Protein

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Genbank accession
AOO12679.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLTRLDNLYSSKTGKYLYVSPDDFNATDELDNRGNSPLRPFKTIQRAFIEVSRYSYLPGANNDRFDQFSIMLMPGNHYIDNRPGLVTETAVEARYFDAGNLLEGNRQEVIDRSVAQVSVQHPDFYYPGDPQTGAWSRFKDAYRLIQKNRDLLIDRATAQIPVDHEDFVYPGDPTVGEWSRYKDAYRLIQKNKDLIAQDAFDLMNANPPSPLPDGYASKCIRDIKILIDSLSLDVHEGGGNKYTRKYIQTYFLDDGTDWVNGSLRGEETQSLVAFAEAARLMKLAITNNYTSTSSPGNEYQDLTVVIGAPNYETDSANDVPNTDPTACSDVQTFIDNLYAIVNTTFSDSDLAANNGNFDLTNVLPAETVSDKISAGHAKCKRDTGFVLDALSLDVHEGGGNRYTRKLLQNYFDSTGNNWVVNGLQGETAESLTAFGQLFTEMKRALTNQLYFKDLTITPGDAIFGNTNSPQENLPSGNPAACADIQTQIDTLGAIVTQIINDENLTNLPDETLSDVISAGLAKCKRDAGIITDGIINDLRTEGNANTITNAKAYFDRFGNPIANGLLGEESESITAFNGIATFAKQAVTNQLFFKDLTISPGPAYANANTPEIPNLASGNAATCVDVQATIDTLIKILTDVIEVGNLDELAAIKVTGVLPSFNYNRALEEWQDNSIVDLANPDNVLYKFNAADGGCIVPRGCSLIGYDLRRTVVRPLYVPDPADTSQPRTSIFNLTGGCYIWQFTIKDGDLSAQSPLYDASAGVGKVYYKKGSTDLAIPEYSHHKICIMEYADSKDLDNYYEKVGKSFQQFQPTIDDGGLEALVQENRIVGPLSDSRTIESIRIDDSATFTGNASNSTILNNVTNAESLEVGYEITSPDVSVVISPNTRIESISGTSVTLNQSISGSGNVSFLASFGYANITIQTKIDHGYFEGQYVAIINSGLSDEINGTWKVTKIDGVNPKIFEYEVYNNTAASLGLVSGQTYLSGEVGGVSTNAVVLAEIDSVESASPYVFNCSIRSTWGQCGMWADGSKATGFKSMVVAQYTGVSLQKDDRAFIRYDALTNTWNQASLTDAFATVPYHTKGDAYWKDDWRNFHIRASDDSFVQCVSVFAVGFFDHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHSVGFKGFSFNQDKGGYITDIVPPEIVSTSNEVINQWYTLDVPASNSRTNHTRLYLAGDDIENPDDRPASSINGYRIGAKSGETLSVDLARYAIEPTGPIEFSQTLEPNGFKSFTVGIETLTPNSANVDNYAQDSANQIEDNKALIQAEGYQYIIAKYPELLTKPNITIGKCERDIGYFVDAVVNDLRIGGNINSIQAAEGYYIAGEVAYIAGELNETIDSLDYVKNIMIAAMRNFDYLVRDAETFSGSAIVNVPSTQGLMIGMRVVEYDPSDFTNGLLNIANTPIYTNIPQNAFIKNIISDTQIELGIPGAKLNQGSTRNATGSVSGAFLYFTLENPAWASISPAVDPTITQDAQLDGNGNPLPECQNIATTIEGYFNEIFLVLNTGYTALGGREVDAYNAIIDNKRFIAAEAVYRIANDAAYAGTKLGQGLLASTGETIQDACVDDVENVLSQIAYNVKFGGNNRIYDAAELYLTGAHVQGEEAESIAVFNLARDLAINAMRQETITVQGNHGLTQTINNQVLPEYDQNGQLVTPPCADVALTISTLTALVTTAINGGSIGNKTLPAFSAVTRVEPTSDLTGLSARATLFTLATGGFGGNPNPHDLETGTPVRLVPRPKVGTNPDKRVIRLPKGFDTNTKYYVIAPGRNLYPENFSISNSVITVTEAAGTSFSTANATRATVAGIYRSLVAQPKIDTDGTALARGTGLRYNLTVNADGSIEFGNAVNNLDGIANGGSRYEIGDIVVISDGQLGGSGAPDLEIEITAVSPAEYPGVFDGTETNKLMLATSPENAAAGIYMYSSETDSVDSEVEIVINRFVLDTKYDLHKYKSNVVGASEIETNVAHIFDVPAPNTTPQIVFVRLADDIQGSTLPQLSGSASSISTQTEYFVRYVSNKRVTLHLTAADAESGDRALTFVSGTGSNFYIYANKRPSPLRFDPTYSTASNQTGLWYLNVADESSNGTANYNRYSILSRFHGGNELANDFQTKTDPTLDTRYTRVEDKREKEERVYRMRYVVPSYLETVRDPLNGFVIKTRTDDKRRLIPQRVLLKPIAGNPNNVASFYNPVGANEQIGLNKDELIADQIRTIDPSVVDLLPEQQNLYDPYLAPKVVEFDSKIAATVQSARKVIPAGESDEFIELTLFDHTIVNQSVKNEIFTVVRTNFLQGGFLQPNATQSNENNKITWETVSGNAASSGSAYLQAWFNDVNTAQITLVLKDVQGDIYYDPAGNVTFTQSNGANVQLTDVPNSFGEISVSPRDKSLRDNYLYRVEGSNVYTICPGDTITDDTGQNTYYVHTIEDQGDFDDCFYIFDIDTLQKRIPNQQDGIYYLTCLRGNISPFPTGSGVGENFRNFKFSQPISQLYPINYKNDPLWFQVDGTTGVRDTSIVDVPQTFSAADNYVHGLVTVNDAKGSETKEMVEDIIRNTALDQYSYTNSTTDSSSGDIIDNRIQAQEGNATSGSEDRLIPISGDSQFPTERKLYIELRRPSIARSGNHTFEYLGFGPGNYSTGFPLRQEVVLTDKQDFYAQAKREDGGIVFYTGLNSNGDLYIGNKKVNAITGEETFLESAALVDSEDEDEDIGTLVTTFDSPVTFNSTITVAGKSTLNAPVEINVEANEGDALRVFSNIGAGDDPTLFNGSWRTQSDGDVVISKNQIKAAVFYLNARPKPGAQYGQSYTWRTNYLAGEPSNIVPWQETNYFYASQTVSYGGNDPEAGDIIYKGSSIGQSGSIGWILTNQFKSAETSVQTITADGTQNLTITWIATETNDSIGIKGNSTIRISNFSNPVVNGTWEIVGWDETTSPGQQTLKFRISTPIENGTIYNWADQNTGADLQFSVSNWKETGVLGAETLRTYTEQRGDFRLGINTVSRAAHSAVLTANVDDFTTPRATLDVVGTTFISGKTLVEYNAAGDVSDNRYDDNNLNSDQREGLNGAPLLTQGFIPQDNALLVGGDSNDLEQRATLRVATTDAATVDQGIGYQTGGRLGINTTLGLQARDELDRNLVVVGDGRITGNMLLEQDISVDGGDINTTSETFNLINNNANIINFAGDAQLIDMFSNTTNDQTITIGSNANFQTVRIGNNSGRSIFSVHALSANALVDIASVADDATNASQVFIGGAWANTDSKVALGSAQTLAAGNLEIGYKVAAGTGVSRIFTQTGKARLFDDDRTQVIEAFTKANDITIASLGGSTTIRNSLKVQASATVDSNIILDGGTTAGIIEIVRARFSTPLNLHNLGSLDVPNLDFYKYSTTGRFLDTEGNRFWGGSQDQSGGGRIGAFDNLQAAPDPLRVSGQYTFRFADGGTGSGAAFDVGVAFDGTVTVELVAAGSGYADNQTLTIRDNQLGGGGAPDITFDINGVTDASEVFILPITTPAASDFDIGDLILLDRGNAASPDEVTPAGGTSVINLRDQQYSEIMRVVGLDNLTNPNDPQGFRLSVTRAQEGTGDPATGDGWTNHPDGCVIAKLDKQPAASYITGKDVGSFADPNVPDGILDEPRAGIDGTSGNVRIGVAEFGGVLTTLDLLRIDQSEIVAIADVVSTDIQSLIVTDGGDPAVTNFKVESTTGNTVIAGNVGIGLGFNQFTIAGGSGNTNIAGTLTVEDTITLNGSTIPSTEFFTITNGGPSFEDDGVTVITPLRTTFQVDSATGNLLMNGGNINIFGVDGTTPRLTFNNSSGDFTTYGSFSALGDGMSSFGGPVTMAGDLTVNGGDLTVNQNGVEVFAVDDDGSLNIGGISNYFSSTGGRKWVVSNTNIINAEANVNYFVDISGTALFKLPANAQMGDMIRIIDIGGILSYDKSLVVRAPNLVRIQGSVSNTGTTVTGNTLGENFSLTHDGGELVVQTPNAAFGLVFAGTSDADGGPGANPNKAGWYLMDV
