Protein

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Genbank accession
CAB5222944.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MANYSIDVIDSNNITVEVTPTSTTEITIDRGIAGASGYSGYSGYSGYSGLGYSGASGISGYSGFSGYSGFSGLGLSGYSGYSGSGTSGYSGYSGYSGQSIQGASGYSGYSGYSGVGVSGYSGYSGYSGSGVSGYSGFSGSGISGFSGFSGFSGAVGQSGISGFSGFSGAVGQSGISGYSGFSGSGISGYSGWSGISGYSGSGVSGYSGFSGISGYSGSGISGYSGFSGYSGQQGANINIVGEVATPASLPPSANINDAYIVTSDGDLYVWNGSTWFDAGQIVGPPGASGISGFSGYSGEVGASGISGFSGFSGQSGFSGAVGDSGISGFSGASGISGFSGFSGEKGDSGISGFSGISGWSGFSGQIGDSGISGYSGYSGAVGTSGISGYSGYSGSGISGWSGFSGYSGEVGASGISGFSGFSGQNGAQGESGFSGISGYSGYSGSGVSGYSGYSGSGVSGYSGYSGYSGIGTSGYSGISGFSGYSGAPGLGGTVASWGSFWSTQDQTASVVNTAYAMTVNNTDADSRDVSVVSNSRITFATAGVYNFQFSSQFHNNGGGGSGQTVNIWLRKNGTDVADTNTKLIVPSNAPYVVAAWNFVLKLNANDYLELMWDTDNTNIQMDQVAAGNPPPSIPSVIITATQVAYAISGYSGYSGFSGISGYSGFSGSGISGYSGYSGSGISGYSGYSGSGISGYSGYSGSGISGFSGYSGYSGVQASLVSNLIYNAYTATAGQTSFTTTNTYTANKIQVSVNGVILVNGSDCTVSGGTTFTTTALALNDRVLAIYPI
Physico‐chemical
properties
protein length:788 AA
molecular weight: 77037,95060 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,14086
hydropathy:-0,01472

Domains

Domains [InterPro]
IPR050149
283–713
IPR050149
IPR008160
283–340
IPR008160
CAB5222944.1
1 788
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB5222944.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798310 [NCBI]
CDS location
range 24609 -> 26975
strand -
CDS
ATGGCAAATTATTCTATTGATGTTATTGATAGCAACAATATAACAGTAGAAGTAACACCTACTTCTACAACTGAAATTACTATTGATCGCGGCATTGCTGGCGCATCAGGTTATTCAGGATATTCAGGTTATTCAGGTTATAGTGGTCTTGGATATTCAGGCGCTTCAGGCATTAGTGGATATAGCGGATTTTCGGGTTATTCAGGATTTTCAGGATTAGGTTTAAGTGGTTATTCCGGTTATTCAGGTTCAGGAACTTCAGGTTATTCAGGCTATTCAGGTTATTCAGGTCAATCAATTCAAGGTGCTAGTGGTTATTCAGGCTATAGTGGTTATAGCGGAGTTGGCGTATCAGGTTATAGTGGCTATTCCGGTTATTCCGGTAGTGGTGTATCCGGCTATTCAGGTTTTAGCGGTAGTGGCATAAGTGGTTTTTCAGGATTTAGCGGATTTTCGGGCGCAGTTGGTCAATCAGGAATTTCAGGATTTTCGGGTTTTAGCGGCGCAGTTGGACAATCAGGAATTTCAGGCTATTCAGGATTTAGTGGAAGTGGAATTTCAGGCTATAGTGGCTGGTCAGGCATTAGTGGATATAGCGGAAGTGGCGTAAGTGGCTATAGTGGATTTTCAGGCATATCAGGATATTCAGGAAGTGGCATATCAGGATATAGTGGTTTTTCAGGCTATAGCGGACAACAAGGCGCAAATATTAATATTGTAGGTGAAGTTGCTACACCAGCAAGTTTACCACCAAGCGCAAATATTAATGATGCTTACATTGTTACTTCTGATGGCGATTTATATGTTTGGAATGGATCAACTTGGTTTGATGCTGGACAAATTGTAGGGCCACCGGGTGCTAGCGGTATATCAGGATTTTCAGGATATAGCGGCGAAGTTGGCGCAAGCGGAATTTCAGGATTTAGCGGATTTAGCGGACAATCAGGATTTAGCGGCGCAGTTGGTGATTCAGGAATTTCAGGATTTTCCGGCGCTTCAGGAATTAGCGGATTTTCAGGATTTAGTGGCGAAAAAGGCGATAGTGGAATTTCAGGATTTAGTGGAATTTCGGGATGGTCAGGATTTTCAGGACAAATTGGCGATAGCGGAATTAGTGGCTATAGCGGATATTCAGGCGCAGTTGGCACATCAGGGATTTCAGGCTATTCGGGATATAGCGGTTCAGGTATAAGTGGATGGTCAGGATTTAGTGGCTATTCAGGCGAAGTTGGCGCATCAGGCATTAGCGGATTTTCGGGATTTAGCGGACAAAATGGCGCACAAGGCGAATCAGGATTTTCAGGAATATCGGGATATAGCGGATATTCAGGAAGCGGTGTAAGTGGTTATAGTGGTTATTCCGGTTCAGGTGTTTCAGGCTATAGCGGTTATAGTGGATATTCAGGAATAGGAACTTCCGGATATAGCGGCATTTCAGGGTTTAGCGGATATTCAGGCGCACCGGGACTTGGTGGCACAGTTGCATCTTGGGGTTCATTTTGGTCTACACAAGATCAAACTGCTAGTGTTGTAAATACTGCTTATGCAATGACAGTTAATAATACTGATGCTGATTCAAGGGATGTATCAGTTGTATCAAATTCAAGAATTACATTTGCAACTGCTGGTGTTTATAACTTTCAATTTTCTTCACAATTTCATAATAATGGTGGTGGCGGTTCAGGACAAACAGTTAATATTTGGTTAAGAAAAAATGGAACTGATGTTGCTGATACAAATACAAAATTAATTGTTCCTTCTAATGCGCCTTATGTTGTAGCGGCTTGGAATTTTGTATTAAAACTTAATGCAAATGATTATTTGGAATTAATGTGGGATACAGATAATACAAATATACAAATGGATCAAGTTGCGGCTGGAAATCCACCGCCATCTATTCCTTCAGTTATTATTACTGCAACACAAGTTGCTTATGCAATTTCAGGATATAGCGGTTATAGCGGTTTTAGCGGGATATCAGGGTATTCAGGTTTTTCAGGAAGCGGCATTAGCGGTTATTCCGGTTATAGTGGTTCAGGTATATCAGGGTATTCGGGCTATTCGGGTAGCGGTATATCGGGCTATAGCGGTTATTCAGGTAGTGGTATTAGCGGGTTTTCCGGTTATTCAGGTTATAGTGGCGTTCAAGCAAGTTTAGTAAGCAATTTAATTTATAATGCTTATACTGCAACTGCGGGACAAACATCATTTACAACAACAAATACTTATACTGCAAATAAGATTCAAGTTTCAGTTAATGGTGTTATACTTGTTAATGGAAGTGATTGCACAGTATCAGGCGGCACTACATTTACAACAACTGCATTAGCTTTAAATGATAGGGTATTAGCTATATATCCAATATAA

Tertiary structure

PDB ID
9332cde00bb15d043d877334a607a0448ee1668f739cdb5956ee45d25ddc51ea
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2582
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50