Protein

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Genbank accession
CCE26317.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fibre protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MSQTRESARFSNRALIDGKLNYQDGTLSSGKPTSSSLKTQSFFQIFKGKAVKFGGNYKLKTFLGNSIKNSSYSYIILGNLYKDIYIDGKLGIAGSNKVKISLKVVNGYVKKYTMENNENYQNSLVSVVYNGIEYLALALSNVIAAAPVIVDAVMSEDTLETLSYIIDPTQFTTIKPWAVYTDGSKKIYESFNLPLNGWIDAEAVTLTDGTVLLTGGFYNPVLVLDEYSTSQTKVVTNKSYIFNPADRTFRETSNLPYPVNNHRLCAIKNNCALQLGGGAYYSDQANTNNQWWKTVGDILLYTSDNVSGGQKWVILGQWSNYLFRSHGVTYDDVNDYLYVYIPFGTTSPDGADVAINHFGRRKIIYGSDTNNVTLGAVEVLASIPTSLMPSGSSGSNYPWRNTYLHYYNGKIYLPLQDNASNSFSAYGKWNYGLVYDVATNTWSKWINTIAAGDGSQIVRIKDKLYTTGWVSQLKEGTTATTVPLQFESDVNVADMLCFDLTKGTMTYKSPLNLTNNASVIDKNILSAGSSCAMAALKDGRIAIFGGDRGNSFSGVPEYLNTKGLVNLNRPSVGFIYYPDNDTSDTFSGIVVEREISDNTYSSFNQPFKYKGDFYYLSTGKSNDFGTPIDGSKLIKYSVSYGTETILNVDKLTKGLKGAATAVSKSGRVFILGGDKEGVLSNSFFTNDLITYSDTWAAITSLPISVAYGRAKVTPDNKVLYIGGVKSDGTFNRNVYAYDLTSTTWSILTTLPYDFIAGDITENTFNGNTYVFYGLHPDTTTNNNFSIISNTGTVTTKSLSDLSTAISNSYIVGASYLNKDVIRLVDNTGRHWDYDLVNSKITVSLTRRNNFYPQNGIVKLDSDKCCTVDKYGRIYITHLYQREFSERIDHPDRDKIISGFKTDVTGAYNDVVGWESLVDIYTAPMVIPCNEYDNTSIFFTFTVQSRAPNNTTTPQNIIGIYNRVTEKFTFYPSSQLSSVYGATCSDRDGNPIIVGGVKNKTLVQFTENGISYIDSRNVNNVFNMFVYKFDMATKTISQIATMPYQYGNGAAYFDKDTRKLYMFGGYTAQKVPYWDIASNSLSTQRCMVYDVDTNTFSLIASLPNYGIGWGNCFRKDKDKIIIFGGYIGLVDDKVDLPSLRQDLGNPNKIIYEYSISSNTYKDVSVEYSFIQNFRGLTNGKNEFCEVHFAERIPNCEKNEILFYNQLNTSKDSSSGFIHTGYTPKFLGGQLNILNLDTKEFRVVDTANMVPIASAALWSPYLSASKSLLHYGVDGKFYEMNKYIAGSASVFNSPTKIGIVRNYL
Physico‐chemical
properties
protein length:1302 AA
molecular weight: 144700,70400 Da
isoelectric point:7,41399
aromaticity:0,12826
hydropathy:-0,25760

