Protein
View in Explore- Genbank accession
- UCR74186.1 [GenBank]
- Protein name
- L-shaped tail fiber protein
- RBP type
-
TSPTSPTFTF
- Protein sequence
-
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDEDDNVVQLAGKGVPFLDTAGNLNVDGTTTLKDNVTISPNKAINFEATDLSGAIVRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGILEIGTIDDGAETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLSTNKTVKINNGSTLVLEMGVGSNDVYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYVISAATAGTPRWVKVATIKHPGDASSQLDLMITGGIDSGHGRHYVDFITLSGRNLTSWSTSNLDNWVEWRRIGSPNKGNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTAGYNGQDSGKVIIYETGQDTGATGQSGSILVSMKQIFDSSAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLGTAAVRDVGEGAGNLLENGAYGLGGNGGKSIEDIVSNVDMMTRLKAYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNSGLAAGNVRYNELYGTANKPTKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLAAPNLHASGSGTASVYVNAGTGNAHVWFRTDANERGVIWATPNTADLGQINIRAKTTGNTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLNTIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGSMVDLGSENSDKYSRLTLARKVGSGASVAMLKITPEGYVQFGYQDAVANPSPSKYIRVKPDGLDVEGDLVFNQTYRGTEEAVDISDKTVDLNGLVIKRTDPGTRQLYKCVSSGGGSNISNKPTSDGNFVLEVLSLRKVSDTDWSCKQTFTTKNGGVEGTYVRYGQNGSWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSAASARNNLGVGEGQSVKFGWLVVNGVGTSDPTITFKNGAVVREAQGGSTGALIMSASATAATAAKYIAFRPYGDSSNSEIRVKAFGNNETSLEWSQGAGVRSNTQGAFVVYAKAGQALHLRPNGDSANQSTVIDQNGKMTVGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKNGMPGKMAIGKSNSFTVMVSANTNNQINPADTFSDIFKVDANGNQTVYGNAQINRQLTVSSSATVAGAINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNNQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGSLDVTGTRLKTWRLEVDGGGTVLGGTIDVAGKAVFSKDILVEKQLDVRGAGACHLRFSKADGSEKGLIYADDDKNVSIRSGGDNGPSWNFWSSGSCQFPGAISNYNGISSTTYYPGGNKNDYLNTAGLVSRFSNGAYASLYFQEYVGNYHQAILNVNGYGEDDSFYFRSGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYVLHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1516 AA molecular weight: 159821,31190 Da isoelectric point: 6,10408 aromaticity: 0,07124 hydropathy: -0,34017
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage vB_KpnM_5N [NCBI] |
2873401 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UCR74186.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ890186.1
[NCBI]
CDS location
range 57006 -> 61556
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGATCAAAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATTGTGTTAAATACGCATGGACGTACTCTCGCTATCTACACCAAAGATGAAGATGATAATGTTGTTCAGCTTGCCGGTAAAGGTGTTCCTTTCTTAGACACCGCTGGTAATCTTAATGTAGATGGAACTACTACGTTAAAAGACAACGTAACTATTTCTCCGAATAAAGCAATCAATTTTGAAGCTACGGATTTAAGCGGAGCAATAGTGCGTCATATCGTCGGCAAATGCGCTACTAACGATGGCTGGTACATCGGCGCCGGTGGTACAAGCAATAGCGGTATTCTTGAAATCGGTACTATTGATGATGGTGCTGAAACCATCCAATTTGTGCAACGTGGCGCAGGTAATGTTGAAGCCCGAAAATTAGTCTTGCTTGATGGTTCAGGTAATACTACTCTTCCTGGCGATTTAAGATTATCCACTAATAAAACTGTTAAAATTAACAATGGAAGTACACTTGTCCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCAACGAGGTGTAGGTGTTCTTCAATTAACCAATGATAGTAACCTGACGTTCAGAAATTCACAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCCGGTACTCTTCTGACGAATGTAGAAAACAACCGTCAGGCATGGCAATACGTAATTTCTGCTGCAACCGCTGGAACTCCGCGCTGGGTTAAAGTAGCTACAATTAAACACCCAGGTGATGCGTCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACTGGTGGCATTGATTCTGGACACGGAAGGCATTATGTTGATTTTATCACGTTATCTGGTCGCAATTTAACATCCTGGAGCACTAGCAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATTGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCAGAGTATTACGTTGTTAAAAATGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCATTTGATTTTTACGCTAAAGTTCCTCGATACGGAAATGGACTTTATGTTACAGTGCTAAACACTGCTGGATACAACGGACAAGATAGCGGTAAAGTAATTATCTATGAAACTGGCCAAGATACTGGTGCTACTGGACAGTCTGGAAGTATTCTTGTTTCAATGAAACAGATTTTTGACAGTTCCGCAAAACCAGATTTCGGCGATACTACGGGTACTCTTCCGGTTAACCGCGGTGGTACAGGTGCTACTAACGTAGGAGATGCTAGAAATAACTTAGGTCTTGGTACTGCTGCTGTGCGCGATGTTGGTGAAGGCGCTGGTAACCTTTTAGAAAATGGCGCTTACGGGTTGGGTGGTAACGGTGGTAAATCCATCGAAGATATCGTTTCTAACGTGGATATGATGACCCGTTTAAAAGCATACGGTGGCACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGTGTTAGTGTTCAAAATGGTCTTTATAGCCATGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCAGCTATTAATATCGACTACGCTAGCGCTAAGGTTCGTGTATATGCAGCTAACAACAGCGGTCTTGCTGCAGGAAATGTTAGATACAACGAACTTTACGGAACAGCAAACAAACCAACTAAGGCTGACGTCGGACTCGGTAATCTAACAAACGATACTCAGGTTAAGAAAGCTGGCGATACCATGACCGGCGATTTAGCTGCACCTAACCTCCATGCCTCTGGATCGGGAACCGCATCGGTGTATGTTAATGCTGGGACTGGAAACGCTCATGTGTGGTTTAGAACAGACGCCAATGAACGCGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACTGCTGACTTAGGACAAATTAATATTCGTGCAAAAACCACTGGAAATACTTCTGCCGGTGATTTTAGTTTCCGTTCTGACGGCCGACTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTCGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGAAACATTACCTCAGGTTCAATGTTTGGCGGTAACCTTAACAACTATTTGAATACCATTAAAAACGACATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGCAAGACTGGTGATACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGATCAATGGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCTGATAAGTATAGCAGATTAACCCTTGCTCGTAAAGTTGGCTCTGGCGCTTCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGATACGTGCAATTTGGTTATCAAGATGCAGTTGCTAATCCGTCTCCCAGCAAGTACATCCGAGTTAAACCTGATGGTCTTGATGTAGAAGGAGATTTGGTTTTTAATCAGACATATCGCGGCACCGAAGAGGCAGTTGATATCTCCGATAAGACTGTTGACCTTAATGGTCTTGTCATTAAAAGAACCGACCCAGGTACTCGTCAGTTATATAAATGTGTATCTTCTGGCGGCGGAAGTAATATATCGAACAAACCTACCTCTGATGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTACGCAAGGTTTCTGATACCGATTGGTCATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAACGGCGGCGTTGAAGGTACGTATGTTCGCTACGGACAAAACGGCTCATGGTCTGCATGGAAAGAAGTTGTTGCTGGCGTCCAACCAATTAATTTAGGTGGTACTGGTGCAACTTCTGCAGCTTCTGCTCGTAACAACCTCGGTGTTGGTGAAGGTCAGAGTGTGAAGTTCGGCTGGTTAGTTGTTAATGGCGTCGGAACAAGTGATCCAACTATCACATTTAAAAATGGCGCAGTAGTTCGTGAAGCCCAAGGTGGTAGTACTGGTGCATTGATCATGTCAGCTTCTGCTACAGCCGCTACAGCCGCTAAGTATATTGCTTTCAGGCCATATGGGGATTCGTCCAACTCCGAGATTAGAGTCAAAGCATTTGGTAATAACGAGACATCACTTGAGTGGTCGCAGGGCGCTGGTGTTCGTTCAAATACGCAGGGGGCTTTCGTAGTTTATGCAAAAGCCGGACAAGCGCTTCATTTAAGACCAAACGGTGACAGTGCTAACCAATCTACCGTTATTGATCAGAACGGTAAAATGACAGTCGGCGGTGAGTTCGAGGCGCAGAACTCGAAAATCACAGGCAACTTGAACGTCTCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGCAAAAACTCTGATATTGGTTTAGTCAAGAAAAACGGTATGCCAGGAAAAATGGCTATCGGTAAATCTAACTCATTTACCGTTATGGTATCTGCAAATACCAACAACCAAATTAATCCTGCTGACACGTTTAGCGATATATTCAAAGTTGATGCTAACGGAAACCAAACTGTTTATGGAAATGCCCAAATCAATAGACAGTTAACTGTTTCTAGCTCAGCTACTGTTGCAGGTGCTATTAATGCTAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTGCAAATTGCCGATGCTCCTACACAGAATAACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCTGGCGACACGTATCTTCCGTTAGCAGGTGGTACCGTAACTGGTAGCTTAGATGTTACAGGAACTCGACTCAAAACGTGGCGCTTAGAAGTAGATGGTGGCGGAACTGTACTTGGCGGAACTATTGATGTTGCCGGTAAGGCAGTGTTTTCTAAAGATATTTTAGTTGAAAAGCAATTAGATGTTCGAGGTGCTGGAGCTTGTCACTTACGCTTTAGTAAAGCTGATGGTTCTGAAAAAGGACTAATTTATGCTGACGATGATAAAAATGTTAGTATTAGAAGTGGCGGCGACAACGGTCCGTCATGGAATTTCTGGTCTAGCGGTTCATGTCAATTCCCTGGAGCCATTAGTAACTATAACGGAATTAGCAGCACTACTTATTACCCTGGTGGTAATAAAAACGACTATTTAAACACAGCAGGATTAGTATCTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCTTCGTTATATTTCCAAGAATATGTAGGAAACTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAACGGATACGGCGAAGACGATAGCTTTTACTTTAGATCTGGCGGTGACTTCTTCTGTACTCGTAACGGGTCATTCGATAACGTAGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCTAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTAGAAACACTGAGCGGTAATACGTATGTGCTTCACAACACATCTGGCGGTACTACCCGTTCTGCGGGTTTAATCGCGCAGGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAAGATATTGAAGCGGACGGGGGTTTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTTGTTGAATCAGTGAAAGAACTTTCTGCTGAGGTTAAAGGCCTTAAAGCGGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA
Tertiary structure
PDB ID
2df1f577b58601e24a2ed171af7a8586ae87e61471a062e38120ee60e6b4685f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Environmental Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca bacteriophages and their therapeutic applications | Weber-Dabrowska,B., Zaczek,M., Lusiak-Szelachowska,M., Laczmanski,L., Owczarek,B., Orwat,F., Lodej,N., Kaszowska,M., Lobocka,M. and Gorski,A. | — | — | GenBank |