Protein
View in Explore- Genbank accession
- WBF82171.1 [GenBank]
- Protein name
- glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MTDRPRTQASLGSQWQRVNSDNLKFDNLILAKVIKVYYQYQTVELQSLSGKMRIAQGLGTSGKFSAPYPKEFTGMTPENNPYGHIPVIVPGTLVLVAFVDGNPSNPIIVNSYGYNDLNTKLVRTPMISGDMRDNEQFKFNSSSYTLKPSLTYEYFDGEGNVVKTWNGKSLLSVTSDHNEQESSTDFMYGTLYDDLFTSRYADNSLIEPRIQRAPNMLFKHQGEFDMYGEPDNHITMFYLSSDGTFRRSTLNKEEQFRTTVEQDNKGNYRVQYQADSVIIDEGQDYVEFGIDTEKQEFYVKNLDHSFRFNDDGILVDGKPLLANIDDGINDAFEKLDKLEKSMERINDIIQDLGDRNLRELINATNKAISDVSDLTNALATTNKNVSDNKTKIDNSIIKYDKFMQDIGDYQITNNEIVNSHTTSINKINNTELPSIKLDISNIKNKVKTQYVIGDDSPTSNFTTRFQNILNEIRDNGGGTLYVLPGNYEIKSRIKIYDNTTIIMTNQTKLLRCHNGGFFDNGDPYNNVGGYDGVSNITIIGGILDNNYENIDKYPTKQINMIALRHAKNITIKDLTFRNGITVHCVDMNGSKDVLFDGCRFEGYVNLNNASDKEALQISEYVTGGIDGGIFDGTPCKNITIKNCTFSSSDILGGYNVCIGNHISANNVFNSNIKIYNNTFKDCNIAIRDWKWNDLDIHGNTFINNKECLRASSIGSSYDSAKNIDGTPSNQSQATRNLIFNENKIYNFTSVAIGIYGIQDNDTALIENVKVRDNYIKGSGQGIISSLVKDIVIEGNDIEDTYRAIKYSATKNIRVLNNTISNSKTEAIYGDVSNYGEVHSINYNSIIKHNIIDNTQKNGVFISTGDIINITDNVITNSNMINEENNKRGSIKVDYSDKCIINNNSLYGQTERFAIQATTSTNVISNNNNTNIQE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 933 AA molecular weight: 104819,24970 Da isoelectric point: 5,11371 aromaticity: 0,09003 hydropathy: -0,54866
Domains
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Mammaliicoccus virus vB_MscM-PMS2 [NCBI] |
3003794 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBF82171.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP913465
[NCBI]
CDS location
range 68273 -> 71074
strand +
strand +
CDS
ATGACAGATAGACCAAGAACACAGGCAAGTTTAGGTTCTCAATGGCAACGAGTAAATTCAGATAATTTAAAATTTGATAACTTAATATTGGCTAAAGTCATAAAAGTTTACTACCAATACCAAACGGTAGAGTTACAATCCCTAAGTGGTAAAATGAGAATAGCACAAGGATTAGGTACAAGTGGTAAGTTCTCTGCACCATACCCTAAAGAATTTACGGGAATGACACCGGAAAATAATCCTTACGGACATATACCGGTTATCGTACCCGGAACATTAGTATTAGTTGCTTTTGTTGACGGTAATCCTAGTAATCCTATTATTGTCAATAGTTATGGATATAATGACTTAAACACTAAACTAGTAAGAACACCTATGATTAGTGGGGATATGAGAGACAATGAGCAATTTAAATTTAACAGTTCATCTTACACATTAAAACCAAGTCTTACATATGAATACTTTGACGGTGAGGGTAATGTAGTTAAGACATGGAATGGTAAGTCTCTGCTATCGGTAACTAGCGACCACAACGAGCAAGAAAGCTCTACCGACTTTATGTATGGAACTCTTTATGACGACCTATTTACGAGCCGTTACGCCGATAACTCACTAATAGAGCCGAGGATACAAAGGGCACCTAACATGTTATTTAAACACCAAGGTGAATTTGACATGTATGGTGAGCCGGATAATCATATTACAATGTTTTATTTGAGTTCCGATGGTACATTTAGACGTTCTACATTAAATAAAGAAGAACAATTTAGAACAACGGTAGAGCAAGATAATAAAGGTAACTATAGAGTACAATATCAAGCAGATAGTGTTATTATAGATGAGGGTCAAGATTACGTAGAGTTTGGTATAGATACGGAAAAACAAGAGTTCTATGTTAAAAACTTAGACCACTCATTTAGATTTAATGATGATGGTATATTGGTAGACGGTAAACCTTTATTAGCTAATATTGATGACGGTATTAATGATGCATTTGAGAAACTAGATAAGCTAGAAAAATCTATGGAAAGAATAAATGACATTATCCAAGATTTAGGAGATAGAAATTTAAGGGAACTTATTAATGCAACAAATAAAGCTATTAGTGATGTTAGTGACTTAACTAATGCCTTAGCTACAACTAATAAAAATGTTTCCGATAATAAAACTAAAATAGATAATTCCATAATCAAGTATGATAAGTTCATGCAAGATATAGGTGATTACCAAATTACTAATAATGAGATTGTTAATAGTCATACTACTAGTATAAATAAGATAAATAATACGGAATTACCTAGTATAAAATTAGATATAAGTAATATAAAAAATAAAGTTAAAACCCAATATGTAATAGGTGACGATAGTCCTACTAGTAATTTCACAACAAGATTTCAAAATATATTGAATGAAATTAGAGATAATGGTGGGGGTACGCTATATGTGTTACCGGGAAATTATGAAATTAAAAGTAGAATTAAGATATATGATAACACTACAATAATAATGACTAACCAAACAAAGCTATTAAGATGTCATAATGGTGGTTTCTTTGATAATGGAGACCCATATAACAATGTAGGTGGTTATGATGGTGTGTCTAACATTACTATTATAGGTGGCATATTAGATAATAATTATGAAAATATAGACAAATATCCTACTAAACAAATAAATATGATAGCTCTAAGACATGCTAAAAATATAACAATTAAAGACTTGACATTCAGAAATGGTATAACGGTTCATTGTGTAGATATGAATGGTAGTAAAGATGTTCTATTTGATGGGTGTAGGTTTGAGGGTTATGTTAATCTTAATAATGCATCAGATAAAGAGGCTCTACAAATATCTGAATATGTTACAGGTGGTATAGATGGTGGAATATTTGATGGTACACCATGTAAGAATATAACTATTAAGAATTGTACATTTAGTAGTTCTGATATTTTAGGTGGATATAATGTATGTATAGGTAATCACATATCAGCTAATAATGTGTTTAATAGTAACATTAAAATATACAATAATACTTTTAAGGATTGTAATATCGCTATACGAGATTGGAAGTGGAATGACTTAGATATTCATGGTAATACTTTTATTAACAACAAAGAATGTCTAAGAGCATCGTCTATAGGTAGTAGTTATGATAGTGCTAAAAATATAGACGGAACACCAAGTAACCAATCTCAAGCTACTAGAAATTTGATATTTAATGAAAACAAAATATATAATTTTACTAGTGTAGCTATAGGTATCTATGGCATACAGGATAATGATACAGCTCTTATAGAGAATGTTAAGGTAAGAGATAATTATATTAAAGGTTCAGGACAAGGTATTATAAGTAGTTTAGTTAAAGATATAGTTATAGAAGGTAATGACATAGAGGATACTTATAGAGCTATTAAATACAGTGCAACTAAGAATATTAGAGTACTAAATAATACAATAAGTAATTCTAAGACTGAAGCTATATATGGAGATGTATCAAATTATGGAGAAGTACACTCTATAAACTATAATTCTATTATAAAACATAATATTATAGATAATACACAAAAAAATGGTGTATTTATTTCTACAGGAGATATTATTAATATTACAGATAATGTAATAACTAACTCTAATATGATTAATGAGGAAAACAATAAGAGGGGTAGTATTAAAGTAGACTATAGTGATAAGTGCATTATAAATAATAACTCTCTATATGGTCAAACAGAAAGATTTGCTATACAAGCAACAACAAGCACTAATGTAATCTCAAATAATAATAATACAAATATACAAGAGTAA
Tertiary structure
PDB ID
494ba4cfe3da264aff429ceefd9c6dd48e7e36010b1e076bf5e1db033bfddc7f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50