Domains

Domains [InterPro]
IPR015915
196–377
IPR015915 IPR015915 IPR037293 IPR015915
IPR015915
197–562
IPR015915 IPR011043
IPR006652
707–751
IPR006652
CCE26317.1
1 1302
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage phiR1-37
[NCBI] 		331278 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Yersinia enterocolitica
[NCBI] 		630 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Yersinia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CCE26317.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AJ972879 [NCBI]
CDS location
range 209700 -> 213608
strand -
CDS
ATGTCACAGACTAGAGAGTCCGCAAGATTTAGTAACAGAGCACTAATAGATGGTAAATTAAATTATCAGGACGGAACCTTATCTTCTGGTAAGCCTACTAGCTCTAGTTTAAAAACTCAATCTTTCTTCCAAATTTTTAAAGGTAAAGCTGTAAAATTTGGCGGTAACTATAAACTTAAGACATTTTTAGGTAATTCTATTAAAAATAGCTCTTATTCATATATTATTCTAGGCAACCTATACAAAGACATCTATATTGATGGTAAATTAGGTATTGCTGGAAGTAATAAAGTAAAAATCTCTTTAAAGGTAGTAAATGGGTATGTTAAAAAGTATACTATGGAAAATAATGAGAATTATCAGAATTCTCTAGTTTCAGTAGTATATAATGGCATAGAATATTTAGCATTAGCTTTATCAAACGTCATAGCTGCAGCACCTGTAATTGTGGATGCTGTAATGTCTGAAGACACATTAGAAACCCTTTCATACATTATTGATCCTACGCAATTTACTACAATTAAACCTTGGGCTGTATATACAGACGGGTCTAAGAAAATTTATGAAAGTTTCAATTTACCCTTAAATGGATGGATTGATGCTGAAGCAGTTACTCTTACAGATGGTACTGTATTACTAACTGGAGGGTTTTACAATCCAGTATTAGTATTGGATGAATATAGTACTTCTCAGACAAAAGTAGTTACCAATAAATCATACATCTTCAATCCAGCGGATAGGACTTTTAGAGAAACTTCTAATTTACCTTATCCAGTAAATAATCATAGGCTTTGTGCTATAAAAAATAACTGCGCCTTACAATTAGGAGGGGGTGCATATTATAGTGATCAAGCAAATACTAATAATCAGTGGTGGAAAACTGTTGGGGACATACTGCTTTACACTAGTGATAATGTAAGTGGTGGTCAAAAATGGGTTATTCTTGGTCAATGGAGTAATTACTTATTTAGAAGTCATGGCGTAACTTATGATGATGTAAATGATTATCTATATGTATACATTCCATTTGGGACTACATCACCTGACGGAGCTGATGTAGCAATAAACCATTTTGGTAGAAGAAAAATTATTTATGGGTCTGATACGAACAACGTAACTCTAGGAGCAGTAGAAGTCTTAGCTTCTATTCCTACCTCATTAATGCCGTCTGGTTCGTCTGGTAGTAATTATCCTTGGAGAAATACATATCTACATTATTATAATGGTAAAATTTATTTACCATTACAGGATAATGCTTCTAATTCATTTTCTGCTTATGGTAAATGGAATTATGGTTTAGTATATGACGTAGCTACTAATACTTGGTCTAAATGGATTAATACTATCGCTGCAGGTGATGGCAGTCAGATAGTAAGAATTAAGGATAAATTGTATACCACTGGTTGGGTGTCTCAGTTAAAAGAAGGTACTACTGCTACTACTGTCCCATTGCAATTTGAATCGGATGTCAACGTAGCAGATATGTTATGCTTTGATTTAACAAAAGGTACCATGACATATAAATCCCCATTAAACCTTACAAATAATGCATCGGTTATAGATAAGAACATTTTAAGTGCCGGTTCCAGTTGCGCTATGGCTGCACTTAAAGATGGTAGGATAGCAATTTTTGGCGGAGATAGAGGAAACAGTTTTTCTGGAGTACCTGAGTACTTAAATACTAAAGGATTAGTAAATCTAAATCGTCCTTCTGTTGGATTTATTTACTATCCAGATAATGATACCAGTGACACCTTCTCAGGTATTGTAGTTGAAAGAGAGATTTCTGATAATACATATTCTTCTTTCAACCAACCATTTAAGTATAAAGGTGATTTCTATTACTTAAGTACTGGTAAGAGTAATGATTTCGGTACACCAATTGATGGTTCAAAATTAATTAAATATAGTGTATCTTATGGTACTGAAACTATTTTAAATGTAGATAAACTTACAAAAGGATTAAAAGGTGCAGCTACGGCTGTTTCTAAATCTGGTAGAGTATTTATTTTAGGTGGTGATAAAGAAGGCGTTTTATCAAATAGTTTCTTCACTAATGATCTGATTACATATTCGGATACTTGGGCTGCTATAACCTCTCTACCAATATCAGTGGCATATGGTAGAGCTAAAGTAACTCCGGATAATAAGGTACTGTATATTGGTGGGGTTAAATCAGATGGAACATTTAATCGGAATGTATATGCATATGATTTGACTAGCACTACTTGGTCAATCTTAACTACATTACCATATGATTTTATTGCTGGCGATATAACTGAAAATACATTTAATGGAAATACTTATGTATTTTATGGTTTACATCCAGATACTACTACTAATAATAATTTTTCCATTATTAGTAATACTGGTACAGTAACAACTAAATCTCTAAGTGATTTATCTACAGCTATATCTAATTCTTATATTGTTGGCGCAAGCTATTTGAATAAAGATGTTATTCGCTTAGTAGATAACACTGGTAGGCATTGGGATTATGATTTAGTTAACAGTAAAATTACTGTATCTCTGACTCGTAGAAATAATTTCTATCCACAAAATGGTATAGTTAAACTTGACTCCGATAAATGTTGTACAGTAGATAAGTATGGAAGAATCTACATCACGCACTTGTATCAGCGAGAATTTTCTGAAAGGATTGACCATCCAGATAGAGATAAAATTATTTCTGGATTTAAAACTGATGTTACTGGAGCATACAATGATGTTGTAGGTTGGGAAAGTTTAGTTGATATTTATACGGCACCTATGGTTATACCATGTAATGAATATGATAATACATCAATATTCTTTACTTTTACTGTACAATCAAGAGCGCCAAATAATACAACTACTCCTCAAAATATTATAGGTATCTATAATAGAGTGACGGAGAAATTTACTTTCTATCCTAGTTCTCAATTAAGTTCTGTATATGGTGCAACTTGTTCTGATAGAGATGGAAATCCTATTATTGTTGGTGGCGTAAAGAATAAGACTTTAGTACAATTTACAGAAAATGGTATATCCTATATAGATAGTCGTAATGTAAATAATGTATTTAATATGTTTGTTTACAAATTTGATATGGCTACTAAAACCATAAGTCAGATAGCAACTATGCCTTATCAATATGGTAATGGTGCTGCATATTTTGACAAAGATACGAGAAAATTGTATATGTTTGGCGGATATACAGCTCAAAAAGTACCATATTGGGATATTGCTAGTAATTCCCTATCTACCCAACGTTGTATGGTATATGATGTAGACACCAATACTTTCTCATTAATAGCTAGCCTACCAAATTATGGGATAGGTTGGGGGAATTGTTTCAGAAAAGATAAGGATAAGATTATTATCTTTGGTGGGTATATTGGACTAGTAGACGATAAAGTAGATTTACCTTCTCTTCGCCAAGACTTAGGGAATCCTAATAAAATTATTTATGAGTATTCAATTTCTTCAAATACTTATAAAGATGTAAGTGTAGAGTACTCATTTATTCAAAATTTCCGTGGTCTTACTAATGGTAAGAATGAATTTTGTGAGGTTCACTTTGCCGAAAGAATTCCTAACTGTGAGAAGAATGAAATTCTATTCTATAATCAACTAAATACCTCTAAGGATAGTTCTTCTGGATTTATTCATACTGGTTATACTCCTAAGTTCCTAGGCGGGCAATTAAATATTCTTAATTTAGATACTAAAGAATTTAGAGTAGTAGATACAGCCAATATGGTACCTATAGCTAGTGCAGCACTTTGGTCTCCATATCTGTCGGCATCTAAATCATTACTCCATTATGGAGTTGATGGTAAATTCTATGAAATGAATAAATATATAGCTGGCTCAGCTTCAGTGTTTAATTCCCCTACCAAAATTGGTATTGTGCGTAATTATTTATAA

Tertiary structure

PDB ID
bf1ada56ed8609db77e73127c65e895879f8a873645d309d2e785632df92f89d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5587
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Yersiniophage phiR1-37 is a tailed bacteriophage having a 270 kb DNA genome with thymidine replaced by deoxyuridine Kiljunen,S., Hakala,K., Pinta,E., Huttunen,S., Pluta,P., Gador,A., Lonnberg,H. and Skurnik,M. 2005 16339954 GenBank