Protein

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Genbank accession
XAO16659.1 [GenBank]
Protein name
L-shaped tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,86
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLGIAKGGQVDGDVTINGKLTLNGAYVQTLAGINTTGGINSGAAISATTYYARSGSFYARAPDANANTHIWFENNNGIERGVIWAVPNTSDLGQVKIRAKTTGGVFAGEYSFRSDGQFEVPVAVKIGGAAMLTKDGNITSGSLFGGNLNNYLNTIKNDIVTGDNKKVSKTGDTMSGNLTINANLKVENSNGTFVDLGSENSDKNSRLTLARKIGDGAGVAMLKVTPEGNVQFGYQPTVATPSPTKYILIKSNGLEVEGDLVFKQTYRGVEEAVDITNQTIDLNSLIIRGSDLGTRKLYKCRSSGGGSNILNKPTSDGNFTLEVLSLRKVSDTDWSCKQTFTTKNNNVVGVYVRYGQVGSWTEWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQTVTFGNLVTNNLNANGQVKIGRTGDALRIWNAEYGAIFRRSETALHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSIGLNNGMVQMRHSVELGDDGAGGNMITVDNDSKNVVITSNARLSPNFRMQLGQASYIDAECTTSVRPAGAGSFASQNNENVRAPLYMNIDRTDNSTYVPILKQRYVQGNSCYSLGTLINNGDFRLHYHEGGDGSSTGAVIKDISWEFKRNGDFYSPGRLRTANVYIGTDGNITGGSGNFANLNTTLNRKVNVGGWAGSSYGGWYKFATVTIPQGTGTVTFKISGGAGFNFKRYSQASIAEIVLRTGNNNPKGINAVLWNRSDLSFNQIATMNTSGDTYDVYVFCDGYTNALVVEYSCSENSSVTVVGLNGGIQPAVDALPEGHVVGKTVRLLNNIGGTFAAGESDIVTRGEYVTDNQKGMRIKSNGNNIGSNAAILRNDGRSFYILATDKNTAEKSDAANGDWNSLRPFTISMTTGEVSMNNGITVRNYATFYNDIVLKDNGYIHFNKSGNNPRNMSIFHAGDATRGNRIEIADDSSYLVYFQRLPGGANQCTFNSAALSGITQTNSFGVNTSNALGGNSITFGDNDTGIKQNGDGLLDIYTNSVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1179 AA
molecular weight: 126187,07790 Da
isoelectric point:8,12400
aromaticity:0,07803
hydropathy:-0,32494

