Protein

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UniProt accession
A0A8S5M1F5 [UniProt]
Protein name
Tailspike protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MSEKDNNVMPLATDPHNLGEFDNVYDAMRRYPNGGVDGDYIYILGVQHFWNVNRQSWGILKDKEDNLVQMVEDFIGLFERRGYVFAGYALPDTTPVSGLDNIFYIAAKNGAYTHFGSDLKLLNEVAILRKPRRSSIWIKDSMDIPNSERIDVIDDAISRINVDIKTIKSAIIGMENDLDGVHDSIDDINKDIDAFKKETSENFEEVNSDLDKVEKRLDYIPKESFLSAHPAGFKPDIDLTPEITVDRAWRDHEGNVIRDTYITRSGLRNEIIDITNQQVTDLKPGSVDPDDLSEATKQLIGNKSITNLPDEEDITVLENQTLKLKDKEYAPKDYSGMGRVYLRKHYVNGVNTLTQHMMRKPNTIYIIQYDYCLAGQTIEVPDNCVLDFQGGSLRNGKLIGYNTRISGKTINIFDNIKLGGRFLDDLNPLSFNINLLDWTSTYDLLYSLHTTAISMGVNVNYKDVRRINIEIPSVFNSIPLSNTTDFNNCEFHIRNNSKDCYLFARGDERPLITLDIDPILLKGVDYSSVPELNNGKFILIVKDNNLWSKRILNQGDLNIYRYDVIIIQDGFARNIPIQPYDTIDSDPIFYAVDVREDKNPTICNGKFFRENSTKLTKLFNIKKVDGMMIKDLYVYTDKNNVPKDMKADATFYFNFVTNLTLDNVYQMNTYSDAANAITHGYFLSVFNGFNIKLININAHDNDWGVIGCRCINTAFVDKSSINRFDIHTYGTHVTIRDSIISNKFCQIGDYYGDIVFDNCIFNKCSSPLVHEHTYNYMTKYNIYLKNCTINGSDNLVHYLYSHMDVAPIRVEQNKKYLPNIYIEGLTVNLLKDKVFKLILNNGNWKKSSLYEGIYGLENVVLKNLVINYDKDDSREYTYMNLQYEQIDLLSCPNIVIDNCVFGKVIKGSELKLINSNLNVETLRVQYTLLRPNTKGKFTIKNSLIALPTKEYCPYDFIVENSDIINVRTSSLEENKYNNYMFVNCNLHFNRYGNTLDEGYAGNYVNCKFLMYRDKPSIYFESILDNWETNIINCSTNKQDYGTILYNNPFIPYSVENSHIIKNEFKKTRLSKTTINGISYVLLEQDTPESIEKIPYDAYNYARFLREKSLPLNFQRVKISGEEDAKWVNKAVSVIIAGSTNDMPKTGSITGLTYYDWDKRKLFVWSGERWRNAGTGFESKFEVIGSTNSRPTDLSIDEKGFQYYDTILNKPIWWTGTNWVDATGATV
Physico‐chemical
properties
protein length:1226 AA
molecular weight: 140883,54740 Da
isoelectric point:5,36858
aromaticity:0,11338
hydropathy:-0,41134

