Protein

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Genbank accession
AHY83450.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,55
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQLVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSIQEVGTHSIEGRTTIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTAQTIELKLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQDTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYDKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDARIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDTGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSVLTISNTGTETHLIFEKGPQTGTNQAQTVTIRVWGNQFSGESDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140227,79820 Da
isoelectric point:5,29162
aromaticity:0,07215
hydropathy:-0,31102

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
AHY83450.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_112
[NCBI] 		1495285 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHY83450.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ668714 [NCBI]
CDS location
range 149413 -> 153282
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGTGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGTACGATGGAGAGCGTTACGTACCGATGCAAACTGGACAACTGTTTCATCAGGACCTTATCAATTAAAGTCAGGTGAATCAATTTCAGTTAATACTGCAGCAGGAAATGATATCACATTTACTTTACCATCTTCTCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAGTCACAGCTAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTACGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGTAGTTGTAACACCGGCAAGTCTCTATCAGGCGCAATCTAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAATACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACAACGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCGCGTTTACGTATTATAACAACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAGCTCAGACAATTGAGCTTAAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTTACAGTCCAAGAATTAGTTTTTAATGGTGAAACTAATTATGTTCCGGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTAGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCAAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTGGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTTAACCAGGATACTACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATTACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACAGCTACTGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATGCAGGAACCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGCCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATGATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGCGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGCAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAACACAGGAACTGACTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACACAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTCAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCAACTACTCTGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACGTTTGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTACGAGAAAAATAGTTATGCAGTATCACCATATGAATTAAATCGCGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCGGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTCTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCGCAGACAGTTAATGGATCATTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTGTACTAACTATTTCTAATACTGGAACAGAAACTCATCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCAAGCGCAGACGGTGACTATTAGAGTGTGGGGTAATCAATTTAGTGGGGAATCAGACACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCATTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCTGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCTATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGTGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAACGGAAATTATGGTTTCATTGTTCGCAATGATGGATCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTGCGTCCTTTAGCTATCAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGCGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGCGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGACTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGTGAAGAGGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACACCAGAAGCGCGTACCACTCGTTGGACGCGCACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGACATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTGTTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
519de389d98f86c90eeab4ca8d3f6c239c8d655fc860a9c8782d001505acd3fa
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5625
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50