Protein

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Genbank accession
QLF88515.1 [GenBank]
Protein name
tail tube B
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,74
Protein sequence
MGSVVSQSIPNFLNGMSQQTPTQRGINQGEDQINLQNGLVDGLSKRPPLDFVATLDSSNIYSNKTKFWSIQRDADNQFIVALYNGGIKVFDLLGNEKTVTVASGSSYLTSTNPRENFKLVNIADYTFIANTATTVAADSTTSAAKVEEFLIVCKLTNYGREYKVALKHPSMAQELEVIFQLPSGNDASTDAKFRDTNKITDILLYGTSSTHWDSTADGIGFKVVRTDTNASVSTTQGLANYSGFTSYFTFEAFDSVIYGKPTDQNANYTITTSDGSGNTAMYAIRDEIQDFSKLPFYGKEGVIIKITGEEGDTLSDYYVNFSGKSGVWNETIAPATSVGLDNSTMPHALINNNNGTFTFQQLDWTDRVCGDIDTNPNPTFVGKKINNLTFYKNRLGILSGENLVLTENASFFNYFATTSTQVLDTDPIDIAASGTQVNTLKNSVGFNESLLIFSDTAQYKLDSAAETITPTTAILNAVSTFEHDAKVTPVAAGKFAYFAQARTNNTAIREYFADDDTLTNDGLDITVSVQNLIPSNCYQIVSNTTEDTLIFLTSDTADSQTAPYSGTVSTTYANTMYIYKYFFDGGEKVQNAWSKWTFTGVKIIGAMSLESFIYVLASEGTTTKLLKIDLRNLKDTTIGHGVYLDLKTSVTGTYDAATNLTTFTSLYGVKTGLIAVDRTNGSNYTATNTTGSTYTIVGNHTALYIGVPYESKYTMSTQFVRENTGRGLVAVTSGRYQIRNISFNFENSGFFQVEVTPENRDTSTAIMNGYVIGTSTSVIGQPAISTGTLRVPVQAENTQFTLDIKSSSHLPMYIAGAEVEGYYHNRARRI
Physico‐chemical
properties
protein length:830 AA
molecular weight: 90627,50600 Da
isoelectric point:4,86487
aromaticity:0,10723
hydropathy:-0,23458

