Protein

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Genbank accession
QYS24415.1 [GenBank]
Protein name
tail assembly protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,52
Protein sequence
MDFYITDRTFKLETVVSTNGSTQFKVISAEDVSNLETSSRRMTMEISFTPETTGLAKDFFKVGNYVLYIDLNGKYEWMTILKSKHDPLTQVRTLECEDAGLDLLNETVGEYKADKAYNIAYYINKFTYDSGFKIGLNEISKLTRKLEWDGEATALERIQSVATQFDNAEIEFRFEFRGNELVQRYIDIKKKRGTDDFHRLYVNKDVHSIVVEEDIYELVNAIYATGGTPEGAENPINLKGYSWTDPDGRFTLNKSDGIIRDTQNIKQWSRTNTNSHYFLQHKTWETTDKKTLVNNVVSHLKKYSQPVINYVVDIANIPDMLQVGDTVELVDENEKLYLSSRVQQLTFNYESGSCEAVLSDFVRLSSGIAEQLRDIQINIKNDTTAKFNSVPRVFVQEEEPATPKENDIWWVQETVQPTVQPTVQPARLLRLSDVQPLEATPKAEPEKRVNAYKVYKDGQWQDQTIDQSVLNIETLNAVNINGSIINGSEFINTWNKTESISGGQARRQGTTVIGDGAIVQDNDTYIIPTGSTLEKLRTEESTTIQYGQILNSTNNYDVATGTTIEKKSHGLLSSSRVYLSELDYTKANTEVNQQATLEPKGLTFVTTTREGDGLAKITGTTELTGGLIKVNGHSPNMSAWGEGVNTLNAKTTNLFKFGGLVALGFNTDINALNNFVQPASTNDAFQAQRDARIKMQATVLMQGDNATTSSDYAYCKLQVKNTYNELKTTSGGVMLSSAIGTGASDSVRLQWVGTATVVFDVKAGQWFGCVLELRPSRNNLMAMRLVNVQLEEWFPTA
Physico‐chemical
properties
protein length:797 AA
molecular weight: 89306,85560 Da
isoelectric point:5,06597
aromaticity:0,08908
hydropathy:-0,44931

Domains

Domains [InterPro]
IPR007119
61–357
IPR007119
IPR010572
128–346
IPR010572
QYS24415.1
1 797
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterococcus phage VEsP-2
[NCBI] 		2859565 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QYS24415.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ333461 [NCBI]
CDS location
range 22847 -> 25240
strand +
CDS
ATGGATTTTTATATTACAGATAGAACTTTTAAACTAGAAACAGTGGTTTCTACAAACGGAAGTACACAATTTAAAGTTATTAGTGCGGAGGATGTTTCTAACTTGGAAACATCTTCTCGTAGAATGACTATGGAAATTAGTTTCACACCTGAAACAACAGGGTTAGCCAAAGACTTTTTTAAGGTTGGTAACTACGTTTTGTATATTGACTTAAATGGTAAATATGAGTGGATGACTATTCTTAAATCAAAGCACGACCCACTAACACAAGTTAGAACTCTTGAATGTGAGGATGCTGGCTTAGACTTACTAAATGAAACAGTGGGTGAATATAAAGCAGACAAAGCGTATAACATTGCGTACTATATTAATAAATTCACTTACGATAGTGGGTTTAAAATTGGTTTAAATGAAATTAGTAAGCTAACACGCAAACTAGAATGGGATGGTGAAGCTACGGCTTTAGAGCGTATCCAATCAGTAGCCACACAGTTTGACAATGCAGAGATTGAGTTTCGTTTTGAGTTTAGAGGTAATGAGTTAGTACAGCGTTATATAGATATTAAGAAGAAACGTGGTACAGATGATTTTCACAGATTATACGTAAATAAAGATGTGCATTCTATTGTGGTGGAAGAAGATATTTATGAACTTGTAAATGCTATTTATGCAACAGGTGGAACACCAGAGGGTGCGGAAAACCCTATTAACTTAAAGGGTTATTCATGGACAGACCCAGATGGTAGATTCACATTAAATAAGTCAGATGGTATTATACGTGATACGCAGAACATTAAACAATGGTCCAGAACTAACACAAATTCACACTATTTCTTACAGCATAAGACATGGGAAACAACAGATAAGAAAACCTTAGTCAATAACGTGGTTTCCCATTTAAAGAAATACAGTCAACCAGTGATTAATTATGTAGTGGATATTGCAAACATTCCAGACATGTTACAAGTTGGCGATACCGTTGAATTAGTTGACGAAAACGAAAAACTATATCTTAGTTCACGTGTTCAACAGTTAACGTTCAATTATGAATCTGGTTCATGTGAAGCCGTATTATCTGATTTTGTTCGTTTAAGTTCAGGTATTGCGGAACAATTAAGAGATATTCAAATAAATATAAAGAATGATACTACAGCTAAATTCAATAGTGTGCCACGTGTTTTTGTACAAGAGGAAGAGCCAGCAACACCAAAAGAAAATGATATCTGGTGGGTTCAAGAAACCGTGCAACCAACTGTACAGCCAACTGTACAGCCAGCTAGATTATTGAGATTGAGCGATGTGCAACCATTAGAAGCTACACCAAAAGCAGAGCCTGAAAAGCGTGTTAATGCGTACAAGGTATATAAAGATGGTCAATGGCAAGACCAAACAATTGACCAATCTGTATTGAATATTGAAACGCTAAATGCGGTTAACATTAATGGTTCAATTATTAATGGTTCTGAATTTATCAATACATGGAATAAAACAGAGTCTATTAGTGGTGGTCAAGCACGCAGACAAGGAACAACTGTAATTGGTGATGGTGCTATTGTACAAGATAATGATACCTATATTATTCCAACAGGCTCAACATTAGAAAAACTTAGAACGGAAGAGAGTACAACAATTCAGTATGGGCAAATTCTTAATAGCACCAACAACTATGATGTTGCAACAGGTACAACTATAGAGAAAAAATCTCATGGTTTACTTTCATCAAGTCGCGTGTATCTAAGTGAGTTAGACTATACAAAAGCTAATACAGAAGTAAACCAACAGGCAACATTAGAACCAAAAGGTCTTACATTCGTAACCACGACTAGGGAGGGTGATGGACTAGCAAAAATTACAGGTACAACAGAGTTAACTGGTGGGTTAATCAAAGTTAATGGTCACAGTCCTAACATGTCCGCATGGGGTGAGGGTGTAAATACCCTCAACGCAAAAACTACTAACCTATTCAAGTTTGGTGGTTTGGTTGCTCTAGGTTTTAACACAGATATTAATGCTTTAAATAATTTTGTACAACCCGCTAGCACAAATGATGCGTTCCAAGCACAGCGCGATGCTAGGATAAAAATGCAAGCCACAGTATTAATGCAAGGCGACAACGCGACTACCTCATCAGACTATGCGTATTGTAAATTACAAGTTAAAAATACCTATAATGAGTTGAAAACTACATCAGGAGGGGTAATGTTATCCTCCGCAATTGGTACAGGCGCAAGCGATTCTGTGCGTTTACAATGGGTTGGTACAGCAACCGTTGTATTTGATGTTAAGGCTGGTCAATGGTTCGGTTGTGTATTAGAGTTACGACCTAGCAGAAACAACTTGATGGCAATGCGTTTGGTAAACGTTCAATTAGAAGAATGGTTCCCAACTGCATAA

Tertiary structure

PDB ID
95bfa44e62142ef40cc013c9c635000f1c9137d3ab12ffea85b5fd43f5fa93f0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2690
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Comparisson of different enterococcal bacteriophages isolated from single source Tkachev,P.V., Azarov,D.V., Goncharov,N.E., Goncharov,A.E. and Suvorov,A.N. 2023-01-21 — GenBank