Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_012134648.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MAITKIILQQMVIMDQNSITASKYPKYTVVLSNSISSITAGELTTAIESSKASAAAAKQSEINAKQSELNAKDSENEAEISAASSQQSATQSASSATTSANSAKAAKTSETNAKASETAAKTSETNAKASETAAKTSETNANSSKTAAAASASAAKTSETNAAASASAAKTSETNANSSKTAAANSANAAKVSETNAKTSETNAAASATKAENVASGMKASIGLGNAPRDCPDISGNPSAYIGFMRIMSNAVGFPSIASGESSLTGFISQVDGSPAYTGVFQGWASRSLYTYRWSTSTGPQWTRHARKNEVDKLVQLNSETQLLNPNEGAKIIITSNKLWGAYDIENRTYIPLAVGQGGTGGRSAAEARTNLQLNRFQRSSDTRTIVCSTDIQSDGCYLQVDAGGQWGAFNPTTSRWQPLAIAQGGTGALNTSDARRNLEVMYRRFSTLTDQNLNDLTGESAGFYYQNLSANATIARNYPIQEAGNLMVLQNSANGVAGCCQIYITFSTNRIYERSYNPGTSTWSAWGSILNSYDPSYCRQLIELGSQHAPLFAGLSLTGYSDSTAAAGGIINSYLRAVNGTQRARMRLYPEKLSDGTAAATLQIMGEDTGPSYKTFHFKHNGQLFVPNEINTDTIAVRNLTVTQQNLGIPTTGFIGTYQTINAPSGAVDGKYYPVIFYTGGVNGNGVMPVPISIRTPGRSAGHEMNNNVFSGYVTCGGWSDSPSIAYGVFTTYDPNELGILCIKGSNKDYAQHIAVYVHYKAFPVNIMTDPKVVINVPTEDYVLGTNGVKFKFGVTDAGDGNAEGNVSNLLNFTGGGSGFYSNHPFRQGLSPNFALTNNLNSGNAFSATAPSFTFNGSVVGANSFSARGDAVTKNTYTSQLVNSADTILGQSEFRATEEAGQIIVRDMTSSASHKFFNFNKDGTFSAPSGMLSSTGVDWNTQHNTINKFYGIAGQVNSPENNVVYGGVHIGFSGNYATQLAGRGNKYYLRSIESGTIGAWNRIITDQYADFKVPLFINKNGEALTLKSSVDDTSESGYLAGRTANNTRMWYFGKTGAGKSVVIANEMMGSSLSLGEDGNTSIRTPNYGGGVFADSTAIVVRRSNNRQFRIENTSNAAKDAILQLWGNTTGRPSVIECKLTDGYLFYAQQNTDGSRVLQVNGAAQAIAFNQASDRDLKDNIVEIPNATESLRKMKGYTYTLKENGMPYAGVIAQEVMEALPEAVSGFTKYTDLAGATLNGEPLVGEERFYSVDYGAITGLLVQVSRESDSRITALESEVSDLKKQIADLTIVVNSLLANR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1300 AA molecular weight: 138142,21520 Da isoelectric point: 6,49041 aromaticity: 0,08385 hydropathy: -0,32900
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage BB1 [NCBI] |
2747781 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_012134648.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_106597
[NCBI]
CDS location
range 49682 -> 53584
strand -
strand -
CDS
