNEDIPLGTQVSAVNTSTRVITMTASSTDTVTGNIIFGEEVTVNWVNLDIQRTISINSELAQAGQTPGSRLYLFGYTAEPSPPATKVQGYGIGARQDGTGANAVADKINVLLYANSSATQPSVVSANVAPYGPSVSGLSAGVDGSPFQYDSSTYTIGGTSKIGGWYLSTEGGSSNTIYTALSSQSASSQRYENAAFTPTTFIKRIPDSRDLQDRTYRVRYVIDKNKTNPLPRDPLSGYVMQPLNSDATSYNLNRTFYIYDIEIVQEYERGVADGIYYLTLLCASISPSTSNFDNRKFSQNVNEVYPTFDRDNPLGDPDPSVSVADNETIGLVYSTDGATPPNKDPKLSITKEGIEFLLGDTGWVQPGTSPNWDSVNKRLSGVQLTSRYGDEEVRKIPVRENVDGTVAPVPVELRRHSIMRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSTDQIKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQIINPVTGQITSEDIAQLNVIGEEGTTIETFSEVVLTDKLTVIGGASNQLESIFSGPVTFQNTTTFTGNLQTSKFTLFNTDGTVVRQQLLAPSTTGAGGSNAQPDFATIVGYDTPSTGDLVYNSNWTPGTSLGWIYDGDTASWKQFGLTNTGDIEIQTFNTRQNIGIGEAPDSTYRVRMNGSARIDGDLVVTGRGGVGSDKYVTRTYTGDGVTQTFALTTYANVSHTANSLLVFVNGVAQIGGTNFSVDGTGANIVFSAGDEPTSIDTVHIIELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1330 AA
molecular weight: 143302,36780 Da
isoelectric point:4,66923
aromaticity:0,09474
hydropathy:-0,28759

Tail Spike Domain Segmentation

Segmented into three structural domains: N-terminal, central, and C-terminal.

Domain layout
H8ZMD7
1 1330 aa
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 90 90 0,9725
Central domain 91 308 219 0,9583
C-terminal 309 1330 1021 0,1345
N-terminal Central domain C-terminal

View these domains on the 3D structure via the Color by → Tail spike option in the Tertiary structure section below.

