Protein
View in Explore- Genbank accession
- CAO0864813.1 [GenBank]
- Protein name
- virion structural protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MFELLLSSGLTNTPIYSDPYPGPKTLIAGTRELGLYGETTSSELFGYDDAAKLVNMTFGTVINDGQPWLKFSNKNVTCYIPKKPARKSIQKSRLNNAGLRNGDYEVRFMGNIYKFGLLTMAGATSEWQRLLYNVHVSNLNGANWPYKFTDNDLGINQAVAGGISTDGTTNWGRDPGSDPVNDQLYRGYYAIDITSSSSSETGAATQGWRPVVYASGTYPFVKDNVIKLTDFETDNEMAAGAQIGNLVYYYGGKNNANTALRTLNLATGKLTTLQPTGTPIAVKQCSAVAFNGKVYFYGGESATDGVLTKGMQCYDPATNTWEIKSPGTIACRYARGTSLNGLIYILGAADTTATNNRGFTLMYNPTTDTYTSGAAFNDTGVYTQDYSVSVYNNSVCVIGGMVGAGVNTGIISYNQTNNNWSKPITTGIPLGAAINIRPSGELYVIAGENQNNAPIKYYEPRLARWINLGNLETGLVDAGFANTFNNDGKIYVLNGNQNLKYQIS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 504 AA molecular weight: 54545,27990 Da isoelectric point: 6,62904 aromaticity: 0,11111 hydropathy: -0,30635
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAO0864813.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ318630
[NCBI]
CDS location
range 211688 -> 213202
strand +
strand +
CDS
ATGTTTGAGTTATTGTTGTCTTCTGGACTAACAAATACGCCTATATATTCCGATCCTTATCCAGGTCCTAAAACACTGATAGCTGGGACAAGGGAATTAGGTTTGTATGGTGAAACAACATCTTCAGAATTATTTGGTTATGATGATGCAGCTAAATTAGTTAATATGACATTTGGAACAGTAATCAATGATGGACAACCATGGTTAAAGTTCTCTAATAAAAATGTTACTTGTTACATACCAAAGAAACCAGCTCGTAAATCAATACAAAAATCACGGCTTAATAATGCCGGACTCCGTAATGGTGACTATGAAGTTAGATTTATGGGGAACATTTATAAATTTGGTTTATTAACAATGGCTGGTGCCACATCAGAATGGCAAAGGTTACTTTATAATGTTCACGTATCTAATTTAAATGGTGCTAACTGGCCTTATAAATTTACAGATAATGACTTAGGTATTAACCAAGCGGTCGCTGGTGGTATTAGCACTGATGGTACTACTAACTGGGGAAGAGACCCAGGTAGTGATCCAGTTAATGACCAGCTCTATCGTGGCTACTATGCGATTGATATAACTAGCTCGTCAAGTAGTGAAACGGGTGCTGCAACCCAAGGTTGGCGTCCAGTGGTTTATGCTAGTGGTACATATCCATTCGTTAAAGATAATGTTATTAAACTTACTGATTTTGAAACTGATAACGAAATGGCAGCAGGTGCCCAAATAGGTAACTTAGTCTATTATTACGGTGGTAAGAATAATGCTAATACTGCTCTACGTACATTGAATTTAGCCACGGGTAAGTTAACAACATTACAACCAACTGGTACACCTATAGCAGTTAAACAATGCTCGGCTGTTGCATTTAATGGTAAAGTATATTTCTATGGTGGTGAAAGTGCCACAGATGGTGTACTCACTAAAGGTATGCAGTGTTATGATCCTGCAACTAATACATGGGAAATAAAATCACCAGGTACGATAGCTTGTCGGTATGCACGTGGAACTAGTCTTAATGGGTTAATCTACATATTAGGTGCAGCTGATACAACTGCAACAAATAATCGTGGATTTACATTAATGTACAATCCAACTACAGATACATATACCAGTGGTGCAGCATTTAATGATACTGGGGTATATACCCAAGATTATTCAGTGAGTGTTTATAATAATAGCGTATGTGTTATTGGTGGTATGGTTGGTGCCGGTGTTAATACTGGAATCATATCGTACAATCAAACCAACAATAATTGGTCTAAACCAATAACTACAGGTATACCTCTTGGTGCAGCTATTAATATACGCCCATCTGGTGAACTTTATGTAATCGCTGGTGAAAATCAAAATAATGCACCAATTAAGTATTATGAACCACGATTAGCACGATGGATAAATTTAGGTAATTTAGAAACTGGTTTAGTGGATGCAGGTTTTGCCAATACGTTTAATAACGATGGTAAGATTTATGTTCTAAACGGTAATCAGAATTTAAAATACCAAATTAGTTAA
Tertiary structure
PDB ID
3f7223a1123b9f9113c7cd9b3b8ea4c8474a62d6b43c0f0e2ed5486a45059f42
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50