Protein
View in Explore- Genbank accession
- YP_009281583.2 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber protein distal subunit
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHIGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQITTEGGEFITKSSGTAHVRFHDSADRERGIIFSPANDGLTTQVVNIRVQDYKASSESTFAFNGNGLFSSPEVFGWKSVSTPVIYTNKVITNGKVVGDYDIYSMANNNSDTDKNYLRVVRTNPAAAMLHEICENNGISWYSGSTPTVFMLSFAYSGGFQAGHSIAVGMESAGPMTYSALGKGSIALGDNDTGLKWYQDGYFYVVNNGTRTFLYSPESTVSLRKMVMGYSVNGNDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNASTLMFRGNTTGNSSVDNMTISVWGNTFTNPSEGTRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGNKGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKHGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFTGHGAGAGGYDIQYVQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNSKAVWSLGTEINSGTFVLHHIKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVLVGGGEAAIARNGNIFSDIWKTFTSAGDITNIRDAIATRVAKEGDTMTGTLWINKDAAGIVLNPPLASDSSFIRSDTAGENNWYIGKGGADNGLGFYSYITQGGVYITNTGEISLSPQGQGTFHFNRDRLYINASQWVAHKSGAWGDQWGLEAPVFVDFGSVGNDSYYPIIKGKSGITNEGYISGVDFGMRRITNQWAQAIIRVGNQGNASDPQAIFEFHHNGNMYVPDMVKAGVRISAGGGDPAWTGACVVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGVHIASWSAAYQLHEGLWDTTGALWTEQGKAIISFGHLIQQSDAYSTFVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASEKLSKINGYTYMQKRGLDEEGNQKWEPNAGLIAQEVKAILPELVEGDPDGEALLRLNYNGIIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALIKSLLK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1101 AA molecular weight: 118777,55940 Da isoelectric point: 5,53233 aromaticity: 0,09900 hydropathy: -0,29201
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage UFV-AREG1 [NCBI] |
1837867 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009281583.2
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_031030
[NCBI]
CDS location
range 153785 -> 157090
strand +
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAATTTAAAAGACCGCGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATCATTGATCTGGGTTTTGCTAAAGGCGGTAGCATTGACGGGAATGTTATTCATATAGGAAATTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGAACCTTCACTCAGACTGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCTGCTGGGCAGATTACGACTGAAGGCGGAGAATTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCACATGTTCGTTTTCATGATTCCGCCGACCGTGAACGCGGTATTATTTTTTCTCCTGCTAATGACGGTTTAACTACACAAGTAGTTAACATCAGAGTTCAAGATTACAAAGCTAGTTCAGAAAGCACTTTCGCTTTTAATGGAAATGGTTTGTTTTCTTCACCAGAAGTTTTTGGGTGGAAATCTGTATCAACTCCCGTAATTTATACTAATAAAGTTATTACAAATGGTAAAGTTGTCGGCGATTATGATATCTATTCAATGGCCAATAATAATTCTGACACAGATAAAAACTATTTGCGCGTTGTACGTACCAACCCAGCGGCCGCAATGCTCCATGAAATTTGTGAAAATAACGGCATCAGTTGGTATTCTGGTTCAACCCCTACTGTTTTCATGTTGTCTTTTGCTTATTCAGGTGGTTTTCAAGCTGGGCATTCGATTGCAGTAGGTATGGAATCAGCAGGGCCTATGACGTATTCAGCCTTAGGTAAAGGTTCTATTGCTTTGGGTGATAATGATACCGGATTAAAATGGTATCAAGATGGTTATTTCTATGTAGTAAACAATGGTACGAGAACTTTCCTTTATAGTCCTGAATCAACCGTAAGCCTTAGAAAAATGGTTATGGGTTATTCTGTAAATGGCAATGATTTAACTACTCCTCCTACTGAAAACTATGCTCTCGCTACTGTTGTTACTTACCATGATAATAATGCGTTTGGAGATGGTCAGACTCTTTTAGGATATTACCAAGGTGGTAATTATCATCATTATTTCCGCGGTAAGGGTACCACAAACATTAATACTCATGGCGGTTTGCTAGTTACTCCTGGTAATATTGACGTTATTGGTGGTTCAGTTAATATTGATGGTCGTAATAATGCTTCTACGCTGATGTTTAGAGGTAACACAACTGGTAACAGTTCAGTTGATAATATGACAATTTCTGTATGGGGTAATACCTTTACTAATCCTAGTGAAGGCACCCGTAAAAATGTCATGGAAATTTCTGACGCAACTAGTTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACTACCGGCGAAGTAGAAATGAACGTCAATGGTTCATTTGAATCATCCGGTGTTACTGCTGGAAATAAAGGAGTTCACACAACAGGCGAAATTTCATCTGGGGCTGTGAATGCGCTTCGTATTTGGAACGCAGATTATGGAGCTATTTTTAGACGTTCAGAAGGTAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTATGGTGAAGGTAAACATGGTGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACTGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTTGCTGCTAACGGTTATATTAAATTTACTGGTCACGGCGCGGGCGCTGGTGGTTATGATATTCAATATGTTCAAGCAGCTCCTATTTTCCAGGAAATCGATGATGACGCAGTAAGTAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAACAGTAAAGCTGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCGGGTACATTTGTTTTACACCATATCAAAGAAGATGGATCACAAGGCCATACGTCTCGTTTTAATCAAGATGGTACTGTTAACTTCCCGGATAACGTTCTGGTCGGCGGGGGCGAAGCTGCTATTGCTCGTAATGGTAATATTTTCTCGGATATTTGGAAAACGTTTACTTCAGCAGGAGACATTACAAATATTCGCGATGCAATAGCTACTCGTGTTGCTAAAGAAGGCGATACGATGACCGGCACTCTTTGGATTAATAAAGATGCTGCTGGGATAGTTCTTAATCCTCCTTTAGCTAGTGATTCATCATTTATTCGTTCTGATACGGCCGGGGAGAATAATTGGTATATTGGTAAAGGCGGTGCCGACAATGGTCTAGGTTTTTACAGTTACATTACACAAGGCGGTGTATACATAACAAATACCGGTGAAATATCGCTTTCTCCTCAAGGACAAGGAACATTTCATTTTAATAGAGACCGCCTTTATATAAATGCTAGTCAATGGGTTGCACATAAATCTGGCGCTTGGGGCGACCAATGGGGCTTAGAAGCTCCTGTATTTGTAGATTTTGGTAGTGTCGGCAATGACTCCTATTATCCTATTATTAAAGGAAAATCTGGTATTACCAATGAAGGATATATATCGGGTGTAGATTTCGGTATGCGTCGTATCACTAACCAATGGGCTCAGGCTATTATTCGTGTTGGTAACCAGGGAAATGCTAGCGATCCGCAAGCTATCTTCGAATTCCACCATAATGGAAACATGTACGTTCCTGACATGGTTAAAGCTGGAGTAAGAATATCAGCTGGTGGAGGTGATCCTGCATGGACAGGCGCATGTGTTGTTATTGGTGATAATGATACTGGTTTAGTCCATGGTGGTGACGGCCGAATCAATATGGTTGCAAATGGAGTGCATATTGCTTCATGGTCGGCCGCTTACCAACTCCATGAAGGTCTTTGGGATACTACTGGTGCTTTGTGGACTGAGCAAGGAAAAGCTATTATTTCTTTTGGTCATTTAATTCAACAAAGCGATGCCTATTCAACATTTGTCCGTGATGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAAGACCTTGTTAAATTTGAAAATGCTTCTGAGAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAGCGAGGCCTAGATGAAGAAGGCAATCAGAAATGGGAACCTAACGCCGGTTTGATAGCTCAAGAAGTTAAAGCTATTTTACCAGAATTAGTTGAAGGTGACCCTGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTATAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCAGAACTTAAATCAGAAATCGAAGAACTTAAAGCATTAATTAAATCATTGTTAAAATAA
Tertiary structure
PDB ID
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Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50