Protein

View in Explore
Genbank accession
QGT54570.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,64
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,88
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MNTLPSIKYPRSFVPGKAPTPEQLPFGLMAINHYDGDIFVKRSRSGIGTDVVKVGSGATTTNLIWVTKDGKDTNTGKKQGDAKATIKAAVADSKEGTVIRVTAGIYEEDNPIKLPPQVSIVGDSLREVTVTPLNDDDLFYVGAGNYITGMSYVKEQNTYPLAIVSFDPSDKPYINQSTYVQNCTNFIPNSIGMKIDGNNALGPLKSMVLDSFTQYNPNGIGISITNEGYAQLVSLFTICSDISVYCGTGGACDLTNSNSSFGNKALVANGVSPLKYNARVATEINPSDFIIEVDLSTPSFYVTDASYNNITGDVQIYTDSPHEFVSGMSVEIVGLAFTCNSSPNFVNIGRYQDAANMILLNKQEIVDKSLASIALGHSDFYFPGDNQTTAYSRYKDSYRLIIKNKEEIVDKSLASIAIGYPDFYFPGDTQTNSRSQYFDSYRLIQLNKSEIVGIAWTAIINQYPTVSSTETKCKRDLGYFVDAISTDIFTGGNRYSRDFTKQYFDSDGNPITNGINDIEEINAALVGFTTVRELMKQAITNTLVGSAYSDLTITADPNPLNGPISNTNPTSCDGVQHQINTLVSIVTTVIGNSNVGFLTTFTENKGVFTPGSSKCMRDLGYFVDAVSTDIFLGGNKYSRDFTKQYFNVVGVAITNGLVGEESQSVYAFNAARDWMKAAISNQLNNKDSGISVGPAEYGGGGGNLPNISPNSCTDVKNAVDTLVGIVTNVLGTNNIGFLTTFNETTRTFIPLGEDKCSRDIGYVVDALVNDLKFNTNANIFEAANAYFDSSGVPISNGLVDEEAESITAFTAVREYSKLAINNQLNKKDFTLIPDPLTGSNNAENSCSNAKTTIDNLIGILNNSIATATRPGNPTLPPNILIYPSGKKGNIFEVIYTSPGRYLDAADRIEANRKEILDKSLVGIALSYSDFTYPNDNINDLSYRFKDATRLVLKNKSEIVGVAWTNTYNEFVCNLNEVQDVESKCKRDLGYFVDAVTTDLYTGGNYYSIEFVKQYFNGSTPISGGLIGEEVESVYAFNQARDLMKRAITNQLTYQEVGISTGPIQYGGSGGNVSNTSLNSCTDVQNTVDTLVSIITTVIGSGSLSTLPTVNPGIFLNGENVCRRDLGYILDAIISDLRSYTNEKTLLARDAYFNQSGIIGISSERQQSIVGFTSLREYAKLAINNQLNNKDLALIDDPLTQSNANINSCSDVQSFIDNLISYLITDLTNQTPGNYPTNLTSQSFTVNVGVSTLQHYYAFGGKVKNYVSRPYDGQVLYFDDLYSEVASIEIINGGSGYQESPDFIFSEAETDWGIPAQAIATIRNGTITEVNLVSSGRGYLLLPTLEITTPNAGINTATFAFTMKPTYFSVSSSTPIDSTGITTITLNENIPYFVNSGAGVKFFKQSKILASSHCMEYIGTGPDIQRAIPVLGGVPIQENETISINGGLVVYTTTDQAGNFRIGEGVVINQNTGRVSGTDYTKSLFATLTPFILSLGGE
Physico‐chemical
properties
protein length:1497 AA
molecular weight: 162167,13020 Da
isoelectric point:4,66429
aromaticity:0,09552
hydropathy:-0,16413

Domains

Domains [InterPro]
IPR011050
62–252
IPR011050
QGT54570.1
1 1497
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage B3
[NCBI] 		2674978 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGT54570.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN695334.1 [NCBI]
CDS location
range 206702 -> 211195
strand +
CDS
