Protein

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Genbank accession
YP_009010728.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,75
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAWTNLISAIEAVITANGSNEITGTILKDLLVNNIVPQLGAAEFKGFAETSTDPGTPQSDVFYIAKSDGVYSNFGGIEISSEFAFIAYQSTTWSKFSIGDSIESFTTKNPSGNLYPKGSFEAGYLLTTVGATQGNLASAAGWYRSLPLEVLENTEYTAYGSPRLDVLAYSALPLNSANCLGVVTKSAAIGGGEKFTTPVNTAYLGFNLMDSGDSGTPESAFDGTFVLVVGDTNVGYVPHSRILDSSENAKNPIVVRSEDLIGLIQSVQIAQAAKDELKYNPLTPIVQKNAFTDNYGGVDFTSQQITSNKPVSNTVSNTLKRTAGGLLPTPVGFEGKLVLSANPGDIYAPVLNYKITPEMLQEIGINVLDPNYDDNNPQKISLRSGWLRDFTGGVTGVQQFVNILYGNDPLSYTSYELNGSNALISTTGNFYGNLVNANPGKNFNATSITNESETGYNVRSYNEIPLYKELDLSGTTKTFTGILVSVLPQSVDVAELERKITGFGFAIANAADFPTVSLATNLVNTNEDFTTPPFNIGDAQDVDDTTKTNGDVLAWDASLQKYVPVESNTEINTITFKNSEKIAFYGCSFTESYYAVKNKSWVNKLAQMTDYICANFGVSGNRLVDESKRLLQNSNPYHGTIGIKELNPTYISFANIGNETLHSGGANNLDLYKAQMIEAIQAVYSVGATPIMGTDHNIYNAAIDSLLYDVAKQFNSLYWGIGTIGEKIVNNGILAFWGGGHPATRTNAHQFLEWLYFISQLPRPKRAIKVFRVREEYKNGSPVIADLNYDDITQRVKFWQEINSGEKSLKEANGQNGWEYYDRLNEAFAADTITNEYCKFINKEDVSFNKFGLFEFIIDKVNPTALKIYVKTASTDLDFYIKDNNNPLDYKDTLRNQAAFEVTKTVYDAFNEAVDTAFTSDAHGATELNYKGKSKSEALGGYWLFFYLTSGSATAGGAGNLTKVSGGGNTAYLQSSYNLGRHSYDFFSTVGKPQMRMVPVASTYENGHAVITLNPSDAKYLDFDKVKLVVADTGTFDISDAYIEVTGGTDKPVFQKDVKPKLNGTELNTDTSFGTDWITGNGWVNEGATQEQMPSGLRDYPTINSELRHIKLDFNTDMFPQKIKKSFTYPYSRAYTKVTVKAVVRLFPKVFNTTVPTDNYHTATRQIKADSYDMGTLCLGIDVGRNRPAVLKKLVDIGWAEVTFETYLPPFSTTFEVSLWRDEQDLIDSNYRNHEYPMQLHDVSVQIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1248 AA
molecular weight: 137148,39200 Da
isoelectric point:4,91154
aromaticity:0,11378
hydropathy:-0,28662