Physico‐chemical
properties
protein length:4017 AA
molecular weight: 432851,96140 Da
isoelectric point:4,43176
aromaticity:0,08713
hydropathy:-0,25803

Domains

Domains [InterPro]
IPR009050
1271–1381
IPR009050
AOO12679.1
1 4017
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM44
[NCBI] 		1278485 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO12679.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349296.1 [NCBI]
CDS location
range 22255 -> 34308
strand +
CDS
ATGCCGCTAACAAGACTTGATAATCTGTATTCAAGTAAGACTGGTAAGTATCTTTACGTATCACCAGATGACTTTAATGCAACTGATGAACTAGACAATAGAGGTAACTCACCTTTACGTCCATTCAAGACAATCCAGAGGGCATTTATTGAAGTATCGAGATATTCATATCTCCCTGGTGCCAACAACGACAGATTCGACCAGTTCAGCATCATGCTGATGCCTGGTAATCACTATATTGATAACCGTCCTGGTCTTGTAACAGAGACTGCTGTTGAGGCACGTTATTTTGATGCTGGAAATCTTCTTGAGGGTAACCGTCAGGAAGTTATCGATCGTTCTGTAGCACAAGTATCTGTTCAGCATCCTGATTTCTATTATCCTGGTGATCCTCAGACTGGTGCATGGTCTCGCTTCAAAGATGCATACCGTCTGATTCAGAAGAACAGAGATCTTCTGATCGATAGAGCAACAGCACAGATTCCTGTTGATCATGAAGATTTCGTTTATCCTGGTGACCCAACTGTAGGTGAGTGGTCACGTTATAAGGATGCATATCGTCTAATCCAAAAAAATAAAGATCTTATTGCACAAGATGCGTTCGATTTGATGAACGCAAATCCACCATCTCCTCTACCTGATGGTTATGCTAGTAAGTGTATTCGTGACATCAAGATCCTGATTGATTCACTTTCTCTTGATGTTCATGAAGGTGGTGGTAACAAATATACTAGAAAGTATATCCAAACTTATTTCCTTGATGATGGCACAGATTGGGTAAATGGTAGTCTTCGTGGTGAAGAGACTCAATCTTTAGTTGCATTTGCTGAAGCAGCTAGATTAATGAAGTTGGCAATCACCAACAACTACACTTCCACATCTTCTCCTGGTAACGAGTATCAGGATCTGACAGTTGTTATCGGTGCTCCTAACTATGAGACCGATTCTGCAAACGACGTTCCTAACACCGATCCTACAGCATGTTCTGACGTTCAGACTTTCATTGATAACCTGTATGCAATCGTAAACACTACCTTTAGTGATTCTGACCTTGCTGCAAATAATGGTAACTTTGATCTAACTAATGTTCTCCCTGCTGAAACTGTATCTGATAAGATCTCTGCAGGTCATGCTAAGTGTAAGCGTGACACAGGATTTGTTCTAGATGCACTTTCACTAGACGTTCATGAAGGTGGTGGTAACCGCTACACCAGAAAACTACTCCAGAACTATTTCGACTCTACAGGTAACAACTGGGTAGTCAATGGTTTACAAGGAGAAACTGCAGAATCTCTAACTGCATTTGGTCAACTCTTCACTGAGATGAAGAGAGCACTTACAAACCAACTGTATTTTAAAGATTTAACAATCACCCCTGGTGATGCAATCTTTGGTAACACCAACAGTCCACAGGAGAATCTACCTTCTGGTAACCCTGCTGCGTGTGCTGACATTCAAACCCAGATTGATACTCTAGGTGCAATCGTTACGCAAATCATTAACGATGAGAACCTAACCAATTTGCCTGACGAAACTCTATCTGATGTTATCTCTGCTGGTCTTGCTAAGTGTAAGCGTGATGCTGGTATCATTACTGATGGCATCATCAATGACCTTCGCACAGAAGGTAATGCAAACACGATTACTAATGCAAAAGCATACTTCGATCGCTTCGGCAATCCTATTGCTAATGGTCTTCTGGGTGAAGAATCAGAATCTATCACTGCATTCAACGGCATTGCAACATTTGCTAAGCAAGCAGTTACTAACCAACTGTTCTTTAAGGATCTGACTATCTCTCCTGGTCCTGCATATGCCAATGCAAATACACCTGAGATTCCAAATCTAGCATCAGGTAATGCTGCTACTTGTGTAGATGTTCAGGCAACAATTGATACTCTCATCAAAATTCTGACTGATGTTATCGAAGTTGGTAATTTAGATGAATTAGCAGCAATCAAAGTTACGGGTGTTCTTCCTTCCTTTAACTACAATAGAGCACTAGAAGAGTGGCAGGATAACTCTATTGTTGATCTAGCAAACCCTGACAACGTTCTTTACAAATTCAATGCTGCTGATGGTGGTTGTATTGTTCCTAGAGGTTGTTCACTGATTGGTTACGACCTGAGAAGAACAGTTGTTCGTCCTCTGTATGTTCCTGATCCTGCTGATACTTCGCAACCAAGAACTTCTATCTTTAACCTGACTGGTGGTTGTTACATCTGGCAGTTCACTATTAAAGATGGTGACCTATCTGCACAATCTCCTCTATATGATGCCTCTGCTGGTGTTGGTAAAGTTTACTATAAGAAAGGTTCAACTGATCTTGCAATTCCTGAGTATTCTCACCACAAGATCTGCATCATGGAGTATGCAGATTCTAAAGATCTTGACAACTACTATGAAAAAGTAGGAAAATCATTCCAACAGTTCCAACCAACTATCGATGATGGTGGACTGGAAGCACTGGTTCAGGAAAACAGAATCGTTGGTCCTCTGTCTGACAGCAGAACTATCGAAAGTATCAGAATTGATGACTCTGCAACCTTCACTGGTAATGCATCTAACAGCACAATTCTGAATAATGTTACTAATGCTGAGAGTCTTGAAGTTGGATATGAGATTACATCACCTGATGTCAGTGTTGTTATCTCTCCAAACACTAGAATTGAGAGCATCTCTGGCACTTCAGTTACGCTGAACCAATCGATTTCAGGATCTGGTAATGTATCATTCCTTGCATCCTTTGGTTATGCTAACATCACAATTCAGACAAAAATTGATCATGGATACTTTGAAGGTCAGTATGTTGCTATCATCAACTCTGGACTATCTGATGAAATTAATGGAACCTGGAAGGTTACCAAGATTGATGGCGTAAATCCCAAAATCTTTGAGTATGAAGTATACAATAATACTGCAGCATCCCTTGGATTGGTATCTGGACAGACCTATCTGTCAGGTGAAGTCGGTGGAGTTAGCACAAACGCGGTAGTTCTTGCGGAAATTGACTCTGTTGAGTCCGCATCTCCGTATGTTTTCAACTGCTCGATTCGTTCTACCTGGGGTCAGTGCGGCATGTGGGCGGATGGATCCAAGGCCACTGGATTCAAGTCAATGGTCGTGGCTCAATATACTGGAGTTTCACTTCAGAAAGATGATAGAGCATTCATCCGTTATGATGCACTAACTAATACTTGGAACCAAGCATCACTTACTGACGCATTTGCTACTGTTCCTTATCATACCAAAGGTGATGCATACTGGAAAGATGACTGGAGAAACTTCCACATCCGTGCTTCGGATGACTCTTTCGTTCAGTGCGTCTCGGTCTTCGCTGTTGGTTTCTTCGATCACTTCCTGATGGAAAGTGGTGGAGATATGTCCATCACGAACTCCAACTCTAACTTCGGTAATACATCACTTCACTCTGTTGGTTTCAAAGGATTCTCCTTTAACCAAGATAAGGGTGGTTACATCACTGACATTGTTCCTCCCGAGATTGTATCTACAAGCAACGAAGTTATTAACCAATGGTATACTCTAGATGTTCCTGCATCTAACTCAAGAACTAACCACACCAGACTGTATCTTGCTGGTGATGATATTGAAAATCCAGATGATCGTCCAGCATCTTCTATCAATGGATACAGAATTGGTGCTAAGTCTGGTGAAACTCTATCTGTTGACCTTGCACGTTATGCAATTGAACCAACTGGTCCTATTGAGTTCTCTCAGACTTTGGAACCAAATGGATTCAAATCCTTTACAGTTGGTATCGAGACACTGACACCTAACAGTGCAAACGTTGACAACTATGCACAGGATTCTGCTAATCAGATTGAAGATAACAAGGCACTAATTCAAGCAGAAGGTTATCAGTATATCATTGCTAAGTATCCTGAGCTACTCACCAAACCAAACATCACGATTGGTAAGTGCGAAAGAGACATCGGATATTTTGTTGATGCTGTTGTCAATGACTTGAGAATTGGTGGTAACATCAACTCTATTCAAGCAGCAGAAGGTTATTACATCGCTGGCGAAGTTGCATACATTGCTGGTGAACTAAACGAAACGATTGATTCTCTTGATTATGTCAAGAACATCATGATCGCAGCAATGCGTAACTTTGATTATCTGGTTAGAGATGCTGAGACATTTAGCGGTTCTGCAATTGTCAATGTTCCCTCTACTCAGGGTCTGATGATTGGTATGAGAGTTGTTGAGTATGATCCTAGCGATTTTACCAACGGTCTTCTCAACATTGCCAACACACCAATCTACACCAACATTCCTCAGAATGCATTCATTAAGAACATCATTAGTGATACTCAGATTGAACTTGGTATCCCTGGTGCTAAACTAAATCAAGGTTCTACTAGAAACGCTACTGGTAGTGTTAGTGGTGCATTCCTCTACTTTACTCTAGAGAATCCTGCATGGGCAAGTATCTCACCTGCTGTTGATCCTACGATCACTCAGGATGCTCAACTTGATGGTAATGGTAATCCTTTACCTGAGTGTCAGAACATTGCAACCACAATCGAAGGTTACTTCAATGAAATCTTCCTGGTTCTGAACACTGGTTACACTGCACTTGGTGGTAGAGAAGTTGATGCATACAATGCTATCATCGATAACAAGCGTTTCATTGCTGCAGAAGCAGTTTACAGAATTGCTAACGATGCTGCATATGCTGGCACTAAACTGGGTCAAGGTCTACTAGCATCGACTGGTGAGACCATTCAGGATGCTTGTGTAGACGACGTTGAGAACGTTCTTAGTCAGATTGCTTACAACGTCAAGTTTGGCGGCAACAACAGAATCTACGACGCAGCAGAACTGTATCTGACTGGTGCTCATGTTCAAGGTGAAGAAGCAGAATCTATTGCTGTATTCAACTTGGCAAGAGACTTGGCAATCAATGCAATGCGCCAGGAAACAATTACAGTTCAAGGTAATCATGGTTTAACTCAGACAATTAATAATCAAGTTCT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Tertiary structure

No tertiary structures available.