Protein
View in Explore- Genbank accession
- XPO97398.1 [GenBank]
- Protein name
- capsid and scaffold protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MQIWIHDKNMRKVCALNNNVPGMLPYSNSQWHTYLEYSTSTFDFAIPKIVNGKLHDDIKYINDQMYVSFYYDNSYHVFYVSQLVENDTAFQVTCNNTNLELAMESAQSRKADKPQNIAWYLKELDLLGNAGLEIGINEISDKTRTITFDSQQGTKLEQLHSLMNQFDAEFIFRTELNRDGTLKRFIIDIYQQPDENHHGIGKVRGDVILYYQNGLKGVQIASDKTQLFNAGYFVGQEGTNLIDVEFEKKNELGQVEFYSKKGSPMVYAPISLEKYPSTLRDSDTDRWTRKDFETEYKDVNALKGYALRTIKQYAYPLLTYTVDVQSSFVENYKDINLGDTVKIINNNFRDGLALEARVSEMVISFDMPLNNSVVFTNFRKIANNPSSSLQQRIDEIAARALPYRVEITTTNGTAFKNGVGRSTVRPVLKQGDKTVNATWRFVINGEIKYVGMTYDMVASEITQPTALTVSAWVDNKEVASEEVTFLNVSDGKNGAKGDPGPKGDKGDRGNDGLPGKNGVGLKSTTITYGMSDNETTMPTSWTANPPILIKGKYLWTKTQWMYTDLSSETGYQKTYIPQNGSKGDDGLPGKDGVGLVNTTLRYAKSTDGVNKPSGSVVVALNDKYQPSGSTIDNLIMTGQRVRLEQGKTYILSAETNGVFTNQHSETTSNNNATIWIVNPSFSTWAVISDSNTANGTRYTHNRPTGEYEIRVNTYVTDNSIWVKNIVFEDGTWSPDIPTVNPGEYLWTRTTWFYSDGTSEQGFSVAKMGEQGPKGDRGNDGIPGKNGIGIRNTSVLYGLSMAETVPPTAWYQNPPSLVKGQWFWTKTVWTYTNNTTETGYQKTYVARDGNDGNNGIAGKDGVGIRSTTITYAQGTSGTVAPTSGWNSQVPNVPAGQYLWTKTVWTYTDNTNETGYSVSKMGEKGEKGERGAQGERGPQGLQGPQGTQGIPGAKGADGKTQYTHIAYADNTIGGGFSQTDTNKPFIGMYQDFNAIDSQNPQDYRWSKWKGSDGRDGIPGKAGADGRTPYVHFAYADSADGRNGFSLSQNGNKRYLGVCTNFNQADSTNPADYVWNDMVGSVSLGGENLITNSAFPEDLDNWGFWEVPQTNANLSISSHPFYYNGAKPIFLLKTSPSSLVPASTLRFPVKRNTDYSFNIQSFANGNIKGVDIYFLGRKSNETNKTFTKAVNFKSHNGSPSTGGVVKWHLTFNSGECDEGFIRIDNKGTNNGSESLLFFTELDCYEGTTDRAWQASPKDLKKQLDGKADAALTQDQLNKLNEINSVMKAEIEAKASLDTLNQWVKAYQDFVNANNTNRAQAEKNLADASARVAKLENNLNDMSERWNFIDSYMASSNEGLVIGKTDNSSSMLFNPNGRISMFSAGNEVMYISQGVIHIENGIFSKTIQIGRFREEQDYNNPDRNVIRYVGGK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1428 AA molecular weight: 158542,87030 Da isoelectric point: 5,66704 aromaticity: 0,10644 hydropathy: -0,61898
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPO97398.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ571305.1
[NCBI]
CDS location
range 37134 -> 41420
strand +
strand +
CDS