Domains

Domains [InterPro]
IPR036514
563–723
IPR036514
SSF52266
579–743
SSF52266
YP_009010728.1
1 1248
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Croceibacter phage P2559Y
[NCBI] 		1327037 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Croceibacter atlanticus HTCC2559
[NCBI] 		216432 Bacteria > Bacteroidetes > Flavobacteriia > Flavobacteriales > Flavobacteriaceae > Croceibacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009010728.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_023614 [NCBI]
CDS location
range 17810 -> 21556
strand +
CDS
ATGGCTTGGACGAATTTAATATCTGCAATAGAGGCCGTTATAACTGCCAACGGCAGTAATGAAATAACGGGAACTATTTTAAAAGACCTTTTGGTAAACAACATAGTTCCACAATTAGGTGCGGCAGAATTTAAAGGATTTGCCGAAACATCAACCGACCCCGGAACACCTCAAAGTGATGTTTTTTATATCGCTAAATCTGACGGTGTTTACAGTAATTTCGGAGGTATCGAGATTAGTTCGGAGTTTGCTTTTATAGCTTATCAGAGTACTACGTGGTCTAAATTCAGTATCGGAGACAGTATCGAAAGTTTTACAACTAAGAACCCTTCAGGGAATTTATACCCCAAAGGATCTTTTGAGGCTGGATATTTATTAACAACCGTCGGAGCTACACAAGGGAATTTAGCAAGTGCCGCGGGGTGGTATAGGTCTTTACCTTTAGAGGTTTTGGAAAACACAGAATATACAGCCTACGGGTCGCCGAGACTCGACGTTTTGGCATATTCCGCACTACCTTTAAATAGTGCAAATTGTTTAGGTGTGGTAACTAAGTCGGCGGCAATAGGTGGTGGCGAAAAATTTACGACACCCGTTAATACTGCATATTTAGGTTTTAACCTTATGGATTCTGGCGACTCTGGTACTCCTGAAAGTGCGTTCGATGGAACTTTTGTTCTGGTAGTTGGAGACACTAACGTCGGATATGTTCCACACAGTAGGATTTTAGACAGTTCCGAAAATGCGAAAAACCCAATAGTTGTAAGGTCTGAGGACTTAATCGGATTAATACAATCCGTGCAAATAGCACAGGCCGCAAAAGACGAATTAAAATACAATCCGTTAACTCCTATCGTTCAAAAAAACGCTTTTACTGATAATTACGGAGGTGTCGATTTTACTTCTCAACAAATAACCTCAAATAAACCCGTATCGAATACGGTATCAAATACTTTAAAAAGGACTGCGGGCGGTTTATTACCTACACCAGTAGGTTTTGAAGGTAAATTGGTTTTGTCTGCAAACCCAGGCGATATTTACGCACCAGTTTTAAATTACAAGATAACTCCTGAAATGTTACAGGAAATCGGAATCAATGTTTTAGATCCGAATTATGACGACAACAACCCTCAAAAAATATCCTTACGATCAGGTTGGTTAAGAGATTTTACAGGAGGTGTAACTGGTGTACAACAATTCGTAAATATTCTATACGGCAATGACCCTTTGAGTTATACAAGTTACGAACTGAATGGTAGTAATGCGTTAATATCTACAACGGGTAATTTTTACGGTAATTTAGTAAATGCAAATCCGGGTAAAAACTTTAACGCTACATCGATTACAAATGAGTCAGAAACAGGGTACAATGTACGTTCGTATAACGAAATCCCACTCTATAAAGAATTAGATTTGTCGGGCACAACTAAAACGTTTACGGGTATTTTAGTTAGTGTTTTACCTCAATCGGTTGACGTTGCGGAATTAGAGAGAAAAATAACAGGGTTCGGATTTGCTATTGCAAACGCTGCGGACTTTCCAACTGTTAGTCTGGCAACAAATCTTGTAAACACAAACGAAGATTTTACGACTCCACCTTTTAACATTGGCGACGCTCAGGATGTGGACGACACCACCAAAACCAATGGAGACGTTTTGGCTTGGGATGCAAGTTTACAAAAATATGTACCCGTTGAAAGTAATACCGAGATAAACACGATAACGTTTAAAAACTCCGAGAAAATAGCTTTTTACGGATGTTCTTTTACAGAGTCTTATTATGCAGTAAAAAATAAAAGTTGGGTTAATAAACTAGCTCAAATGACTGATTACATTTGTGCAAATTTCGGTGTGTCTGGGAATAGGCTTGTTGACGAAAGTAAAAGACTTTTACAAAATTCAAATCCTTACCATGGTACTATCGGTATAAAAGAATTAAACCCGACTTATATTTCATTTGCAAATATAGGTAACGAGACTTTACACTCTGGGGGTGCTAATAATTTGGATTTATATAAAGCCCAAATGATTGAAGCTATACAGGCCGTGTATTCAGTCGGTGCGACTCCGATAATGGGTACAGACCACAATATCTATAACGCTGCGATTGATAGTCTTTTATACGATGTAGCAAAACAATTCAACTCGTTGTATTGGGGTATTGGTACTATTGGCGAAAAAATAGTAAACAACGGTATTTTAGCGTTTTGGGGTGGAGGACATCCCGCGACGAGAACAAACGCACATCAATTTTTGGAGTGGTTGTATTTTATTTCACAATTACCAAGGCCAAAAAGAGCAATAAAAGTTTTTAGAGTGCGAGAGGAATACAAAAACGGTTCGCCAGTAATTGCAGATTTAAACTATGACGATATAACTCAAAGGGTTAAATTTTGGCAAGAGATTAACTCAGGCGAAAAATCTCTAAAAGAGGCGAACGGTCAAAACGGTTGGGAATATTACGACAGATTAAACGAGGCTTTCGCCGCTGACACGATTACTAACGAGTATTGTAAATTTATCAATAAAGAGGACGTTTCTTTTAATAAATTTGGATTGTTCGAGTTTATAATCGACAAAGTAAATCCAACAGCTTTAAAAATATATGTAAAAACCGCGTCAACAGACTTGGACTTTTACATAAAAGACAATAACAATCCTTTGGATTATAAAGATACTTTGAGAAATCAAGCAGCTTTTGAAGTTACAAAAACTGTTTACGATGCTTTCAATGAGGCCGTAGATACTGCCTTTACTTCTGACGCACATGGAGCAACAGAATTGAACTACAAAGGAAAATCGAAAAGCGAAGCCCTTGGGGGTTATTGGTTATTCTTTTACTTAACTTCTGGTAGTGCAACCGCTGGAGGGGCTGGAAACCTTACAAAAGTTTCTGGGGGTGGTAATACCGCGTATTTACAAAGTAGTTATAATTTGGGTCGTCATTCTTACGATTTTTTCTCTACCGTAGGTAAACCACAAATGAGAATGGTACCGGTTGCCTCTACTTATGAAAACGGACACGCCGTAATAACTTTAAATCCTTCAGATGCTAAATACTTGGACTTTGATAAAGTTAAATTAGTTGTTGCAGATACAGGAACTTTCGACATTTCGGACGCATACATCGAAGTAACTGGAGGTACTGATAAACCAGTATTTCAAAAAGATGTTAAACCAAAATTAAACGGTACAGAATTGAATACCGACACATCATTCGGTACGGACTGGATTACTGGTAATGGGTGGGTAAACGAGGGCGCAACTCAGGAACAAATGCCGTCAGGGTTGAGAGATTACCCAACCATAAACAGCGAACTAAGGCATATTAAATTGGATTTTAATACTGATATGTTCCCTCAGAAAATAAAAAAATCATTTACATACCCATACAGCAGGGCATATACAAAGGTAACAGTTAAAGCCGTTGTTCGATTGTTCCCTAAAGTTTTTAATACAACAGTCCCAACAGATAACTACCATACAGCCACAAGACAAATAAAAGCGGATAGTTACGACATGGGTACTCTATGTTTAGGAATAGACGTTGGCAGAAATAGGCCGGCAGTGTTAAAAAAATTAGTTGACATCGGTTGGGCTGAGGTAACTTTCGAGACATATTTACCGCCTTTTTCAACGACTTTTGAGGTATCTTTATGGCGAGACGAGCAAGATTTAATCGACAGTAATTATAGAAATCACGAATACCCTATGCAGTTACATGACGTATCTGTACAAATAAACTAA

Tertiary structure

PDB ID
739f6e97820c235748b876132cea2c7dcf8856d2b960b6a26b3757bd51479013
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4301
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and genome analysis of bacteriophage infecting marine bacterium Croceibacter atlanticus HTCC2559 Cho,J.-C. 2016-10 — GenBank