Protein

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Genbank accession
QNJ49541.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,62
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,86
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYNNRFWAATDNIPKPAGNFNRIRWKALRTDAVYTTVSSGPYQLKSGEAISVDTSVGNDIEFTLPPSPLDGETVIIQDIGGKPGINQVKINSSNQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQMVFIFNNRLWQMYIADYSREAAIVTPSTAYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNNSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLIRGFVKTSSGSLTFVGNDTVGSTQPLESYEKNGYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSGESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAISGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATISSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGAIPSDNGIIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140323,82460 Da
isoelectric point:5,50607
aromaticity:0,07292
hydropathy:-0,34678

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
QNJ49541.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage PYps11T
[NCBI] 		2764915 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QNJ49541.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT515751.1 [NCBI]
CDS location
range 57540 -> 61409
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAGCAATATGACCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATAATAATCGTTTTTGGGCAGCAACGGATAATATTCCAAAACCTGCTGGAAATTTTAATAGAATTCGTTGGAAAGCATTACGTACTGATGCCGTATATACAACCGTATCATCTGGACCATATCAATTAAAATCCGGAGAAGCAATTTCAGTAGATACATCAGTTGGCAATGACATTGAGTTTACTTTACCACCTTCTCCGCTTGATGGAGAAACCGTAATAATTCAAGATATCGGTGGAAAACCTGGCATAAATCAGGTTAAAATAAATTCTTCAAATCAGAGTATTGTCAATTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTTTTAATGACTCATCCAAAGTCACAGATGGTATTCATTTTTAATAATCGTTTGTGGCAAATGTATATTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGCGATTGTTACTCCATCGACTGCATATCAAGCACAATCTAATGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCGCCAATTAATGTTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAACTGAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGACGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTATTTGGCGCGAATAATGGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTAACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTACCAGTTTTGCAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACAGTTGAAAGAGTCGATTCTTTAAATAATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCAAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTGGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTATTGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTCGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATACAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAAACATTATCGGGTATTGTAACTTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGCGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGACTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAGGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCAACTTGGGCAGCAACTACTCTGATAAGAGGGTTTGTTAAAACTTCTTCTGGTTCATTAACGTTTGTTGGTAATGATACGGTAGGTTCAACACAGCCATTAGAATCATATGAGAAAAATGGTTATGCAGTATCACCATATGAATTAAATCGCGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTCTAGATTCGCTCCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAAACAGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACATTCGGTGGATCAGTTTCAGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAACCCAGCTCAAACGATGACAGTCAGAGTGTGGGGAAATCAGTTTAGTGGGGAATCAGACACAACACGTTCTACCGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACGTCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGTAATAAAGCTGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCGATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGTGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAGCGGAAATTATGGTTTCATTGTTCGCAATGACGGGTCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAAACTGGCGGATTTAATGGATTGCGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCAAAAGGTGCTACTATAAGTTCGGGTGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACCTCTGATTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACAGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGTGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCACTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACCCCAGAAGCACGTACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCTTCAGATATAGGAGCGATCCCATCTGATAATGGAATAATAGGTAATCTTACTATTCGCGATTTCTTGCGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Tertiary structure

PDB ID
49244f713ac178adde59f3d823acaae36f112571b06549262dc22210f0d1451f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5636
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Yersinia pseudotuberculosis phages Hammerl,J.A. 2018-05-10 — GenBank