ATGCAAATTTGGATTCATGATAAGAATATGCGCAAGGTGTGTGCGTTAAACAACAACGTTCCTGGCATGTTGCCATATTCTAACAGTCAATGGCATACTTATCTTGAATACTCAACTAGTACATTTGATTTTGCGATTCCGAAAATCGTCAACGGGAAACTACATGATGATATAAAATACATCAACGATCAAATGTATGTGTCGTTTTACTACGATAATTCCTACCACGTTTTCTATGTCTCTCAGCTCGTTGAAAATGACACAGCGTTTCAAGTGACTTGTAATAACACTAACCTTGAGTTAGCGATGGAGTCTGCACAGTCTCGTAAGGCGGATAAACCACAGAATATTGCTTGGTATTTAAAGGAGCTAGACTTATTAGGAAATGCCGGTCTTGAAATTGGTATCAATGAGATTTCTGACAAAACAAGAACAATTACGTTCGATTCTCAGCAAGGCACGAAACTTGAGCAATTACATAGCTTAATGAATCAGTTTGACGCTGAGTTTATTTTTAGAACAGAGTTAAACAGAGACGGGACGTTAAAACGCTTTATCATTGACATCTACCAACAACCAGATGAAAATCACCACGGTATTGGTAAGGTTAGAGGTGATGTCATCCTCTACTATCAAAACGGCTTGAAAGGTGTTCAAATTGCTAGCGATAAAACCCAACTATTCAATGCTGGGTATTTTGTTGGACAAGAAGGCACCAACCTTATAGACGTTGAGTTTGAAAAAAAGAACGAATTAGGACAAGTAGAATTCTATTCTAAAAAAGGCAGTCCGATGGTTTATGCTCCAATATCCTTGGAAAAATATCCATCAACGTTAAGAGATAGCGACACAGATAGATGGACACGTAAGGACTTCGAAACCGAGTACAAGGATGTCAATGCACTTAAAGGATACGCATTGCGTACCATTAAGCAATACGCTTACCCACTATTGACCTATACTGTTGATGTTCAATCTAGTTTCGTTGAAAATTACAAGGACATTAACTTAGGTGATACTGTTAAAATTATCAACAACAACTTTAGGGATGGTCTAGCCCTTGAAGCTCGTGTTTCTGAAATGGTAATCAGTTTTGATATGCCATTGAATAATTCAGTAGTATTTACCAATTTCAGAAAAATAGCTAACAACCCGTCTAGCAGTTTGCAACAACGTATTGATGAAATCGCAGCCAGAGCCTTGCCATATCGTGTTGAGATCACGACAACAAACGGAACAGCATTCAAGAATGGCGTTGGTCGTTCTACCGTTCGTCCAGTCTTGAAACAAGGTGATAAGACAGTTAACGCTACATGGCGTTTCGTGATTAACGGTGAAATCAAATATGTGGGTATGACCTACGACATGGTAGCGTCAGAGATTACCCAACCAACCGCCTTGACGGTTTCGGCGTGGGTAGACAATAAAGAAGTAGCTTCAGAAGAAGTTACTTTTTTAAATGTCTCAGACGGTAAAAACGGGGCTAAAGGCGACCCCGGACCTAAAGGCGACAAAGGTGACCGTGGTAATGACGGCTTACCCGGAAAAAACGGTGTAGGTCTAAAATCTACCACTATCACCTATGGCATGAGTGACAATGAAACCACAATGCCTACGAGCTGGACGGCAAACCCACCGATTTTGATTAAAGGTAAATACCTTTGGACTAAAACGCAATGGATGTATACAGACTTATCTAGCGAAACTGGATATCAGAAAACATACATCCCACAGAATGGTTCCAAGGGTGATGATGGTCTACCAGGTAAAGATGGTGTAGGGTTGGTTAATACCACTCTACGTTATGCGAAATCCACGGACGGTGTCAACAAACCGTCTGGCAGTGTGGTAGTAGCCTTAAATGATAAATACCAACCGTCTGGCTCGACCATTGATAACCTTATCATGACTGGTCAGCGTGTTCGATTGGAACAAGGAAAGACTTACATTCTATCCGCTGAAACTAACGGGGTTTTCACTAATCAACATAGCGAGACCACAAGTAACAATAACGCTACGATTTGGATTGTCAATCCTAGCTTCAGTACATGGGCTGTTATTTCTGATAGCAACACGGCAAATGGAACGAGGTACACGCATAACCGTCCGACTGGAGAATATGAAATCCGTGTCAACACCTATGTTACAGATAATTCAATCTGGGTTAAAAACATCGTGTTTGAAGATGGTACATGGTCGCCAGACATCCCAACGGTTAACCCCGGTGAATACCTCTGGACAAGAACGACATGGTTCTATTCGGACGGTACGAGTGAGCAAGGTTTTTCTGTTGCAAAGATGGGAGAACAAGGACCCAAGGGAGACCGTGGGAACGATGGGATACCGGGTAAGAATGGTATCGGAATTAGAAACACTAGCGTTCTATATGGTCTATCTATGGCCGAAACTGTACCACCTACAGCATGGTATCAAAACCCGCCATCACTAGTTAAGGGACAATGGTTTTGGACTAAGACAGTCTGGACTTACACGAATAACACCACCGAAACCGGTTATCAGAAAACCTACGTTGCTAGAGATGGTAACGACGGGAATAATGGTATCGCTGGTAAGGATGGTGTCGGTATCCGTAGCACTACGATCACTTATGCGCAAGGCACATCGGGCACGGTAGCACCAACAAGCGGTTGGAATAGCCAAGTACCTAACGTGCCAGCAGGGCAATACCTATGGACCAAGACGGTTTGGACTTATACGGATAACACCAATGAAACGGGCTACTCAGTGTCTAAAATGGGCGAAAAGGGCGAAAAGGGCGAACGTGGAGCGCAAGGTGAGCGTGGTCCACAAGGCTTGCAAGGCCCACAAGGAACCCAAGGGATACCGGGTGCAAAGGGCGCTGATGGTAAAACACAGTATACCCACATTGCTTATGCTGATAACACAATCGGTGGTGGTTTTAGTCAAACAGATACTAACAAGCCATTTATTGGAATGTATCAAGATTTCAATGCTATTGATAGTCAAAACCCGCAAGACTACCGTTGGTCTAAGTGGAAAGGTAGCGATGGACGGGATGGCATCCCGGGTAAAGCTGGGGCGGACGGAAGAACACCTTACGTCCACTTTGCTTATGCAGACAGTGCCGATGGTCGAAATGGTTTCAGTTTGAGCCAGAATGGCAACAAGCGCTATTTGGGTGTATGTACCAACTTCAACCAAGCAGACAGCACAAACCCAGCTGATTATGTTTGGAATGATATGGTTGGTAGCGTGTCGCTCGGTGGTGAAAACTTAATAACAAACTCAGCATTTCCAGAGGATCTGGATAACTGGGGATTCTGGGAAGTGCCGCAAACAAACGCAAACTTGTCGATTTCTAGTCACCCGTTTTATTACAATGGCGCTAAACCGATATTCTTACTTAAGACATCGCCATCATCATTAGTGCCAGCTTCTACGCTGCGTTTCCCAGTTAAACGCAATACTGATTATTCATTCAATATTCAATCGTTTGCTAATGGGAATATTAAAGGCGTAGATATCTATTTTCTCGGACGTAAGTCAAACGAAACGAACAAAACGTTTACTAAAGCAGTCAATTTCAAGTCGCATAACGGTTCACCATCAACTGGCGGGGTTGTTAAATGGCACTTGACATTTAATTCCGGCGAATGTGACGAGGGTTTCATCCGTATCGACAACAAGGGAACGAATAACGGCAGTGAGTCACTGTTATTCTTCACAGAGCTGGATTGTTACGAGGGCACCACTGACCGAGCATGGCAAGCGTCGCCTAAAGATTTAAAAAAACAATTAGACGGTAAGGCTGACGCTGCATTAACACAAGATCAGTTGAATAAGCTAAACGAAATCAATTCCGTGATGAAAGCAGAAATCGAAGCAAAAGCATCCCTTGATACGCTTAACCAATGGGTGAAAGCTTACCAAGATTTCGTGAATGCAAATAATACCAATCGAGCACAAGCCGAAAAAAACCTTGCGGATGCAAGCGCTCGTGTAGCAAAGCTAGAGAACAATCTGAATGACATGTCAGAGCGTTGGAATTTCATTGATAGCTACATGGCATCGTCTAACGAGGGTCTAGTTATTGGTAAAACCGATAATTCTAGCTCTATGCTATTCAATCCAAATGGCAGAATTTCAATGTTCTCAGCAGGTAATGAAGTGATGTATATCTCGCAAGGTGTGATTCACATTGAGAATGGTATCTTCTCGAAAACGATTCAAATAGGTCGATTCAGAGAGGAACAAGATTACAACAACCCAGACCGTAACGTCATTAGATATGTAGGAGGTAAGTAA
Tertiary structure
PDB ID
0b3915bf67fb1a686b2e41a002d8d6e3b8f624030f06024e864dccfd77df57a0
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50