Protein

View in Explore
Genbank accession
AKJ72879.1 [GenBank]
Protein name
putative long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHKGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFHDSADRERGIIFSPANDGLTTQVLNIRVQDYAAGSESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSMSTPQILTNKVITNNKSTGDYDIYSMADNVPLSESTTAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYSGDGLDAYLWSFTWSGGIKSSHSISIGLTPGNKDYSILGPSSIALGDNDTGFKWHQDGYYFSVNNGTKTFLFSPSETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGRYHHYFRGKGVTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNSSTLMFRGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFINPSEGNRKNVMEISDATSWMSYIQRTTAGKVESVINGTQIVNENLTVVKNATFDGTISAAGEIATNAVNGLRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKHGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFAGHGAGAGGYAVQYAQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKAVWSLGTEINSGTFVIHHLKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVSVGGGEATIARNGNIWSDIWKTFTAAGDITNIRDAIATRVSKEGDTMTGRLTLNANSDVIVINSAASESGYMKGQKAGVDNWYVGNGGADNTISFYSFQTNSGVNINEVGEIALSPQGSATFNFNRDRLYINGAYWTAHQAGDWGSQWRQEAPIFVDFGYVGNDSYYPIIKGKSVITNEGYVSGVDFGMRRITNKWAQGIIRVGNQENGSDPQAIYEFHHDGVLYAPNMVQTGARLSAGGGDPAWTGPCLVIGDNDTGLVHGGDGRINMFANGQHIASWGTMYQEHSGLWGSHGGLWTEVDKAIISHGHLVQANDSYSTFVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASQKLSKINGYTYMQKRGTDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDPDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALVKSLLK
Physico‐chemical
properties
protein length:1109 AA
molecular weight: 119780,20410 Da
isoelectric point:5,59463
aromaticity:0,09648
hydropathy:-0,34743

