Protein

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Genbank accession
XYL33254.1 [GenBank]
Protein name
putative colanic acid-degrading protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATFPTYPATSLEQGVDLVIFSSNQLHDVINGSATESIETESGLIPTLRKALVDNFFFKSPLDWAQGTNETVFNQLRYFQNGVLSGYYYAPNATLVNPIPMQGTPVGDNNWVLWGLKTEQLATEVTPWVYSGATGYETVISPPYIFDSAIVTINGVIQVLGEAFRIEDSKIILSEPLGHDPATGLPNKLFAYIGKIVASADTDPNLENRLVSLETKTEELTESMDKVPLQTIARKYGLLDDEVAYATAGQSLTGIKALYDPVAQSSYTLPPNITGTLTSLSVSGVMTYSGGSVDLSALAVERGQFVHLPTSFGNNVTLTAKNQTIGRGAGRYRWAGSLPKSILASDTLETSGGLGPNAWVLTNTEGLLTPRGGTYNDLFDVVYLSEFANNTTTYTTPEAAFQAALLAAKASKSKILDAYGCDMTFTTSSFDIQGITLRGGVFRGQRDYRVQNATVEGTTFRNSRVMYWGGAVRMFDCLWDGAPRAGQVGSLVFQGNPISGTFEIDNCTFKNGLYGILQQGTGEPVTRGVFRNLTFMDMQGDAIELNVINKHYDDGCVIENIYLSNIDGTNAPIPLSNWGIGIGVAGKGPYGYGIPDDQYCKNITIRNVFAKRCRQIVHVEVGRNISIENIHGDPDQTVSVGTGLATGAVVMYGSKDFTIDGVYGEPKTDGSTLASNIRMIYLEWGTNAVLDEEGNPVVPAQGRPSNPCFNYSVRNIHTKTGRVFAGVSAGPGYENRVSFENIRCAALQLFGIASWLSMSNITCNIFDCVGQPESGPGTFYDGFFRREKSVLEMVNVNCYPDGKTMVTGRPQWSRCRYSDIHRVNCNVEANMYTNIAGGIGAIVGTTGKVYYLEPNPSRNIDGMHFPTGKEFDKGDMIVKADNTFFLVTTSGAYIPDIPAFGIRATQAGDTFLTQNLTPNGTATNASWLYHYPLSAGTRIRIPGAGVGGADLDTVITRAPYQDNDTWTNPVKIDIADPIVTPTSAGVRIKTIPNDSSNVSVGNTAVIRPTPVVDVPTT
Physico‐chemical
properties
protein length:1017 AA
molecular weight: 109867,27630 Da
isoelectric point:5,02504
aromaticity:0,09538
hydropathy:-0,13845

Domains

Domains [InterPro]
IPR058969
10–113
IPR058969 G3DSA:3.30.2020.50 G3DSA:2.10.10.80 IPR011050
IPR040775
302–361
IPR040775 IPR012334
XYL33254.1
1 1017
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ShWW/46
[NCBI] 		3444376 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYL33254.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV808485 [NCBI]
CDS location
range 94561 -> 97614
strand +
CDS
ATGGCAACATTCCCAACGTATCCAGCAACGTCTCTTGAACAGGGCGTAGATCTGGTTATTTTCTCGTCCAATCAACTTCATGATGTTATTAATGGAAGTGCGACAGAAAGTATTGAGACAGAATCAGGGTTGATACCAACCCTGAGAAAAGCCCTTGTTGATAACTTTTTCTTTAAAAGCCCATTGGATTGGGCGCAAGGCACAAATGAAACGGTTTTTAACCAACTACGTTATTTTCAGAATGGGGTATTGAGCGGTTATTATTATGCTCCTAATGCTACATTGGTAAACCCAATCCCTATGCAAGGTACTCCAGTAGGAGATAACAACTGGGTATTGTGGGGATTGAAGACAGAACAATTGGCAACAGAAGTCACACCTTGGGTATATTCTGGTGCAACTGGTTATGAAACAGTAATCAGTCCTCCTTACATCTTTGATAGTGCTATTGTTACGATCAATGGTGTTATTCAGGTTCTGGGGGAAGCTTTCCGTATAGAAGATAGTAAGATCATCTTATCTGAACCTTTGGGACACGATCCTGCAACAGGACTGCCAAACAAGCTTTTCGCTTATATTGGTAAAATCGTAGCTTCAGCAGATACAGATCCTAATCTAGAGAACCGTCTTGTTAGTTTAGAAACAAAAACGGAAGAACTAACAGAAAGCATGGATAAAGTCCCTCTGCAAACTATTGCTCGTAAATATGGTTTGTTAGATGATGAGGTGGCTTACGCAACAGCAGGTCAATCGTTAACAGGGATTAAAGCTCTGTATGATCCGGTAGCACAGTCTTCCTACACATTACCTCCTAACATCACAGGAACTTTAACATCTTTGTCTGTTTCTGGAGTAATGACTTATTCTGGGGGATCTGTAGATCTTTCTGCACTGGCTGTTGAACGTGGACAATTTGTCCATTTGCCTACAAGCTTTGGTAATAACGTAACCCTGACAGCTAAAAATCAGACGATTGGACGTGGTGCTGGTCGTTATCGTTGGGCTGGAAGTTTACCAAAAAGTATTTTGGCCTCTGACACATTAGAGACAAGCGGTGGATTAGGTCCAAACGCATGGGTTCTGACCAATACAGAAGGACTGTTAACCCCTCGTGGTGGAACATACAACGATTTATTCGATGTTGTCTACTTGTCAGAATTTGCTAACAATACAACTACCTATACCACACCAGAAGCAGCTTTCCAGGCGGCACTGTTAGCAGCAAAAGCTTCGAAAAGCAAGATTCTCGATGCTTACGGTTGCGATATGACTTTCACGACAAGCTCTTTTGATATTCAAGGTATCACTTTGCGTGGGGGTGTGTTCCGTGGTCAACGCGACTATCGTGTGCAAAATGCTACAGTAGAAGGCACAACTTTCCGTAACTCTCGTGTTATGTATTGGGGTGGTGCTGTGCGCATGTTCGATTGTTTGTGGGACGGTGCTCCTCGCGCAGGTCAAGTTGGTAGCTTGGTATTCCAAGGCAACCCAATATCAGGTACTTTTGAAATTGATAACTGTACTTTTAAAAACGGGTTGTATGGCATCCTTCAACAAGGAACAGGGGAACCAGTAACACGTGGTGTCTTCCGTAACCTTACCTTCATGGACATGCAAGGTGATGCAATAGAACTGAACGTCATCAATAAACATTATGACGATGGTTGTGTGATTGAGAATATTTACCTGTCTAATATCGATGGGACTAACGCTCCTATTCCTCTGTCCAACTGGGGTATCGGTATCGGTGTAGCTGGTAAAGGACCATATGGTTACGGAATCCCTGATGATCAATATTGTAAGAATATTACAATTCGTAACGTTTTTGCAAAACGTTGTCGTCAGATTGTCCACGTAGAAGTTGGTCGTAATATCTCTATCGAAAACATTCATGGCGATCCAGACCAGACCGTATCTGTTGGGACAGGTTTGGCAACTGGCGCAGTTGTAATGTATGGAAGTAAAGATTTTACGATTGACGGTGTTTACGGAGAGCCTAAAACAGACGGTAGCACACTTGCAAGTAATATCCGTATGATTTATTTGGAGTGGGGAACTAACGCAGTTCTGGACGAAGAGGGTAATCCGGTAGTTCCGGCACAGGGTAGACCTTCAAACCCATGCTTTAACTATTCTGTTCGTAACATTCACACCAAAACTGGGCGTGTTTTTGCGGGAGTTTCCGCTGGGCCAGGTTATGAAAACAGAGTTAGCTTTGAAAATATTCGTTGCGCTGCATTGCAGTTGTTCGGTATAGCTTCTTGGCTTTCAATGTCTAACATCACCTGTAATATCTTCGATTGTGTTGGTCAACCTGAGTCTGGTCCAGGGACATTTTATGATGGATTCTTCCGTAGAGAAAAATCTGTTCTTGAAATGGTTAACGTAAACTGTTACCCAGATGGCAAGACGATGGTTACTGGTCGTCCACAGTGGAGCCGTTGCCGTTACTCGGATATTCATCGTGTCAACTGTAATGTTGAAGCTAATATGTATACCAATATCGCAGGTGGTATTGGAGCTATTGTAGGGACAACGGGCAAAGTTTATTACTTAGAGCCTAATCCTAGTCGAAACATTGATGGAATGCATTTCCCAACAGGGAAAGAGTTTGACAAAGGTGATATGATAGTCAAGGCGGATAATACGTTCTTCCTTGTAACAACAAGTGGGGCATATATTCCAGATATCCCAGCTTTCGGTATTCGAGCTACACAGGCAGGAGATACCTTCCTGACACAGAACTTGACTCCTAACGGGACAGCAACAAATGCTTCTTGGTTGTATCATTACCCTCTGTCAGCAGGGACACGTATTCGTATTCCTGGTGCTGGCGTAGGTGGAGCAGATTTGGACACAGTTATTACTCGTGCACCTTATCAAGATAATGATACGTGGACTAACCCAGTTAAAATAGACATTGCAGATCCAATTGTAACGCCTACAAGTGCTGGAGTTAGAATTAAAACCATACCTAATGATTCCAGTAATGTTTCTGTAGGTAATACTGCGGTTATTCGCCCAACGCCAGTAGTAGATGTGCCAACAACCTAA

Tertiary structure

PDB ID
d1bfb5d1661ae79e66b98bb5c573c8249be675beec531677a2953275494625a6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6635
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50