Domains

Domains [InterPro]
IPR058003
3–830
IPR058003
QLF88515.1
1 830
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage Ran EXVC014P
[NCBI] 		2736234 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLF88515.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT375530 [NCBI]
CDS location
range 11483 -> 13975
strand -
CDS
ATGGGAAGTGTTGTTTCACAATCTATTCCTAACTTCTTAAATGGTATGTCTCAACAGACACCAACTCAAAGAGGTATTAATCAGGGAGAAGACCAAATAAACTTACAAAATGGTTTAGTAGATGGTCTATCTAAAAGACCTCCTTTAGATTTTGTAGCAACATTAGACAGTAGTAATATTTATTCTAACAAAACAAAATTTTGGTCAATACAAAGAGATGCAGATAATCAGTTTATTGTAGCTTTATATAATGGTGGTATCAAAGTATTTGATTTATTAGGTAATGAAAAAACTGTTACAGTTGCAAGTGGTTCAAGTTATTTAACTTCAACAAACCCTAGAGAAAACTTTAAGTTAGTTAACATTGCTGATTATACATTTATTGCTAACACAGCAACAACAGTTGCGGCTGACAGCACAACGTCTGCGGCTAAAGTAGAAGAGTTTTTAATTGTTTGTAAATTAACAAACTATGGTAGAGAATATAAAGTTGCATTGAAACACCCATCAATGGCACAAGAACTAGAAGTTATTTTTCAGTTACCTTCAGGTAATGATGCTTCTACTGATGCAAAATTTAGAGATACAAACAAAATTACAGATATACTTTTATATGGAACTTCAAGTACACACTGGGATAGTACGGCTGATGGCATTGGATTTAAAGTAGTAAGAACTGACACAAATGCTTCTGTATCAACTACACAAGGATTAGCTAACTATTCTGGTTTTACATCTTATTTTACGTTTGAGGCTTTTGATAGTGTAATTTATGGTAAACCGACAGACCAAAATGCAAACTATACTATAACTACATCTGATGGTTCTGGTAATACAGCCATGTATGCCATTAGAGATGAGATACAAGATTTTAGTAAGTTACCTTTTTATGGAAAAGAAGGTGTAATTATAAAAATTACTGGAGAAGAAGGTGATACATTATCTGATTACTATGTAAATTTTTCAGGTAAATCTGGTGTATGGAATGAAACTATAGCACCTGCAACTTCCGTAGGTTTAGATAATTCTACAATGCCACACGCATTGATTAATAACAACAATGGTACATTTACATTTCAACAATTAGATTGGACAGATAGAGTATGTGGAGATATTGATACTAATCCTAATCCAACTTTTGTTGGTAAAAAAATTAACAATTTAACATTTTACAAAAACAGATTAGGTATATTATCAGGAGAGAATTTAGTATTAACAGAAAATGCTTCTTTCTTTAATTACTTTGCAACAACATCTACACAAGTATTAGATACTGACCCTATTGATATAGCGGCTTCGGGTACACAAGTAAATACACTTAAAAACTCTGTTGGCTTTAATGAAAGTTTGTTAATATTTTCTGATACAGCACAATATAAATTAGATAGTGCGGCAGAAACTATTACACCTACTACAGCTATCCTTAATGCTGTTTCTACTTTCGAACATGATGCAAAAGTTACACCTGTTGCGGCAGGTAAGTTTGCATATTTTGCACAAGCAAGAACTAATAATACAGCCATAAGAGAATATTTTGCTGATGATGATACTCTTACTAATGATGGATTAGATATTACAGTTTCAGTACAAAACTTGATACCTAGTAACTGTTATCAAATTGTAAGTAATACAACAGAAGATACTTTAATATTTTTAACATCTGATACCGCAGATAGTCAAACAGCACCTTATAGTGGCACAGTGTCTACAACATACGCTAACACAATGTACATCTATAAGTATTTCTTTGATGGTGGTGAGAAAGTGCAAAACGCATGGTCTAAATGGACATTTACTGGTGTTAAAATTATAGGTGCTATGTCATTAGAAAGTTTTATTTATGTATTAGCGTCAGAAGGAACTACTACAAAATTATTAAAAATAGATTTAAGAAATTTAAAAGATACAACAATAGGTCATGGAGTTTATCTTGACCTTAAAACTTCAGTTACAGGAACGTATGATGCGGCAACTAATTTAACTACGTTTACTTCACTTTATGGAGTAAAAACTGGATTGATTGCAGTAGATAGAACTAATGGAAGTAACTACACAGCAACAAATACTACAGGCTCAACTTACACAATCGTCGGAAACCACACAGCGTTATACATTGGTGTGCCATACGAAAGTAAATACACAATGTCTACACAGTTTGTTAGAGAGAATACTGGAAGAGGACTAGTAGCAGTAACTTCAGGTAGATACCAAATACGAAACATATCTTTTAATTTTGAAAACAGTGGGTTCTTCCAAGTAGAAGTCACACCAGAAAATAGAGATACGTCTACAGCTATTATGAATGGTTATGTTATTGGTACTTCTACTTCAGTAATAGGACAACCTGCTATTTCTACAGGTACACTAAGAGTACCAGTACAAGCAGAAAACACACAATTTACTTTAGATATTAAATCGTCATCTCACTTGCCTATGTATATCGCAGGTGCAGAGGTTGAAGGTTATTATCACAATAGAGCAAGAAGGATTTAA

Tertiary structure

PDB ID
67f420970705ce219763ba3c8eba098eba4d86664d64b6d5e291c4ffcfc2a8a6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2472
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50