ATGAATACACTTCCGTCTATAAAATACCCTAGATCTTTTGTCCCTGGAAAGGCTCCGACACCAGAGCAGCTTCCGTTTGGTTTGATGGCAATAAACCATTATGATGGAGATATTTTTGTAAAACGATCAAGGAGTGGTATTGGAACCGATGTAGTAAAAGTAGGTTCTGGTGCAACTACTACAAATTTAATTTGGGTAACAAAGGACGGTAAGGATACAAATACTGGTAAAAAACAGGGTGACGCAAAGGCAACAATTAAGGCGGCAGTTGCAGATTCAAAAGAAGGAACTGTAATTCGTGTAACTGCCGGGATTTATGAGGAAGATAATCCAATTAAACTCCCACCACAAGTTAGCATAGTTGGGGATAGCCTTAGGGAAGTAACAGTTACTCCATTAAATGATGATGATCTTTTTTATGTTGGGGCCGGTAATTATATTACTGGTATGTCTTATGTAAAAGAGCAAAATACATATCCTTTAGCTATAGTATCTTTCGATCCTAGCGATAAACCATATATTAATCAATCGACTTACGTTCAAAATTGTACTAATTTCATTCCTAATAGTATAGGAATGAAAATTGATGGTAATAATGCCTTGGGGCCATTGAAGTCAATGGTTCTCGACAGCTTCACTCAATATAATCCGAATGGTATTGGTATTTCTATTACTAATGAGGGATACGCCCAGTTAGTATCACTTTTTACCATTTGTTCGGACATATCAGTTTATTGTGGTACTGGTGGGGCATGTGATTTAACAAATAGTAATTCTTCTTTCGGTAATAAAGCTTTAGTTGCAAATGGTGTCAGTCCTCTTAAATATAATGCGAGAGTGGCCACTGAAATAAATCCCAGTGATTTTATTATTGAAGTTGATTTATCTACTCCATCTTTTTATGTGACTGATGCTAGTTACAACAATATAACTGGTGATGTTCAAATTTATACTGATTCCCCGCATGAATTTGTATCAGGAATGAGTGTAGAAATTGTTGGACTCGCCTTCACTTGTAATTCTTCTCCTAATTTTGTAAATATTGGGAGATATCAAGATGCGGCAAATATGATTCTTCTGAATAAGCAAGAAATTGTAGATAAATCTCTTGCTTCTATCGCTTTGGGTCATTCTGATTTTTACTTTCCTGGAGATAATCAAACCACAGCATACTCAAGATATAAGGATTCGTATAGACTCATTATAAAAAATAAGGAAGAAATTGTAGATAAATCTTTAGCATCTATTGCGATTGGATATCCTGACTTTTATTTTCCCGGTGATACGCAAACTAATTCAAGATCTCAATATTTTGATTCTTATCGTTTAATTCAGTTAAATAAATCTGAAATAGTTGGTATTGCATGGACTGCAATTATTAATCAATATCCTACAGTATCTTCAACTGAAACAAAGTGTAAGCGAGATTTGGGATATTTTGTTGATGCTATTTCTACTGATATATTTACGGGTGGAAATCGATATTCGAGAGATTTTACTAAACAATATTTTGATTCGGATGGAAATCCAATTACAAATGGTATTAATGATATAGAAGAAATAAATGCAGCCTTGGTTGGATTTACGACAGTTAGAGAATTGATGAAACAAGCAATTACCAATACTCTTGTCGGTTCTGCTTATAGTGATCTTACAATTACAGCAGATCCAAATCCACTAAATGGGCCGATATCAAACACAAATCCAACTTCTTGTGATGGAGTCCAACATCAAATTAATACTCTAGTTAGTATTGTGACAACTGTTATTGGTAATTCTAACGTTGGATTTTTGACTACTTTTACTGAAAATAAAGGAGTATTTACTCCAGGATCATCTAAATGCATGAGAGATCTCGGATATTTTGTTGATGCTGTTTCGACTGATATTTTCCTGGGTGGAAATAAGTATTCTAGAGACTTTACTAAACAATATTTTAATGTCGTTGGTGTCGCTATCACTAATGGATTGGTTGGAGAAGAATCTCAATCTGTTTATGCTTTTAATGCTGCAAGAGATTGGATGAAGGCGGCAATTTCCAATCAATTAAATAATAAAGATTCTGGCATTAGCGTTGGTCCCGCTGAATATGGTGGTGGGGGTGGAAATTTACCAAACATTAGTCCAAATTCATGTACCGATGTCAAGAATGCAGTAGACACTTTAGTTGGCATTGTCACAAATGTTTTGGGAACTAACAATATTGGATTTTTGACCACTTTTAATGAGACTACAAGAACCTTTATTCCCTTAGGTGAAGATAAGTGTAGTCGGGATATTGGATATGTTGTGGACGCCTTAGTAAATGATCTTAAATTTAATACTAATGCAAATATATTTGAAGCGGCAAATGCATACTTTGATTCTTCTGGGGTCCCAATTTCAAATGGCTTAGTGGATGAGGAAGCTGAATCAATCACCGCATTTACAGCTGTAAGGGAATATTCAAAACTTGCAATTAATAATCAATTAAACAAAAAAGATTTTACTTTAATTCCAGATCCCCTAACCGGATCGAATAATGCTGAAAATTCTTGCTCAAACGCAAAGACTACTATAGATAATTTAATTGGTATTTTAAATAACTCAATTGCCACCGCAACTCGCCCTGGAAATCCTACATTACCTCCCAATATTTTAATATATCCAAGTGGTAAAAAAGGTAATATATTTGAGGTTATATATACTTCTCCTGGAAGATATCTTGATGCCGCTGATCGAATTGAAGCAAATAGAAAGGAGATTTTAGATAAATCTTTAGTTGGAATCGCCCTTTCCTATTCGGACTTTACATATCCAAATGATAATATAAATGATTTGAGTTATCGTTTCAAGGATGCTACTAGATTAGTTTTAAAGAATAAGAGCGAGATTGTTGGTGTTGCCTGGACGAATACATACAATGAATTTGTTTGTAATTTAAATGAAGTCCAGGATGTAGAATCTAAATGTAAAAGGGATCTTGGTTATTTTGTGGATGCCGTAACTACAGATTTATATACTGGCGGTAATTATTATAGTATTGAGTTTGTTAAACAGTATTTTAATGGCTCCACTCCAATCTCTGGTGGATTGATAGGTGAGGAAGTCGAATCAGTTTATGCATTTAATCAAGCAAGAGATCTGATGAAACGGGCAATTACTAATCAATTGACATATCAGGAAGTTGGTATCAGTACTGGTCCTATACAGTATGGTGGATCAGGTGGAAATGTTTCGAATACAAGTTTAAATTCCTGTACGGATGTTCAAAATACAGTAGATACTTTAGTTAGTATCATCACCACTGTAATTGGTTCAGGTAGTCTTTCAACTCTACCAACGGTAAATCCAGGTATTTTCCTTAATGGTGAAAATGTATGTAGACGAGATCTTGGATATATTTTAGATGCAATTATAAGTGATTTGCGAAGCTATACAAACGAAAAGACTTTATTGGCACGAGATGCCTATTTTAATCAAAGTGGCATTATTGGAATTTCCTCTGAAAGGCAACAATCAATTGTAGGATTTACTTCATTAAGAGAATATGCGAAACTCGCAATTAATAATCAATTAAATAATAAGGATTTGGCTTTAATTGACGATCCACTTACACAATCTAATGCTAATATAAATTCTTGTTCTGATGTCCAGAGTTTTATTGACAATTTAATTTCTTATTTAATTACTGATTTGACTAATCAAACACCGGGAAATTATCCAACTAATCTTACCAGTCAATCTTTTACAGTGAATGTTGGAGTTTCTACTTTGCAACATTACTATGCTTTTGGTGGTAAAGTTAAAAATTATGTAAGCAGGCCATATGATGGCCAGGTATTATATTTTGATGATCTTTATTCTGAAGTCGCTTCGATAGAAATTATCAATGGTGGTTCTGGATATCAAGAATCTCCCGATTTCATTTTTTCTGAAGCAGAAACTGATTGGGGAATTCCAGCACAAGCAATCGCCACCATACGCAATGGAACTATTACTGAGGTTAACTTAGTTTCAAGTGGAAGAGGATACTTATTACTCCCAACACTAGAAATCACCACCCCAAATGCTGGAATAAATACTGCAACATTCGCATTCACAATGAAGCCTACATACTTTAGTGTTTCTAGTTCAACGCCAATTGATTCAACTGGAATTACCACAATTACTTTGAATGAAAATATTCCTTATTTTGTGAATTCTGGGGCTGGAGTAAAGTTTTTCAAACAAAGTAAAATTCTTGCATCTAGCCATTGTATGGAATATATTGGAACAGGGCCTGATATTCAAAGGGCTATTCCTGTTTTGGGTGGTGTTCCAATACAAGAAAATGAAACGATTTCAATTAATGGTGGTTTGGTTGTATATACCACGACTGATCAGGCTGGAAATTTTAGAATTGGTGAAGGAGTTGTAATTAATCAAAATACTGGTCGAGTGTCTGGTACGGATTATACAAAGAGTCTTTTTGCAACACTGACCCCATTCATACTATCATTAGGAGGAGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
a5627e3d647bbdbf4a7844cbcad859a2eff40d390d0041af9a9aca1f66c4cddb
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,3782
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequences for two Myoviridae strains infecting cyanobacteria in a subarctic lake Levesque,A.V., Thaler,M., Labrie,S.J., Marois,C., Vincent,A.T., Lapointe,A.-M. and Culley,A. — — GenBank