Protein

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Genbank accession
CEK40415.1 [GenBank]
Protein name
Putative regulator of chromosome condenstation family protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MKKNKLLQRGSLFGNKEFKIEEFNKNFDTFNVKDIFTDMDSGSVFIIKDDLKLYAAGYNVFGNLGLGNKVSPIRYFSKIDIDNVKYVSSSGTHSLLLKNNGDVYSTGLNTDGELGLGDNIDRNTFTKINISNVKQIACGNGYSMLVTNDNELYVCGNNKFGGIGLGNTSTVNTFTKIDNLSVKEIFAGVSCSYILTLNNEVYSTGTNSYGQLGLNDTTNRNIFTKVNLDNVIKISTAQGAVNFLLENGDVYGCGDNSNGQVGVGGGATVTVLTKLSISNVKNIESGRYHKFYIANNNDIYVTGANPDGRLGDKINCDRSTYTPRKSSISIKNISKIKCAHAISFILTSNNELYMTGDNSYSFSYLKRYDKFIYGFEKFEDFDIEECNHIESIDNRLLINKNDERVLDIGLENNFVNISLVKANDTSTFIVVNGNELYAAGYNAYGGLGLGHNRHCYEFTRVPLELEEGVTIKDIYLNLGSYFTFILLSDNTLYSTGYNVFGVLGLGDNINRNTFTKVNISSVDKISVGDNHALLKTTTNELFSTGLNNYGQLGLNDTTNRNIFTKVSTVTYVNEIIAYSNSSYCIDNSRISYAAGYNVFGELSLNDTSSRSVFVKMRYSRYKTDTTVSDVSNIAEIIPFNNGCLIRTTSNNYYVSGRHNYYSTSIKNSVTDDYYSRFGEFVGSKNSNANEVAVLIDEPKLSKVLVSNYNLCLLLDASDGGYKEIKFTGRPSTFGASSQDKNLGLRSLISSSMPYYNHYLGTDNLLYTTSKTRMESKFEIRGRNAGGQRGDSSYYSNSQKYTLSNAFFAYNSQVIYASGLRIVIKDYFGNIYCSGVNSHGCFGIKKPYDVRHDGFVNISKQFSKKYIISNIKEIKSDRQALYILLNNSEGYVCGNNAGNKLGTIKARSEFIKVPIDNIKEFIPSNDCLFILTNNNQVYSIGTNDLGQLGLGDNIDRGTFTKVPIDNVKKVITCYKSSYILTYDNELFSTGSNGYGQLGLGDNINRNTFTKVNISGTIKDIFCGRYVFIILLENDNIISLMGCGNRNYISSNTNSNSLTKINIEGLTDPSTISNLMLEEGKTIITMKNRIFVTGYNSLGGLGVGTSYNNSSGYIEGYKDLAFNSNIKEVALGEYTIFVLLENGDLYSGGNADDGIGFNESGTVVLKKLTSNIKHIYANGKNAYYIDNDNALYVFGSRQLGQINNYSDVVQKTPVRNCLNVKQVYTQHNGLIVQYTNNKLEGKGNAVVGQVGIFNGHEENQIANTSGDNPSDLSFSNEMSIIRNNYGLLVNKKIFLHNDDSINYRIPFGTNAGNYSTSLPFDNIKKMSLSSTHSILILENGDVYGCGSNQFGELAINKSELTTTSEFIKINLTNIIDIACGDNFTYFLKNDGSLFSIGKNSEYQLGIGHNDEVNELQEVLTISNIREIYAYSNYILAITTEGQLYVQGYNINGILGLNENTKNTIIKLFTKVLENVKYIKSYDDKHIFVIKNDKTLYVTGINKETYKIKDVEIGSMLYTFSQIYIPRDVNDIVDALIKDETLYIISKVDSEKTCLEIKNKSYSSIEIDLQNPNNELTKIEMFINNISSSIIEDLSTGTVTFEINPENLVLGENKIVFKAHSDIGNNLYINVYIYKKETGATIVKDSTVLIDGNTYNVSSIVDNSQDVVLTLNKGLLEDLNSNNPIYHLVNKLKVQLKINESDTFKDMVKVETRKTENGYKEIYELKDMNIQSAQPKVIVEEGNTNTTIKKPSMLFNLDVETL
Physico‐chemical
properties
protein length:1759 AA
molecular weight: 195674,25020 Da
isoelectric point:5,77089
aromaticity:0,10290
hydropathy:-0,30080

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Clostridium phage phiCD211
[NCBI] 		1582152 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CEK40415.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LN681537 [NCBI]
CDS location
range 43298 -> 48577
strand +
CDS
