Protein

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Genbank accession
XXK93209.1 [GenBank]
Protein name
colanic acid degradation protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATFPTYPATSLEQGVDLVIFSSNQLHDVINGSATESIETESGLIPTLRKALVDNFFFKSPLDWAQGTNETVFNQLRYFQNGVLSGYYYAPNATLVNPIPMQGTPVGDNNWVLWGLKTEQLATEVTPWVYSGATGYETVISPPYIFDSAIVTINGVIQVLGEAFRIEDSKIILSEPLGHDPATGLPNKLFAYIGKIVASADTDPNLENRLVSLETKTEKLTESMDKVPLQTIARKYGLLDDEVAYATVGQSLTGIKALYDPVAQSSYTLPPNITGTLTSLSVSGVMTYSGGSVDLSALAVERGQFVHLPTSFGNNVTLTAKNQTIGRGAGRYRWAGSLPKSILASDTLETSGGLGPNAWVLTNTEGLLTPRGGTYNDLFDVVYLSEFANNTTTYTTPEAAFQAALTAAKASKSKILDAYGCDMTFTTSSFDIQDITLRGGVFRGQRDYRVQNATVEGTTFRNARVMYWGGAVRMFDCLWDGAPRAGQVGSLVFQGNPITGTFEIDNCTFKNGLYGILQQGTGEPVTRGVFRNLTFMDMQGDAIELNVINKHYDDGCVIENIYLSNIDGTNAPIPLSNWGIGIGVAGKGPYGYGIPDDQYCKNITIRNVFAKRCRQIVHVEVGRNISIENIHGDPDQTVSVGTGLATGAVVMYGSKDFTIDGVYGEPKTDGSTLASNIRMIYLEWGTNPVLDEEGNPVVPAQGRPSNPCFNYSVRNIHTKTGRVFAGVSAGPGYENRVSFENIRCAALQLFGVASWLSMSNITCNIFDCVGQPESGPGTFYDGFFRREKSVLEMVNVNCYPDGKTMVTGRPQWSRCRYSDIHRVNCNVEANMYTNIAGGIGAIVGTTGKVYYLEPNPSRNIDGMHFPTGKEFDKGDMIVKADNTFFLVTTSGAYIPDIPAFGIRATSAGDTFLTQNLTPNGTATNASWLYHYPLSAGTRIRIPGAGVDGADLDTVITRAPYQDNDTWTNPVKIDIADPIVTPTSAGVRIKTIPNDSSNVSVGNTAVIRPTPVVDVSTT
Physico‐chemical
properties
protein length:1017 AA
molecular weight: 109957,35430 Da
isoelectric point:5,02442
aromaticity:0,09538
hydropathy:-0,14454

