Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_009813090.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MDNLDNGLELLSGRLVVLFLTYDLALKASANFPAGTKVKVTNDPNPDLNGEYTWDGTKLVKTTNNTLEKAKEEAEKIVNDKIDNTLTKDKILDLISGEITESDLDQNLRQRIDEIESISPIIDKLKKDVKKSKEEVDEKVFFLNVDYQNLKEEVQNIQLQVDLDFQAIQDRIDQIQAEVDAKWLEVDQIRDDLTKEINDRVAAVREETEQRIEDVRKLNDGLTQEIIDRKDGDQKLYENIENYKVSNDDALANVREEVRVAVDTANASAEKVDSMDARVKVAEDNAGTALENSAAAVSKANAASDLASATAGRVDSMQADVVKALDDSGTALTNSATAIEQSQVAVDKANAAAESVTVLESKLNSKNATYRQDTAPTKDTHPNLTEGDLWINPSANNEQKRWNGTDWVDISDVRVGQNATAISELKTSVKEQDDKITAVSEKVTSLEATIGDMATSEALEQLKGTVTEQGDKIDANTEKLVALETTVGKNQEANAKALQDLTTRIEKDEDDIKANTSAITALDSTVNASLNAINITADMNLENDLIYYNSSSQNVVKSISESGTTRRVLTIGDNSSDDMAWMYPKAMLPYDPDVMYKVRAKLRRLSGDGAVYLGLVVKNSDKTQFVTSNNILSDNVSSSSYFADGVIPPLNEWVEYEWYIKGRASSSALLPPTYGGLGNPIQMQNATGYITPVFIANYSGLSGVVELAYMVLERAEAYKVISANANALTSLKTDVQKNTDGIQAMGEAITNVEASITNMDIGGQNHWTIWPIEPTQSDADNPYLSVQWLTESQEWIRTTLTKDVNSYHHSFDGLLIDLSYPIVIGELYTLTFEMRASKAITIAATTINFGTNVTYTDNSLTTDTEWKTYTITFPTKGTLTSKANQAFGLTLLKGHGWTTNDWYELRRIQMQKGNKATRYQKAQAGLVEGIKANSQAFNGLKATVEQQGEDIKSQGQAITGLKQEIADKASSQALSELKSTVEQQGESIRINTEAITSLKGVVDGKADADALNSLKITVQEQGETLLTQGQAITSVRATADLALNGKKTLIDLTALDPNLYYPVFIPVSTTGISEIEISPKLGDFQAPWSTHYSGSYSLGVRWTTRGHGWGAEAIDRVIEKFGYLWADQSPAMEINQRGEDSKEYIYLRGGTIYPFVTNQFADTPYLESNPVGVAFDQSKVPQSVNARVGANASAISSLDSKINIVGDKVDVNAQAITGLQAEIKDKASSEALNQLSVTVRDQGQLIDTQGQAITKVESKVDNLKVGTGNLLRNSSFSESLDQWAWNGQVESADFIAEYGIPSGQSKYLKMRVSTGGSGYYQGVPFVKQGEEVIFSIWARGETGNEVLRLLWEGHEAFADHQLTTSWARYTLKTKPVINAPNVVIYTVNAGTFHISSAQYERGNIVSDWHPNSEDMASARAVSLLNTKIDNVDNKVNIQAQAITDLRSDLNNKANAQALNELSTTVQEQGETIQSQGKVLTSVEATANRTSSQLGTTVSYMLYTFRNGASSITKTGLYKADGTRLEGVSRGLNVYLFAANGDFVSLRFFDTYGDIDNACNNMVAYLSDLPQNSFIAIAGCDNLGAVSWPSGPPKALRDHLRDVWGVAQSSVDKWQYNDIPIVICRKWGPKNSAIDKLYTSSINGDWYSLGITFIDGIPNDWGGDTSKTNIEANASAISTMNADVIKNRDDIRVNAEAITGLSGRIDGKADAQALSQLQITVKEQGETISSQGQAITQVQASADMALNGKKYVVDLTALDPNLYYPVFIPVSSGSGISEISVTASLDEYKAPWSSHGSGTYSLNVRWRVRGSGWGANSIEREILRFGYAWCGDQSPVIEISQQGEQSREYIYLRGGTQYPFYVNQYAGQPFTDLGNYGGVPYRTDLMPVTINAATQANASAVSTLNAKVDIVDGKATSAAESVTKLQTSSTAATYQLLRDSNKIREKPVGSNPYPFYSAVYDKALVVGKTYTLVYEAEFQSGGANSFFRPYFSGTQHFSETNQSFGRQVFVVKAQLWAQNTDAINFYIVGSQPDQDNSYAKVYWACLYEEDQPNPIKVWMPNTRENSAKLEVQGQSIDGLMTKWSVKADVNGYVSGVAMNNNGREANFIIRADTFAIAPPVGSGGGDVPKYGFVYQASAKTLPNGTVIPAGLYVDNLMLGEINAEKINANSLSAISANLGTFTSSNAKGTMTISGTDISVKDTNGVERIFIGL
Physico‐chemical
properties
protein length:2211 AA
molecular weight: 241312,59750 Da
isoelectric point:4,77308
aromaticity:0,07734
hydropathy:-0,37440

Domains

Domains [InterPro]
Coil
60–84
Coil Coil Coil PTHR34491 IPR039477
IPR008979
800–878
IPR008979 G3DSA:2.60.120.260
G3DSA:2.60.120.260
800–922
G3DSA:2.60.120.260
YP_009813090.1
1 2211
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage vB_AbaM_B09_Aci01-1
[NCBI] 		2315466 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009813090.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048074 [NCBI]
CDS location
range 19035 -> 25670
strand +
CDS
ATGGATAATTTAGACAACGGTTTAGAGTTATTATCAGGTAGATTAGTAGTCTTATTTTTAACTTATGATTTGGCTTTGAAAGCTTCTGCTAATTTTCCAGCTGGAACCAAAGTCAAAGTAACCAATGACCCAAACCCTGATTTAAATGGTGAATACACTTGGGATGGAACAAAGTTAGTAAAAACTACAAATAACACACTTGAGAAGGCTAAAGAGGAAGCTGAAAAGATTGTCAATGACAAAATAGACAATACTTTAACTAAAGATAAGATTTTAGACCTTATCTCTGGTGAAATTACAGAAAGTGACTTAGATCAAAACTTAAGACAACGTATAGATGAGATTGAAAGTATTTCACCGATCATCGATAAGTTGAAGAAAGATGTGAAAAAATCTAAGGAAGAGGTGGATGAAAAAGTTTTCTTCTTAAATGTTGATTATCAGAATTTGAAAGAAGAAGTTCAGAATATCCAACTCCAAGTAGATTTAGATTTCCAAGCGATTCAAGATCGTATTGATCAGATTCAAGCTGAAGTTGACGCTAAATGGCTTGAAGTTGACCAAATTAGAGATGATTTAACAAAAGAAATTAATGATCGTGTTGCTGCTGTCCGTGAGGAAACAGAACAACGTATCGAAGATGTAAGAAAATTAAATGATGGTTTAACTCAAGAGATCATTGATCGTAAAGATGGTGATCAGAAGTTATATGAAAACATCGAAAACTATAAAGTGTCAAATGATGATGCTCTTGCTAACGTAAGAGAGGAAGTCAGAGTTGCCGTAGATACTGCCAATGCTTCTGCTGAAAAAGTAGATTCTATGGATGCCAGAGTTAAGGTTGCAGAGGACAATGCTGGAACTGCTTTAGAAAACTCTGCTGCTGCTGTTAGTAAAGCCAATGCTGCTTCTGATTTAGCTAGTGCAACTGCTGGTCGTGTCGATAGTATGCAAGCTGATGTAGTCAAAGCTCTTGACGACTCTGGTACAGCTCTTACAAACTCTGCTACAGCTATTGAGCAATCACAGGTTGCTGTTGATAAAGCTAATGCTGCTGCTGAGTCTGTTACTGTACTTGAATCGAAGCTTAACAGCAAGAATGCTACATACAGACAAGATACTGCACCAACAAAAGACACACACCCAAATTTAACTGAAGGTGATCTATGGATTAACCCTTCGGCTAACAATGAACAAAAACGCTGGAATGGTACTGACTGGGTTGACATCTCAGATGTTCGTGTAGGTCAGAATGCTACAGCTATCTCAGAGTTGAAAACCTCTGTAAAAGAGCAAGATGATAAAATCACTGCCGTTTCTGAGAAAGTAACGAGCCTTGAGGCAACGATAGGTGATATGGCTACCTCAGAGGCCCTTGAACAATTAAAGGGTACTGTAACTGAACAGGGTGACAAAATCGATGCCAATACAGAAAAGCTTGTAGCTCTTGAGACAACTGTAGGGAAGAATCAAGAAGCAAATGCTAAGGCTCTTCAAGATTTAACTACTCGAATCGAGAAAGATGAAGATGATATTAAGGCAAACACCTCAGCTATCACAGCATTGGATTCAACAGTAAATGCATCATTGAATGCAATCAACATCACAGCTGATATGAACCTTGAAAATGACTTGATATACTACAATAGTTCATCACAAAATGTTGTTAAGTCAATCTCTGAATCAGGTACAACAAGAAGGGTTTTAACTATTGGAGACAATAGTAGTGATGATATGGCTTGGATGTATCCAAAAGCCATGTTACCTTATGATCCAGATGTTATGTACAAGGTAAGAGCTAAATTAAGACGCTTATCTGGAGATGGTGCTGTTTACCTTGGATTAGTTGTTAAGAATAGTGATAAAACCCAATTTGTTACTTCTAACAACATATTATCAGATAATGTTTCTAGTTCATCTTATTTTGCTGATGGAGTCATTCCTCCATTAAATGAGTGGGTTGAATATGAGTGGTATATTAAAGGTAGAGCTTCTTCTAGCGCTCTTCTTCCACCTACATACGGTGGCTTAGGAAACCCTATCCAAATGCAGAACGCTACTGGATACATCACCCCTGTTTTTATTGCTAACTATTCAGGCTTATCTGGTGTTGTTGAACTTGCTTATATGGTATTAGAGAGAGCTGAAGCATACAAAGTTATTTCAGCAAATGCTAATGCGCTGACAAGTCTTAAAACAGATGTCCAGAAAAATACTGATGGCATTCAAGCAATGGGTGAGGCTATCACTAATGTTGAAGCTTCTATCACAAATATGGATATTGGTGGACAAAACCATTGGACTATTTGGCCTATTGAACCAACACAATCTGATGCTGATAATCCTTACCTTTCTGTACAATGGTTAACCGAGAGTCAGGAATGGATTAGGACTACACTCACAAAGGATGTAAATTCTTACCATCACTCTTTTGATGGTTTGCTGATTGATCTGAGCTATCCTATCGTTATTGGTGAGTTATACACACTGACATTTGAGATGAGAGCTTCTAAGGCAATCACTATTGCAGCTACCACAATCAACTTTGGTACTAATGTCACTTATACAGATAATAGCTTAACAACTGATACTGAATGGAAGACATACACAATCACATTCCCAACGAAAGGGACATTGACATCTAAGGCCAATCAAGCATTTGGTTTAACATTGCTTAAAGGTCATGGATGGACTACAAATGATTGGTATGAATTAAGACGTATCCAAATGCAAAAGGGTAACAAAGCTACTCGATACCAAAAAGCTCAAGCTGGACTGGTTGAAGGAATCAAAGCTAACTCTCAGGCATTTAATGGCTTAAAAGCTACTGTTGAACAGCAAGGTGAGGATATCAAGTCTCAAGGTCAAGCTATCACAGGGCTTAAGCAAGAAATTGCTGACAAAGCAAGTTCTCAAGCATTGTCAGAATTAAAGTCTACTGTCGAACAGCAAGGTGAGAGTATTCGTATTAATACCGAAGCAATTACATCATTAAAAGGTGTAGTTGATGGTAAAGCCGATGCAGATGCCTTGAATAGTTTAAAAATCACAGTTCAAGAGCAAGGTGAAACACTTTTAACTCAAGGTCAGGCGATTACTTCTGTTAGGGCGACAGCCGATCTTGCACTGAATGGTAAGAAAACTTTAATTGACTTAACAGCACTTGACCCTAATCTTTACTACCCCGTATTTATTCCTGTAAGTACAACAGGTATCTCAGAGATTGAGATTTCCCCAAAACTTGGAGATTTTCAAGCTCCTTGGTCCACACACTACAGTGGCTCATATTCACTTGGTGTTCGATGGACAACTCGTGGACATGGGTGGGGTGCAGAGGCAATTGATAGGGTTATTGAAAAATTTGGATATCTTTGGGCAGATCAGTCTCCAGCAATGGAAATTAACCAACGTGGTGAGGATTCGAAAGAATACATCTACTTACGTGGTGGTACAATTTACCCATTCGTGACAAACCAATTTGCTGATACTCCATATTTAGAAAGTAATCCTGTAGGTGTCGCTTTTGATCAAAGTAAAGTTCCACAATCAGTTAATGCTAGAGTAGGTGCAAATGCATCGGCTATTAGTAGTCTTGATTCTAAGATTAATATCGTAGGAGATAAGGTTGATGTTAATGCACAAGCTATCACAGGGTTACAAGCTGAGATAAAGGACAAAGCAAGTTCAGAAGCTTTAAATCAACTATCTGTAACAGTTAGAGATCAAGGTCAATTAATTGATACACAAGGTCAGGCGATTACAAAGGTTGAGTCTAAAGTTGATAATTTGAAGGTTGGTACAGGAAACTTACTTAGAAACTCATCTTTCTCTGAAAGTTTAGATCAATGGGCTTGGAATGGACAAGTTGAATCAGCTGATTTTATTGCAGAGTATGGTATTCCCTCTGGACAATCTAAGTACTTGAAAATGAGAGTTTCTACTGGAGGTTCTGGCTACTACCAAGGTGTTCCATTTGTCAAGCAAGGAGAAGAGGTTATCTTTTCTATTTGGGCAAGGGGTGAAACAGGTAATGAAGTTCTTAGACTACTTTGGGAAGGTCATGAAGCGTTTGCTGACCACCAACTTACAACAAGTTGGGCTAGGTATACGTTAAAGACTAAACCTGTAATCAATGCACCAAACGTTGTTATCTACACTGTTAATGCTGGTACTTTCCATATTTCAAGTGCTCAATATGAGCGAGGGAATATTGTTTCTGATTGGCACCCAAACAGTGAAGATATGGCATCGGCTAGAGCCGTTTCTCTGTTAAATACTAAGATTGATAATGTTGACAATAAAGTTAACATTCAAGCTCAAGCCATCACAGACTTGAGGTCTGACCTTAACAATAAGGCAAATGCTCAAGCTCTTAATGAGCTTAGCACCACAGTCCAAGAGCAAGGTGAGACGATTCAATCTCAAGGCAAAGTCTTGACATCTGTTGAGGCTACAGCGAATAGGACCTCAAGTCAACTTGGAACTACTGTTTCTTACATGCTATACACATTTAGGAATGGTGCTTCGTCAATTACCAAAACTGGTTTATACAAAGCTGATGGAACACGACTGGAAGGTGTTTCTCGTGGACTCAACGTCTATTTGTTTGCTGCTAATGGTGATTTTGTAAGTTTGAGATTCTTCGATACCTATGGTGATATAGATAATGCATGTAACAATATGGTTGCCTACTTATCTGACTTACCTCAGAACTCATTTATTGCAATTGCAGGGTGTGATAACCTTGGGGCAGTAAGCTGGCCTTCAGGTCCTCCAAAAGCATTAAGAGATCACCTTAGAGACGTATGGGGTGTTGCACAAAGCTCAGTAGATAAATGGCAATATAACGATATTCCAATAGTTATTTGTCGTAAATGGGGTCCTAAAAACTCTGCTATTGACAAGCTGTATACATCTAGTATTAATGGAGACTGGTACTCTTTGGGTATTACCTTCATTGATGGCATCCCTAATGATTGGGGTGGAGACACGTCAAAGACTAACATTGAAGCTAATGCTTCAGCCATCTCTACTATGAATGCCGATGTTATTAAAAACAGAGACGATATTAGAGTTAACGCTGAAGCAATTACAGGGTTGAGTGGTAGGATTGATGGTAAAGCAGATGCTCAAGCTTTAAGTCAATTACAAATCACAGTAAAAGAACAAGGTGAAACTATCTCATCTCAAGGTCAAGCTATCACTCAAGTTCAAGCCTCTGCTGACATGGCATTGAATGGTAAAAAATACGTCGTAGACTTAACTGCTCTTGACCCTAACCTTTACTATCCAGTGTTCATTCCAGTCTCATCTGGTAGTGGTATTTCAGAGATTTCGGTCACAGCTTCATTGGATGAATACAAAGCACCTTGGTCATCACATGGTTCAGGTACTTACTCACTAAACGTTAGGTGGAGAGTTAGAGGTAGTGGTTGGGGAGCAAACTCAATAGAAAGGGAAATCCTAAGATTTGGTTATGCTTGGTGTGGTGATCAGTCACCTGTAATCGAGATTAGCCAACAAGGAGAACAATCACGAGAGTATATTTACTTACGTGGTGGTACACAATACCCATTCTACGTTAACCAGTATGCTGGACAGCCATTCACTGACTTAGGAAATTATGGTGGTGTCCCATACCGTACTGACTTGATGCCAGTTACTATCAATGCTGCAACACAAGCTAATGCTTCTGCTGTTAGTACGTTGAACGCTAAGGTTGACATTGTAGATGGTAAAGCGACAAGTGCTGCTGAATCTGTTACTAAGCTTCAAACATCAAGTACAGCTGCAACATACCAGTTGTTAAGAGACTCGAATAAGATTAGGGAAAAGCCTGTAGGTTCTAACCCATATCCATTCTACTCAGCTGTATACGATAAAGCATTGGTTGTTGGTAAAACATACACCTTAGTTTATGAAGCAGAGTTCCAGTCAGGTGGTGCAAACAGTTTCTTTAGGCCATACTTCTCTGGAACTCAACATTTCAGTGAAACTAACCAAAGCTTTGGAAGACAGGTGTTCGTCGTGAAAGCTCAACTTTGGGCACAGAACACAGATGCAATTAACTTCTACATCGTTGGTAGTCAACCTGATCAAGACAACTCTTATGCGAAAGTATATTGGGCTTGTTTATATGAGGAAGATCAACCAAACCCAATTAAGGTGTGGATGCCTAACACCAGAGAGAACTCAGCTAAGCTTGAAGTTCAAGGCCAAAGTATTGATGGTTTGATGACTAAATGGTCTGTCAAAGCTGATGTGAATGGTTATGTCTCTGGTGTAGCAATGAACAACAATGGTAGAGAAGCTAACTTCATTATCAGAGCTGATACATTTGCTATTGCACCTCCTGTTGGTTCTGGCGGTGGTGATGTTCCTAAGTATGGGTTCGTATATCAAGCTAGTGCGAAGACATTACCTAACGGTACTGTTATTCCAGCTGGATTGTATGTTGACAACTTAATGCTTGGAGAGATTAACGCTGAGAAGATTAATGCTAATAGCTTAAGTGCTATCAGTGCTAACTTAGGTACATTCACAAGTTCAAACGCTAAAGGTACTATGACAATCTCTGGTACTGATATCTCAGTCAAGGATACAAATGGGGTTGAGCGTATTTTCATTGGATTATAA

Tertiary structure

PDB ID
0ada1c71b2e17cbba219923d3b004820690e934e84d3962126162a0cf5f47525
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6108
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of five Acinetobacter baumannii phages from Abidjan, Cote d'Ivoire Essoh,C., Vernadet,J.-P., Vergnaud,G., Resch,G. and Pourcel,C. 2019-01-03 — GenBank