Taxonomy

Phage
Synechococcus phage S-MbCM6 [NCBI] · taxon 3126011
Uroviricota Caudoviricetes Pantevenvirales Namakavirus Namakavirus smbcm6
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession
AFD02648.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN371768 [NCBI]
CDS location
range 24889 -> 28881
strand +
CDS
ATGGCATTAACACGTCTTAAGAATATTATTACGTCCCGTACGGGGCGTATTATTTACGTTAACCCTGATGATTTCGACGCTTCGGATGCCATTGATAACCGAGGAAACTCTGCACTTAGACCTTTTAAAAGTCTACAGAGAGCATTTCTTGAGGTAGCGAGATTCTCATATCGAGTTGGTTTATCAAATGACGAATTTGATGCCTTCTCGATTATGCTGTATCCAGCAGAATATGTTGTTGATAATAGACCAGGTGAAGTATTATATACTAATGTTGCTCCCATTGACGAGAATTCAAACTTAGATATTACTTCTCCAAACAACGTATTATATAAGTATAATTCTGTTGAAGGTGGTATTATTGTACCTAGAGGTTGCTCTTTAGTTGGCACAGATCTTAGACGCACTAAGATTATTCCTAAGTATGTGCCGTATCCAACCACATATACTGCAAAAGGAATCAATACTGAAGCAGATGTACCACCTCGCACTGCTATCTTTAAGGTAACTGGTGGCACATATTTCTGGCAATTCTCTTTCTTTGATGGTGCTGAAGAAGGTGTATACTTCAAACCTGACAGCACAGAATTAATCTCACCTAAATTCTCTCACCATAGACTCACTTGTTTCCAATTTGCTGATGGTTTGAATAGTCTACAGACATTAATTGACTCAGGCACTGTGCCTGTAGGAAACTATGGTGTGGTTGATGACATTTATGAGCGCACAGATTTAGAGATTTACTATCAAAAAGTATCTAAGGCATTTGCTACTATTCCTGATACATCTGGTGATCCTACAACTGACCAAATTCAGGCAAGAGTAGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATTTCTGATGAATATCGAGTCTTACAAATCACTCGTAATGGTAATACTGCAACAGCAGTCACTGTTGATGAATTTGATAACCCAAGAGATCATGGATTCTCTGTAGGTGTTAACATTAATATCAGTGGTGTTACAGGATCTACAGGTCCACAGTCTGAAGTTGACGCAACAGAATATAATGGATCATTTACTGTAACCTCGGCATCAGGTAATGTCTTTACCTATCAGATGTCAGCAACACCAACAGGTAATGCAGTTGGATCAAACATTACTGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCACCATATGCGTTTAACCTGTCACTGAGATCAGTGTGGGGTATGAATGGTATGAGAGCGGATGGTAGTAAAGCAACTGGATTTAAGTCCATGGTTGTTGCTCAATTTACTGGTTTGAGTCTTCAAAAGGATGATAGAGCATTCGTAAGATATAATGCTTCTACTGGCAATTATGATGTTGCAACTGAAGGAGATGGTGCTCACCTAGATGGTTTTGCTGAATACCGTAAGGGTTGGGCACATGAGCATATTACTGCAACAAATGATTCATTTATTCAGGCAGTTTCGGTGTTTGCTGTTGGATATGGCACACACTTTACTACTGAGAGTGGTGCTGACATGTCTATCACCAACTCAAACTCTAACTTCGGTAACACTGCTTTAAGATCTGCTGGTTTCAAAGCAAAATCATTCTCGAAGGATAAAGCGGGTGAAATTACACATATCATTCCACCTAGATCTTTGAATGTTATTTCAACATCAGCAACTGGCACATCTGGCACTAATACAGTTACATTAGCAGATGATGGATCTGTTGAGGGTATTATCGAAGGTATGCTTATCAATAATGAGGATATTCCTCTTGGCACTCAAGTATCTGCTGTTAATACTAGCACCAGAGTAATTACAATGACTGCAAGTAGCACTGATACTGTTACTGGAAATATTATTTTTGGTGAGGAAGTCACTGTAAACTGGGTAAACCTTGATATTCAACGCACAATCAGTATCAATAGTGAATTAGCACAGGCAGGTCAAACACCTGGATCCAGACTTTATCTGTTTGGATATACTGCAGAACCTTCTCCCCCTGCAACAAAGGTTCAGGGTTACGGAATTGGTGCCAGACAAGATGGCACGGGTGCTAATGCTGTAGCAGATAAAATCAATGTGCTACTATATGCTAATTCTAGTGCAACTCAACCTTCAGTTGTTTCTGCTAACGTAGCACCGTATGGTCCTAGTGTATCTGGTTTATCTGCTGGTGTTGACGGATCACCCTTCCAATATGATTCATCAACATATACTATTGGCGGCACTTCTAAAATTGGTGGTTGGTATCTCTCTACAGAAGGTGGATCTAGTAATACAATTTACACTGCATTATCTTCTCAAAGTGCAAGTAGTCAAAGATATGAGAATGCTGCTTTCACACCGACAACATTTATTAAACGTATTCCTGACAGTAGAGACCTACAAGATAGGACATATCGTGTTCGTTATGTAATTGATAAGAATAAAACTAATCCACTTCCTCGTGATCCACTGTCTGGTTATGTAATGCAACCACTTAATAGTGATGCAACCAGTTATAACCTTAACAGGACATTCTACATTTACGATATTGAAATTGTCCAAGAATATGAGCGAGGCGTTGCTGATGGAATTTACTACCTTACACTCCTTTGTGCATCTATTTCACCTTCAACTTCTAATTTCGACAACAGAAAATTCAGTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACATTTGACAGAGACAACCCTCTTGGTGACCCTGATCCTTCGGTATCCGTCGCTGACAATGAAACTATTGGTCTAGTATATTCTACCGATGGTGCAACACCACCTAACAAAGATCCCAAACTTTCTATTACTAAAGAAGGGATTGAATTCTTATTGGGTGATACTGGTTGGGTGCAACCTGGCACATCTCCAAACTGGGATTCTGTTAATAAAAGGTTGAGTGGTGTGCAACTAACTTCTAGATATGGTGATGAAGAAGTCAGAAAGATTCCTGTCAGAGAAAATGTTGATGGCACCGTTGCACCTGTCCCTGTTGAGTTACGCAGACACTCAATTATGAGATCTGGTAACCATACCTTTGAGTATCTTGGATTCGGTCCTGGTAACTACTCAACTGCATTCCCTCAGACACAAGTAGAGACGCTATCTACAGACCAGATTAAGTTCTCTCAGTCTATTAAAGAGGAAGCAGGAGTTGCATTCTATTCGGGTCTTAACTCTAATGGTGACCTATTCATTGGTAACCAGATTATTAACCCTGTTACAGGTCAAATTACATCTGAAGATATTGCACAACTGAATGTTATTGGTGAAGAAGGCACAACGATTGAAACATTCTCTGAAGTTGTATTGACTGATAAACTCACTGTTATTGGTGGTGCATCTAACCAGTTAGAATCTATTTTCTCTGGTCCTGTTACCTTCCAAAATACAACTACATTTACAGGTAACTTGCAAACTAGTAAGTTTACTTTATTCAATACAGATGGCACTGTTGTTAGACAACAACTCTTAGCACCTTCTACAACAGGAGCAGGTGGATCTAATGCACAACCAGATTTTGCAACTATCGTTGGATATGACACACCATCTACAGGTGACTTAGTTTATAATAGTAATTGGACACCTGGCACATCTCTTGGTTGGATTTATGATGGTGATACTGCATCTTGGAAGCAGTTTGGTCTAACTAACACGGGTGATATTGAAATTCAAACATTCAATACTCGTCAAAATATTGGTATTGGTGAAGCACCAGATTCAACATATCGTGTTAGAATGAATGGTAGCGCCAGAATTGACGGTGACTTGGTTGTTACTGGTCGTGGTGGTGTTGGATCTGATAAATATGTCACTCGCACATATACTGGCGATGGTGTAACACAAACTTTTGCACTTACCACTTATGCAAATGTTTCGCATACTGCAAACTCTTTGTTAGTATTTGTAAACGGTGTTGCACAGATTGGTGGCACTAACTTTAGTGTAGATGGCACAGGTGCAAATATTGTATTTTCAGCAGGTGACGAACCTACTTCGATTGATACAGTTCATATTATCGAGTTGCCCATCTAA