ATGAAAAAGAATAAACTATTACAAAGAGGTTCTTTATTTGGAAACAAAGAATTTAAAATAGAAGAGTTTAATAAAAATTTTGATACTTTTAATGTTAAAGATATATTTACAGATATGGATTCTGGTTCTGTGTTTATAATTAAGGATGATTTAAAGTTATATGCAGCAGGATATAATGTTTTTGGCAATTTAGGACTTGGAAATAAAGTATCACCTATAAGATATTTTTCAAAAATAGATATTGACAATGTTAAGTATGTTTCATCTTCTGGAACTCATTCTCTTTTACTTAAAAATAACGGAGATGTGTATTCTACTGGCTTAAACACAGATGGGGAGTTAGGTTTGGGAGATAATATTGATAGAAATACTTTTACTAAGATAAATATAAGTAATGTAAAACAAATTGCTTGTGGGAATGGCTATTCTATGTTAGTTACAAATGACAACGAGCTTTATGTATGTGGTAATAATAAATTTGGAGGGATAGGCTTAGGAAATACATCTACTGTAAATACATTTACTAAAATTGATAATTTGAGTGTTAAAGAAATATTTGCAGGAGTCAGTTGTTCATATATATTAACTTTAAATAATGAAGTCTATTCAACAGGTACAAATTCCTATGGGCAGTTAGGACTTAATGACACTACTAATAGAAATATTTTTACTAAAGTAAATTTAGATAATGTAATAAAGATTTCTACTGCTCAAGGTGCTGTAAATTTTCTTTTAGAAAATGGGGATGTCTATGGTTGTGGAGATAATTCAAATGGGCAAGTTGGTGTTGGTGGAGGAGCTACAGTAACAGTCTTAACAAAACTATCTATATCTAATGTAAAAAATATAGAAAGTGGTAGATATCATAAATTTTATATAGCTAATAATAATGATATATATGTAACTGGAGCCAACCCAGATGGGCGTTTAGGAGATAAAATAAATTGTGATAGATCAACATATACTCCTAGAAAATCTTCTATTAGTATTAAAAATATAAGTAAAATTAAATGTGCTCATGCTATAAGCTTTATATTAACTAGCAACAATGAATTGTATATGACAGGAGATAACAGTTATAGTTTTTCTTATTTAAAAAGATATGATAAATTTATATATGGATTTGAAAAATTTGAGGACTTTGATATTGAAGAATGTAATCATATTGAGTCTATTGATAATAGATTATTAATAAATAAAAATGATGAAAGAGTTTTAGATATAGGGCTTGAAAATAATTTTGTGAATATCTCTTTAGTGAAAGCAAATGACACCTCTACATTTATTGTTGTGAATGGTAATGAACTATACGCAGCAGGATACAACGCTTATGGAGGTTTAGGTTTAGGTCATAATCGTCATTGTTATGAGTTTACTAGAGTGCCATTGGAATTAGAAGAAGGAGTTACTATAAAAGATATATATTTAAATCTAGGCTCATATTTCACGTTTATATTACTAAGTGATAATACATTATATTCAACAGGATATAATGTATTTGGAGTGTTAGGATTAGGGGATAATATTAATAGAAATACTTTTACTAAAGTAAATATTTCTTCTGTTGACAAAATTTCTGTAGGAGATAACCATGCGTTATTAAAAACAACTACTAATGAATTATTTTCAACTGGTTTAAACAATTATGGGCAGTTAGGACTTAATGACACTACTAATAGAAATATTTTTACTAAAGTAAGTACTGTAACTTATGTAAATGAAATTATTGCATATTCAAATTCTTCATATTGCATAGACAATAGCAGAATATCTTATGCAGCAGGATATAATGTTTTTGGCGAATTAAGTCTTAATGATACCTCAAGTAGGAGCGTTTTTGTTAAGATGAGATATTCAAGATATAAAACAGATACAACAGTATCAGATGTATCTAACATTGCTGAAATTATTCCTTTTAATAATGGATGTTTAATTAGAACTACGTCTAATAACTACTATGTTTCTGGGAGACATAATTATTATAGCACAAGTATTAAAAATTCTGTAACTGATGATTATTATTCAAGGTTTGGAGAGTTTGTAGGAAGTAAAAACTCAAATGCAAATGAAGTCGCAGTTTTAATAGATGAACCTAAATTATCAAAAGTTCTGGTTTCTAACTATAATTTATGTTTATTATTAGATGCTAGTGATGGAGGATATAAAGAAATAAAATTCACAGGAAGACCTTCGACTTTTGGAGCTTCATCCCAAGACAAGAATTTAGGTTTAAGAAGTCTTATATCGTCTTCTATGCCTTATTATAATCATTATCTTGGAACAGACAATCTTTTATATACAACAAGTAAAACAAGGATGGAGTCTAAATTTGAAATAAGAGGTAGAAATGCAGGTGGGCAAAGAGGAGACAGTAGTTATTATTCTAATAGTCAAAAATACACATTATCAAATGCTTTTTTTGCATATAATTCACAAGTAATATATGCTAGTGGATTAAGGATAGTAATTAAAGATTATTTTGGGAACATATATTGTTCTGGAGTAAATTCTCATGGCTGTTTTGGCATAAAAAAACCTTATGATGTTAGACATGATGGTTTTGTAAATATATCAAAACAATTTTCTAAAAAATATATCATATCAAATATAAAAGAAATTAAAAGTGATAGACAAGCTTTATATATATTATTAAATAATAGCGAAGGATATGTCTGTGGTAATAATGCTGGTAACAAGTTAGGGACAATTAAAGCTCGGTCTGAATTTATAAAAGTTCCTATAGATAATATAAAAGAATTTATTCCATCGAATGATTGTTTATTTATTCTTACAAATAATAATCAAGTCTATTCAATTGGAACAAATGACTTAGGGCAATTAGGTTTAGGAGATAATATTGATAGGGGTACTTTTACTAAGGTGCCTATTGATAATGTAAAAAAAGTAATAACATGTTACAAATCTTCTTACATTCTAACCTATGACAATGAATTATTTTCAACTGGTTCAAATGGCTATGGTCAATTAGGATTAGGGGATAATATTAATAGAAATACTTTTACTAAAGTAAATATTTCTGGAACAATAAAGGATATATTTTGTGGAAGGTATGTTTTTATTATATTATTGGAGAATGATAATATAATTTCTTTAATGGGTTGTGGAAATAGAAATTACATAAGTTCAAATACAAATTCAAACAGTTTAACTAAAATAAATATTGAAGGATTAACAGACCCATCAACTATATCAAATTTAATGTTGGAAGAAGGCAAAACTATAATTACAATGAAAAATAGAATATTTGTCACAGGATATAACTCATTAGGAGGTTTAGGTGTTGGTACTTCATATAATAATTCATCAGGATATATTGAAGGATATAAGGATTTAGCGTTTAATAGTAATATAAAAGAGGTTGCTCTAGGAGAATACACTATTTTTGTTTTACTTGAAAATGGAGATTTATATTCTGGAGGAAATGCTGATGATGGTATAGGTTTTAATGAATCTGGTACTGTAGTATTAAAAAAATTAACAAGTAATATAAAGCACATATATGCAAATGGTAAAAATGCTTATTATATAGATAATGATAATGCCTTATATGTGTTTGGTAGTAGACAATTGGGTCAAATCAATAATTATTCTGATGTTGTACAAAAAACACCTGTTAGAAATTGCCTTAATGTAAAACAGGTATATACACAGCATAATGGTCTTATAGTTCAATATACTAATAATAAATTAGAAGGAAAAGGTAATGCTGTAGTTGGTCAAGTAGGTATTTTTAATGGACATGAAGAAAATCAGATTGCAAACACTTCTGGTGATAATCCTAGTGATTTAAGTTTTTCTAATGAAATGTCTATTATAAGAAATAATTATGGACTATTAGTAAATAAGAAGATATTTTTACATAATGATGATAGTATTAATTATAGAATACCATTTGGCACAAATGCTGGAAATTACTCAACTTCATTGCCTTTTGATAATATAAAAAAGATGTCTTTATCATCAACTCATTCAATTTTGATATTAGAAAATGGGGATGTCTATGGTTGTGGTTCAAATCAATTTGGGGAACTTGCTATAAATAAATCTGAGCTAACAACAACTTCTGAATTTATAAAAATTAACTTAACAAATATAATAGATATTGCTTGTGGTGATAATTTTACTTACTTCTTAAAAAATGATGGCTCATTGTTTTCTATTGGTAAAAACTCAGAATATCAACTTGGAATAGGGCATAATGATGAGGTTAATGAGTTACAAGAAGTATTAACTATTTCTAATATAAGGGAGATATATGCTTATAGTAATTATATATTGGCTATAACTACAGAAGGTCAATTATACGTACAAGGATATAATATAAATGGGATTTTAGGACTGAATGAGAATACAAAAAATACAATTATTAAATTATTTACTAAAGTATTAGAAAATGTAAAATATATAAAATCTTATGATGATAAACATATATTTGTTATAAAAAATGATAAGACTTTGTATGTTACAGGGATAAATAAGGAAACATATAAAATTAAAGATGTAGAGATTGGTTCTATGTTATATACTTTCTCACAAATATATATTCCAAGAGATGTTAATGATATAGTGGATGCTTTAATAAAAGATGAAACATTATATATAATCTCAAAAGTAGATTCAGAGAAAACTTGTTTGGAAATAAAGAATAAGTCATACTCATCTATTGAAATAGATTTGCAAAATCCAAATAATGAATTGACAAAAATAGAGATGTTTATAAATAATATTAGTTCAAGTATAATAGAAGACTTATCTACAGGAACAGTCACGTTTGAGATTAATCCAGAGAATTTAGTTCTTGGAGAAAATAAGATTGTATTTAAAGCACATTCTGACATTGGAAATAATTTATATATAAATGTTTATATTTATAAAAAAGAAACAGGAGCAACTATAGTAAAAGATTCAACTGTATTAATCGATGGGAATACTTATAATGTATCTAGTATAGTTGATAATTCACAAGATGTAGTACTTAC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Tertiary structure

PDB ID
5b50c9ffb71d5adc8a8ea2630098ba536932f1d9f257ea7a89326c83467ac617
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6558
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
High prevalence and genetic diversity of large phiCD211-like prophages in Clostridium difficile Garneau,J.R., Sekulovic,O., Dupuy,B., Soutourina,O., Monot,M. and Fortier,L.C. 2018-02 — GenBank