Protein

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Genbank accession
ADP00057.1 [GenBank]
Protein name
tail tube B
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,99
Protein sequence
MAAINQRIPNFLGGVSQQPDTIKFPGQLRVCDNAVPDVTFGLMKRPPGEFVKTLTNANASGYWYDILRDGDEKYLVQMTASSSYSGTKPIRIWNLLTGVEQSLTNSNGDSLFQYMQQTGTTKPYAIQSVQDYTIITNPQKTIGTDGNTAVPLNSGDYAFARLDTIAYNTEYVLYTGSAPSANTYYRVTSLKVDYTNTQGGSAVGSTWDDTNEDGRYAGQLGFSFSGGSAVTIPGGQVATEDVEGTLLINGQSFITSQDPQYQADDSSSTSTSGDGSDFIGYVSDYDTRYTATVTLKNGGIIKGTKAQAEACYIDVVVEGKYYRISVEAVEPVETYQGVSSIAYYKTAQSPDKGRASMATILKGLETAVNSDLANVTAEIYGSGLYLYGSAAPNVNFLGGAVNEAMNVFGNTAQDVARLPSMCKHGYIVQVANSENVDADNYYVKFLADNGSGGSGKWEETVRPHNFSSGSDPMVKGLDPATMPHALVNNRNGTFTFKKLDETTANADNTDNYWKYREVGDDETNPFPSFKGLEIQKIFFHRNRLGFVANEQVVMSRPGDYFNFFVVSAITTSDDNPIDITVSDIKPAFINHVLPVQKGVMMFSDNGQFILFTESDIFSPKTARLKKISSYECDDALQPVDMGTSVMFSSSVSAYTRTYEATVVDDDVPPKIVEQTRVVPEFLPKTVDTTANTTSLGIVSYGETNTNELYHYKYFDSGERRDQSAWYSWTLQGTLQYMVYTAGTFYVVTKQDNDYILCRHEYVTDATSARTYVVGGVAADVGSPLKTARWFEGCLDNMTIPTAITYTAQGGSVTGPDFTDLTIPYTPTSADNLYAVALSGTDTAGNDVAGTVIKATSVGTNKATFEGVNMTGWTVAVGYRYTTTVELPNYYMSVEAGKYDVDADLRISGINFEMGISGPMEFHLSSIYADMNDYVQYESGMKLDDSDFGKPPSKTSKSVRVPVQKKNEKYNLTIKIPDPFSTALISASWDGIYNQRRHARK
Physico‐chemical
properties
protein length:1000 AA
molecular weight: 109309,00530 Da
isoelectric point:4,72914
aromaticity:0,11100
hydropathy:-0,34900