Genbank protein accession
AIX22585.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019063 [NCBI]
CDS location
range 24887 -> 28879
strand +
CDS
ATGGCATTAACACGTCTTAAGAATATTATTACGTCCCGTACGGGGCGTATTATTTACGTTAACCCTGATGATTTCGACGCTTCGGATGCCATTGATAACCGAGGAAACTCTGCACTTAGACCTTTTAAAAGTCTACAGAGAGCATTTCTTGAGGTAGCGAGATTCTCATATCGAGTTGGTTTATCAAATGACGAATTTGATGCCTTCTCGATTATGCTGTATCCAGCAGAATATGTTGTTGATAATAGACCAGGTGAAGTATTATATACTAATGTTGCTCCCATTGACGAGAATTCAAACTTAGATATTACTTCTCCAAACAACGTATTATATAAGTATAATTCTGTTGAAGGTGGTATTATTGTACCTAGAGGTTGCTCTTTAGTTGGCACAGATCTTAGACGCACTAAGATTATTCCTAAGTATGTGCCGTATCCAACCACATATACTGCAAAAGGAATCAATACTGAAGCAGATGTACCACCTCGCACTGCTATCTTTAAGGTAACTGGTGGCACATATTTCTGGCAATTCTCTTTCTTTGATGGTGCTGAAGAAGGTGTATACTTCAAACCTGACAGCACAGAATTAATCTCACCTAAATTCTCTCACCATAGACTCACTTGTTTCCAATTTGCTGATGGTTTGAATAGTCTACAGACATTAATTGACTCAGGCACTGTGCCTGTAGGAAACTATGGTGTGGTTGATGACATTTATGAGCGCACAGATTTAGAGATTTACTATCAAAAAGTATCTAAGGCATTTGCTACTATTCCTGATACATCTGGTGATCCTACAACTGACCAAATTCAGGCAAGAGTAGAAGAAAACAGAATCGTTGGTCCTATTTCTGATGAATATCGAGTCTTACAAATCACTCGTAATGGTAATACTGCAACAGCAGTCACTGTTGATGAATTTGATAACCCAAGAGATCATGGATTCTCTGTAGGTGTTAACATTAATATCAGTGGTGTTACAGGATCTACAGGTCCACAGTCTGAAGTTGACGCAACAGAATATAATGGATCATTTACTGTAACCTCGGCATCAGGTAATGTCTTTACCTATCAGATGTCAGCAACACCAACAGGTAATGCAGTTGGATCAAACATTACTGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCACCATATGCGTTTAACCTGTCACTGAGATCAGTGTGGGGTATGAATGGTATGAGAGCGGATGGTAGTAAAGCAACTGGATTTAAGTCCATGGTTGTTGCTCAATTTACTGGTTTGAGTCTTCAAAAGGATGATAGAGCATTCGTAAGATATAATGCTTCTACTGGCAATTATGATGTTGCAACTGAAGGAGATGGTGCTCACCTAGATGGTTTTGCTGAATACCGTAAGGGTTGGGCACATGAGCATATTACTGCAACAAATGATTCATTTATTCAGGCAGTTTCGGTGTTTGCTGTTGGATATGGCACACACTTTACTACTGAGAGTGGTGCTGACATGTCTATCACCAACTCAAACTCTAACTTCGGTAACACTGCTTTAAGATCTGCTGGTTTCAAAGCAAAATCATTCTCGAAGGATAAAGCGGGTGAAATTACACATATCATTCCACCTAGATCTTTGAATGTTATTTCAACATCAGCAACTGGCACATCTGGCACTAATACAGTTACATTAGCAGATGATGGATCTGTTGAGGGTATTATCGAAGGTATGCTTATCAATAATGAGGATATTCCTCTTGGCACTCAAGTATCTGCTGTTAATACTAGCACCAGAGTAATTACAATGACTGCAAGTAGCACTGATACTGTTACTGGAAATATTATTTTTGGTGAGGAAGTCACTGTAAACTGGGTAAACCTTGATATTCAACGCACAATCAGTATCAATAGTGAATTAGCACAGGCAGGTCAAACACCTGGATCCAGACTTTATCTGTTTGGATATACTGCAGAACCTTCTCCCCCTGCAACAAAGGTTCAGGGTTACGGAATTGGTGCCAGACAAGATGGCACGGGTGCTAATGCTGTAGCAGATAAAATCAATGTGCTACTATATGCTAATTCTAGTGCAACTCAACCTTCAGTTGTTTCTGCTAACGTAGCACCGTATGGTCCTAGTGTATCTGGTTTATCTGCTGGTGTTGACGGATCACCCTTCCAATATGATTCATCAACATATACTATTGGCGGCACTTCTAAAATTGGTGGTTGGTATCTCTCTACAGAAGGTGGATCTAGTAATACAATTTACACTGCATTATCTTCTCAAAGTGCAAGTAGTCAAAGATATGAGAATGCTGCTTTCACACCGACAACATTTATTAAACGTATTCCTGACAGTAGAGACCTACAAGATAGGACATATCGTGTTCGTTATGTAATTGATAAGAATAAAACTAATCCACTTCCTCGTGATCCACTGTCTGGTTATGTAATGCAACCACTTAATAGTGATGCAACCAGTTATAACCTTAACAGGACATTCTACATTTACGATATTGAAATTGTCCAAGAATATGAGCGAGGCGTTGCTGATGGAATTTACTACCTTACACTCCTTTGTGCATCTATTTCACCTTCAACTTCTAATTTCGACAACAGAAAATTCAGTCAAAACGTCAACGAAGTCTATCCTACATTTGACAGAGACAACCCTCTTGGTGACCCTGATCCTTCGGTATCCGTCGCTGACAATGAAACTATTGGTCTAGTATATTCTACCGATGGTGCAACACCACCTAACAAAGATCCCAAACTTTCTATTACTAAAGAAGGGATTGAATTCTTATTGGGTGATACTGGTTGGGTGCAACCTGGCACATCTCCAAACTGGGATTCTGTTAATAAAAGGTTGAGTGGTGTGCAACTAACTTCTAGATATGGTGATGAAGAAGTCAGAAAGATTCCTGTCAGAGAAAATGTTGATGGCACTGTTGCACCTGTCCCTGTTGAGTTACGCAGACACTCAATTATGAGATCTGGTAACCATACCTTTGAGTATCTTGGATTCGGTCCTGGTAACTACTCAACTGCATTCCCTCAGACACAAGTAGAGACGCTATCTACAGACCAGATTAAGTTCTCTCAGTCTATTAAAGAAGAAGCAGGAGTTGCATTCTATTCGGGTCTTAACTCTAATGGTGACCTATTCATTGGTAACCAGATTATTAACCCTGTTACAGGTCAAATTACATCTGAAGATATTGCACAACTGAATGTTATTGGTGAAGAAGGCACAACGATTGAAACATTCTCTGAAGTTGTATTGACTGATAAACTCACTGTTATTGGTGGTGCATCTAACCAGTTAGAATCTATTTTCTCTGGTCCTGTTACCTTCCAAAATACAACTACATTTACAGGTAACTTGCAAACTAGTAAGTTTACTTTATTCAATACAGATGGCACTGTTGTTAGACAACAACTCTTAGCACCTTCTACAACAGGAGCAGGTGGATCTAATGCACAACCAGATTTTGCAACTATCGTTGGATATGACACACCATCTACAGGTGACTTAGTTTATAATAGTAATTGGACACCTGGCACATCTCTTGGTTGGATTTATGATGGTGATACTGCATCTTGGAAGCAGTTTGGTCTAACTAACACGGGTGATATTGAAATTCAAACATTCAATACTCGTCAAAATATTGGTATTGGTGAAGCACCAGATTCAACATATCGTGTTAGAATGAATGGTAGCGCCAGAATTGATGGTGACTTGGTTGTTACTGGTCGTGGTGGTGTTGGATCTGATAAATATGTCACTCGCACATATACTGGCGATGGTGTAACACAAACTTTTGCACTTACCACTTATGCAAATGTTTCGCATACTGCAAACTCTTTGTTAGTATTTGTAAACGGTGTTGCACAGATTGGTGGCACTAACTTTAGTGTAGATGGCACAGGTGCAAATATTGTATTTTCAGCAGGTGATGAACCTACTTCGATTGATACAGTTCATATTATCGAGTTGCCCATCTAA

Genome Context

Tertiary structure

H8ZMD7
ESMFold structure
Source ESMFold
pLDDT 36.1
Oligomeric state monomer
Download structure