Protein
View in Explore- Genbank accession
- XPN41337.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MSTTITNLPETSKVNGSDYLVLDQPDKTVKSTVSNFLTDTGVVLATQLKDTDGADLIQSSNGNTVQEELNNNLLNDREQWRRSLAEAGLTLVNGSFEEGATVNNKTDAVWHIAGGQCYTWDGEFPKTVPAGSTPGTSGGIGTGAWLSVGDATLRTELLSVNGAVIQSFNSVSDMKSYNITAGRTYHTKGYWAEGDGGGALYYVTTPSGDEPNGYSDHKSENGLYIRLLSEPTDLNHGVKISDIYDPETARWNRNAIQTMLRDTRWSYTECKAQGVIYLLGSVNVGRDNITFKINKGCSLKGRYSDPSISTPDQGGHMIGFAKFFDPDNGDFIPWRDGDTRINPYIENVHVILEGDVSTEFNDSHINKYNNNCIGFLKAKNCSIRGTGGSSSSDHRAFNFDGIDTNAPNGSENRGGSINCHIDVGYSYNCVDNPCMIAADQFTASSCSIKIGDVRKMVAGGYNSPIVINVSGISHFDINIGRFLVDGGVTPALVVARGARSVNVTGGVIQGCTMGVYSVDTLDISLNIKEMFNVPIGVAVANNSTIGPRSIIIRGINAVNSSFSAAYAHQASALPAAYVEIADNNFSAASSSFKFIGGKTSGNTPKRQNIHDNVTSSTGDGGQDLNYLPGTQKNIIGGSSTTSLSVNFKDGNWNFTKATVVAGQGGGRGIATIDLLAKGVSSNSMVIRAGAYDVTVAMPANGNTLTVSVVSPNFIDYVTLHN
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 721 AA molecular weight: 76687,09190 Da isoelectric point: 5,36113 aromaticity: 0,07906 hydropathy: -0,26033
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage EC.P2 [NCBI] |
3384876 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPN41337.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ631072.1
[NCBI]
CDS location
range 91814 -> 93979
strand +
strand +
CDS
ATGTCAACTACAATTACTAATTTACCCGAAACATCAAAAGTTAATGGTTCAGATTACCTGGTTTTAGATCAACCTGATAAAACTGTTAAAAGCACAGTTTCCAACTTTCTTACTGACACTGGGGTGGTTTTAGCCACCCAGTTGAAAGATACAGATGGAGCAGATTTAATACAATCCTCAAATGGTAATACTGTTCAGGAAGAGTTGAATAACAATCTTCTTAATGATCGTGAACAGTGGCGTCGTAGTCTTGCTGAGGCAGGGTTAACCCTTGTCAACGGTAGCTTTGAAGAAGGGGCTACAGTAAACAATAAGACGGATGCTGTTTGGCATATTGCTGGTGGGCAGTGCTATACGTGGGATGGCGAGTTCCCTAAAACTGTTCCTGCCGGATCAACCCCAGGAACATCTGGTGGTATTGGTACTGGAGCGTGGTTGAGTGTTGGTGATGCAACATTAAGAACAGAATTGTTATCTGTTAATGGTGCTGTAATTCAATCTTTTAACAGTGTTTCAGACATGAAATCTTACAATATAACAGCAGGAAGAACATATCATACAAAAGGATATTGGGCAGAAGGTGATGGTGGTGGTGCTCTATATTATGTCACAACTCCGTCAGGAGACGAACCAAATGGTTATAGCGATCACAAGTCTGAAAATGGTTTATACATTCGTTTGTTGTCAGAACCTACTGATTTGAATCATGGGGTTAAGATTAGCGATATTTATGACCCTGAAACGGCAAGGTGGAATCGAAACGCGATCCAAACTATGTTGCGTGATACCCGCTGGAGCTATACCGAATGTAAAGCACAAGGCGTAATTTATCTTTTGGGTAGTGTAAATGTAGGTAGAGATAATATCACATTCAAAATCAACAAAGGGTGCTCGCTTAAAGGTAGGTATTCAGATCCTAGTATTTCAACCCCAGATCAAGGTGGACACATGATAGGATTCGCTAAATTTTTCGACCCGGATAATGGTGATTTTATACCATGGAGAGATGGTGATACACGTATTAACCCTTATATAGAAAATGTACATGTTATTTTAGAAGGTGACGTATCTACTGAATTTAACGACAGCCATATAAACAAATATAACAATAACTGTATAGGGTTCCTGAAGGCTAAAAATTGCAGTATTCGTGGTACAGGTGGTTCATCATCCAGCGACCATCGAGCTTTTAACTTTGACGGCATAGACACTAATGCCCCCAATGGCTCTGAAAACAGAGGTGGTAGCATTAATTGTCATATTGATGTTGGTTATTCTTACAATTGTGTAGACAACCCTTGCATGATTGCTGCTGACCAATTCACCGCAAGTAGTTGCAGCATTAAAATCGGCGATGTGCGTAAAATGGTAGCAGGTGGTTATAACAGTCCGATTGTTATAAATGTATCCGGCATCTCGCATTTCGATATTAATATAGGTAGATTTTTGGTTGATGGTGGTGTCACACCAGCGTTAGTTGTAGCTCGTGGCGCTCGTTCAGTTAACGTAACAGGTGGTGTTATACAGGGCTGTACAATGGGTGTGTATTCTGTAGATACCCTGGATATTTCTTTAAACATTAAGGAAATGTTTAATGTACCAATAGGTGTTGCTGTTGCAAATAACAGCACTATCGGCCCGAGAAGTATTATTATTCGTGGAATTAACGCAGTTAACTCCAGCTTTTCCGCTGCTTATGCGCATCAAGCATCTGCATTACCAGCAGCATATGTCGAAATAGCTGATAATAACTTCAGTGCCGCTTCTAGTTCATTTAAGTTTATTGGTGGTAAAACTTCAGGAAACACTCCTAAAAGACAAAACATTCATGACAATGTTACATCTTCTACGGGAGATGGTGGTCAAGATCTCAACTATTTGCCAGGCACTCAGAAAAACATTATAGGAGGTAGTTCAACTACTAGTCTCAGTGTCAACTTTAAAGATGGCAACTGGAATTTCACAAAAGCGACCGTAGTTGCTGGGCAAGGTGGTGGGCGTGGTATTGCCACCATTGATCTACTTGCTAAAGGCGTTTCCAGCAACAGCATGGTTATAAGGGCTGGTGCTTATGATGTCACTGTAGCTATGCCTGCCAATGGAAATACGCTGACAGTTAGCGTAGTGTCGCCAAACTTCATTGATTATGTGACGCTTCATAATTAG
Tertiary structure
PDB ID
90fac0cee1c75cc385b1682b9db654b28d995a1adb567cdf1fc761fabff8838d
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50