Protein
View in Explore- Genbank accession
- AIW03308.1 [GenBank]
- Protein name
- tail spike protein
- RBP type
-
TSPTFTFTSPTF
- Protein sequence
-
MAEDIKKVKLLFRKGTQAELSNLDAGEPGLATDTQNLYVGTGGDSKVQLAKQADLTSLQTKVNNNKSQTDQTLTDHSNKLTQQQSSIEGQYNALQNHEGRIVANEQALPNKVDTTTYNGLKSTVDTLKTNTENSISQLNQDVSALEGTVAQNTSDIEYLKANGGGGGGGSSEDLTELQSEVSTLKSDVSTNKSDISTLKQTTQTQGTAISAAQGDISKNKTDIQTLQATKKEVDDAKGTGTLKEKFDSIEKSQNSEEFEVTTARKVFTLTSGQYVPNSKTLKVYIQGILQSPQDYVQTNSTTVTFKEDVPAGNIVTLEWLQGKLPTQFGHNSTHELGGPDEIDLAKLKNYQEKVVKPIADVYKRSDIFFNMLETTAKGDGATNDTSVFTTLENSFTDKIIELNGKTYLVDSLPTKNKYVNGRFLVGGSYFDASFTINVKSNHGVIALGIGAAKSSPTFPVYSGTDKFYKNIAIGGYALQNSIGSFNNIAIGWNAMDAATSGEFYNIAIGNEALWSVKKTNTSDSFAASRNIAIGMNAMRFNINGHHNVALGRNNLQCSKNGSRNTAIGVNAMAGIAPLDLTGVIADYTKYDSNDTTAIGAEALLNSVGNENTGVGAYAANNLVKATRNVAVGKNALYSLQKDMTVDGNNKIYWSKTGSYVWSGTKITVTMSGHGLQNGNLISLKLTTGSNLKTSEENQYTISNVTTNTFDIVSPLSNNTVGNCSSSWYSDMTANTKTADNNNAIGNYAMENSVSGQNNTAIGTWTLRNIIGEFNSFVGNLSGTNLTSGSFNSALGYGALRAMQDGTTATNLTNVTALGYNTRASGDNQVQLGDANTTTYAFGPVQSRSDKRDKLDIQDTDLGLEFIKKVPIRKFRYNYRDLYEEGDNSKGDKAGKRFHQGVIAQEVKKVMDDLGVDFGGYQDHKVNGGSDVLSIGYEEFIPVSMKAIQELAEKDKLKDQKIEKLESAIASLLERVEKLEGGN
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 982 AA molecular weight: 105813,90370 Da isoelectric point: 5,52318 aromaticity: 0,07026 hydropathy: -0,50418
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Bacillus phage Mater [NCBI] |
1540090 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Bacillus megaterium [NCBI] |
1404 | Bacteria > Firmicutes > Bacilli > Bacillales > Bacillaceae > Bacillus |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIW03308.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KM236245.1
[NCBI]
CDS location
range 88111 -> 91059
strand -
strand -
CDS
ATGGCAGAGGATATTAAAAAGGTTAAACTACTTTTTCGTAAAGGTACTCAGGCAGAGCTAAGCAACTTAGACGCAGGGGAACCGGGACTAGCTACAGATACACAAAACCTGTATGTAGGTACTGGAGGGGATAGTAAAGTTCAGCTGGCTAAACAAGCGGATTTAACCTCTTTACAGACAAAAGTAAATAACAATAAATCACAAACTGATCAGACACTGACTGATCATAGTAATAAGCTAACTCAACAACAATCAAGTATAGAAGGTCAATATAACGCTTTACAAAATCATGAGGGGCGTATTGTTGCTAATGAACAGGCCTTACCAAATAAGGTAGATACTACTACGTATAACGGTCTTAAAAGTACTGTAGACACTCTAAAGACAAATACAGAGAATAGTATATCGCAGCTAAACCAAGATGTAAGTGCTCTAGAGGGTACCGTTGCTCAAAATACCTCAGACATTGAATACCTTAAAGCTAATGGAGGCGGTGGGGGCGGAGGTAGTAGCGAAGACCTTACTGAGCTTCAGTCAGAGGTATCGACATTAAAATCAGATGTCTCTACTAACAAGTCTGATATTTCTACCTTAAAGCAAACGACTCAAACTCAAGGTACAGCTATTTCAGCAGCTCAAGGAGACATCTCTAAAAATAAAACAGACATCCAAACGTTGCAGGCTACTAAGAAAGAGGTAGACGATGCTAAAGGAACTGGTACTCTTAAAGAGAAGTTCGACAGCATTGAAAAGTCTCAAAATTCAGAAGAGTTTGAAGTTACTACCGCTAGGAAGGTATTTACGCTTACTTCAGGCCAATACGTACCAAACAGTAAAACATTAAAGGTGTACATACAAGGTATCTTACAATCTCCTCAAGACTATGTACAAACAAACTCTACTACCGTCACTTTCAAAGAGGACGTACCAGCAGGGAACATTGTTACGCTTGAATGGCTGCAAGGTAAACTACCTACACAATTCGGGCATAACTCTACTCACGAACTAGGTGGCCCGGATGAAATTGACTTAGCTAAACTTAAAAACTATCAAGAGAAAGTCGTAAAGCCGATCGCAGACGTGTACAAACGATCAGATATCTTCTTTAACATGCTAGAAACAACAGCTAAAGGTGATGGAGCTACAAATGATACGAGCGTATTCACTACACTAGAGAACTCGTTTACAGATAAAATCATCGAGCTAAATGGTAAAACATATCTAGTAGATAGTTTACCAACAAAGAATAAATATGTCAATGGTCGTTTCCTAGTAGGCGGTTCATACTTCGATGCTAGCTTTACCATTAATGTCAAGTCTAACCACGGAGTTATTGCTCTTGGTATTGGTGCAGCTAAGTCATCTCCAACGTTCCCTGTTTACTCCGGGACTGACAAGTTCTATAAGAATATTGCTATTGGAGGGTATGCACTACAAAATAGTATTGGTTCTTTCAATAACATTGCTATCGGGTGGAATGCAATGGACGCAGCTACTTCGGGGGAGTTCTATAACATTGCTATCGGTAATGAAGCTTTATGGAGTGTAAAGAAAACAAATACTTCAGATAGCTTTGCAGCAAGTCGTAATATTGCTATCGGCATGAACGCTATGCGCTTTAACATTAACGGACACCATAACGTAGCATTAGGTCGTAACAATTTACAATGTTCAAAAAACGGTTCGCGCAACACAGCGATTGGTGTTAATGCTATGGCAGGTATTGCTCCATTAGACCTTACAGGAGTTATTGCAGACTATACCAAATATGATAGCAACGATACAACGGCTATCGGAGCAGAAGCTTTACTTAACAGTGTAGGGAATGAGAACACAGGTGTCGGTGCTTATGCAGCAAACAACCTTGTCAAAGCTACACGTAACGTAGCAGTAGGTAAGAACGCATTGTATAGCCTCCAAAAAGATATGACAGTAGATGGTAACAATAAAATCTATTGGAGTAAGACAGGCTCGTATGTCTGGTCTGGAACAAAGATTACAGTTACAATGTCTGGTCATGGTCTTCAGAATGGAAACCTAATTTCACTTAAACTTACGACTGGCAGTAACTTGAAAACTTCTGAAGAAAATCAGTACACAATCTCCAACGTAACTACTAATACATTTGACATTGTTTCCCCGTTATCTAACAACACGGTAGGTAACTGTTCTTCTTCTTGGTATAGCGACATGACTGCTAACACGAAGACTGCGGATAACAATAATGCGATTGGTAACTATGCAATGGAGAACAGCGTAAGCGGCCAGAACAATACAGCTATCGGTACATGGACACTCCGTAATATTATCGGAGAGTTTAACAGCTTCGTAGGTAACTTGTCAGGAACTAACTTAACTAGCGGAAGCTTTAACTCTGCTTTAGGTTATGGTGCGCTTCGAGCTATGCAGGATGGTACTACAGCAACTAACCTAACAAATGTAACAGCTCTTGGTTATAACACTCGAGCAAGCGGAGACAATCAAGTTCAGTTAGGGGATGCTAATACTACTACATATGCTTTCGGGCCTGTACAGAGTCGTTCAGATAAACGAGACAAGCTTGATATTCAAGACACGGATTTAGGTCTCGAGTTTATCAAGAAGGTTCCTATCCGTAAGTTCCGATATAACTACCGCGATCTTTACGAGGAAGGAGATAACAGTAAGGGAGACAAAGCTGGTAAACGTTTCCACCAAGGGGTTATCGCTCAGGAAGTCAAGAAAGTTATGGATGACCTTGGCGTAGACTTTGGGGGGTACCAAGACCACAAAGTAAACGGCGGTAGTGATGTTTTATCCATTGGTTATGAGGAATTTATCCCGGTATCCATGAAAGCTATCCAAGAGTTAGCGGAAAAGGATAAGCTAAAAGATCAGAAAATTGAAAAACTTGAATCTGCTATCGCTAGTCTACTTGAGCGTGTAGAGAAATTAGAAGGAGGGAACTAG
Tertiary structure
PDB ID
dac8ae1212740c0165c800b605adb5f849c0353c6926c6093af3668a71cde3a6
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50