ATGGCTATAACTAAAATAATTTTACAGCAAATGGTCATTATGGACCAGAATAGCATAACTGCAAGTAAGTATCCTAAGTATACAGTTGTGCTTTCTAATTCCATTAGCTCTATTACGGCAGGAGAACTAACTACTGCTATAGAATCCTCTAAAGCTTCTGCTGCAGCAGCTAAACAATCAGAGATTAATGCTAAACAGTCAGAGCTAAACGCTAAAGACTCTGAGAATGAAGCAGAAATTTCCGCAGCATCTTCCCAGCAATCTGCAACTCAGTCTGCCTCTTCTGCTACTACTTCTGCTAATAGCGCTAAAGCTGCTAAGACTTCTGAGACTAACGCAAAAGCTAGTGAGACGGCTGCAAAAACTTCAGAAACCAATGCAAAAGCTAGTGAAACAGCGGCTAAAACTTCTGAGACCAATGCTAATAGTAGCAAAACTGCTGCTGCTGCATCTGCTTCCGCAGCAAAAACCTCAGAAACTAATGCTGCTGCATCTGCTTCTGCCGCTAAAACTTCTGAAACTAACGCTAATAGTAGTAAAACTGCTGCTGCTAACAGTGCTAATGCTGCTAAAGTATCAGAAACTAATGCTAAAACTTCGGAAACTAATGCGGCTGCTTCAGCTACTAAAGCTGAAAATGTAGCTTCCGGCATGAAAGCCTCTATAGGTTTAGGTAATGCCCCTCGTGATTGTCCTGATATTTCTGGTAATCCTTCTGCGTATATTGGCTTTATGCGTATCATGAGTAATGCAGTAGGCTTCCCATCAATAGCCTCTGGTGAGAGTAGTCTTACAGGGTTTATTAGTCAAGTGGATGGTAGTCCAGCGTACACTGGTGTTTTCCAAGGATGGGCGTCTCGCTCATTATACACCTATCGTTGGAGTACATCTACTGGCCCGCAGTGGACACGTCATGCACGTAAGAATGAGGTTGATAAGCTCGTCCAACTAAATTCTGAAACTCAACTATTAAACCCTAATGAAGGTGCAAAAATAATTATTACTTCCAATAAACTCTGGGGAGCTTATGATATAGAGAATAGGACATACATACCTCTTGCAGTAGGACAGGGTGGTACCGGAGGTAGATCAGCTGCTGAAGCGAGAACTAATCTACAGCTAAACCGCTTCCAACGTTCCAGTGATACAAGAACCATCGTTTGTTCAACAGATATTCAGTCGGATGGCTGTTACTTACAGGTTGATGCTGGTGGTCAGTGGGGAGCATTTAATCCTACAACTAGTAGGTGGCAACCTCTCGCAATAGCTCAGGGCGGCACTGGTGCTCTTAATACTTCTGACGCACGTAGAAATCTGGAAGTAATGTATCGTAGATTTTCTACCTTAACAGATCAGAACTTGAATGATCTTACGGGTGAGTCTGCAGGTTTCTATTACCAGAATCTATCTGCTAATGCAACTATAGCCCGTAATTATCCTATTCAAGAAGCGGGAAACTTAATGGTACTACAAAATAGTGCTAATGGGGTTGCTGGATGTTGTCAGATATACATTACCTTTAGTACTAATAGGATATACGAACGTAGTTATAACCCAGGTACCTCAACATGGTCTGCCTGGGGATCTATCCTTAATAGTTACGATCCTAGCTACTGTAGACAGCTTATTGAGCTAGGTTCCCAGCATGCACCATTATTTGCTGGTCTATCATTAACTGGATATAGTGATAGTACGGCAGCTGCTGGAGGTATTATTAATAGTTACTTAAGAGCTGTGAATGGTACTCAAAGAGCGCGTATGCGCTTATACCCTGAAAAACTTTCTGATGGTACTGCTGCTGCAACTCTGCAGATTATGGGAGAAGATACTGGCCCATCTTATAAAACATTCCATTTTAAACATAATGGTCAACTATTCGTACCAAATGAGATTAATACGGATACTATAGCTGTTAGGAATCTTACTGTAACTCAACAAAATTTAGGTATACCTACTACAGGATTTATAGGTACTTACCAAACTATTAATGCGCCTTCAGGTGCTGTTGATGGGAAATACTATCCAGTTATATTTTATACTGGAGGTGTTAATGGTAATGGGGTTATGCCAGTACCTATATCTATTCGTACTCCTGGTAGATCGGCCGGCCATGAGATGAATAATAATGTTTTTTCTGGCTACGTAACTTGTGGTGGCTGGAGCGATAGCCCTAGTATAGCATATGGAGTATTCACAACGTATGACCCCAATGAGTTGGGTATTCTATGCATAAAAGGAAGTAACAAGGACTATGCTCAACACATAGCAGTTTATGTGCACTATAAAGCATTTCCTGTGAACATTATGACAGACCCAAAGGTTGTTATAAATGTTCCAACGGAAGACTATGTATTAGGAACTAACGGGGTTAAATTTAAATTTGGAGTAACAGATGCGGGTGATGGAAATGCTGAGGGTAATGTTAGCAACCTCTTGAACTTTACTGGTGGCGGTTCTGGCTTTTACTCTAATCATCCTTTCCGTCAGGGATTATCTCCTAATTTTGCTTTAACTAATAATCTTAACTCTGGTAACGCCTTTTCTGCTACTGCACCTTCTTTTACTTTTAATGGTAGTGTTGTTGGTGCTAATAGTTTTTCTGCTAGAGGCGATGCTGTAACAAAAAATACATACACATCTCAGTTAGTAAATAGTGCTGATACCATATTAGGACAAAGTGAGTTTAGGGCAACAGAAGAAGCTGGACAGATTATTGTTAGGGATATGACTAGTTCTGCTAGTCATAAATTCTTTAATTTTAATAAGGATGGGACCTTCTCAGCTCCTTCAGGTATGTTATCTTCTACTGGTGTAGACTGGAATACACAACATAACACTATCAATAAGTTTTATGGTATTGCTGGTCAAGTTAATAGTCCTGAAAACAATGTTGTATATGGTGGGGTACATATAGGTTTTAGTGGTAACTATGCTACTCAACTAGCCGGTAGGGGTAATAAATATTATCTGAGAAGTATTGAATCTGGCACTATAGGTGCATGGAATCGTATAATTACGGATCAATATGCTGATTTTAAAGTCCCTCTTTTTATAAATAAAAATGGAGAGGCATTAACCCTAAAATCTAGTGTTGATGATACTTCTGAAAGTGGTTATTTAGCAGGTAGAACAGCTAATAATACTAGAATGTGGTATTTTGGTAAAACCGGAGCTGGAAAATCTGTTGTTATAGCTAATGAGATGATGGGCAGTTCATTAAGTTTAGGGGAGGATGGTAATACTTCAATAAGGACCCCTAATTATGGTGGTGGAGTTTTTGCAGATAGTACTGCTATAGTTGTACGTCGTTCAAATAATCGACAGTTTAGAATTGAAAATACATCAAATGCAGCTAAAGATGCTATACTTCAATTATGGGGTAATACTACTGGAAGACCTTCTGTTATTGAGTGTAAATTAACTGATGGATACTTATTTTATGCGCAACAAAATACTGATGGATCTCGTGTTCTCCAAGTAAATGGGGCTGCTCAAGCAATCGCATTTAACCAAGCTTCTGATAGGGATCTAAAAGATAACATAGTAGAGATACCCAATGCTACAGAATCTCTCCGTAAAATGAAAGGATATACATATACCCTTAAAGAAAACGGTATGCCGTACGCGGGAGTTATAGCCCAGGAAGTGATGGAAGCGCTACCGGAGGCTGTAAGTGGATTTACAAAATATACAGATCTCGCAGGTGCCACCCTAAACGGTGAGCCTCTCGTTGGAGAGGAACGATTCTATTCGGTAGATTATGGGGCCATTACCGGGTTGTTAGTACAGGTAAGCAGAGAATCTGATAGCAGGATCACAGCTCTAGAATCAGAAGTATCTGATCTTAAAAAGCAAATTGCAGATCTAACCATAGTAGTTAACTCTCTACTAGCGAATAGATAA
Tertiary structure
PDB ID
2a09e96497aa1d010dacc408f2bf26415423b87ea058b7d038727f492fd4da09
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Sequencing coliphages | Kelly,A. | 2013-12-30 | — | GenBank |