Domains

Domains [InterPro]
IPR058003
1–177
IPR058003 IPR058003
ADP00057.1
1 1000
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage 9515-10a
[NCBI] 		444875 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Prochlorococcus marinus str. MIT 9515
[NCBI] 		167542 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADP00057.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071100 [NCBI]
CDS location
range 29768 -> 32770
strand -
CDS
ATGGCAGCAATTAATCAACGAATCCCAAACTTTTTAGGAGGTGTATCCCAACAGCCCGATACAATTAAATTTCCAGGGCAGCTTAGGGTATGTGATAACGCAGTACCTGATGTAACCTTTGGCTTAATGAAACGTCCTCCAGGAGAATTTGTGAAGACGTTGACTAATGCTAATGCTAGTGGTTATTGGTATGATATACTAAGAGATGGAGATGAAAAATATTTAGTACAAATGACAGCATCATCTAGTTATTCTGGTACTAAACCTATTAGGATTTGGAACCTTTTAACTGGAGTAGAACAGAGTCTTACCAATAGTAATGGTGATTCTTTGTTTCAATATATGCAACAAACAGGTACAACTAAACCATATGCTATTCAATCAGTACAGGATTATACAATCATTACCAACCCGCAAAAAACGATTGGTACGGATGGGAACACTGCTGTTCCTCTCAACAGTGGGGACTACGCTTTTGCTAGGTTAGATACTATTGCTTATAATACTGAGTATGTATTATATACAGGTTCTGCACCGTCTGCTAATACTTATTATCGAGTAACTTCTTTAAAAGTAGATTATACTAATACCCAAGGTGGTAGTGCTGTGGGTAGTACATGGGATGATACTAATGAAGATGGTAGATATGCTGGACAATTAGGTTTTTCGTTTTCAGGAGGTAGTGCTGTAACTATTCCTGGAGGACAGGTAGCCACAGAAGATGTAGAAGGTACATTACTAATTAATGGTCAATCATTTATTACTTCACAAGATCCTCAATATCAAGCTGATGATTCTAGTTCAACATCTACTTCAGGAGATGGATCTGACTTTATTGGTTATGTTTCCGATTATGATACACGATACACAGCTACAGTTACATTAAAAAACGGTGGTATAATTAAAGGTACTAAAGCACAAGCTGAAGCATGTTATATTGATGTTGTTGTAGAAGGTAAATATTACCGTATTTCAGTAGAAGCTGTAGAACCTGTTGAAACATATCAAGGTGTTTCTAGTATTGCATACTACAAAACAGCACAAAGTCCAGATAAAGGTAGAGCTAGTATGGCTACTATCCTTAAAGGATTGGAAACTGCTGTTAATAGCGATTTAGCTAATGTTACTGCTGAAATATATGGTTCAGGTTTATATTTATATGGTAGTGCAGCTCCTAATGTAAACTTTTTAGGAGGTGCTGTGAATGAAGCTATGAACGTGTTTGGTAACACAGCACAAGATGTAGCTCGTTTACCATCTATGTGTAAACATGGTTATATAGTACAAGTAGCTAATTCAGAAAACGTAGATGCTGATAATTATTATGTAAAATTTCTAGCTGATAACGGTTCAGGTGGTTCAGGTAAATGGGAAGAAACTGTAAGACCACATAACTTCTCATCAGGTAGTGACCCTATGGTTAAAGGATTAGATCCTGCTACTATGCCACACGCTTTAGTTAATAACCGTAACGGTACTTTTACTTTTAAAAAGTTAGACGAAACTACAGCTAATGCTGATAATACAGATAATTATTGGAAGTACAGAGAGGTAGGTGATGATGAGACTAACCCATTTCCTAGTTTTAAAGGCTTAGAAATTCAGAAAATATTTTTTCACAGAAACAGATTAGGTTTTGTTGCAAACGAGCAAGTAGTAATGAGTCGTCCTGGAGATTATTTTAATTTCTTTGTTGTCTCTGCGATTACTACAAGTGATGATAATCCTATTGATATTACAGTATCTGATATTAAACCTGCATTTATTAATCATGTCTTGCCTGTTCAAAAAGGTGTGATGATGTTTAGTGATAACGGTCAGTTTATATTATTTACTGAATCTGATATATTTAGTCCTAAAACAGCAAGGCTGAAAAAGATATCTAGCTATGAATGTGATGATGCTTTACAACCTGTAGACATGGGAACTTCAGTTATGTTTAGCTCGTCTGTATCTGCATACACTAGAACGTATGAAGCTACTGTTGTAGACGATGATGTACCTCCAAAAATAGTAGAGCAAACACGAGTAGTTCCTGAATTTTTACCAAAAACTGTTGATACTACAGCTAACACAACCTCTTTAGGTATAGTTAGTTATGGTGAAACAAATACAAACGAGTTGTATCATTATAAATATTTTGATTCAGGAGAACGTAGAGATCAATCTGCATGGTATTCATGGACATTACAAGGTACATTACAGTATATGGTATATACTGCTGGTACTTTCTATGTTGTCACTAAACAAGATAATGATTATATATTATGTAGACATGAATATGTCACAGATGCTACATCTGCTCGAACATATGTTGTTGGTGGAGTAGCTGCTGATGTAGGTTCTCCGTTAAAAACAGCTAGATGGTTTGAAGGTTGTCTAGATAACATGACTATACCAACTGCTATAACTTATACAGCTCAAGGAGGTTCAGTAACAGGACCAGATTTCACTGATTTAACTATACCTTATACTCCAACTTCAGCTGATAATTTATATGCTGTAGCTCTTTCTGGAACAGATACAGCTGGAAATGATGTTGCTGGTACGGTAATTAAAGCTACTTCTGTAGGTACTAATAAAGCCACGTTTGAAGGAGTCAATATGACTGGATGGACAGTAGCTGTAGGTTATAGATATACAACAACAGTAGAGCTACCTAATTACTATATGTCCGTAGAAGCTGGTAAATATGATGTAGATGCTGACTTAAGAATTTCTGGAATAAATTTTGAAATGGGTATTTCTGGTCCTATGGAGTTTCATTTATCTTCTATCTATGCAGATATGAATGATTACGTTCAATATGAATCTGGTATGAAACTAGATGACAGTGACTTTGGTAAACCACCTTCTAAAACATCTAAGTCAGTGAGAGTACCAGTACAGAAAAAGAATGAAAAATATAATCTTACTATAAAAATACCTGATCCTTTTTCCACCGCTTTAATCTCAGCAAGCTGGGATGGCATTTATAACCAACGAAGACATGCACGAAAGTAA

Tertiary structure

PDB ID
5dd3691de72a488589dc89df5a4675483e1f1b91105bd875474cfe6b7a54020b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7146
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage 9515-10a Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank