Protein

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Genbank accession
YP_010067397.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,80
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGQRPAASVLAEGELAINLKDKTIFTKDDSGSVIELGLKYGGTIDGSLTVNGSIIGNLTGNAATATKLKTARKINGISFDGSKDITLTPSDINVNSTTFIKNNGELPTDANLDTYGPIEEYLGVWSKSTSTNAQPANKFPEENAVGVLEVFVAGQFAGTQRYTVRSGNVYIRSLSAKWNGVDGPWGVWRNVQASTRPLSQTIDLDSLGELEHCGLWRNSSSAIASFDRHYPEEGSSAQGFLEIFEGGLYTRTQRYTTRMGMVYTRCLAAAWDASAPKWEEWKQVGHGTPATFYDGDLNDFKTPGLYNILGTDAVINCPTGEGLPTVIVGLLEVKQRASGGAIFQKFTTAGTGATTRDRIFERAYTGSAWGAWNEVYTSYSLPITLGMGGIKAQLTELDWQTFDFVPGSMFSVPLNKIKNMPANMNWGTIDGNLVMFSVGPSEHTSTGRTVQVWRGTVSQTNYRYFVVRVFGNSGNRTCTVRRVVLEDGRHTWTAQQDFNGAVNFGAPTNFNSTVNLNNTTTFKTEVKFRSLNAFRMYGGKFGTFLRNDGESLYILSTDEDDQDGNFNTNRPFRYELRTGDVTLGGTSGANVLKLKRDSLTAFFGGDINIKGLMTFDAGRLGSRDYFKFNHWGDSNNARDNIIQLEDSKGVHFSTERTLATGAIKTKFFGEVESEGRLIIKRPGDSIVLSTTASNSLHIRGDIDGTGNWYIGKGGADNGLAFYSYATNAGVYITNAGDITLSPKGVEMAHVNNVRLYVHGERWTASQPGDWGSQWQVEAPLFVDHGYVGQDSYYPILKARSVITNQGYSTAVDFGMRRIPSQWGQAIIRVGSTEASPDAGHPQAIFEFHHDGFFYTPGNGSFSDVYIRSDSRLKINKEELEYGAVEKVCRLKVYIYDKVKSIKDRSVIKREVGIIAQDLEKELPEAVSKVEVDGSDVLTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPFFTKIARKISNYFKF
Physico‐chemical
properties
protein length:994 AA
molecular weight: 109375,19200 Da
isoelectric point:6,94785
aromaticity:0,10664
hydropathy:-0,35443

