Protein

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Genbank accession
QHR72234.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNTFSRNQNIQSDGNALRLRNQIANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGEDAVSLYNSKYNSAVIVASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLVGNNTFSGLNTFSNNVNVNSDGAAIILKNKTVNETLFILAKDSENNNLWYIGKGDVTSNITIYDYKGDTSIKLNASGVTFSKTVKITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLNNLPKLNVSNTFTNVQTIVSNNEGLVLKNLTQGQPQYIRGVDTANVSRWWVGVGGTNSTDVALNNSYSGTQITLGSSVIKANKSLDITGQVQPSDWTNLDARYFTRSASDSRYLRIRSTGFNNGNGEKWVKIATVVMPQSASTAVIEVFGGAGFNINTPQQAGKCEVVLRTSNNNPKGLNAVAWRTSDNVIITDIGYVNTSGDAYDIYCRVGPYQNNTTSRVQSSSNASVQLFEAPQTFDDAPQGIVKGTVAKYYTSLQKPTPSDIGAYTKDETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGHHNHSISWIGQNSTHYSGGGGGSIGVGPGYTDAAGAHTHTISGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:843 AA
molecular weight: 90153,40280 Da
isoelectric point:8,59352
aromaticity:0,08066
hydropathy:-0,36168

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
157–218
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
158–247
IPR048388 IPR048388 IPR048388
QHR72234.1
1 843
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage finno
[NCBI] 		2696395 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR72234.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850619 [NCBI]
CDS location
range 65938 -> 68469
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGCAGTACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCGGTATTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAATGCAAACGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTACCACACTTTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGAATGAGAACCAATGAAGAGAACGATGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGTAACAAACACATTCTCTAGAAATCAGAACATTCAAAGTGATGGTAATGCACTTCGCCTTAGAAACCAGATTGCAAATAATGCACAATACATTGAGGGTGTAAACCTAGATGGTTCAGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGCAATGGCGAGGATGCAGTAAGCCTGTATAACAGCAAATACAACTCAGCAGTGATTGTTGCAAGCAATATCTCTGTTAATAAATCTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAGCCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCGCAGCTAGTTGGTAATAACACCTTCAGTGGTTTAAACACATTCAGTAATAATGTCAATGTGAACTCTGATGGTGCTGCTATCATTCTAAAAAATAAAACGGTCAATGAGACTCTGTTCATCCTAGCAAAGGACAGTGAAAACAATAATTTGTGGTATATTGGTAAAGGTGATGTAACCTCTAATATCACAATTTATGATTACAAGGGGGACACTTCCATTAAATTAAACGCGTCTGGTGTAACATTTAGTAAGACTGTCAAAATCACTGGTCAAGTACAACCTTCTGACTGGACTAACATTGATTCTAGATACATTCCAGCAGCTACTTTGAATAATCTTCCTAAACTTAATGTGTCTAATACTTTCACAAATGTGCAAACTATTGTATCTAACAATGAGGGTTTGGTATTAAAGAACTTGACACAGGGGCAGCCGCAATATATCCGTGGTGTGGATACTGCGAACGTATCTAGGTGGTGGGTAGGTGTAGGTGGAACAAATTCTACTGATGTAGCCTTAAACAACAGCTACTCTGGTACTCAAATTACTCTTGGGTCGTCAGTAATTAAGGCTAATAAGAGTTTAGACATTACTGGTCAAGTACAACCTTCTGACTGGACTAACTTAGATGCTAGATATTTCACTCGAAGTGCTAGTGATAGCAGATACCTGAGAATCAGAAGTACTGGCTTCAATAATGGAAACGGTGAAAAATGGGTTAAAATTGCTACTGTTGTAATGCCGCAATCCGCATCTACTGCGGTGATTGAAGTGTTTGGTGGGGCAGGTTTTAATATCAATACACCACAACAAGCAGGTAAGTGTGAGGTTGTTTTACGAACATCAAATAACAATCCAAAAGGTTTAAATGCCGTGGCTTGGAGAACATCAGATAATGTCATCATCACTGATATCGGTTATGTTAATACATCTGGCGATGCTTATGACATTTACTGTAGAGTTGGTCCATACCAAAACAACACAACATCAAGAGTTCAATCTTCTAGTAATGCAAGTGTACAGTTGTTTGAAGCTCCACAGACATTTGATGATGCACCACAAGGTATTGTGAAGGGTACAGTTGCAAAATACTACACTAGTTTGCAAAAACCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAGATGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAATAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACGCACAGTTTTTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACACACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTCACCACAACCACTCTATTTCATGGATTGGTCAGAACTCTACCCACTACTCTGGTGGTGGTGGTGGTAGTATTGGTGTAGGACCGGGTTACACTGATGCTGCTGGTGCTCACACCCACACAATCTCTGGTACTGCTGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTTAGCGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Tertiary structure

PDB ID
11c3c32b8470d2728b475a8ab7eb6e3ad052e0eb18f5c31055dc19537dd9e25c
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2723
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank