Protein

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Genbank accession
XLM52267.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
Protein sequence
MSRIKHRIDNVFQLIDGHIQFLDRNTGLTVDPTVQHYVLNPQNVLANNRHFINWTAQEGQPNGDATTEGQSVLILGCAYAYLASGDTKYLDSAKKYWQAYIDYFFGGQPIPDPPAKYRPNWIINGKEPRLAHYPLTDDGYPTHGGFKGSLMTWTNGRTVIPHGAPHWGEYLDKAWFAFNGNLGWNSVNATVYAVNADGTTDWSKNGDQWDVDWIIDRLGRKVDWDGNILEEGFPTSQYGTVQLKNTSVNGTYKFNYATCNPVEHGGYLMERNTMWHNRPVNVPVEMGFQDNASDAETWWCDANYLMYQITGERKYWLCWQSSLLVCQDYSNIDMFDKFFRKSTYATIPFTDGISYDYSYPSTAIPKYSRDTLGYIVIRQDVAAQTTLEQQAIWFKVDQNSKLRVQFQGVDDAGHGILFRPELELSKTKDENNTVTYRCGLPLGTANMTSMDIPLSSFMRSTPPSGGTYIIADPRIIVDWGDNTVVQYKYVTGIAGTNNDQIVTASMDTDGGVTVGFWLTPTSKANVKSITYRTYEDDFNMTITDAQGWRWWAMLPKTQGAWSTKTLSTSDFKLSAYQPNHPDTDPKPSAINLTAVDQVNLVLDTAPVNGLTGTIDFYCINDVPERYSSSSGDDYTMYFRITVQASSPHTAKLGDCTIIDYKLNSLNYTPGIIPFSNISDPNTALYDGWRGIPYPGYQYPSLYCFAGRDIDWTRLNNSIDFLYDAQMWFYNTFDPVMPGPMAQAYVWDRWDARKYGEPNTFTMKHWNEKAWDGYEARAFYCACHAVYELVQRGETPPEKLVTVCKNWINYLKWFQDNNDGRTPTIFNPDGTVLAPIDDFTSHMSALFMAGCSIMGLAGYDSQIPNIGIVADRCFDLIQQNYIVLSPNHPMNGSWSVAPRPDSDNGMFFGFHAGELLRGFGLYALYRKLNPQNALPILDNSNIPTLTVLTMNDISVDVTK
Physico‐chemical
properties
protein length:958 AA
molecular weight: 108431,12310 Da
isoelectric point:5,01584
aromaticity:0,13466
hydropathy:-0,41743

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_Eco_J-01
[NCBI] 		3374113 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLM52267.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ438393 [NCBI]
CDS location
range 51621 -> 54497
strand -
CDS
ATGTCAAGAATTAAGCACAGAATTGACAATGTTTTTCAATTGATCGATGGACATATTCAGTTCTTAGATCGTAATACAGGTTTAACTGTAGATCCTACAGTGCAACACTATGTATTAAACCCACAAAACGTTCTAGCTAATAACAGACACTTTATAAACTGGACTGCTCAAGAAGGGCAACCAAACGGGGATGCTACAACAGAAGGTCAATCCGTGCTTATTCTTGGTTGCGCTTATGCATACCTGGCTTCCGGCGATACAAAGTATTTAGACTCTGCTAAAAAATATTGGCAAGCCTATATAGATTACTTCTTTGGTGGTCAACCTATTCCAGATCCGCCAGCAAAATATCGCCCTAACTGGATTATTAACGGTAAAGAACCACGTCTTGCACACTATCCTCTTACAGATGATGGCTACCCTACACACGGAGGTTTTAAGGGTAGCTTAATGACGTGGACTAACGGTAGAACAGTTATTCCTCATGGTGCTCCTCATTGGGGAGAATACCTTGACAAAGCATGGTTTGCTTTTAATGGTAATCTAGGATGGAACTCTGTAAACGCTACAGTATATGCTGTTAATGCAGATGGAACAACAGATTGGTCTAAGAATGGAGATCAATGGGACGTTGATTGGATCATTGATCGTCTAGGACGTAAAGTTGATTGGGATGGAAATATCTTAGAAGAAGGTTTTCCAACATCTCAATACGGAACAGTTCAACTAAAAAATACTTCTGTAAACGGTACATATAAATTTAACTACGCGACTTGTAACCCTGTTGAACACGGTGGTTATTTAATGGAGCGTAACACTATGTGGCATAACAGACCAGTTAACGTTCCGGTAGAAATGGGCTTTCAGGATAATGCGTCAGATGCTGAAACTTGGTGGTGTGATGCTAATTACCTGATGTACCAAATTACAGGAGAAAGAAAATATTGGCTATGCTGGCAGTCTTCACTGTTAGTGTGTCAAGATTACTCAAACATTGATATGTTTGATAAATTCTTCCGTAAGTCTACATATGCAACTATCCCGTTTACAGATGGCATCTCTTACGATTATTCGTATCCGTCTACAGCAATACCTAAATATTCAAGAGATACTTTAGGTTATATTGTTATTAGACAAGATGTTGCTGCTCAAACAACATTAGAACAGCAAGCCATTTGGTTTAAAGTTGATCAGAACTCTAAGTTACGAGTTCAGTTTCAAGGTGTAGATGACGCAGGACATGGTATTCTTTTCCGTCCAGAGTTGGAACTAAGTAAGACCAAAGATGAAAATAACACAGTAACTTACCGCTGTGGCTTACCACTAGGTACAGCTAATATGACAAGCATGGATATTCCACTATCCAGCTTTATGAGAAGTACCCCTCCTAGTGGTGGAACATATATTATCGCAGATCCGCGAATTATTGTTGACTGGGGTGACAATACTGTGGTACAATATAAATATGTAACAGGTATTGCTGGAACTAATAATGACCAGATTGTTACTGCATCAATGGATACGGATGGTGGTGTCACTGTTGGTTTTTGGTTAACTCCTACATCAAAAGCTAATGTTAAGTCTATTACATATAGAACATATGAAGATGACTTTAACATGACTATCACGGATGCTCAAGGTTGGAGATGGTGGGCTATGCTGCCTAAAACGCAAGGAGCATGGAGTACGAAGACTTTATCAACTTCTGATTTTAAGTTAAGTGCTTACCAGCCTAATCATCCAGATACAGATCCTAAACCTTCAGCCATAAATCTTACTGCGGTAGATCAGGTAAATTTAGTTCTTGATACGGCTCCTGTCAATGGTTTAACAGGAACAATAGATTTCTATTGTATTAACGATGTACCTGAAAGATATTCGTCATCTTCTGGTGATGATTATACCATGTACTTCCGTATTACTGTACAGGCTTCAAGTCCTCATACTGCTAAGTTAGGTGATTGTACTATTATTGACTATAAGTTAAATAGTCTTAATTACACACCAGGAATAATTCCATTCTCTAATATCAGTGACCCAAACACTGCATTATACGATGGATGGCGTGGTATTCCATACCCAGGATACCAGTATCCTTCCTTATACTGTTTCGCAGGTAGGGATATTGATTGGACACGTTTAAACAACAGTATTGATTTCTTGTATGATGCTCAAATGTGGTTTTATAACACGTTTGATCCTGTGATGCCTGGGCCTATGGCACAAGCATATGTGTGGGATCGTTGGGATGCAAGAAAATATGGTGAACCTAATACGTTTACAATGAAACACTGGAATGAAAAAGCGTGGGATGGTTATGAAGCTCGTGCATTCTACTGTGCTTGCCATGCAGTATACGAACTTGTACAAAGAGGAGAAACACCTCCTGAAAAACTAGTAACAGTTTGTAAAAATTGGATCAACTATCTTAAATGGTTCCAAGACAATAATGATGGAAGAACACCAACTATCTTTAATCCAGATGGTACAGTTCTTGCACCTATAGATGACTTTACTAGTCATATGTCTGCACTGTTTATGGCGGGTTGTTCAATCATGGGCTTGGCAGGTTATGATTCACAAATTCCAAACATTGGTATTGTAGCAGACAGATGTTTTGATCTGATTCAGCAAAACTATATTGTGCTTTCCCCTAACCATCCGATGAATGGTTCCTGGAGTGTTGCACCACGCCCAGATTCAGATAACGGAATGTTCTTTGGTTTCCATGCTGGAGAACTATTACGTGGTTTTGGTTTATATGCCTTGTATCGTAAACTAAACCCTCAAAACGCTTTACCAATTTTGGATAATAGTAACATACCAACACTAACTGTTCTAACTATGAATGATATTAGTGTTGATGTAACCAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
16f1f709dabd1186b8fb95e7c90c7687826ad695b71325a39270531fb09a1cb8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2375
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization of 4 new bacteriophages with antibiotic activity against multidrug-resistant Escherichia coli isolates recovered from cystic fibrosis patients Garcia-Gonzalez,G., Garcia-Perez,J.M., Rodea,G.E., Rivera-Rios,R. and Martinez-Flores,P.D. 2011-03-17 — GenBank