Domains

Domains [InterPro]
cd19958
117–203
cd19958 cd19958 cd19958 IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR030392
882–980
IPR030392
YP_010067397.1
1 994
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterobacteria phage T6
[NCBI] 		10666 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010067397.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_054907 [NCBI]
CDS location
range 155705 -> 158689
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTCAACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAAAACAATTTTCACAAAAGATGACTCAGGTAGTGTTATAGAATTAGGTTTAAAATATGGAGGAACAATTGATGGTTCTTTAACTGTTAATGGAAGCATAATTGGAAATTTAACAGGTAACGCTGCAACCGCAACGAAATTAAAAACAGCACGAAAGATTAATGGTATATCTTTTGATGGGTCAAAGGACATTACCCTAACTCCATCTGACATAAATGTAAATAGTACAACATTTATAAAAAATAATGGTGAATTACCTACTGATGCTAATTTAGATACGTATGGGCCCATTGAAGAATATCTTGGTGTTTGGTCGAAATCTACTTCAACAAATGCGCAACCAGCAAATAAATTCCCAGAAGAAAATGCCGTAGGTGTACTAGAAGTATTTGTGGCCGGCCAATTTGCTGGCACTCAGCGTTATACTGTAAGATCTGGTAACGTCTATATTCGTTCCTTATCTGCTAAATGGAATGGTGTAGATGGTCCGTGGGGTGTGTGGCGTAATGTTCAAGCGTCAACTCGTCCACTTTCACAAACGATTGACCTTGATAGCTTGGGAGAATTAGAACATTGTGGCTTATGGCGAAACAGTTCAAGCGCAATCGCATCATTTGATCGCCATTATCCAGAAGAAGGATCATCCGCACAAGGATTTTTAGAAATATTTGAAGGTGGTTTATACACGAGAACGCAGCGATATACTACCCGCATGGGTATGGTTTATACTCGTTGTCTCGCTGCTGCATGGGATGCTAGTGCACCTAAGTGGGAGGAATGGAAGCAGGTTGGTCATGGCACACCAGCGACTTTCTATGACGGAGATCTGAATGATTTTAAAACTCCTGGGTTATATAATATTTTAGGCACTGATGCCGTTATTAACTGTCCTACCGGTGAAGGTTTGCCGACTGTTATTGTTGGTTTGCTGGAAGTTAAACAGCGTGCTTCTGGCGGTGCTATTTTCCAAAAATTTACTACTGCCGGAACGGGTGCAACTACTCGCGATCGTATTTTTGAGCGTGCATATACTGGTAGTGCGTGGGGGGCATGGAACGAAGTATATACATCTTATTCTCTGCCAATTACTTTGGGTATGGGTGGTATTAAAGCTCAATTAACGGAGTTAGATTGGCAAACCTTTGATTTTGTCCCTGGTAGTATGTTTAGCGTTCCTTTGAACAAAATAAAGAACATGCCAGCAAATATGAATTGGGGTACGATTGACGGAAACTTGGTTATGTTTTCTGTCGGTCCTAGCGAACACACTAGCACAGGGCGTACTGTTCAGGTTTGGCGTGGTACTGTATCCCAGACAAACTACCGTTATTTTGTCGTTCGTGTGTTCGGTAATTCTGGAAATAGAACTTGCACAGTCCGCCGTGTTGTTCTTGAAGATGGTCGCCACACATGGACAGCTCAACAAGATTTTAATGGTGCTGTTAACTTCGGTGCTCCTACCAATTTTAACTCTACTGTTAACCTTAATAACACTACCACATTTAAAACAGAAGTTAAATTCCGCTCGTTGAATGCATTCCGTATGTATGGCGGAAAATTTGGTACATTTTTACGTAATGATGGAGAGAGTCTTTATATTCTTTCCACCGACGAAGATGATCAAGATGGAAACTTTAATACAAATAGACCTTTCCGTTATGAATTAAGAACTGGTGATGTTACTTTAGGTGGTACTAGTGGTGCTAACGTTTTAAAATTAAAACGCGATTCTCTCACCGCATTTTTTGGTGGTGATATTAATATAAAAGGCTTGATGACTTTTGATGCCGGACGTTTAGGATCACGAGATTATTTTAAATTTAACCATTGGGGTGATAGTAATAATGCGCGCGATAACATTATTCAGTTAGAAGACAGCAAAGGCGTTCATTTTTCCACTGAACGCACTTTAGCGACAGGTGCAATTAAGACTAAATTTTTTGGTGAAGTTGAATCCGAAGGTAGATTGATTATTAAACGTCCGGGTGATTCTATTGTATTATCAACAACTGCTAGTAATTCTTTGCATATTCGTGGTGACATAGACGGGACTGGTAACTGGTATATTGGTAAGGGTGGTGCTGATAATGGATTAGCGTTCTATAGTTATGCTACTAATGCTGGTGTATACATTACAAACGCAGGAGATATCACGCTAAGTCCAAAAGGCGTCGAAATGGCTCATGTCAATAACGTTCGATTATATGTTCATGGTGAACGTTGGACTGCTAGTCAACCAGGTGATTGGGGTAGTCAGTGGCAAGTAGAAGCTCCATTATTCGTTGATCATGGTTATGTTGGTCAAGATAGTTATTATCCTATTCTTAAAGCAAGAAGCGTTATAACCAATCAAGGATATAGCACCGCTGTTGACTTTGGTATGCGTCGTATTCCATCACAGTGGGGGCAAGCAATCATTCGCGTCGGATCCACGGAGGCTTCTCCTGATGCTGGACACCCACAAGCTATATTTGAATTCCATCATGATGGATTCTTTTATACACCAGGAAATGGTAGCTTTAGCGATGTGTATATTCGTTCTGACTCCCGTCTCAAGATTAATAAAGAAGAATTAGAATATGGAGCGGTCGAAAAAGTTTGCCGACTGAAAGTTTATATTTACGATAAAGTTAAGTCTATTAAAGACCGTAGTGTTATTAAACGTGAAGTTGGTATTATTGCTCAGGACCTTGAAAAGGAATTACCGGAAGCTGTATCTAAAGTTGAAGTTGATGGATCTGATGTTCTGACAATTTCTAACTCTGCTGTGAATGCTCTTTTAATTAAGGCTATCCAAGAAATGAGCGAAGAAATTAAAGAATTAAAAACGCCTTTCTTCACTAAAATTGCTCGCAAAATTAGTAATTATTTTAAATTCTAA

Tertiary structure

PDB ID
cadd4cacd7481f679113f20b42fa25aa3ca97ab7d5c1076c632c20f048c7d132
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6309
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of bacteriophage T6 Akiyama,T., Ando,H., Kitao,T. and Shimada,K. 2012-04-24 — GenBank