Protein
View in Explore- Genbank accession
- XPP59249.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber protein distal subunit
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MATLKPIQFKRSKTAGSRPLPEQVLEGELALNLEDRMIFTKDDEGNIIDLGFAKGGRVDGDIVQVGNYTQTGNYTTSGDITAKNINASVGINAAGEVRSSTGVFRTRAREGQNAHLWFEGEEVGEGQNFERGVLYASSQTATSGSIKLRVMNGFDNNKAQALFGFDGSGDITAPRDLVSQRGRFSIEAVAPTINTTRIYTRDKPWRSNSDESYGWLDLVNYVPGENGALALNYVYKGRAMAGGTIWHQLVDERTGPEWALYTGSGPENKAFAVGSSAGKGLGNFTGSLHVGNPGYSAIGNNSITIGETNTGLRQTSAGNLDFLSANNMAFRFSAGEAINRSYNRLHVQHSDANGIAVNPPANNAQLQVNTSGDENNAGGNGLTLIGYYAGATGEYNHYFRGKGSASFDMHRGVNINQGGLNVYNGLTNVGQINLTGSMNTTNVPQGTYKWDDLNTVAADAKSYLRRFRSRNNSTIWHETVEGGIWRLSTGSTDAQEEFTISTAGQATFRGEVISRYANGFRIAYGDYGFFIRNDGSNTYFMLTNSGDQYGGWNTFRPFTISNGTGRVSMGNGAGISGGLTVSPGIESEYVKTYTGSIGHGSWASQNDNEAMIFQRITSASSSEYCPIVKQKYIGGNRTWSIGTLISTGSFHIHMKDSAGNDRNFSFQPNGDFNTSGTINTSVISASSARFSSIATPGGGQFANDGNVYINKSGFAGWIDALFVKANGSNAMAGTLTMSNGQIQLAGGNGNIGFQKAGANPRSMRIFIAGDASRGNRIELADDASYLVYFERHPTSGVQLMMNGNGNFNNVYIRSDARLKRNFKPIENALDKVDALNGLIYEKADKIGGEYSTVEAGLIAQDLQKVLPEAVKSVSMDGDDEVLTVSSQATIALLVNAIKELKARVEELESK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 910 AA molecular weight: 97696,69060 Da isoelectric point: 6,13846 aromaticity: 0,09341 hydropathy: -0,41473
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Erwinia phage Vettismorki [NCBI] |
3374951 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPP59249.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ464591
[NCBI]
CDS location
range 158821 -> 161553
strand +
strand +
CDS
ATGGCAACTTTAAAACCTATTCAATTTAAAAGAAGTAAAACAGCAGGTTCAAGACCTTTGCCTGAACAAGTATTAGAAGGCGAATTAGCACTGAACCTCGAAGATCGTATGATTTTCACTAAAGACGACGAAGGGAATATTATTGACCTTGGTTTTGCAAAAGGTGGTCGTGTAGATGGTGATATTGTTCAGGTTGGTAATTACACCCAAACCGGCAACTACACTACTTCAGGCGATATTACCGCTAAAAATATAAACGCTTCTGTAGGAATTAATGCAGCGGGTGAAGTTCGTTCTAGTACTGGTGTATTCCGCACTAGAGCTAGAGAAGGACAAAATGCCCACTTGTGGTTTGAAGGCGAAGAAGTTGGAGAAGGACAAAATTTTGAACGAGGTGTTCTTTATGCTTCTTCTCAAACTGCAACTTCTGGCTCTATCAAGCTTCGTGTAATGAACGGGTTCGACAATAATAAAGCGCAAGCTTTATTCGGCTTCGATGGGTCTGGTGATATTACCGCTCCAAGAGATTTAGTATCTCAACGTGGACGCTTTTCTATCGAAGCTGTGGCCCCTACAATTAATACAACTCGTATTTACACAAGAGATAAACCTTGGCGGTCAAATAGTGATGAATCTTATGGGTGGTTAGATTTAGTTAATTATGTTCCTGGAGAAAACGGGGCACTAGCATTAAACTATGTCTATAAAGGTCGCGCCATGGCTGGTGGGACTATTTGGCATCAATTGGTTGATGAAAGAACAGGTCCTGAATGGGCTCTTTATACTGGTAGCGGTCCTGAAAATAAAGCTTTTGCAGTAGGGTCATCCGCAGGTAAAGGCCTCGGTAACTTCACAGGCAGTTTACATGTAGGTAATCCAGGATATTCTGCTATTGGTAATAATTCTATTACTATTGGTGAAACTAATACTGGTTTAAGACAAACTTCAGCAGGTAATTTAGATTTCTTATCGGCTAATAATATGGCTTTCAGATTTTCTGCAGGCGAAGCTATAAACCGTTCTTATAATCGATTACACGTCCAGCATTCTGATGCTAATGGTATTGCTGTTAATCCGCCAGCTAATAATGCTCAACTACAAGTAAATACTTCAGGTGATGAAAATAACGCAGGCGGAAATGGATTAACCTTAATAGGCTATTATGCTGGAGCCACTGGCGAATACAATCACTATTTCCGTGGTAAAGGTTCTGCATCTTTTGATATGCATCGTGGTGTAAACATTAACCAAGGTGGCCTTAATGTCTATAATGGGTTAACGAATGTAGGTCAAATTAATTTAACAGGTTCAATGAATACTACTAACGTTCCACAAGGGACTTATAAGTGGGATGATTTGAACACTGTAGCTGCTGACGCTAAATCTTATTTACGTAGATTCCGTTCAAGAAATAACTCAACGATTTGGCATGAAACAGTCGAAGGTGGAATTTGGCGTTTATCTACTGGTTCTACTGACGCTCAAGAAGAGTTTACTATTAGTACTGCTGGCCAGGCTACATTTAGAGGCGAAGTTATTAGTCGCTATGCTAATGGATTTAGAATTGCTTATGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGGTTCCAACACTTATTTTATGTTGACTAATTCAGGAGACCAATACGGTGGATGGAATACTTTCCGTCCTTTTACTATCAGTAATGGTACTGGCCGAGTTTCAATGGGTAATGGTGCTGGTATTAGTGGTGGACTGACGGTTTCTCCAGGCATTGAATCGGAATATGTTAAAACTTATACAGGTAGTATAGGTCATGGCTCTTGGGCTTCACAGAATGATAATGAAGCAATGATTTTCCAAAGAATCACTAGTGCTTCTAGTTCTGAATATTGCCCTATCGTTAAACAAAAATATATAGGCGGAAATAGAACTTGGTCAATAGGTACTTTGATTAGCACAGGTTCTTTCCACATCCATATGAAAGATTCTGCAGGTAATGATAGAAACTTTTCTTTTCAACCTAACGGTGACTTCAATACTTCAGGTACTATCAATACTTCTGTTATATCTGCAAGTAGCGCCAGGTTTAGTTCTATCGCTACTCCAGGTGGTGGTCAATTTGCTAATGACGGTAACGTTTATATCAATAAATCTGGTTTTGCAGGTTGGATAGATGCGCTATTTGTTAAAGCGAATGGCTCGAACGCTATGGCAGGCACTTTGACCATGAGCAATGGTCAAATTCAGTTAGCAGGTGGTAATGGCAATATAGGGTTCCAGAAAGCAGGTGCAAACCCTCGTAGTATGAGGATATTCATAGCTGGTGATGCTTCTCGTGGTAACCGTATTGAATTAGCTGATGATGCTTCATATCTTGTTTATTTCGAACGTCATCCTACTTCAGGTGTTCAATTGATGATGAACGGTAACGGTAACTTTAATAACGTTTATATCCGTTCAGATGCTAGATTGAAACGCAATTTCAAACCAATAGAAAATGCTTTAGATAAAGTGGATGCTTTAAATGGTCTTATTTATGAAAAAGCAGATAAAATTGGTGGTGAATATTCTACTGTAGAAGCTGGCTTAATAGCTCAAGACCTTCAGAAAGTCCTCCCAGAAGCAGTTAAATCTGTTTCTATGGACGGTGACGATGAAGTATTAACCGTTTCTTCACAAGCAACTATTGCTTTGTTAGTTAATGCTATCAAAGAACTTAAAGCTCGTGTTGAAGAACTTGAATCAAAATAA
Tertiary structure
PDB ID
609348e359ac6287322692429373d46f7a2bfc14869b022a6f768d61451b2a12
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50