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
327–414
cd19958 IPR030392
IPR030392
1081–1138
IPR030392 Coil
XAO16659.1
1 1179
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage FL12
[NCBI] 		3128053 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XAO16659.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP400786.1 [NCBI]
CDS location
range 85938 -> 89477
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGATCTAGGTATTGCTAAAGGCGGCCAGGTTGATGGTGATGTGACTATCAATGGTAAATTAACATTAAATGGCGCGTATGTTCAGACGCTGGCTGGTATTAATACCACGGGTGGTATTAATTCTGGGGCCGCTATAAGTGCAACAACTTATTATGCTCGGTCTGGTTCTTTTTATGCTCGTGCTCCAGATGCCAATGCGAATACACATATTTGGTTTGAAAATAACAATGGTATAGAACGTGGTGTGATTTGGGCTGTTCCGAACACTTCAGACCTTGGCCAGGTCAAAATTCGTGCAAAAACTACAGGTGGTGTTTTTGCCGGCGAGTACAGTTTCCGCTCTGATGGCCAATTTGAGGTTCCTGTAGCAGTTAAAATCGGCGGGGCCGCGATGCTAACCAAAGACGGTAACATTACATCGGGTTCATTGTTTGGTGGTAATCTTAATAACTATTTGAATACCATTAAAAATGACATTGTTACTGGTGATAATAAGAAAGTGAGTAAAACCGGTGACACGATGTCCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACTCTAACGGAACGTTTGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCTGATAAGAATAGCAGATTAACTCTTGCTCGTAAAATTGGCGATGGCGCTGGTGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGAAACGTGCAATTTGGTTATCAACCTACAGTTGCTACTCCATCTCCTACCAAGTATATTCTAATTAAATCTAACGGTCTTGAAGTAGAAGGGGATTTAGTTTTTAAGCAAACTTACCGTGGTGTTGAAGAAGCAGTTGATATTACTAATCAGACTATTGACCTTAATAGCCTTATTATTAGAGGATCAGATTTAGGTACTCGTAAGCTGTATAAATGCAGATCATCTGGAGGTGGTTCTAATATATTGAACAAACCTACATCTGATGGCAACTTTACTCTTGAAGTTCTGTCTTTACGCAAGGTTTCTGATACCGATTGGTCATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAACAATAATGTTGTAGGCGTATATGTTCGCTACGGGCAAGTCGGCTCATGGACTGAGTGGAAAGAGGTTGTTGCTGGTGTTCAACCAATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCCCGTAATAACCTTGGTGTTGGTGAAGGCCAAACTGTAACATTCGGTAATTTAGTTACCAACAATTTAAATGCAAACGGACAAGTTAAAATCGGCAGGACCGGCGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGCTCAGAAACAGCATTACATATTATCCCGACTCCTAAAGACGCCGGTGAAAGCGGTGGAATAAGTAATCTTCGTCCATTAAGTATCGGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCTGTTGAGTTAGGCGATGATGGAGCTGGCGGTAATATGATTACTGTTGATAATGATAGTAAAAATGTTGTGATAACTTCTAATGCCAGATTAAGCCCTAATTTCCGCATGCAATTAGGGCAGGCGTCGTACATTGATGCCGAATGCACTACCTCTGTTCGCCCTGCTGGAGCTGGTTCATTTGCTTCACAGAATAATGAAAACGTTCGTGCCCCGCTCTATATGAATATTGATAGGACTGATAATAGTACTTATGTTCCTATTTTAAAACAACGTTATGTTCAAGGAAATAGCTGTTATTCTTTAGGTACTTTAATAAATAACGGTGATTTTCGTTTACATTACCATGAAGGCGGCGACGGTTCTTCGACAGGTGCAGTTATAAAAGATATTTCCTGGGAATTTAAACGTAATGGTGATTTCTATTCTCCGGGGCGTTTGCGCACTGCAAACGTTTATATCGGAACTGATGGTAACATTACAGGTGGTTCTGGTAATTTTGCCAACTTAAATACCACGTTAAACCGTAAAGTTAATGTTGGCGGTTGGGCTGGTAGTTCTTATGGTGGATGGTACAAATTTGCTACGGTAACAATTCCTCAAGGTACTGGTACAGTAACTTTTAAGATTTCTGGTGGTGCTGGTTTTAATTTTAAAAGATATAGCCAAGCTTCTATTGCTGAGATAGTTCTTCGCACAGGTAATAATAATCCTAAAGGCATAAACGCTGTACTATGGAACAGGTCAGACCTAAGTTTTAATCAGATAGCTACTATGAATACATCTGGTGATACTTATGATGTATACGTGTTCTGTGACGGTTATACAAATGCATTAGTGGTTGAATATTCTTGTAGTGAAAACTCTTCGGTAACTGTAGTCGGTCTTAACGGAGGCATTCAACCGGCTGTTGATGCATTGCCTGAGGGACATGTTGTAGGTAAAACAGTTCGTCTGTTAAATAATATTGGCGGAACTTTCGCAGCCGGCGAATCTGACATTGTTACTCGTGGTGAATACGTTACTGATAATCAAAAAGGCATGCGTATTAAATCTAACGGTAATAATATCGGTTCTAATGCTGCTATACTTCGAAATGACGGCAGAAGTTTTTATATTTTAGCTACAGATAAAAATACAGCAGAAAAATCCGATGCAGCTAATGGTGATTGGAACTCATTGCGTCCTTTTACAATAAGCATGACTACCGGTGAAGTATCAATGAATAACGGCATAACTGTTCGTAACTATGCCACATTCTATAATGATATTGTTCTCAAAGATAATGGTTATATTCACTTTAATAAGTCTGGCAATAATCCAAGAAACATGAGTATATTCCATGCCGGAGATGCCACACGTGGTAACCGTATTGAAATTGCTGATGATTCAAGTTATTTAGTTTATTTTCAACGTTTACCGGGCGGCGCTAACCAGTGTACATTTAACTCTGCTGCTCTTTCTGGTATAACGCAGACTAACTCTTTTGGTGTCAATACATCAAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAACGTTTGGTGATAATGACACTGGTATTAAGCAAAATGGTGATGGATTATTAGACATATATACGAACAGCGTACAAGTGTTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATACAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTTAAACCTATCGAAAATGCACTCGATAAAGTTGAAAAACTTAACGGTGTCATTTACGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGACAGTAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Tertiary structure

PDB ID
25e1e198a869e2e0546e906c589f78a71e2b264708624a4c147357ebc7cd27e6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5751
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Gp38 adhesins of Straboviridae phages target specific extracellular receptor loops Lutz,V.T., De Sousa,V.K., Taylor,N.M.I., Nugen,S.R., Gambino,M. and Brondsted,L. 2025-04-25 — GenBank