Domains

Domains [InterPro]
IPR058969
10–113
IPR058969 G3DSA:3.30.2020.50 G3DSA:2.10.10.80 IPR011050
IPR040775
302–361
IPR040775 IPR012334
XXK93209.1
1 1017
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage WPEC6
[NCBI] 		3436628 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XXK93209.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV763039 [NCBI]
CDS location
range 90721 -> 93774
strand +
CDS
ATGGCAACATTCCCAACATATCCGGCAACGTCTCTTGAACAGGGCGTAGATCTGGTTATTTTCTCGTCTAACCAACTTCACGATGTTATTAATGGAAGTGCGACAGAAAGTATTGAAACAGAATCAGGGTTGATACCAACCCTTAGAAAAGCCCTTGTTGATAACTTCTTTTTTAAGAGTCCCTTGGATTGGGCGCAAGGCACTAATGAAACAGTTTTTAACCAACTTCGTTATTTTCAAAACGGAGTGTTGAGTGGTTATTACTATGCGCCTAATGCTACACTGGTAAACCCTATTCCTATGCAAGGTACTCCAGTAGGAGATAACAACTGGGTATTGTGGGGACTGAAGACAGAACAATTGGCAACAGAAGTAACCCCTTGGGTATATTCTGGGGCAACTGGTTATGAGACAGTAATTAGTCCTCCTTACATCTTTGATAGTGCTATTGTTACAATCAATGGTGTTATTCAGGTTTTGGGGGAAGCTTTCCGCATAGAAGATAGTAAAATAATCTTATCTGAACCTTTGGGGCATGATCCTGCAACAGGACTGCCAAACAAGCTTTTTGCTTATATTGGTAAAATTGTAGCTTCCGCAGATACAGATCCTAACCTAGAGAACCGTCTTGTTAGTTTAGAAACAAAAACTGAAAAACTGACAGAAAGCATGGATAAAGTTCCTCTGCAAACCATTGCTCGTAAATATGGTTTGTTAGATGATGAAGTAGCATATGCTACAGTGGGACAGTCTTTAACAGGGATTAAAGCCCTGTATGATCCGGTAGCACAATCTTCCTACACATTACCTCCTAACATTACAGGGACGTTAACATCTTTGTCTGTTTCTGGAGTAATGACTTATTCTGGTGGTTCTGTAGATCTTTCTGCACTAGCTGTAGAACGTGGACAGTTTGTTCATTTGCCTACAAGCTTTGGTAATAACGTAACCTTGACAGCTAAAAACCAGACGATTGGACGTGGGGCTGGTCGGTATCGTTGGGCTGGAAGTTTACCAAAAAGCATTTTGGCTTCTGATACATTGGAGACAAGTGGAGGATTAGGTCCAAATGCATGGGTTCTGACCAATACAGAAGGTTTGTTAACACCTCGTGGTGGAACTTATAACGACTTGTTTGATGTGGTTTACCTGTCAGAGTTTGCTAACAACACAACAACATATACAACACCAGAAGCAGCATTTCAAGCAGCTTTAACAGCAGCAAAAGCTTCCAAAAGCAAAATTCTTGATGCTTATGGTTGCGATATGACCTTTACCACTAGTTCATTTGATATCCAAGATATTACTTTACGTGGTGGTGTATTCCGTGGTCAACGTGACTATCGTGTTCAAAACGCAACAGTAGAAGGCACAACTTTCCGTAACGCTCGCGTTATGTATTGGGGCGGTGCTGTGCGAATGTTTGATTGTTTGTGGGACGGTGCTCCTCGCGCAGGGCAAGTTGGTAGCTTGGTATTCCAAGGCAACCCAATTACAGGTACTTTTGAAATTGATAACTGTACTTTTAAAAATGGTTTGTATGGTATCCTTCAGCAAGGAACAGGTGAACCAGTAACGCGTGGTGTCTTCCGCAACCTAACTTTCATGGATATGCAAGGGGATGCAATAGAACTGAACGTCATCAACAAACATTACGATGATGGTTGTGTGATTGAGAATATTTACCTGTCTAATATCGATGGGACTAATGCTCCTATTCCTCTGTCCAACTGGGGTATCGGTATTGGTGTAGCGGGTAAAGGACCATATGGTTACGGAATTCCCGATGATCAATACTGTAAAAATATTACGATTCGTAACGTTTTTGCAAAACGTTGCCGTCAGATTGTTCACGTAGAAGTTGGTCGTAATATCTCTATCGAAAACATTCATGGCGATCCAGATCAAACTGTATCTGTTGGAACAGGTTTGGCAACTGGCGCAGTTGTAATGTACGGAAGTAAAGATTTTACAATTGATGGTGTTTACGGAGAGCCTAAAACAGACGGTAGCACACTCGCAAGTAATATCCGTATGATTTACTTAGAGTGGGGGACTAATCCAGTTCTAGATGAAGAGGGAAATCCTGTAGTTCCAGCACAGGGTAGACCTTCAAACCCATGCTTTAACTATTCTGTTCGTAATATTCATACAAAAACAGGACGTGTCTTTGCAGGAGTTTCTGCTGGACCAGGTTATGAAAACAGAGTCAGCTTTGAAAATATTCGTTGTGCTGCATTGCAGTTATTCGGTGTAGCTTCTTGGCTTTCAATGTCTAACATCACCTGTAATATCTTTGATTGTGTTGGTCAACCTGAATCTGGCCCAGGAACATTTTATGATGGATTCTTCCGTAGAGAAAAATCTGTTCTTGAAATGGTTAACGTAAACTGCTATCCAGATGGTAAGACGATGGTTACAGGTCGTCCACAATGGAGTCGTTGTCGTTACTCTGATATTCATCGTGTCAACTGTAATGTTGAAGCTAATATGTATACCAATATCGCAGGTGGCATTGGAGCTATCGTAGGAACTACTGGTAAAGTTTATTACTTAGAGCCTAATCCTAGCCGAAACATTGATGGTATGCATTTCCCAACAGGGAAGGAGTTCGACAAAGGGGATATGATAGTTAAGGCAGATAATACGTTCTTCCTTGTAACTACAAGTGGAGCGTATATTCCAGATATCCCAGCTTTTGGAATCCGTGCAACATCAGCGGGAGACACTTTCTTGACGCAGAACTTGACTCCTAACGGGACAGCAACAAATGCTTCTTGGTTGTATCATTACCCTCTATCAGCAGGAACACGTATCCGTATTCCTGGCGCGGGTGTAGACGGGGCGGATTTGGACACAGTTATTACTCGTGCACCTTATCAAGATAATGATACATGGACTAACCCAGTTAAAATAGACATTGCAGATCCAATCGTAACGCCTACAAGTGCTGGAGTTAGAATAAAAACTATACCTAATGATTCTAGTAATGTTTCTGTAGGTAATACTGCGGTTATTCGCCCAACACCAGTAGTAGATGTGTCAACAACCTAA

Tertiary structure

PDB ID
e7b97679c665775b7baea0d4d22f0bdfd9367aebfa4f3381f2eb32e27e5b45f3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8376
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50