Protein
View in Explore- Genbank accession
- UOX39550.1 [GenBank]
- Protein name
- putative rhamnogalacturonan acetylesterase
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MSSTGNPIGSPDFRDAYLNATNLDYAINGEDDTYVDRFGVTRPTLHGMEKKALPKGSLEYLSAKMDAGETVKFAFYGDSTVDGFGTTDWIGNPTSGGNAVGNSNHNLNAPNSYPVILETLLREMFNNNNIFMYNAGYSGKSLVDGWALANFDKAIIDNPFYGKPDVVFIDFGLNDARPEGSQIVPFKEQLFLLIDKIVSYGVLPVILTCDPVLRNYNVPNAVFNGEITKQIDMVKYDVAKLRNIPIINKGEQLRDWANNNGNGYRWFLEQSTDVDSDGDFSTGDDVGLHFKDIGHRIKAQILAKTFFKNTVIITGKPESITSNDSRSNSFGNFLLTLSGDSSSNSKQGFTFRVDYKDPNLTHQPSGPRAPMSTIWVWSEIPDCEVIYNGLIGEGWGTDIPDTPINNPLPPAVAIKSFVNNETVTKIPPTVGFRYSGVLKPSDIPYTVGKLKYGLNKIQYLCGDLGHYVRGSKSLFFYGFFDFKPPTPPCLNGPRIHSFLPLADIITTEGFDRTFGVMSEEKLVFLVEAEMAVGTGISLLGSSTFFGLGNDKQDGYGSIQSTVLYRHDDTRYRIANAKYGLIANEVLSTPINVAFTPTQSNGSILLRIEISRSFLLGNYGGGKQVVKVYDGFKPLDTKLLQTTEIVAPSGLPVHMGGIVGGYYSNKTLNLLGGEVILKALTVFKI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 684 AA molecular weight: 75044,02080 Da isoelectric point: 5,53097 aromaticity: 0,11111 hydropathy: -0,18406
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Aeromonas phage ZPAH34 [NCBI] |
2924888 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UOX39550.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM810292
[NCBI]
CDS location
range 104924 -> 106978
strand -
strand -
CDS
ATGTCATCAACAGGTAATCCCATAGGGAGTCCGGACTTCCGTGACGCCTATTTAAATGCGACCAATTTAGATTATGCAATAAATGGTGAAGACGATACTTATGTGGATCGATTCGGTGTAACCCGACCGACTTTACATGGGATGGAGAAAAAAGCTTTACCAAAAGGATCCCTAGAATATTTATCTGCAAAAATGGATGCTGGAGAAACTGTCAAATTTGCCTTTTACGGAGACAGTACTGTAGATGGATTTGGGACAACTGATTGGATCGGTAACCCTACTTCTGGTGGTAATGCGGTTGGAAACAGTAATCATAATTTAAATGCACCAAATTCTTATCCTGTTATTTTAGAAACCCTATTGCGTGAAATGTTCAACAATAATAACATTTTTATGTACAACGCAGGGTATTCAGGAAAATCTTTGGTTGACGGTTGGGCGCTTGCGAACTTTGATAAAGCAATTATTGATAATCCCTTTTACGGTAAACCGGACGTTGTTTTTATTGATTTTGGTTTAAATGACGCAAGACCGGAAGGTTCTCAAATAGTACCATTTAAAGAACAACTCTTTTTATTAATTGATAAAATTGTTTCTTATGGAGTACTTCCTGTTATTTTAACATGTGACCCAGTTCTTCGTAATTATAATGTTCCAAATGCGGTATTTAACGGAGAGATAACAAAACAGATCGACATGGTAAAGTACGATGTTGCTAAGTTAAGAAATATCCCCATTATTAATAAGGGCGAGCAACTTAGAGATTGGGCTAACAATAATGGCAATGGTTATCGTTGGTTCTTAGAACAATCAACCGATGTCGATTCTGACGGGGACTTCAGTACTGGCGACGACGTAGGGTTACATTTTAAAGATATTGGTCATCGTATTAAAGCTCAAATTCTAGCTAAAACTTTCTTTAAAAATACTGTTATTATAACAGGTAAACCAGAAAGTATTACTTCTAATGATTCCAGAAGTAATAGTTTTGGTAATTTCTTATTAACTTTATCTGGCGATAGTTCTAGTAATAGCAAACAAGGATTTACCTTTAGAGTTGATTATAAAGATCCCAATCTTACCCATCAGCCATCTGGTCCACGGGCGCCTATGTCAACAATTTGGGTGTGGTCGGAAATCCCTGATTGCGAAGTTATCTATAACGGTTTAATTGGAGAAGGATGGGGAACGGATATACCAGATACCCCAATTAATAATCCATTACCTCCGGCTGTTGCAATAAAAAGTTTTGTCAATAACGAAACTGTAACTAAAATCCCCCCTACTGTTGGATTTAGATACAGTGGGGTATTAAAACCCTCCGACATCCCATATACTGTTGGTAAACTTAAATATGGATTAAATAAAATCCAATATTTATGTGGAGATCTCGGTCACTATGTCAGGGGAAGTAAGAGTCTGTTCTTTTACGGGTTCTTTGATTTTAAACCACCAACACCACCTTGTTTAAATGGTCCTAGAATACATAGTTTTTTACCTTTAGCAGATATTATTACGACCGAAGGATTTGACCGAACGTTTGGTGTGATGAGTGAAGAAAAACTTGTGTTTTTGGTTGAAGCAGAAATGGCTGTTGGAACCGGAATTTCTTTGCTTGGTTCAAGTACATTCTTCGGATTAGGAAATGATAAACAAGATGGGTACGGTAGTATTCAATCCACTGTTCTTTATCGACATGACGATACTCGCTATCGAATTGCAAATGCCAAATACGGTTTAATTGCAAACGAAGTACTTTCAACACCTATTAACGTAGCATTTACACCAACACAGTCAAATGGTTCAATTTTATTGAGAATTGAAATATCACGTAGTTTCCTTTTAGGTAATTACGGAGGCGGGAAACAAGTTGTAAAAGTTTATGATGGTTTTAAACCATTAGATACTAAGCTTTTACAAACTACAGAAATAGTTGCTCCCTCTGGACTTCCTGTTCATATGGGCGGTATTGTTGGCGGTTACTACTCTAATAAAACATTAAATTTATTAGGTGGTGAAGTTATTTTAAAAGCATTAACTGTTTTTAAAATATAA
Tertiary structure
PDB ID
93b60a8651dc659a2d0add0edac6f5e50a291cf601c063558f6ba586dada27c3
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50