Genbank accession
YP_012134648.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAITKIILQQMVIMDQNSITASKYPKYTVVLSNSISSITAGELTTAIESSKASAAAAKQSEINAKQSELNAKDSENEAEISAASSQQSATQSASSATTSANSAKAAKTSETNAKASETAAKTSETNAKASETAAKTSETNANSSKTAAAASASAAKTSETNAAASASAAKTSETNANSSKTAAANSANAAKVSETNAKTSETNAAASATKAENVASGMKASIGLGNAPRDCPDISGNPSAYIGFMRIMSNAVGFPSIASGESSLTGFISQVDGSPAYTGVFQGWASRSLYTYRWSTSTGPQWTRHARKNEVDKLVQLNSETQLLNPNEGAKIIITSNKLWGAYDIENRTYIPLAVGQGGTGGRSAAEARTNLQLNRFQRSSDTRTIVCSTDIQSDGCYLQVDAGGQWGAFNPTTSRWQPLAIAQGGTGALNTSDARRNLEVMYRRFSTLTDQNLNDLTGESAGFYYQNLSANATIARNYPIQEAGNLMVLQNSANGVAGCCQIYITFSTNRIYERSYNPGTSTWSAWGSILNSYDPSYCRQLIELGSQHAPLFAGLSLTGYSDSTAAAGGIINSYLRAVNGTQRARMRLYPEKLSDGTAAATLQIMGEDTGPSYKTFHFKHNGQLFVPNEINTDTIAVRNLTVTQQNLGIPTTGFIGTYQTINAPSGAVDGKYYPVIFYTGGVNGNGVMPVPISIRTPGRSAGHEMNNNVFSGYVTCGGWSDSPSIAYGVFTTYDPNELGILCIKGSNKDYAQHIAVYVHYKAFPVNIMTDPKVVINVPTEDYVLGTNGVKFKFGVTDAGDGNAEGNVSNLLNFTGGGSGFYSNHPFRQGLSPNFALTNNLNSGNAFSATAPSFTFNGSVVGANSFSARGDAVTKNTYTSQLVNSADTILGQSEFRATEEAGQIIVRDMTSSASHKFFNFNKDGTFSAPSGMLSSTGVDWNTQHNTINKFYGIAGQVNSPENNVVYGGVHIGFSGNYATQLAGRGNKYYLRSIESGTIGAWNRIITDQYADFKVPLFINKNGEALTLKSSVDDTSESGYLAGRTANNTRMWYFGKTGAGKSVVIANEMMGSSLSLGEDGNTSIRTPNYGGGVFADSTAIVVRRSNNRQFRIENTSNAAKDAILQLWGNTTGRPSVIECKLTDGYLFYAQQNTDGSRVLQVNGAAQAIAFNQASDRDLKDNIVEIPNATESLRKMKGYTYTLKENGMPYAGVIAQEVMEALPEAVSGFTKYTDLAGATLNGEPLVGEERFYSVDYGAITGLLVQVSRESDSRITALESEVSDLKKQIADLTIVVNSLLANR
Physico‐chemical
properties
protein length:1300 AA
molecular weight: 138142,21520 Da
isoelectric point:6,49041
aromaticity:0,08385
hydropathy:-0,32900

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage BB1
[NCBI]
2747781 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_012134648.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_106597 [NCBI]
CDS location
range 49682 -> 53584
strand -
CDS
ATGGCTATAACTAAAATAATTTTACAGCAAATGGTCATTATGGACCAGAATAGCATAACTGCAAGTAAGTATCCTAAGTATACAGTTGTGCTTTCTAATTCCATTAGCTCTATTACGGCAGGAGAACTAACTACTGCTATAGAATCCTCTAAAGCTTCTGCTGCAGCAGCTAAACAATCAGAGATTAATGCTAAACAGTCAGAGCTAAACGCTAAAGACTCTGAGAATGAAGCAGAAATTTCCGCAGCATCTTCCCAGCAATCTGCAACTCAGTCTGCCTCTTCTGCTACTACTTCTGCTAATAGCGCTAAAGCTGCTAAGACTTCTGAGACTAACGCAAAAGCTAGTGAGACGGCTGCAAAAACTTCAGAAACCAATGCAAAAGCTAGTGAAACAGCGGCTAAAACTTCTGAGACCAATGCTAATAGTAGCAAAACTGCTGCTGCTGCATCTGCTTCCGCAGCAAAAACCTCAGAAACTAATGCTGCTGCATCTGCTTCTGCCGCTAAAACTTCTGAAACTAACGCTAATAGTAGTAAAACTGCTGCTGCTAACAGTGCTAATGCTGCTAAAGTATCAGAAACTAATGCTAAAACTTCGGAAACTAATGCGGCTGCTTCAGCTACTAAAGCTGAAAATGTAGCTTCCGGCATGAAAGCCTCTATAGGTTTAGGTAATGCCCCTCGTGATTGTCCTGATATTTCTGGTAATCCTTCTGCGTATATTGGCTTTATGCGTATCATGAGTAATGCAGTAGGCTTCCCATCAATAGCCTCTGGTGAGAGTAGTCTTACAGGGTTTATTAGTCAAGTGGATGGTAGTCCAGCGTACACTGGTGTTTTCCAAGGATGGGCGTCTCGCTCATTATACACCTATCGTTGGAGTACATCTACTGGCCCGCAGTGGACACGTCATGCACGTAAGAATGAGGTTGATAAGCTCGTCCAACTAAATTCTGAAACTCAACTATTAAACCCTAATGAAGGTGCAAAAATAATTATTACTTCCAATAAACTCTGGGGAGCTTATGATATAGAGAATAGGACATACATACCTCTTGCAGTAGGACAGGGTGGTACCGGAGGTAGATCAGCTGCTGAAGCGAGAACTAATCTACAGCTAAACCGCTTCCAACGTTCCAGTGATACAAGAACCATCGTTTGTTCAACAGATATTCAGTCGGATGGCTGTTACTTACAGGTTGATGCTGGTGGTCAGTGGGGAGCATTTAATCCTACAACTAGTAGGTGGCAACCTCTCGCAATAGCTCAGGGCGGCACTGGTGCTCTTAATACTTCTGACGCACGTAGAAATCTGGAAGTAATGTATCGTAGATTTTCTACCTTAACAGATCAGAACTTGAATGATCTTACGGGTGAGTCTGCAGGTTTCTATTACCAGAATCTATCTGCTAATGCAACTATAGCCCGTAATTATCCTATTCAAGAAGCGGGAAACTTAATGGTACTACAAAATAGTGCTAATGGGGTTGCTGGATGTTGTCAGATATACATTACCTTTAGTACTAATAGGATATACGAACGTAGTTATAACCCAGGTACCTCAACATGGTCTGCCTGGGGATCTATCCTTAATAGTTACGATCCTAGCTACTGTAGACAGCTTATTGAGCTAGGTTCCCAGCATGCACCATTATTTGCTGGTCTATCATTAACTGGATATAGTGATAGTACGGCAGCTGCTGGAGGTATTATTAATAGTTACTTAAGAGCTGTGAATGGTACTCAAAGAGCGCGTATGCGCTTATACCCTGAAAAACTTTCTGATGGTACTGCTGCTGCAACTCTGCAGATTATGGGAGAAGATACTGGCCCATCTTATAAAACATTCCATTTTAAACATAATGGTCAACTATTCGTACCAAATGAGATTAATACGGATACTATAGCTGTTAGGAATCTTACTGTAACTCAACAAAATTTAGGTATACCTACTACAGGATTTATAGGTACTTACCAAACTATTAATGCGCCTTCAGGTGCTGTTGATGGGAAATACTATCCAGTTATATTTTATACTGGAGGTGTTAATGGTAATGGGGTTATGCCAGTACCTATATCTATTCGTACTCCTGGTAGATCGGCCGGCCATGAGATGAATAATAATGTTTTTTCTGGCTACGTAACTTGTGGTGGCTGGAGCGATAGCCCTAGTATAGCATATGGAGTATTCACAACGTATGACCCCAATGAGTTGGGTATTCTATGCATAAAAGGAAGTAACAAGGACTATGCTCAACACATAGCAGTTTATGTGCACTATAAAGCATTTCCTGTGAACATTATGACAGACCCAAAGGTTGTTATAAATGTTCCAACGGAAGACTATGTATTAGGAACTAACGGGGTTAAATTTAAATTTGGAGTAACAGATGCGGGTGATGGAAATGCTGAGGGTAATGTTAGCAACCTCTTGAACTTTACTGGTGGCGGTTCTGGCTTTTACTCTAATCATCCTTTCCGTCAGGGATTATCTCCTAATTTTGCTTTAACTAATAATCTTAACTCTGGTAACGCCTTTTCTGCTACTGCACCTTCTTTTACTTTTAATGGTAGTGTTGTTGGTGCTAATAGTTTTTCTGCTAGAGGCGATGCTGTAACAAAAAATACATACACATCTCAGTTAGTAAATAGTGCTGATACCATATTAGGACAAAGTGAGTTTAGGGCAACAGAAGAAGCTGGACAGATTATTGTTAGGGATATGACTAGTTCTGCTAGTCATAAATTCTTTAATTTTAATAAGGATGGGACCTTCTCAGCTCCTTCAGGTATGTTATCTTCTACTGGTGTAGACTGGAATACACAACATAACACTATCAATAAGTTTTATGGTATTGCTGGTCAAGTTAATAGTCCTGAAAACAATGTTGTATATGGTGGGGTACATATAGGTTTTAGTGGTAACTATGCTACTCAACTAGCCGGTAGGGGTAATAAATATTATCTGAGAAGTATTGAATCTGGCACTATAGGTGCATGGAATCGTATAATTACGGATCAATATGCTGATTTTAAAGTCCCTCTTTTTATAAATAAAAATGGAGAGGCATTAACCCTAAAATCTAGTGTTGATGATACTTCTGAAAGTGGTTATTTAGCAGGTAGAACAGCTAATAATACTAGAATGTGGTATTTTGGTAAAACCGGAGCTGGAAAATCTGTTGTTATAGCTAATGAGATGATGGGCAGTTCATTAAGTTTAGGGGAGGATGGTAATACTTCAATAAGGACCCCTAATTATGGTGGTGGAGTTTTTGCAGATAGTACTGCTATAGTTGTACGTCGTTCAAATAATCGACAGTTTAGAATTGAAAATACATCAAATGCAGCTAAAGATGCTATACTTCAATTATGGGGTAATACTACTGGAAGACCTTCTGTTATTGAGTGTAAATTAACTGATGGATACTTATTTTATGCGCAACAAAATACTGATGGATCTCGTGTTCTCCAAGTAAATGGGGCTGCTCAAGCAATCGCATTTAACCAAGCTTCTGATAGGGATCTAAAAGATAACATAGTAGAGATACCCAATGCTACAGAATCTCTCCGTAAAATGAAAGGATATACATATACCCTTAAAGAAAACGGTATGCCGTACGCGGGAGTTATAGCCCAGGAAGTGATGGAAGCGCTACCGGAGGCTGTAAGTGGATTTACAAAATATACAGATCTCGCAGGTGCCACCCTAAACGGTGAGCCTCTCGTTGGAGAGGAACGATTCTATTCGGTAGATTATGGGGCCATTACCGGGTTGTTAGTACAGGTAAGCAGAGAATCTGATAGCAGGATCACAGCTCTAGAATCAGAAGTATCTGATCTTAAAAAGCAAATTGCAGATCTAACCATAGTAGTTAACTCTCTACTAGCGAATAGATAA

Tertiary structure

PDB ID
2a09e96497aa1d010dacc408f2bf26415423b87ea058b7d038727f492fd4da09
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7372
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Sequencing coliphages Kelly,A. 2013-12-30 GenBank