Protein

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Genbank accession
AIX17900.1 [GenBank]
Protein name
putative short tail fiber
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,59
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSIQRAFLEVARFSYRVGLSNDEFDAFSIMLYPAEYIVDNRPGEVLYTNVAPIDENSNLDLTSPNNVLHKFNSVEGGIIVPRGCSLVGTDLRRTKIIPKYVPYPTVAGSLGITDEIQVPPRTAVFKVTGGTYFWQFSFFDGAEEGVYYKPDSTDTLAPKYSHHRLTCFEFADGLNPLSTLIASGTVPNQDYSAVANITQRTDLEIYYQKVSKAFASIPDTSGDPAADQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGNTATAVTVDEFDNPRDHGFSVGVNINISGVTGSTGTQSELDAGVYNGSYTVTSASGNIFTYQMTSEPTGNAVGTNITVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMHADGSKATGFKSMVVAQFTGLSLQKDDRAFVRYNESTGNYDVASAGDGAHLDGFAEYRRGWAHEHIKCSNDSFIQAVSVFAVGYGTHFTAESGADMSITNSNSNFGNTALRAAGFKAKSFSKDKAGEITHIIPPKALSTISTSATGVDGESTITLTNDGSVNGVIQGMQVSGSNIGSGALVTSINTNTRVITLSVPNADTVNGNIIFGEETSVNWVNIDIQRTKVVNQSLSGSGGTPGTRLYLYGYTTEASPPATKVQGYAIGSRQDGTGASAVADKINCLLVSQGAAEATIKNASISPYGPSVSGLSAGVTGSPIQFDSNTYTIGGVSGVVGGWYLSVSSTENSIYTTLSTNTTYNNVNFTPTTFIKRIADARDLQDRTFRIRLKIDKDKTNPLPRDPLSGYVMQPLNSDTTTYNLDKTFYIYDIEKTQEFERGVTDGIYYITLLCASIAPTTSNFNNRKFSQNVNEVYPTFDRDNPVADPDASVSVADNETIGLVYATDGASPTPNKDPKRSITKEGIEFLLTDNGWTQPGTTPNYDSVNKRLSNVELTARSGDEESRKINIRENNDGTVAPIPVEFRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLSTDQIKFSQSIKEEAGVAFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVVGEENTTIETFSELVLTDKLTVVGGASNQLESIFSGPVTFAGQVSSTNNITAKKITYNNQDGTIIKQTLLAPEDANGFPDFTNITGYDTPSDGDLVYNTNWSPGKSLGWIYYAGDWKEFGLTDTKQINIATHNDSNGDPQQHMGLGIATSADHRLNVLGNVKIDGNLLTTGTGGIAADKYITRTYRAGDTDEPNGTRTIFPITTYTGGVKHTASSLLIMLNGVVQVGGTETEVNTDSAASYYVDSNGQNVVFGSTVGDAPLSTDVLHIIELPI
Physico‐chemical
properties
protein length:1343 AA
molecular weight: 144521,87750 Da
isoelectric point:4,81571
aromaticity:0,08786
hydropathy:-0,30886

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014b
[NCBI] 		1493508 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX17900.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019043 [NCBI]
CDS location
range 24300 -> 28331
strand +
CDS
ATGGCTCTTACTAGACTAAAGAATATTATTACGTCCAGAACTGGACGTATTATCTATGTTAACCCCGACGATTTCGATGCATCCGATGCTATCGATAATAGGGGAAACTCAGCGTTACGACCCTTTAAGTCTATTCAAAGAGCGTTTCTTGAGGTAGCGAGATTCTCGTATCGTGTTGGTTTATCAAATGACGAATTTGATGCCTTCTCGATTATGCTGTATCCAGCAGAATATATTGTTGACAACAGACCTGGTGAAGTTTTATATACAAACGTTGCTCCCATTGATGAGAACTCAAACTTAGATTTGACTTCTCCAAACAATGTTCTACATAAATTTAATTCGGTAGAAGGTGGTATCATTGTTCCTAGAGGTTGTTCCCTCGTTGGTACTGATCTTCGCCGTACAAAAATTATTCCTAAGTATGTTCCATATCCTACAGTAGCAGGTAGTCTTGGAATTACCGATGAAATTCAAGTTCCTCCTCGTACTGCTGTCTTTAAGGTAACTGGTGGTACTTACTTCTGGCAATTCTCATTCTTTGATGGTGCTGAAGAGGGTGTATATTACAAACCTGATAGCACTGATACTCTCGCACCTAAGTATTCTCATCACAGACTTACATGCTTTGAGTTTGCTGATGGTCTCAATCCTTTATCAACTCTTATTGCTAGTGGTACTGTTCCTAATCAGGACTATTCTGCCGTTGCAAATATCACTCAGAGGACAGACTTAGAGATTTATTATCAGAAAGTTTCTAAAGCATTTGCATCAATTCCTGATACATCGGGAGATCCTGCTGCCGACCAAATTCAGGCAAGAGTAGAAGAGAATAGAATTGTTGGTCCTATTTCGGATGAATATAGAGTCCTTCAAATCACTCGTAATGGTAATACTGCAACCGCAGTTACTGTTGATGAATTTGATAATCCTAGAGACCATGGTTTCTCGGTTGGTGTTAACATTAATATTTCTGGAGTTACTGGATCTACTGGAACTCAATCAGAACTAGATGCTGGTGTATACAATGGTTCTTATACTGTAACTTCTGCATCTGGCAATATTTTTACATATCAGATGACATCTGAACCAACTGGTAATGCTGTTGGTACTAACATCACTGTTAAGACTGAGATTGATACTGTTGACTCTGCATCACCATATGCGTTTAACTTGTCACTGAGAAGTGTCTGGGGCATGAATGGTATGCACGCCGATGGATCTAAGGCAACTGGATTTAAGTCCATGGTTGTAGCTCAATTCACGGGATTGTCCCTGCAAAAAGATGATAGAGCATTCGTAAGATATAATGAATCTACTGGTAATTATGATGTTGCTTCTGCTGGTGATGGTGCTCACTTAGATGGTTTTGCTGAATATAGAAGAGGATGGGCACACGAGCATATTAAGTGCTCTAATGACTCCTTCATTCAAGCAGTTTCTGTGTTCGCTGTTGGATATGGCACACATTTCACTGCTGAGAGTGGTGCTGACATGTCTATTACCAACTCAAACTCTAACTTTGGTAACACTGCTCTTCGTGCTGCTGGTTTCAAAGCAAAATCATTCTCAAAAGATAAAGCAGGCGAAATCACACACATCATCCCACCAAAAGCACTTTCAACCATTTCTACATCTGCAACAGGAGTTGATGGGGAAAGCACGATCACACTTACTAATGATGGTTCTGTGAATGGTGTTATTCAAGGTATGCAAGTTAGTGGTAGTAATATTGGTTCTGGTGCTCTTGTAACCTCAATTAACACCAATACTAGAGTTATTACACTATCTGTTCCTAATGCTGATACTGTGAATGGTAATATCATTTTTGGAGAAGAAACTTCAGTTAACTGGGTAAACATTGATATCCAAAGAACTAAAGTAGTTAACCAATCTTTATCTGGTTCTGGTGGTACTCCTGGTACTAGATTGTATCTTTATGGGTATACTACTGAAGCATCCCCTCCAGCAACAAAAGTTCAGGGTTATGCAATTGGTTCTAGACAAGATGGAACAGGTGCTTCTGCTGTTGCGGATAAAATTAACTGCTTACTTGTATCTCAGGGAGCAGCAGAAGCAACAATTAAGAATGCTTCTATTTCGCCATACGGTCCTTCTGTATCTGGTCTTTCTGCTGGTGTAACTGGTTCTCCAATACAATTTGATAGCAATACCTATACAATTGGAGGTGTTTCTGGAGTCGTTGGTGGTTGGTATCTCTCTGTAAGTTCTACAGAAAACTCTATCTACACAACCCTATCTACAAATACTACATACAACAACGTAAACTTTACTCCTACAACTTTTATTAAGAGAATTGCTGACGCAAGAGACTTGCAGGATAGAACTTTCCGTATTCGTCTTAAGATTGATAAGGATAAGACTAATCCTCTTCCTCGCGATCCTCTCTCTGGTTATGTCATGCAACCTTTGAATAGTGATACAACAACGTATAATCTAGATAAAACATTCTATATTTACGATATCGAAAAAACTCAAGAGTTTGAACGAGGTGTTACAGATGGAATCTACTACATTACCCTGCTATGTGCATCTATTGCACCTACAACTTCTAACTTCAACAACAGGAAGTTCTCTCAAAACGTCAACGAAGTGTATCCTACGTTTGACAGAGACAACCCTGTTGCTGACCCTGATGCTTCGGTATCCGTCGCTGACAATGAAACTATCGGTTTAGTATATGCTACTGATGGTGCATCACCTACACCTAATAAAGATCCTAAGCGTTCTATTACTAAAGAAGGAATCGAATTCCTTTTGACTGACAATGGTTGGACACAACCAGGCACAACTCCAAACTATGATTCTGTAAATAAGAGACTGTCTAATGTTGAATTAACAGCACGTTCTGGTGATGAAGAATCCAGAAAAATTAATATTCGTGAAAATAATGATGGAACAGTTGCTCCAATTCCAGTTGAGTTCAGAAGACACTCAATCCTTCGCTCAGGTAACCATACCTTTGAGTATCTTGGATTCGGTCCTGGTAACTACTCAACTGCATTCCCTCAGACTCAAGTAGAGACGCTATCTACAGACCAGATTAAGTTCTCTCAGTCTATTAAAGAAGAAGCAGGTGTTGCATTCTACTCAGGTCTTAACTCTAATGGTGACCTATTCATTGGTAACCAGGTAATCAACCCTGTTACGGGACAGATTACGAACGAAGATATTGCACAACTTAATGTTGTTGGTGAAGAGAATACAACGATTGAAACATTCTCTGAGTTGGTGTTGACTGATAAACTTACTGTTGTTGGTGGTGCATCTAACCAGTTAGAATCTATTTTCTCTGGTCCTGTTACTTTTGCTGGTCAAGTTTCTTCTACTAATAATATTACTGCTAAGAAGATTACTTATAATAACCAAGATGGTACGATCATCAAACAAACTCTACTTGCACCCGAAGATGCAAATGGATTCCCTGATTTCACCAACATTACTGGGTATGATACACCTTCTGATGGAGACTTAGTTTATAATACAAACTGGTCTCCTGGTAAGTCTCTTGGTTGGATTTATTATGCTGGAGATTGGAAAGAATTTGGTTTAACTGATACAAAACAAATTAACATTGCAACTCATAATGATTCAAATGGAGACCCTCAACAACATATGGGTCTTGGTATTGCAACTAGTGCAGATCATAGACTAAATGTTCTTGGTAATGTAAAAATTGATGGTAATTTACTTACCACAGGCACTGGTGGTATTGCTGCTGATAAGTACATCACAAGAACTTATCGTGCGGGTGATACCGATGAACCTAACGGTACTAGAACTATCTTCCCAATTACAACTTATACTGGTGGTGTTAAGCACACTGCAAGTTCTCTTCTTATTATGTTGAATGGTGTCGTACAAGTGGGTGGAACAGAAACTGAAGTAAATACAGATAGCGCAGCAAGTTACTATGTTGATAGTAATGGTCAAAACGTTGTGTTTGGTAGCACTGTTGGGGATGCTCCGTTATCTACTGACGTTCTTCATATTATTGAATTGCCTATCTAA

Tertiary structure

PDB ID
a846b669ac6e39a1e5b1bfa83d352b09c59f5c84a3b8877bd390e8bfbc2a5d96
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3854
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank