Protein

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Genbank accession
ULA51972.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,67
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVSSGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPAAPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDRLNPLYHTFVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAGTINLTLPSGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTRYWVVKQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTSQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAIDSEVIAGQSQSGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRRATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQNLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGASTRLIFEKGPQTGNNPAQAMNIRVWGNQFAGGSDTSRATIFEVGDETSNHFYSQRDNLGNITFSINGTVRPINVNASGTLNANGAATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAISGNYGFFIRNDAANTYFMLTASSDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSDGLTVNSRIRSQGTKTADLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139618,58500 Da
isoelectric point:5,38916
aromaticity:0,07514
hydropathy:-0,31201

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
981–1094
IPR048390 IPR048391
ULA51972.1
1 1291
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM-RPN187
[NCBI] 		2917961 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ULA51972.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL770074 [NCBI]
CDS location
range 149400 -> 153275
strand +
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACCGATGCACAATGGATAACTGTCTCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACATTGCCAAATACGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGGCACCATACCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAGATTAAACCCGCTGTATCATACATTTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAGCCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTTCTGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTTGCGTTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCGGAGTATCCACCTGATGCACAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTTAAACAAAACGTCCCAACTGTAGAACGTGTCGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCCAAAATTGCTACAACATCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGACTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACGCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCCGAAACACTATCGGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCCGAAACTCGTGGGGCTGCAGGCACTAATGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTACGCCCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTATTGATAGTGAAGTAATTGCTGGACAATCTCAGTCTGGATACTCTCATGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAGAGCGACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGTGTAATCAAGGTTGCAACCCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCGAACACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGCGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAAAACTTAGAGCTATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCGTATGAATTAAACCGTGTATTGGCAAATTACTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACGGCTACGTTTGGTGGTTCGGTATCTGCTAATAGTACATTAACTATTTCTAATACAGGTGCTTCAACTCGCTTAATATTTGAAAAAGGTCCACAAACTGGAAACAACCCTGCTCAGGCGATGAATATCCGTGTATGGGGTAACCAATTCGCCGGCGGTTCTGATACATCTCGTGCTACGATATTTGAAGTTGGTGATGAAACATCTAACCACTTTTATTCACAACGGGATAACCTTGGTAATATTACTTTCAGCATCAACGGTACAGTTCGGCCGATTAATGTTAATGCATCCGGAACATTGAATGCTAATGGTGCGGCAACATTTGGACGTTCGGTGACAGCACAGGGTGAATTTATAACCTATAGTGCAAACGCATTCAGAGCAATTAGTGGTAATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGCTAATACCTATTTTATGCTTACTGCATCAAGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGATGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACCGCTGATTTATACACCCGTGCACCGACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGACATTAATGATTCAGCTACTTATAACCAATTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCGAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGCGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGCGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTTCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
1234986f85e7e8c4faf2ac388bfbdf14e7f81b55a06bacde5ee133da0b22e65b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5543
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization and complete genome sequence of Escherichia phage vB_EcoM-RPN187 Imklin,N., Sriprasong,P., Thanantong,N. and Nasanit,R. 2022-08-01 — GenBank