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
449–555
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392 Coil
IPR030392
999–1097
IPR030392
AKJ72879.1
1 1109
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HY03
[NCBI] 		1654926 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AKJ72879.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KR269718 [NCBI]
CDS location
range 134414 -> 137743
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAATTTAAAAGACCGCGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATCATTGATCTGGGTTTTGCTAAGGGCGGTAGTATTGACGGAAATGTTATTCATAAAGGAAACTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCACTTTCACTCAGACAGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCCGCCGGGCAGATTATGACTGAGGGTGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGAACGGCACACGTTCGTTTTCATGATTCCGCCGACCGTGAACGCGGTATTATTTTTTCTCCTGCTAATGACGGTTTAACTACACAAGTACTTAATATCAGGGTTCAAGACTACGCCGCTGGTAGCGAAAGCACTTATGCATTTTCAGGTAGTGGCCTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATGTCAACTCCTCAGATTTTGACCAACAAAGTCATTACTAATAATAAATCTACAGGTGATTATGACATTTATTCGATGGCAGATAATGTTCCACTGTCTGAAAGCACTACTGCTATTAATCATCTCCGTGTCATGCGTAATGCAGTCGGTTCTGGCATTTTCCATGAAGTTAAAGATAATGATGGAATAACTTGGTACAGCGGAGATGGGCTAGACGCTTATCTTTGGTCATTTACATGGAGCGGCGGAATTAAATCGAGTCACTCAATTTCTATCGGTTTAACACCTGGCAATAAAGATTATTCAATACTAGGACCATCTAGTATTGCTTTAGGGGATAATGATACTGGATTTAAATGGCACCAGGATGGATATTATTTCAGCGTCAATAATGGAACGAAAACATTTTTATTTAGCCCTAGCGAAACAACTAGCCTAAGAAAATTTGTAGCTGGATATTCTACCAATGGAACCGATTTAACTACTCCTCCTACTGAAAACTATGCTCTCGCTACTGTTGTTACATATCATGATAATAACGCGTTTGGAGATGGTCAGACTCTTTTGGGATATTATCAAGGCGGTAGATATCATCACTATTTCCGCGGTAAAGGTGTCACAAACATTAATACTCACGGCGGTTTGTTAGTTACTCCTGGTAATATTGACGTTATTGGTGGTTCTGTTAATATTGATGGTCGTAATAATTCTTCTACGCTGATGTTTAGAGGTAACACAACAGGTAGTAGTTCTGTGGATAACATGACAATTTCTGTGTGGGGTAATACATTTATTAATCCTAGCGAAGGTAATCGCAAAAATGTCATGGAAATTTCTGATGCAACTAGCTGGATGAGTTATATTCAACGAACAACTGCAGGTAAAGTCGAATCGGTTATAAATGGCACCCAGATTGTTAATGAAAACTTGACAGTAGTAAAAAATGCTACATTTGACGGTACAATCAGCGCAGCCGGTGAAATCGCGACAAATGCTGTAAATGGTCTTCGCATTTGGAATGCAGATTATGGAGCCATTTTTAGACGTTCAGAAGGCAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTACGGTGAAGGTAAACACGGCGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACTGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTCGCAGCAAATGGCTATATTAAATTTGCTGGTCATGGAGCTGGGGCTGGAGGTTATGCCGTTCAATATGCTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAATTCTTAAATGGTAAAGCAGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCTGGTACATTCGTTATTCATCATCTGAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACGTCTCGTTTTAATCAAGACGGTACTGTTAACTTCCCAGATAACGTTTCTGTCGGCGGCGGCGAAGCTACTATTGCTCGCAATGGTAACATCTGGTCTGATATCTGGAAAACGTTTACTGCAGCAGGAGACATTACAAATATTCGCGATGCTATTGCGACTCGTGTTTCGAAAGAAGGCGATACAATGACAGGCCGTTTAACTCTTAATGCCAACTCGGATGTTATTGTTATTAATAGTGCTGCAAGCGAATCCGGTTATATGAAAGGACAAAAAGCAGGCGTTGATAACTGGTATGTTGGTAACGGCGGCGCCGATAATACTATATCATTTTACAGTTTCCAAACTAACAGCGGTGTTAACATTAATGAGGTCGGAGAAATTGCTTTATCTCCTCAAGGGTCTGCTACTTTTAATTTTAATAGGGATCGTCTTTATATAAATGGAGCATACTGGACTGCGCACCAAGCTGGCGATTGGGGAAGTCAATGGCGTCAAGAAGCTCCGATATTTGTGGATTTTGGCTACGTCGGTAATGATAGTTATTATCCAATTATCAAAGGAAAATCTGTTATTACGAATGAAGGATACGTATCTGGTGTAGATTTTGGTATGCGCCGTATCACTAACAAATGGGCACAAGGTATTATTCGTGTAGGTAACCAGGAAAATGGTTCTGACCCGCAAGCTATATATGAATTCCACCACGATGGAGTTCTGTATGCTCCTAACATGGTTCAAACTGGAGCAAGATTATCAGCTGGTGGAGGTGACCCTGCATGGACTGGACCATGTCTTGTTATTGGTGATAATGATACCGGATTAGTTCATGGTGGTGATGGTCGTATTAACATGTTTGCTAACGGACAGCATATTGCATCATGGGGTACGATGTATCAAGAACACTCAGGACTATGGGGAAGTCATGGTGGTTTGTGGACCGAAGTTGATAAAGCGATTATTTCTCACGGTCATCTAGTCCAGGCGAATGACAGCTATTCAACGTTTGTCCGTGATGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGCGTTAAAAAAGACCTCGTTAAATTTGAAAATGCTTCTCAGAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAACGTGGAACAGATGAAGAAGGTAATCAGAAATGGGAACCTAACGCTGGTTTGATAGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTGCCTGAATTAGTTGAAGGTGACCCGGATGGTGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCAGAACTTAAATCAGAAATCGAAGAACTTAAAGCATTAGTTAAATCGTTGTTAAAATAA

Tertiary structure

PDB ID
d9a122c7078c0977e8e55b5ea21a00e9a456e5cec6de9833911c6240ef8ca9ff
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5313
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of E. coli O157:H7 Bacteriophage HY03 Lee,J.-H., Park,E.-A. and Lee,D.-H. 2016-12-29 — GenBank