Protein

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Genbank accession
CAL9956864.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,70
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MATKIEVTKLNALDDNLVEGQKVIEIILGPTIGADTADLALAVAQAEAAQAAAELAEDNAKASELAALASEGAAQTAQTLAEVAEGNAKASEIAAQSSEDDAQISEDAAAASEAAALASQNAAAVSAAAALASENAAQSSEDDAQVSEDNAAASEVAAAASAAAALASENAAQSSEDDAQISEDAAAASAAAALASENAAQSSEDDAKVSEDAAAASAAAALTQANRAETEADRSETEADRAQTIADSMTTALVPRGDWDASTGAFPTPTLSPERADFYQISVAGTMTTNKPAGQDDLSVEVGDQLYWNVVIDVWYSIDNTDQVTSVDGKKGVVVIDKYTQAEADARFVNAAGDTMTGALTIEESVMLVGNTAADNYMELAQVYGSSYGFTFQHNNASTMTNLQGSTNQALVLGDVSANVTDVLLGVSLKEGAGAWTKRLELDGAGELYLGSGAAYRTFHENYHPNADTWTTSRTVTLTGDVSGSFAIDGSADVSVSVVVEDDSHVHTDYLSNVATDLSNIMYGNIYASDEKPLIQLVGDDAYFGSHGRVGLQLASSSNPEWKTPTAAYKLFNESYHPNADTWTTARTITLTGDATGSFTMDGSSDESVEVTVVNDSHTHDTRYLKLAGGYMAGEITGPYSWVLNRTFVMIENETPQYLLLCLNAGGNNVNGEFILNRTSGNYQSANLNVVVSSGSSVSPYGTIVSVQSTQDDEEYRLVTVDYAGDSWVAIKYVGNSYPVTDPGLFSGRIQSSKAGSLTAVGAASITNEAPLRDATKFELNGQAIFHQGYHPNADTWTTARTLTFTGDATGSTTLDGSSDKSIAMTVVDDSHNHSYVNGTFEIRHANEQLKLVDTTDGNKWWMLDHQNGDLNFRYNGVSVTPALVIHETGNYVSAPSFSATTYLNLPIENVRTGNQADIRYNPVKGFEGHDGVEWGAIGGGGGVEWEATTGTSVVAETGAGYLVTEAGVTVVLPPTPDQGNTVGVGDYNGLNFEVTINPNGGKIMGLTEDFTFDTKNANIVFSYVDTTVGWILTQGFGESEAPQAIANKVIVTDAVGQSVISIPNNGSQTVDVWYNGLKLLRNDDYIVDEDLDTVTLTDPIDLSDDIVEVYAWNQALVLDTTDLLYHGTQMRKTIEGDGISLTEAIEARAPQPNLLINGDFVINQRQFAISSDVPIDGEFFVDRWFARNAIGGTNLCYSDFRNNTGMYTRMTHTGAAVSAYIGQRIEVMDWRPFVNTTASVEVSHSQDCVMSGVIHLRRVSDDTVLSSVFSNEVIVTPGLKTVVFTMEGLDISMVGSTECYAEFRIIYNNGGSIATPDGQYRFYTAKLESGLLATPFVPDSPQESLAKCQRYFYTTRGRTKSQIFGTATVSSTNDGTFQAGVPIPVPMRINKPALTQFGSFAIYGVSSTSGTKNETVTFTDGGSGAGVGFIDIIIQSNTVPTLLGGAVTLRGLNSSSWFNVDAEL
Physico‐chemical
properties
protein length:1465 AA
molecular weight: 154941,05470 Da
isoelectric point:4,23515
aromaticity:0,07782
hydropathy:-0,16444