Domains

Domains [InterPro]
Coil
196–216
Coil
A0A8S5M1F5
1 1226
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Podoviridae sp. ctIi96
[NCBI] 		2826550 Uroviricota > Caudoviricetes >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
DAD76066.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
BK014795 [NCBI]
CDS location
range 29596 -> 33276
strand +
CDS
ATGAGCGAGAAAGATAACAACGTGATGCCTTTGGCTACAGATCCTCATAATCTGGGCGAGTTCGATAACGTGTATGACGCTATGCGTAGGTATCCTAACGGAGGCGTGGACGGGGATTATATTTATATCTTGGGTGTCCAGCATTTTTGGAACGTGAATCGTCAAAGCTGGGGGATACTAAAGGATAAGGAGGATAATTTAGTCCAGATGGTAGAGGATTTTATCGGCCTTTTCGAGAGAAGGGGGTATGTCTTCGCTGGTTATGCGTTACCAGACACCACTCCTGTTTCTGGGCTTGACAATATCTTTTATATAGCGGCCAAGAATGGGGCTTATACTCATTTTGGAAGCGATCTGAAATTATTGAATGAGGTTGCTATCTTACGTAAACCCAGAAGATCATCTATATGGATTAAGGATTCAATGGATATCCCGAACTCGGAGAGGATAGACGTTATAGATGATGCCATATCACGTATAAATGTCGATATAAAGACAATAAAATCAGCGATTATCGGCATGGAGAATGATCTTGATGGGGTACATGATTCTATCGATGATATAAATAAGGATATAGATGCTTTCAAGAAGGAGACCTCCGAAAATTTCGAGGAGGTAAACTCTGATTTAGATAAGGTGGAGAAGCGTCTTGATTACATACCTAAGGAGTCGTTTTTATCAGCCCATCCCGCCGGTTTCAAGCCGGACATCGACCTTACCCCGGAGATCACGGTAGACCGTGCTTGGAGAGACCATGAGGGTAACGTTATCCGTGATACGTATATCACCCGGAGCGGATTGCGGAACGAGATAATCGACATCACCAACCAGCAGGTAACGGACTTGAAGCCCGGCTCTGTCGATCCGGATGATCTTTCCGAGGCTACCAAGCAATTGATCGGTAACAAGAGCATAACCAACCTTCCGGACGAGGAGGATATAACCGTTTTGGAAAACCAGACCTTGAAACTGAAAGATAAGGAATACGCACCGAAGGATTACTCCGGAATGGGACGGGTGTACCTCCGGAAGCATTACGTGAACGGCGTGAACACGCTCACGCAGCACATGATGAGAAAGCCTAATACCATTTACATCATCCAGTACGACTACTGCCTAGCCGGTCAGACGATTGAGGTGCCGGACAATTGCGTGCTGGATTTCCAAGGGGGGAGTTTGAGGAATGGTAAATTAATTGGTTACAATACACGTATCAGTGGTAAAACAATAAACATTTTTGATAATATCAAACTTGGTGGAAGATTTTTAGATGATCTAAATCCTCTAAGTTTTAATATCAATCTTTTAGATTGGACATCTACTTATGATTTATTATATTCTTTACACACAACCGCTATTTCTATGGGCGTAAATGTGAATTATAAAGATGTTAGAAGAATAAATATAGAGATACCATCTGTGTTTAATTCTATTCCATTAAGTAATACTACTGATTTTAACAACTGTGAATTTCATATTAGAAATAATTCTAAAGACTGTTATTTGTTTGCAAGAGGTGATGAAAGACCTTTAATAACGCTAGATATTGATCCAATACTTTTAAAAGGAGTTGATTATTCTAGTGTGCCTGAATTAAATAATGGAAAATTTATTCTTATAGTAAAAGATAATAATTTATGGTCAAAGCGTATTTTAAATCAAGGTGATCTCAATATATATCGTTACGATGTAATTATTATTCAAGATGGATTTGCTAGAAATATTCCAATTCAACCATATGATACAATTGATTCTGATCCTATATTCTATGCGGTAGATGTACGTGAAGATAAAAATCCTACAATTTGTAACGGTAAATTCTTTAGAGAGAATAGCACAAAACTTACAAAGTTGTTTAATATAAAGAAGGTAGATGGTATGATGATAAAAGATCTGTATGTATATACAGATAAGAATAACGTCCCAAAAGATATGAAAGCTGATGCTACTTTCTATTTTAATTTTGTGACTAATCTCACATTAGATAACGTATATCAAATGAATACTTATTCTGATGCTGCTAATGCAATAACCCATGGTTATTTTTTATCCGTATTTAATGGTTTTAATATAAAACTAATAAATATAAATGCCCACGATAATGATTGGGGTGTAATAGGTTGCAGATGTATAAATACTGCATTTGTGGATAAAAGTAGTATAAATAGGTTTGATATTCATACCTACGGTACGCATGTGACGATTAGAGACAGTATTATTTCTAACAAGTTTTGTCAAATAGGTGATTACTATGGTGATATTGTATTTGATAATTGCATATTCAACAAATGTTCATCTCCTTTAGTTCATGAACATACCTATAATTATATGACAAAATACAATATTTATTTGAAAAATTGTACTATAAACGGTTCTGATAATTTAGTTCATTATTTGTATTCTCACATGGATGTTGCTCCAATTCGAGTAGAACAAAATAAAAAATACTTGCCAAATATATATATTGAAGGATTAACTGTAAACCTTTTAAAAGACAAAGTATTTAAACTTATATTGAATAACGGAAATTGGAAAAAGAGTAGTTTATATGAAGGGATTTACGGATTAGAAAATGTGGTTCTTAAAAATTTAGTAATTAATTATGATAAGGACGATTCTAGAGAATACACTTACATGAATTTACAATATGAACAAATAGATCTATTGTCTTGTCCAAATATAGTTATAGATAATTGCGTTTTTGGAAAGGTTATAAAAGGGTCTGAGTTAAAATTAATTAATTCGAATCTTAATGTTGAAACATTAAGAGTGCAATATACTTTGTTACGTCCGAATACAAAAGGAAAATTTACAATAAAAAACTCGTTAATAGCGTTACCTACAAAAGAATATTGCCCATATGATTTTATTGTTGAAAATTCTGATATAATTAACGTGCGTACTTCTTCTTTGGAAGAAAATAAATATAATAATTATATGTTTGTTAATTGCAACTTACATTTCAATAGATATGGTAATACACTTGACGAGGGTTATGCGGGTAATTACGTTAACTGTAAATTTTTAATGTATAGAGATAAACCTAGTATTTATTTTGAAAGTATTTTAGACAATTGGGAAACTAATATAATTAATTGTAGTACTAATAAGCAAGATTATGGTACAATATTGTATAATAACCCTTTTATTCCATACTCAGTTGAAAATTCACATATAATAAAAAATGAATTTAAAAAAACACGCTTGTCTAAAACTACAATTAACGGTATTAGTTATGTCTTGTTAGAACAAGATACTCCAGAATCAATTGAAAAAATTCCTTATGATGCTTACAATTATGCTAGATTTTTAAGAGAAAAATCTCTCCCGCTTAACTTTCAAAGGGTAAAAATATCCGGTGAGGAAGATGCGAAATGGGTGAATAAAGCTGTAAGTGTAATTATTGCAGGATCTACAAATGATATGCCTAAAACTGGTAGTATTACAGGTCTTACTTATTATGATTGGGATAAAAGGAAATTGTTTGTGTGGTCTGGAGAGAGATGGAGGAATGCTGGAACTGGTTTTGAAAGTAAATTTGAAGTTATAGGTTCAACCAATTCAAGACCAACTGATTTAAGTATAGATGAAAAAGGGTTTCAATATTATGATACAATTTTAAACAAACCAATCTGGTGGACAGGCACGAACTGGGTCGACGCTACCGGAGCTACCGTATAA

Tertiary structure

PDB ID
c41cdc2eb8c0b5061bf4f89eec70267e08b86b0e6b8ad0ef891f818af774bad0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7378
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50