Protein
View in Explore- Genbank accession
- AXC41334.1 [GenBank]
- Protein name
- tail length tape-measure protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPKTLYSIERAADRAAKSLTKMQASRGMMGITKSMDSIGAKLDDLAIAMIEVSDKLESGFTHVGKSVKAMGNDVAAATEKVQDRLYDTNRALGNTARGFNDTTTAAGRASRAIGNTSGSARGATRDFAAMAKVGGSLPLMYAAIASNVFVLQSAFEQLKMGDQLNRLEKFGTIVGTQTGTPVQTLARSLQEAAGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQEIELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNINSLSTFQKQQAYANAVIAESTKRFGYLDEVLRATPWEQFAANADAALRKIQQAAAKYLGPVIDSINAVFYTSQASISASAARAQEETNRQIDPTNVGAVALSLSASEEGYNKALDMYKESLDKRNKLKTEFDKRMSQADASTASAIRLVGEGMPVGLAAGGFEVGGVRIGSSEANKKFVEETAAMGLQVARLGKEVDDSTENLNAWKSAYQAAGAAAAKANPEFQKQINLQKDMNDPDAVYDFNSATLKGLTEQQKAYDQAKKTASDLANDIQNIAQNTNTAAKTSASLSDTIKTIESLSAGTGKNADEYVKSLNLGYNTLSEMKTASQALAGYVKLTGNETKNQLEVQQKIAEVYNQTKDKEKAQEAGRRLEIQQLEEQEAALKRVLETNKGNKAIENEIAKIQLERIKVTNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNNRTMTDTQYRLAQLNLELTVEKEKYAWYTKQADKQKEAEQSRRAQAQIEREIWKFRQDQQMEMASGRERALNISQTSRNVAGESQRLTEQQALYQSLLEITKGNAQAQEEYKRKIQETSAALAQLKIQRDAQMQAGVASSLGANYTPTTGLSGDDKKYADMQNQMASYDEAISKLGALNSQATEVGQSIGNLTNAMMQFSQGSLDTVSTVAAGMQMVSSMIAMGVSNQVSAIDQAIAAEQKRDGKSEASKAKLKKLEAEKVKIQQDAAKKQIIIQTAVAVMQAATAVPYPWSIPLMIAAGVAGALSLAQASSASGMSSIGDSGTETAQYLSLGERQKNVDVSMSANAGELSYIRGDQGIGNANSFVPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVITPMVPMKATPTDELKGSSKGTSGRPIVLNISTMDAASFRDFASSNSAAFRDAVEQALNENGTTLKSLGNS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1235 AA molecular weight: 132840,75540 Da isoelectric point: 6,11868 aromaticity: 0,05182 hydropathy: -0,43215
Domains
Domains [InterPro]
IPR056207
1–81
1–81
1
1235
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Salmonella phage S126 [NCBI] |
2231352 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXC41334.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH370376
[NCBI]
CDS location
range 11157 -> 14864
strand +
strand +
CDS
ATGACTGATAAGCTAATACGAGAACTACTTATAGATGTAAAGCAGAAAGGGGCAACCCGTACTGCAAAATCTATTGAGAACGTTTCCGATGCGTTAGAAAATGCTGCTGCCGCTTCCGAACTGACTAATGAGCAGTTAGGAAAAATGCCCAAAACTCTTTACTCCATTGAGAGGGCAGCGGATAGAGCGGCTAAAAGTCTAACTAAAATGCAGGCTAGCAGAGGTATGATGGGTATCACCAAATCTATGGATAGTATTGGTGCTAAGTTAGACGACCTTGCTATTGCTATGATTGAGGTATCTGATAAGCTAGAGTCTGGATTTACACATGTTGGTAAATCTGTTAAGGCGATGGGTAACGATGTAGCTGCTGCAACTGAAAAAGTTCAAGATAGATTATATGATACTAACCGAGCGCTAGGTAATACTGCTAGAGGCTTTAATGATACAACTACCGCTGCAGGGCGCGCTAGTCGTGCAATTGGTAATACTTCTGGGTCAGCACGTGGTGCAACTCGCGACTTCGCAGCTATGGCTAAAGTTGGTGGTTCTCTACCTCTTATGTATGCTGCTATCGCATCTAACGTGTTCGTTCTACAATCTGCATTCGAACAACTTAAGATGGGTGACCAGTTAAACCGTCTGGAGAAGTTCGGTACTATTGTAGGTACTCAAACAGGTACTCCGGTACAAACTCTAGCTAGATCTCTACAAGAGGCTGCTGGTTATGCAATCTCCTTCGAAGAAGCAATGAGACAGGCATCCTCTGCTTCTGCATATGGATTCGATGCTGAACAACTTAATAAATTTGGTCTAGTAGCTCGTCGTGCTGCTGCTGTTCTTGGTGTTGATATGACTGATGCACTTAACCGTGTAATCAAGGGTGTATCTAAACAAGAAATCGAACTTCTGGACGAACTTGGTGTTACTATTCGTCTTAATGATGCTTACGCTGACTACGTTAAACAGTTAAATGCTGCTAACACAGGTATTACGTATAACATTAATAGTCTTTCCACTTTCCAGAAACAGCAAGCGTATGCTAATGCTGTTATAGCAGAATCTACTAAACGTTTTGGTTACTTAGATGAAGTTTTACGTGCTACTCCGTGGGAGCAGTTTGCTGCTAATGCTGATGCTGCACTAAGAAAGATTCAACAGGCTGCTGCTAAGTATTTAGGGCCGGTAATTGATTCTATCAACGCAGTATTCTATACTTCTCAAGCATCTATCTCAGCTTCTGCTGCTAGAGCACAGGAAGAAACTAACCGTCAGATTGACCCAACTAACGTTGGTGCTGTAGCTTTAAGTCTTTCCGCTTCCGAGGAAGGGTATAATAAAGCTCTTGATATGTATAAAGAGTCTCTGGATAAGCGTAATAAACTAAAGACTGAGTTTGATAAACGTATGTCCCAAGCAGATGCTAGTACTGCCTCCGCTATTAGATTAGTAGGTGAGGGAATGCCTGTTGGATTAGCTGCTGGGGGATTTGAAGTAGGGGGAGTGCGCATAGGTTCTTCCGAAGCTAATAAAAAGTTTGTGGAAGAAACCGCAGCTATGGGACTACAGGTAGCAAGGCTAGGTAAAGAAGTTGATGATTCTACTGAAAACCTTAATGCTTGGAAATCTGCGTATCAAGCTGCGGGTGCTGCGGCTGCTAAGGCTAATCCAGAATTTCAGAAGCAGATTAATCTGCAGAAGGATATGAATGACCCTGATGCGGTTTATGACTTTAACTCTGCGACTCTGAAAGGACTGACAGAACAGCAGAAAGCATATGATCAGGCTAAGAAAACTGCTAGTGATTTAGCTAACGATATCCAGAACATCGCTCAGAATACTAATACTGCGGCTAAAACTAGTGCATCCCTATCAGATACGATTAAAACTATTGAGTCTCTTTCTGCTGGTACTGGTAAAAATGCTGATGAGTATGTTAAGAGTCTGAACTTAGGATATAATACTCTTAGTGAGATGAAGACTGCTTCACAAGCTCTTGCTGGTTACGTAAAATTAACTGGTAATGAGACTAAGAATCAGTTAGAAGTTCAGCAGAAGATTGCAGAAGTATACAACCAGACTAAGGACAAAGAGAAAGCACAGGAAGCTGGTAGACGTCTGGAAATCCAACAGTTAGAAGAACAGGAAGCAGCTCTTAAACGTGTCCTAGAAACTAACAAGGGTAATAAAGCAATCGAGAATGAAATAGCTAAGATTCAGTTAGAACGTATCAAAGTTACTAACCAGGGTATGGAAGCCCAGAAGAAGGTTAAGGACTATACGGATAAGATTCTTGGTGTTGATCGTGAAATTGCTCTCCTGAATAACCGTACTATGACAGATACTCAGTATCGTTTAGCTCAGTTGAACCTTGAACTGACTGTCGAGAAAGAGAAATACGCATGGTATACTAAGCAAGCAGATAAGCAGAAAGAAGCAGAACAGTCAAGACGTGCTCAGGCACAGATTGAACGTGAAATCTGGAAATTCCGTCAGGATCAGCAGATGGAAATGGCTTCTGGACGCGAAAGAGCTCTTAATATTTCACAGACTAGCAGAAACGTTGCTGGGGAATCTCAGAGACTAACTGAACAGCAAGCTCTGTACCAAAGTTTACTGGAAATTACAAAAGGAAATGCACAAGCTCAGGAAGAGTATAAGCGTAAAATCCAAGAAACTTCGGCAGCTCTAGCACAGCTTAAGATACAACGTGATGCTCAGATGCAGGCAGGTGTTGCTTCTTCCTTAGGTGCCAACTACACCCCAACTACTGGTTTATCTGGGGATGATAAGAAGTATGCTGATATGCAGAACCAGATGGCCTCTTACGACGAAGCTATTTCTAAACTTGGAGCATTAAATAGCCAAGCAACGGAAGTTGGCCAGAGTATAGGCAATCTTACTAATGCCATGATGCAGTTCTCCCAGGGATCTTTAGATACTGTTAGCACTGTGGCGGCAGGTATGCAGATGGTTTCTTCAATGATCGCTATGGGAGTAAGTAATCAAGTATCCGCTATTGATCAGGCTATTGCAGCAGAGCAAAAACGTGACGGTAAATCCGAAGCATCTAAAGCTAAGCTCAAGAAACTAGAAGCGGAAAAGGTTAAGATCCAGCAGGACGCAGCTAAGAAGCAAATCATTATTCAGACGGCAGTAGCGGTGATGCAAGCAGCAACAGCTGTTCCTTACCCCTGGTCTATTCCTCTTATGATTGCCGCAGGTGTTGCAGGTGCATTGTCTCTTGCACAAGCATCCTCTGCATCTGGTATGTCTTCTATTGGAGACTCTGGTACTGAGACAGCTCAATACTTATCTCTTGGAGAGCGCCAGAAGAACGTGGACGTTTCTATGTCGGCTAACGCAGGAGAACTTTCTTATATTCGAGGAGATCAAGGGATTGGTAATGCGAACTCTTTCGTACCTCGTGCAGAAGGTGGTAATATGTATCCTGGAGTTAGTTACCAGATGGGTGAGCATGGTACCGAAGTAATCACTCCTATGGTTCCGATGAAGGCTACTCCTACTGATGAACTCAAAGGATCTTCAAAAGGTACATCGGGTAGACCTATTGTGCTGAACATCAGTACGATGGATGCGGCTAGCTTCCGAGACTTTGCTTCGAGTAACAGTGCTGCTTTCAGGGATGCCGTAGAACAGGCTCTTAATGAGAATGGAACCACCCTGAAATCACTTGGTAATTCTTAA
Tertiary structure
PDB ID
4508e88d0ae026b0d90a9503c2c20cffc6ab0d3c6fa6b3a06287b1de963b00b3
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50