Domains

Domains [InterPro]
Coil
39–66
Coil Coil
CAL9956864.1
1 1465
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage D126
[NCBI] 		3104877 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAL9956864.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ195760 [NCBI]
CDS location
range 20301 -> 24698
strand +
CDS
ATGGCAACAAAAATAGAAGTAACCAAGCTTAATGCCTTAGATGACAATCTAGTAGAGGGTCAGAAGGTAATTGAGATCATACTTGGTCCGACTATCGGGGCAGACACAGCAGATCTAGCCCTTGCTGTTGCGCAAGCAGAAGCAGCACAGGCAGCTGCAGAGTTAGCGGAAGATAACGCTAAGGCCTCTGAACTTGCAGCGCTAGCATCAGAAGGTGCGGCACAAACAGCACAAACACTTGCAGAAGTGGCAGAAGGCAATGCTAAGGCATCCGAAATAGCTGCACAGAGCTCAGAAGATGATGCTCAAATATCAGAAGATGCGGCAGCAGCCTCTGAAGCGGCAGCGCTTGCGTCTCAAAACGCAGCAGCAGTATCAGCAGCAGCAGCCCTTGCTTCAGAAAACGCAGCACAAAGCTCAGAAGACGATGCTCAGGTGTCAGAAGACAACGCGGCAGCCTCAGAAGTAGCGGCAGCGGCATCAGCAGCTGCGGCACTTGCGTCAGAAAACGCAGCACAGAGCTCTGAGGATGATGCACAGATCTCCGAGGATGCAGCGGCAGCCTCAGCAGCAGCAGCACTTGCATCTGAGAATGCAGCGCAAAGCTCAGAAGACGATGCTAAAGTATCAGAAGATGCAGCAGCGGCATCCGCAGCGGCAGCACTAACTCAGGCAAACCGCGCAGAGACAGAAGCAGATCGCTCAGAAACAGAAGCGGATCGTGCTCAAACCATCGCAGATTCTATGACAACAGCTCTAGTTCCTCGCGGTGACTGGGATGCATCTACAGGAGCATTCCCTACACCTACACTATCTCCTGAACGAGCAGACTTCTATCAGATCTCCGTAGCAGGTACAATGACAACTAACAAGCCTGCTGGACAGGATGATCTATCAGTTGAAGTAGGTGACCAATTATACTGGAACGTTGTAATCGACGTTTGGTACTCAATAGACAACACAGACCAAGTTACTAGCGTAGATGGTAAGAAAGGTGTTGTTGTAATTGATAAATACACACAGGCTGAAGCAGACGCTCGCTTTGTAAACGCTGCAGGCGATACGATGACTGGCGCTTTAACTATCGAAGAAAGCGTAATGTTAGTGGGAAATACCGCGGCGGATAACTACATGGAACTTGCCCAAGTTTATGGTAGCTCTTACGGGTTTACTTTCCAACATAATAACGCATCCACTATGACTAACTTGCAGGGTTCAACCAACCAAGCACTAGTTCTAGGTGATGTTAGTGCAAATGTTACAGACGTGCTATTGGGGGTGTCCCTAAAAGAAGGTGCGGGTGCATGGACTAAGCGTCTTGAACTCGACGGAGCAGGTGAATTATACCTTGGCTCTGGTGCAGCTTATAGGACTTTTCATGAAAACTACCACCCTAATGCAGATACATGGACTACCAGCCGTACAGTAACTCTTACTGGTGACGTTTCTGGTAGCTTTGCTATTGATGGATCGGCAGATGTCTCAGTCTCCGTTGTTGTTGAGGACGACAGTCACGTCCACACGGATTACTTGAGTAATGTAGCAACCGACCTAAGTAACATTATGTATGGTAACATATATGCCTCCGACGAGAAGCCCCTAATACAACTAGTCGGGGATGACGCATATTTTGGGTCTCACGGCCGAGTAGGATTGCAACTGGCATCCTCGTCAAACCCAGAGTGGAAGACTCCAACAGCCGCCTACAAACTATTTAATGAGTCCTACCACCCTAACGCAGATACTTGGACTACTGCTAGAACAATTACTCTTACTGGTGATGCTACAGGTTCATTTACTATGGACGGTTCCTCTGATGAATCGGTAGAAGTTACAGTCGTTAATGACTCCCATACCCATGATACGCGTTACTTAAAACTAGCTGGTGGGTACATGGCCGGTGAGATTACAGGGCCTTACAGCTGGGTACTAAATCGCACTTTCGTTATGATTGAGAACGAGACTCCTCAGTACCTATTGCTATGTCTCAACGCGGGAGGCAACAATGTGAACGGTGAGTTCATACTGAATAGGACGTCTGGTAATTACCAGTCTGCTAACCTTAATGTTGTAGTCTCTTCTGGTTCTTCTGTATCGCCGTACGGTACTATAGTGTCCGTGCAATCTACCCAAGATGATGAAGAGTACAGGCTAGTAACAGTGGACTATGCAGGCGATAGTTGGGTAGCTATTAAGTACGTAGGCAACTCGTATCCTGTAACAGACCCTGGTCTATTCTCAGGGCGTATACAGTCTTCTAAAGCTGGTTCACTTACTGCTGTAGGTGCCGCGAGCATAACCAATGAAGCACCCCTAAGAGACGCTACTAAGTTCGAGTTAAATGGGCAGGCTATATTCCATCAAGGATACCACCCTAACGCAGATACTTGGACTACTGCTAGAACTCTTACGTTTACAGGCGACGCTACGGGCTCTACTACTTTAGACGGCTCCTCAGACAAGTCTATTGCTATGACAGTGGTAGATGACTCACATAATCACAGCTATGTTAACGGTACATTTGAGATTCGCCACGCTAATGAGCAACTTAAGTTAGTGGATACTACAGATGGTAATAAATGGTGGATGCTAGATCACCAGAATGGTGACCTTAACTTCCGCTATAACGGAGTGTCAGTAACCCCTGCCCTAGTAATACATGAAACAGGTAATTACGTTAGTGCCCCTAGCTTTAGTGCTACAACCTACTTAAACCTACCTATAGAGAATGTCCGTACTGGTAATCAGGCAGATATTCGATACAACCCAGTCAAAGGCTTCGAAGGACACGACGGAGTAGAGTGGGGAGCTATTGGTGGTGGTGGTGGTGTTGAGTGGGAAGCAACCACAGGAACATCTGTAGTTGCAGAAACTGGCGCAGGCTATTTAGTTACAGAAGCCGGAGTTACAGTTGTACTTCCACCAACCCCAGATCAAGGTAATACTGTAGGTGTAGGTGATTACAACGGTCTTAACTTCGAAGTAACTATTAACCCTAACGGTGGTAAGATCATGGGGCTTACTGAAGATTTTACCTTTGATACCAAGAACGCTAACATAGTATTCTCTTACGTAGATACAACGGTTGGTTGGATCCTTACACAAGGTTTTGGTGAATCTGAAGCGCCACAGGCTATTGCTAACAAGGTTATAGTAACAGATGCAGTCGGACAGTCCGTTATCTCTATCCCAAATAATGGATCTCAGACGGTAGATGTATGGTATAATGGTCTTAAACTCCTACGCAACGACGACTACATCGTAGATGAGGACTTAGATACTGTTACGCTAACAGACCCTATAGACTTAAGTGATGATATAGTTGAGGTATACGCTTGGAATCAGGCTCTAGTACTAGATACTACTGATTTACTGTACCACGGTACGCAGATGCGTAAAACAATCGAGGGTGACGGTATTTCTCTTACAGAAGCTATTGAAGCCCGTGCTCCGCAACCAAATCTATTGATTAATGGTGACTTTGTTATCAACCAGCGTCAGTTTGCTATAAGTAGTGATGTTCCAATTGATGGGGAGTTCTTTGTTGACCGTTGGTTCGCTCGTAACGCAATAGGCGGTACTAACCTTTGTTACTCTGATTTCCGTAATAACACAGGTATGTATACTCGTATGACTCACACAGGAGCTGCAGTTAGCGCATACATTGGTCAAAGAATTGAAGTTATGGACTGGCGTCCGTTCGTAAATACAACAGCGTCTGTGGAAGTTAGTCACTCGCAAGATTGTGTCATGAGTGGTGTTATTCATCTTCGTCGGGTTTCTGATGATACTGTCCTTTCTTCTGTATTTAGTAATGAAGTTATCGTTACACCAGGGTTAAAGACAGTAGTGTTTACTATGGAAGGTTTAGACATCTCTATGGTGGGGTCTACAGAATGTTACGCAGAGTTCCGAATCATCTATAACAACGGAGGTAGCATCGCTACACCGGATGGTCAGTATCGTTTCTATACTGCTAAGTTGGAATCTGGTTTATTAGCTACACCATTTGTTCCGGACTCTCCTCAAGAGAGCCTGGCTAAGTGTCAGCGCTACTTCTACACAACTAGGGGCAGAACAAAGTCTCAAATATTCGGAACAGCTACCGTATCCAGTACTAACGATGGCACATTCCAAGCAGGCGTACCGATTCCTGTACCTATGCGAATTAATAAACCAGCACTTACTCAGTTTGGTTCTTTCGCTATTTACGGGGTTTCTTCTACGTCAGGTACTAAGAATGAGACAGTAACCTTTACAGACGGAGGCTCTGGGGCAGGTGTAGGTTTCATTGACATCATAATACAGTCTAATACAGTGCCTACCTTGTTAGGAGGTGCGGTAACGCTTAGGGGACTTAACTCAAGTTCGTGGTTTAATGTAGACGCGGAACTGTAA

Tertiary structure

PDB ID
fe62956b30b26e7c726b2bd10c429dfa490b97f076f8dc897797bb60f1e1c34b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5558
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50