Protein
View in Explore- Genbank accession
- QFG06615.1 [GenBank]
- Protein name
- major tail protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MRKLTNFKFFYNTPFTDYQNTIHFNSNKERDDYFLNGRHFKSLDYSKQPYNFIRDRMEINVDMQWHDAQGINYMTFLSDFEDRRYYAFVNQIEYVNDVVVKIYFVIDTIMTYTQGNVLEQLSNVNIERQHLSKRTYNYMLPMLRNNDDVLKVSNKNYVYNQMQQYLENLVLFQSSADLSKKFGTKKEPNLDTSKGTIYDNITSPVNLYVMEYGDFINFMDKMSAYPWITQNFQKVQMLPKDFINTKDLEDVKTSEKITGLKTLKQGGKSKEWSLNDLSLSFTKLQEMMLSKKDEFKHMIRNEYMTIEFYDWNGNTMLLDAGKISQKTGVKLRTKSIIGYHNEVRVYPVDYNSAENDRPILAKNKEILIDTGSFLNTNITFNSFAQVPILINNGILGQSQQANRQKNAESQLITNRIDNVLNGSDPKSRFYDAVSVASNLSPTALFGKFNEEYNFYKQQQAEYKDLALQPPSVTESEMGNAFQIANSINGLTMKISVPSPKEITFLQKYYMLFGFEVNDYNTFIEPINSMTVCNYLKCTGTYTIRDIDPMLMEQLKAILESGVRFWHNDGSGNPMLQNPLNNKFRVGV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 587 AA molecular weight: 68461,86650 Da isoelectric point: 6,69577 aromaticity: 0,12606 hydropathy: -0,54446
Domains
Domains [InterPro]
IPR031772
3–115
3–115
1
587
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Rosenblumvirus portland [NCBI] |
2956381 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QFG06615.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN098325
[NCBI]
CDS location
range 8073 -> 9836
strand -
strand -
CDS
ATGAGAAAATTAACAAATTTTAAATTTTTTTATAACACACCTTTTACAGATTATCAAAACACGATTCATTTTAATAGTAATAAAGAACGTGATGATTATTTTTTAAATGGCCGTCATTTTAAATCACTAGACTATTCCAAACAACCTTATAATTTTATACGTGATAGAATGGAAATCAATGTTGATATGCAGTGGCATGATGCACAAGGGATTAACTACATGACGTTTTTATCAGATTTTGAGGATAGACGTTATTATGCGTTTGTGAATCAAATCGAATATGTAAATGATGTTGTGGTTAAAATATATTTTGTGATTGATACTATTATGACGTACACGCAAGGTAATGTATTAGAGCAACTCTCAAACGTTAATATTGAACGACAACATTTATCAAAACGCACGTATAACTATATGTTACCGATGTTACGTAACAATGATGATGTGTTAAAAGTATCGAATAAAAACTATGTTTATAACCAAATGCAACAGTATTTGGAAAATTTGGTATTATTCCAGTCAAGTGCTGATTTATCAAAAAAATTTGGTACGAAAAAAGAGCCAAACTTAGATACGTCTAAGGGTACTATATATGATAATATCACATCACCAGTCAACTTATATGTTATGGAATATGGTGACTTTATTAACTTTATGGATAAAATGAGTGCATATCCATGGATTACACAAAACTTTCAAAAAGTTCAAATGTTACCTAAAGACTTTATTAATACAAAAGATTTAGAGGACGTTAAAACAAGTGAAAAAATTACTGGATTAAAGACGTTAAAACAAGGTGGAAAATCAAAAGAATGGAGTTTAAACGATTTATCATTAAGTTTCACAAAGCTTCAAGAAATGATGTTGTCTAAAAAAGATGAATTTAAACATATGATACGTAACGAATATATGACCATTGAATTTTACGATTGGAATGGAAATACAATGTTGCTTGACGCTGGTAAAATATCACAAAAAACAGGTGTTAAGTTACGCACAAAATCAATCATTGGTTATCATAATGAAGTTCGAGTTTATCCAGTAGACTATAACAGCGCTGAAAATGATAGACCGATACTCGCAAAAAATAAAGAAATATTGATTGATACAGGTTCATTCTTAAATACAAATATCACATTTAATAGTTTTGCACAAGTACCAATATTAATTAATAATGGTATCTTAGGACAATCACAACAAGCAAATAGACAAAAGAATGCGGAAAGTCAATTAATTACAAATCGTATTGATAATGTATTAAATGGTAGCGACCCGAAATCACGCTTTTATGACGCTGTAAGTGTGGCAAGTAATTTAAGTCCGACAGCTTTATTTGGTAAGTTTAATGAAGAATATAATTTCTACAAACAACAACAAGCTGAGTATAAAGACTTAGCATTGCAACCACCATCAGTGACAGAATCAGAAATGGGAAACGCGTTCCAAATTGCGAATAGCATTAATGGTTTAACGATGAAAATTAGTGTACCGTCACCTAAAGAAATTACATTTTTACAAAAATATTATATGTTGTTTGGTTTTGAAGTAAATGACTATAATACATTTATTGAACCAATTAACAGTATGACTGTATGCAACTATTTAAAATGTACAGGTACGTATACAATACGTGACATTGACCCTATGTTAATGGAACAATTAAAAGCAATTTTAGAATCTGGTGTGAGATTTTGGCATAATGACGGTTCAGGTAATCCAATGTTACAGAACCCGTTAAATAATAAATTTAGAGTAGGTGTATAA
Tertiary structure
PDB ID
a3ff223adb2f109d092f1d96b4dfd1c50077c6bc00ccf809a94b503f52e2ca02
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Coding-Complete Genome Sequence of Staphylococcus aureus Podophage Portland | Bonasera,R.M., Korn,A., Newkirk,H., O'Leary,C., Gill,J. and Liu,M. | 2019 | 31753959 | GenBank |